More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_5057 on replicon NC_008688
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008688  Pden_5057  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 		 313 aa  599  1e-170  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2925  secretion protein HlyD family protein  50.32 
 
 		 314 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0402  HlyD family secretion protein  50.65 
 
 		 314 aa  266  2.9999999999999995e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0463  HlyD family secretion protein  50.32 
 
 		 314 aa  265  1e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0052  secretion protein HlyD family protein  40.21 
 
 		 324 aa  175  8e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0163  lipoprotein  40.2 
 
 		 311 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0904469  normal  0.961053 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0055  secretion protein HlyD family protein  39.86 
 
 		 324 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.873688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0456  secretion protein HlyD family protein  42.42 
 
 		 324 aa  173  2.9999999999999996e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.119386  normal  0.109818 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3131  secretion protein HlyD  38.74 
 
 		 344 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0978227  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3452  HlyD family secretion protein  41.03 
 
 		 326 aa  164  2.0000000000000002e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.349475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3691  secretion protein HlyD family protein  41.95 
 
 		 320 aa  163  3e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.951717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0409  secretion protein HlyD  38.11 
 
 		 332 aa  160  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0350  secretion protein HlyD  39.53 
 
 		 320 aa  160  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1719  secretion protein HlyD  35.92 
 
 		 315 aa  160  3e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0706497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1744  HlyD family secretion protein  39.51 
 
 		 321 aa  160  4e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0223446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4329  secretion protein HlyD family protein  38.81 
 
 		 327 aa  159  6e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4164  secretion protein HlyD family protein  41.28 
 
 		 320 aa  157  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.571077  normal  0.349969 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0700  putative lipoprotein  39.1 
 
 		 359 aa  157  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1084  HlyD family secretion protein  42.21 
 
 		 356 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.335201 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0146  auxiliary membrane fusion protein family transporter  33.99 
 
 		 326 aa  153  4e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000237701  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2054  periplasmic component of efflux system  33.01 
 
 		 332 aa  150  2e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0506  secretion protein HlyD family protein  43.37 
 
 		 317 aa  150  3e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3668  putative efflux protein  33.56 
 
 		 263 aa  138  8.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.285174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4665  secretion protein HlyD family protein  38.6 
 
 		 328 aa  138  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.267783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2904  secretion protein HlyD family protein  38.19 
 
 		 329 aa  135  7.000000000000001e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.839486  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1792  putative efflux protein  31.6 
 
 		 266 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.0000336857  normal  0.255323 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1342  HlyD family secretion protein  32.52 
 
 		 317 aa  129  8.000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4312  hypothetical protein  31.25 
 
 		 267 aa  123  4e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2707  secretion protein HlyD family protein  35.89 
 
 		 328 aa  119  6e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0650452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0717  hypothetical protein  31.63 
 
 		 257 aa  117  3e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.369321  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5305  hypothetical protein  29.51 
 
 		 258 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.141224 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1777  secretion protein HlyD family protein  37.46 
 
 		 320 aa  112  6e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0865879  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0659  secretion protein HlyD  32.52 
 
 		 335 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0195539 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0971  secretion protein HlyD family protein  37.5 
 
 		 333 aa  108  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.70003 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2823  HlyD family secretion protein  36.4 
 
 		 329 aa  107  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3037  secretion protein HlyD  32.96 
 
 		 344 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.714598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3278  secretion protein HlyD family protein  37.28 
 
 		 333 aa  105  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3107  secretion protein HlyD family protein  40.56 
 
 		 355 aa  103  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.128244  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8104  secretion protein HlyD family protein  32.87 
 
 		 354 aa  100  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2942  hypothetical protein  31.79 
 
 		 342 aa  99  9e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.495568  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2339  secretion protein HylD  33.67 
 
 		 357 aa  98.6  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.581598  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2420  hypothetical protein  32.56 
 
 		 334 aa  96.3  6e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0441115  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2446  secretion protein HlyD  28.29 
 
 		 331 aa  95.9  7e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0391443  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1147  secretion protein HlyD family protein  33.45 
 
 		 328 aa  95.5  9e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000143256  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2812  hypothetical protein  29.51 
 
 		 328 aa  95.1  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.659594  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2900  hypothetical protein  29.51 
 
 		 328 aa  95.1  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.441654  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1286  hypothetical protein  32 
 
 		 331 aa  94.4  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1480  secretion protein HlyD family protein  26.44 
 
 		 349 aa  92.4  8e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.785095  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1586  secretion protein HlyD family protein  27.93 
 
 		 328 aa  92.4  9e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.125031  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1263  hypothetical protein  29.17 
 
 		 315 aa  91.3  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00237907  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0916  secretion protein HlyD family protein  35.14 
 
 		 335 aa  91.3  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1382  secretion protein HlyD family protein  32.06 
 
 		 340 aa  91.3  2e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.396008  hitchhiker  0.000481704 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1422  secretion protein HlyD  31.42 
 
 		 359 aa  89.7  6e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0497268  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3464  secretion protein HlyD  28.03 
 
 		 335 aa  89.4  8e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0351  secretion protein HlyD  27.37 
 
 		 326 aa  89  8e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0129  hypothetical protein  33.22 
 
 		 344 aa  88.2  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.993938  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1329  hypothetical protein  29.6 
 
 		 328 aa  87.8  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3420  secretion protein HlyD family protein  29.96 
 
 		 357 aa  87.8  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1521  hypothetical protein  30.32 
 
 		 342 aa  87.4  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0176899  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2847  secretion protein HlyD family protein  30.62 
 
 		 331 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1133  secretion protein HlyD  28.06 
 
 		 371 aa  84.3  0.000000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1035  secretion protein HlyD  39.71 
 
 		 324 aa  84.7  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.833081  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2370  secretion protein HlyD  28.97 
 
 		 344 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.972198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4361  secretion protein HlyD family protein  28.84 
 
 		 313 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00610  Type I secretion protein, HlyD family  32.97 
 
 		 339 aa  84.7  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.211465  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00762  hypothetical protein  30.62 
 
 		 332 aa  84  0.000000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0818  hypothetical protein  30.62 
 
 		 331 aa  84.3  0.000000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2848  hypothetical protein  30.62 
 
 		 331 aa  84.3  0.000000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0314529 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00779  hypothetical protein  30.62 
 
 		 332 aa  84  0.000000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0860  hypothetical protein  30.62 
 
 		 331 aa  84  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0943  hypothetical protein  30.62 
 
 		 331 aa  84.3  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0849  hypothetical protein  30.62 
 
 		 331 aa  84.3  0.000000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0913  hypothetical protein  30.23 
 
 		 331 aa  83.6  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.16155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0853  hypothetical protein  30.23 
 
 		 331 aa  83.6  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0945  hypothetical protein  30.23 
 
 		 331 aa  82.8  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0881  hypothetical protein  30.23 
 
 		 331 aa  82.8  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.775184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0966  hypothetical protein  30.23 
 
 		 331 aa  82.8  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2557  hypothetical protein  30.23 
 
 		 331 aa  82.8  0.000000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3705  hypothetical protein  34.24 
 
 		 343 aa  82.4  0.000000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1152  secretion protein HlyD family protein  32.97 
 
 		 355 aa  82.4  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.162032  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2390  secretion protein HlyD family protein  29.59 
 
 		 348 aa  82  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.313977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0875  secretion protein HlyD family protein  26.48 
 
 		 315 aa  82  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.316135 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2861  secretion protein, HlyD family  32.98 
 
 		 345 aa  81.3  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2482  secretion protein HlyD family protein  32.98 
 
 		 345 aa  81.3  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1189  secretion protein HlyD  31.8 
 
 		 323 aa  81.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.315896  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0259  secretion protein HlyD  24.18 
 
 		 327 aa  80.9  0.00000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.689376  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06357  hypothetical protein  28.46 
 
 		 316 aa  80.5  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2843  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.75 
 
 		 496 aa  80.9  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0169  secretion protein HlyD  29.12 
 
 		 356 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2777  secretion protein HlyD family protein  31.8 
 
 		 323 aa  80.5  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.991626  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3589  HlyD family secretion protein  31.25 
 
 		 320 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1305  hypothetical protein  36.58 
 
 		 346 aa  80.1  0.00000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.126611  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1741  secretion protein HlyD family protein  32.98 
 
 		 336 aa  79.7  0.00000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1263  efflux transporter  30.84 
 
 		 415 aa  79.3  0.00000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.471028  normal  0.778162 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4061  secretion protein HlyD family protein  28.25 
 
 		 354 aa  79  0.00000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3000  hypothetical protein  31.62 
 
 		 337 aa  79  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1250  hypothetical protein  27.59 
 
 		 322 aa  78.6  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.249085  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2104  secretion protein HlyD family protein  33.99 
 
 		 541 aa  78.6  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2682  secretion protein HlyD family protein  31.38 
 
 		 323 aa  79  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430212  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2839  secretion protein HlyD family protein  36.09 
 
 		 377 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>