More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1719 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_1719  secretion protein HlyD  100 
 
 
315 aa  640    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0706497  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0052  secretion protein HlyD family protein  54.33 
 
 
324 aa  304  1.0000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0055  secretion protein HlyD family protein  54.33 
 
 
324 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.873688  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0163  lipoprotein  54.49 
 
 
311 aa  292  6e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0904469  normal  0.961053 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4329  secretion protein HlyD family protein  52.41 
 
 
327 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1744  HlyD family secretion protein  53.31 
 
 
321 aa  285  5e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0223446  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0409  secretion protein HlyD  54.36 
 
 
332 aa  281  1e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0350  secretion protein HlyD  51.52 
 
 
320 aa  269  4e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3691  secretion protein HlyD family protein  54.18 
 
 
320 aa  268  8e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.951717  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4164  secretion protein HlyD family protein  54.18 
 
 
320 aa  266  4e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.571077  normal  0.349969 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1084  HlyD family secretion protein  43.23 
 
 
356 aa  223  2e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.335201 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0700  putative lipoprotein  41.82 
 
 
359 aa  221  9e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2054  periplasmic component of efflux system  37.58 
 
 
332 aa  214  9.999999999999999e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0146  auxiliary membrane fusion protein family transporter  37.58 
 
 
326 aa  215  9.999999999999999e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000237701  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3452  HlyD family secretion protein  43.43 
 
 
326 aa  214  1.9999999999999998e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.349475  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3131  secretion protein HlyD  44.98 
 
 
344 aa  199  6e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0978227  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2707  secretion protein HlyD family protein  40.75 
 
 
328 aa  173  3.9999999999999995e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0650452  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0456  secretion protein HlyD family protein  37.01 
 
 
324 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.119386  normal  0.109818 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1342  HlyD family secretion protein  31.79 
 
 
317 aa  160  2e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2925  secretion protein HlyD family protein  33.76 
 
 
314 aa  159  6e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4312  hypothetical protein  34.78 
 
 
267 aa  158  9e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0402  HlyD family secretion protein  34.89 
 
 
314 aa  158  1e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0463  HlyD family secretion protein  34.58 
 
 
314 aa  155  6e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1792  putative efflux protein  31.23 
 
 
266 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.0000336857  normal  0.255323 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3668  putative efflux protein  31.99 
 
 
263 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.285174  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0717  hypothetical protein  31.1 
 
 
257 aa  142  7e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.369321  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5305  hypothetical protein  31.09 
 
 
258 aa  136  4e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.141224 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5057  secretion protein HlyD family protein  35.92 
 
 
313 aa  131  2.0000000000000002e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0506  secretion protein HlyD family protein  32.5 
 
 
317 aa  129  5.0000000000000004e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4665  secretion protein HlyD family protein  36.93 
 
 
328 aa  129  6e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.267783  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2440  secretion protein HlyD family protein  44.96 
 
 
265 aa  125  1e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.41732 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0659  secretion protein HlyD  30.63 
 
 
335 aa  110  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0195539 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1035  secretion protein HlyD  37.76 
 
 
324 aa  107  4e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.833081  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2823  HlyD family secretion protein  31.74 
 
 
329 aa  105  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2904  secretion protein HlyD family protein  29.97 
 
 
329 aa  102  6e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.839486  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2900  hypothetical protein  31.88 
 
 
328 aa  100  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.441654  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2812  hypothetical protein  31.88 
 
 
328 aa  100  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.659594  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1480  secretion protein HlyD family protein  28 
 
 
349 aa  97.8  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.785095  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4203  hypothetical protein  26.2 
 
 
316 aa  97.4  3e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.99855  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0916  secretion protein HlyD family protein  30.65 
 
 
335 aa  97.1  4e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2861  secretion protein, HlyD family  31.03 
 
 
345 aa  92.8  7e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2482  secretion protein HlyD family protein  31.03 
 
 
345 aa  92.8  7e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8104  secretion protein HlyD family protein  31.44 
 
 
354 aa  92.4  9e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0875  secretion protein HlyD family protein  27.48 
 
 
315 aa  91.3  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.316135 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3464  secretion protein HlyD  28.66 
 
 
335 aa  89.7  5e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2446  secretion protein HlyD  24.57 
 
 
331 aa  89.4  7e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0391443  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1420  secretion protein HlyD family protein  28.52 
 
 
332 aa  89  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1329  hypothetical protein  29.07 
 
 
328 aa  88.2  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1147  secretion protein HlyD family protein  28.91 
 
 
328 aa  87.8  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000143256  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2339  secretion protein HylD  29.37 
 
 
357 aa  87.4  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.581598  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1286  hypothetical protein  27.3 
 
 
331 aa  87  4e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2179  secretion protein HlyD family protein  29.86 
 
 
467 aa  85.9  9e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1549  secretion protein HlyD family protein  28.48 
 
 
372 aa  85.5  9e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0737  hypothetical protein  35.59 
 
 
190 aa  85.1  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4061  secretion protein HlyD family protein  26.09 
 
 
354 aa  85.1  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3278  secretion protein HlyD family protein  31.67 
 
 
333 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0971  secretion protein HlyD family protein  31.11 
 
 
333 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.70003 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2942  hypothetical protein  27.4 
 
 
342 aa  84.3  0.000000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.495568  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1705  HlyD family secretion protein  26.54 
 
 
308 aa  83.2  0.000000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0587  hypothetical protein  28.22 
 
 
314 aa  83.2  0.000000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0654708  hitchhiker  0.0000117707 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0913  hypothetical protein  28.82 
 
 
331 aa  82.4  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.16155  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0853  hypothetical protein  28.82 
 
 
331 aa  82.4  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1305  hypothetical protein  29.76 
 
 
346 aa  82.4  0.000000000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.126611  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3107  secretion protein HlyD family protein  31.19 
 
 
355 aa  82  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.128244  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1513  secretion protein HlyD family protein  27.74 
 
 
384 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2833  secretion protein HlyD family protein  27.74 
 
 
383 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.121026  normal  0.828234 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0966  hypothetical protein  28.47 
 
 
331 aa  80.1  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0881  hypothetical protein  28.47 
 
 
331 aa  80.1  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.775184  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0945  hypothetical protein  28.47 
 
 
331 aa  80.1  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2847  secretion protein HlyD family protein  28.96 
 
 
331 aa  79.7  0.00000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0860  hypothetical protein  28.96 
 
 
331 aa  80.1  0.00000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00762  hypothetical protein  28.96 
 
 
332 aa  79.7  0.00000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0943  hypothetical protein  28.96 
 
 
331 aa  79.7  0.00000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1250  hypothetical protein  23.75 
 
 
322 aa  79.7  0.00000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.249085  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0849  hypothetical protein  28.96 
 
 
331 aa  79.7  0.00000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0818  hypothetical protein  28.96 
 
 
331 aa  79.7  0.00000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1020  hypothetical protein  30.31 
 
 
345 aa  79.7  0.00000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2848  hypothetical protein  28.96 
 
 
331 aa  79.7  0.00000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0314529 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00779  hypothetical protein  28.96 
 
 
332 aa  79.7  0.00000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2810  secretion protein HlyD family protein  24.43 
 
 
368 aa  79.3  0.00000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.653473 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0351  secretion protein HlyD  25.16 
 
 
326 aa  79.3  0.00000000000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2557  hypothetical protein  28.62 
 
 
331 aa  78.6  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1522  secretion protein HlyD family protein  27.61 
 
 
378 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0259  secretion protein HlyD  23.81 
 
 
327 aa  79  0.0000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.689376  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3000  hypothetical protein  30.65 
 
 
337 aa  78.2  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2370  secretion protein HlyD  30.69 
 
 
344 aa  77  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.972198  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3420  secretion protein HlyD family protein  26.07 
 
 
357 aa  76.6  0.0000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0718  hypothetical protein  43.02 
 
 
99 aa  76.3  0.0000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1586  secretion protein HlyD family protein  23.26 
 
 
328 aa  75.5  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.125031  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1382  secretion protein HlyD family protein  27.91 
 
 
340 aa  75.5  0.000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.396008  hitchhiker  0.000481704 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2420  hypothetical protein  27.84 
 
 
334 aa  75.5  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0441115  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3445  secretion protein HlyD family protein  23.92 
 
 
359 aa  74.7  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.858033 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1082  putative ABC transport system, lipoprotein  24.42 
 
 
302 aa  74.7  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0628  secretion protein HlyD family protein  28.22 
 
 
352 aa  74.7  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69090  hypothetical protein  26.09 
 
 
357 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3250  hypothetical protein  30.67 
 
 
337 aa  74.3  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1777  secretion protein HlyD family protein  26.79 
 
 
320 aa  73.9  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0865879  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0169  secretion protein HlyD  25.9 
 
 
356 aa  73.9  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00129  probable membrane fusion protein (HlyD family of secretion proteins) linked to ABC efflux pumps  27.15 
 
 
350 aa  74.3  0.000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000116655  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3705  hypothetical protein  28.72 
 
 
343 aa  73.9  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>