More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3691 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_3691  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 		 320 aa  632  1e-180  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.951717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4164  secretion protein HlyD family protein  97.5 
 
 		 320 aa  479  1e-134  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.571077  normal  0.349969 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1744  HlyD family secretion protein  90.03 
 
 		 321 aa  473  1e-132  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0223446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4329  secretion protein HlyD family protein  69.87 
 
 		 327 aa  378  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0052  secretion protein HlyD family protein  61.87 
 
 		 324 aa  329  4e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0055  secretion protein HlyD family protein  61.87 
 
 		 324 aa  329  5.0000000000000004e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.873688  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0350  secretion protein HlyD  61.07 
 
 		 320 aa  319  5e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0163  lipoprotein  61.87 
 
 		 311 aa  317  1e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0904469  normal  0.961053 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0409  secretion protein HlyD  61.2 
 
 		 332 aa  313  1.9999999999999998e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1719  secretion protein HlyD  52.72 
 
 		 315 aa  304  1.0000000000000001e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0706497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1084  HlyD family secretion protein  47.63 
 
 		 356 aa  252  6e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.335201 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3452  HlyD family secretion protein  46.39 
 
 		 326 aa  246  3e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.349475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0700  putative lipoprotein  43.37 
 
 		 359 aa  229  6e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0146  auxiliary membrane fusion protein family transporter  37.81 
 
 		 326 aa  222  6e-57  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000237701  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2054  periplasmic component of efflux system  37.5 
 
 		 332 aa  221  9.999999999999999e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3131  secretion protein HlyD  42.67 
 
 		 344 aa  194  2e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0978227  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2925  secretion protein HlyD family protein  40.56 
 
 		 314 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1342  HlyD family secretion protein  35.46 
 
 		 317 aa  179  8e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0402  HlyD family secretion protein  40.33 
 
 		 314 aa  178  1e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0456  secretion protein HlyD family protein  40.68 
 
 		 324 aa  177  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.119386  normal  0.109818 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0463  HlyD family secretion protein  40 
 
 		 314 aa  176  3e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2707  secretion protein HlyD family protein  41.18 
 
 		 328 aa  173  2.9999999999999996e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0650452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4665  secretion protein HlyD family protein  44.95 
 
 		 328 aa  169  7e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.267783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0506  secretion protein HlyD family protein  34.75 
 
 		 317 aa  157  2e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5305  hypothetical protein  33.22 
 
 		 258 aa  150  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.141224 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1792  putative efflux protein  31.95 
 
 		 266 aa  149  5e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.0000336857  normal  0.255323 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5057  secretion protein HlyD family protein  42.11 
 
 		 313 aa  149  5e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3668  putative efflux protein  32 
 
 		 263 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.285174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0717  hypothetical protein  32.23 
 
 		 257 aa  145  9e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.369321  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4312  hypothetical protein  31.77 
 
 		 267 aa  144  3e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2440  secretion protein HlyD family protein  45.04 
 
 		 265 aa  127  3e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.41732 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1035  secretion protein HlyD  40.8 
 
 		 324 aa  121  9.999999999999999e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.833081  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2904  secretion protein HlyD family protein  28.34 
 
 		 329 aa  110  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.839486  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1329  hypothetical protein  28.72 
 
 		 328 aa  104  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8104  secretion protein HlyD family protein  29.77 
 
 		 354 aa  103  5e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2823  HlyD family secretion protein  29.01 
 
 		 329 aa  100  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2810  secretion protein HlyD family protein  29.17 
 
 		 368 aa  98.6  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.653473 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0971  secretion protein HlyD family protein  31.51 
 
 		 333 aa  98.2  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.70003 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1480  secretion protein HlyD family protein  25.27 
 
 		 349 aa  97.4  3e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.785095  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3464  secretion protein HlyD  30.39 
 
 		 335 aa  97.4  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2900  hypothetical protein  28.38 
 
 		 328 aa  97.1  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.441654  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1263  hypothetical protein  29.17 
 
 		 315 aa  97.1  4e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00237907  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2812  hypothetical protein  28.38 
 
 		 328 aa  97.1  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.659594  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69090  hypothetical protein  30.22 
 
 		 357 aa  96.3  7e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3278  secretion protein HlyD family protein  31.69 
 
 		 333 aa  95.1  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0875  secretion protein HlyD family protein  26.17 
 
 		 315 aa  95.1  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.316135 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2339  secretion protein HylD  29.55 
 
 		 357 aa  94.4  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.581598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5975  hypothetical protein  29.6 
 
 		 382 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1586  secretion protein HlyD family protein  25.16 
 
 		 328 aa  91.7  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.125031  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2942  hypothetical protein  28.42 
 
 		 342 aa  90.5  3e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.495568  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1705  HlyD family secretion protein  28.94 
 
 		 308 aa  89.4  7e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2446  secretion protein HlyD  22.07 
 
 		 331 aa  89.4  7e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0391443  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2179  secretion protein HlyD family protein  30.55 
 
 		 467 aa  89  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1521  hypothetical protein  29.01 
 
 		 342 aa  87.8  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0176899  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0760  secretion protein HlyD family protein  29.55 
 
 		 363 aa  87.8  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.92181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3037  secretion protein HlyD  28.77 
 
 		 344 aa  88.2  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.714598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1493  secretion protein HlyD family protein  28.66 
 
 		 332 aa  88.2  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.172966  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2687  HlyD family secretion protein  29.84 
 
 		 357 aa  87.4  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0966  hypothetical protein  28.38 
 
 		 331 aa  87  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0881  hypothetical protein  28.38 
 
 		 331 aa  87  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.775184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0945  hypothetical protein  28.38 
 
 		 331 aa  87  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2370  secretion protein HlyD  26.42 
 
 		 344 aa  87.4  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.972198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1794  secretion protein HlyD family protein  31.07 
 
 		 350 aa  87  4e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2511  hypothetical protein  30.72 
 
 		 334 aa  87  4e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.607384  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1503  secretion protein HlyD family protein  28.06 
 
 		 357 aa  86.7  5e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.996003  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2420  hypothetical protein  28.43 
 
 		 334 aa  86.3  6e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0441115  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1286  hypothetical protein  26.69 
 
 		 331 aa  86.3  7e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0659  secretion protein HlyD  26.05 
 
 		 335 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0195539 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0913  hypothetical protein  28.04 
 
 		 331 aa  85.9  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.16155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0853  hypothetical protein  28.04 
 
 		 331 aa  85.9  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1420  secretion protein HlyD family protein  29.1 
 
 		 332 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2833  secretion protein HlyD family protein  28.03 
 
 		 383 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.121026  normal  0.828234 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0916  secretion protein HlyD family protein  26.14 
 
 		 335 aa  83.6  0.000000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3578  secretion protein HlyD  28.32 
 
 		 358 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.551051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1549  secretion protein HlyD family protein  28.36 
 
 		 372 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1513  secretion protein HlyD family protein  28.03 
 
 		 384 aa  83.6  0.000000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1115  secretion protein HlyD family protein  31.46 
 
 		 347 aa  82.4  0.000000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.719605  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1522  secretion protein HlyD family protein  27.68 
 
 		 378 aa  82.8  0.000000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6207  secretion protein HlyD family protein  30.8 
 
 		 357 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.19774 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4203  hypothetical protein  24.3 
 
 		 316 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.99855  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4061  secretion protein HlyD family protein  24.57 
 
 		 354 aa  82.4  0.00000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3420  secretion protein HlyD family protein  26.96 
 
 		 357 aa  82  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00610  Type I secretion protein, HlyD family  27.33 
 
 		 339 aa  82.4  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.211465  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1777  secretion protein HlyD family protein  27.46 
 
 		 320 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0865879  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1147  secretion protein HlyD family protein  27 
 
 		 328 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000143256  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0169  secretion protein HlyD  27.39 
 
 		 356 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2750  secretion protein HlyD family protein  27.72 
 
 		 337 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0317  secretion protein HlyD family protein  28.52 
 
 		 354 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1422  secretion protein HlyD  27.8 
 
 		 359 aa  80.9  0.00000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0497268  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5882  secretion protein HlyD family protein  29.09 
 
 		 357 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3250  hypothetical protein  28.08 
 
 		 337 aa  80.5  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3000  hypothetical protein  28.08 
 
 		 337 aa  79.7  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0807  secretion protein HlyD family protein  28.39 
 
 		 310 aa  79.7  0.00000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1685  secretion protein HlyD  29.32 
 
 		 355 aa  79.3  0.00000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00216281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2115  secretion protein HlyD family protein  25.75 
 
 		 334 aa  79.3  0.00000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.441068  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3589  HlyD family secretion protein  30.36 
 
 		 320 aa  79.3  0.00000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3445  secretion protein HlyD family protein  27.95 
 
 		 359 aa  78.2  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.858033 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2575  secretion protein HlyD family protein  27.37 
 
 		 337 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0506  secretion protein HlyD family protein  26.43 
 
 		 324 aa  77  0.0000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0259  secretion protein HlyD  20.61 
 
 		 327 aa  77  0.0000000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.689376  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>