More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5305 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5305  hypothetical protein  100 
 
 		 258 aa  529  1e-149  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.141224 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1792  putative efflux protein  74.6 
 
 		 266 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.0000336857  normal  0.255323 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0717  hypothetical protein  78.6 
 
 		 257 aa  391  1e-108  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.369321  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3668  putative efflux protein  73.31 
 
 		 263 aa  385  1e-106  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.285174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4312  hypothetical protein  76.72 
 
 		 267 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0456  secretion protein HlyD family protein  37.62 
 
 		 324 aa  187  2e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.119386  normal  0.109818 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1084  HlyD family secretion protein  31.31 
 
 		 356 aa  138  7.999999999999999e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.335201 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4329  secretion protein HlyD family protein  29.32 
 
 		 327 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2440  secretion protein HlyD family protein  33.72 
 
 		 265 aa  135  8e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.41732 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0052  secretion protein HlyD family protein  32.66 
 
 		 324 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3131  secretion protein HlyD  34.62 
 
 		 344 aa  133  3e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0978227  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0055  secretion protein HlyD family protein  32.32 
 
 		 324 aa  132  7.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.873688  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0163  lipoprotein  30.77 
 
 		 311 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0904469  normal  0.961053 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2925  secretion protein HlyD family protein  30.67 
 
 		 314 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4665  secretion protein HlyD family protein  31.82 
 
 		 328 aa  127  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.267783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0402  HlyD family secretion protein  29.07 
 
 		 314 aa  126  4.0000000000000003e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0463  HlyD family secretion protein  29.97 
 
 		 314 aa  125  6e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1744  HlyD family secretion protein  45.74 
 
 		 321 aa  124  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0223446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0146  auxiliary membrane fusion protein family transporter  28.66 
 
 		 326 aa  120  1.9999999999999998e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000237701  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2054  periplasmic component of efflux system  28.66 
 
 		 332 aa  120  1.9999999999999998e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3691  secretion protein HlyD family protein  43.9 
 
 		 320 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.951717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3452  HlyD family secretion protein  45.61 
 
 		 326 aa  116  3e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.349475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4164  secretion protein HlyD family protein  43.09 
 
 		 320 aa  115  6e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.571077  normal  0.349969 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1342  HlyD family secretion protein  25.65 
 
 		 317 aa  115  6.9999999999999995e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0409  secretion protein HlyD  46.4 
 
 		 332 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1719  secretion protein HlyD  41.27 
 
 		 315 aa  114  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0706497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2707  secretion protein HlyD family protein  47.2 
 
 		 328 aa  111  1.0000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0650452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0350  secretion protein HlyD  42.28 
 
 		 320 aa  110  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0700  putative lipoprotein  28.1 
 
 		 359 aa  108  9.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1035  secretion protein HlyD  42.19 
 
 		 324 aa  100  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.833081  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5057  secretion protein HlyD family protein  40.94 
 
 		 313 aa  95.1  9e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0506  secretion protein HlyD family protein  27.86 
 
 		 317 aa  95.1  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0807  secretion protein HlyD family protein  25.17 
 
 		 310 aa  90.1  3e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1291  secretion protein HlyD family protein  28.77 
 
 		 285 aa  84.3  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0717284  normal  0.800787 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0809  secretion protein HlyD family protein  29.14 
 
 		 351 aa  82.8  0.000000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0713  hypothetical protein  30.45 
 
 		 281 aa  79.3  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2370  secretion protein HlyD  28.23 
 
 		 344 aa  79.3  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.972198  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0737  hypothetical protein  31.62 
 
 		 190 aa  79  0.00000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0695  hypothetical protein  30.45 
 
 		 281 aa  78.6  0.00000000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1110  putative ABC transport system, lipoprotein  24.82 
 
 		 304 aa  78.6  0.00000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.318737 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0178  secretion protein HlyD family protein  32.8 
 
 		 291 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.590801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1082  putative ABC transport system, lipoprotein  25.26 
 
 		 302 aa  78.2  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5049  secretion protein HlyD family protein  32.8 
 
 		 291 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.383553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0203  secretion protein HlyD family protein  32.8 
 
 		 291 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0199  secretion protein HlyD family protein  32.8 
 
 		 291 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.232672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2339  secretion protein HylD  27.44 
 
 		 357 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.581598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4492  secretion protein HlyD  32.03 
 
 		 382 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0226833 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004022  membrane-fusion protein  33.12 
 
 		 369 aa  76.6  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000160707  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3791  secretion protein HlyD family protein  28.69 
 
 		 348 aa  75.5  0.0000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.884849 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3620  HlyD family secretion protein  30.2 
 
 		 294 aa  75.5  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.315743  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0614  membrane fusion protein  31.76 
 
 		 404 aa  75.1  0.0000000000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1815  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.5 
 
 		 388 aa  74.7  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.100454  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1921  RND family efflux transporter MFP subunit  28.85 
 
 		 340 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00271277  normal  0.413551 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0119  secretion protein HlyD family protein  28.35 
 
 		 287 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.940377  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1856  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.73 
 
 		 316 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0971  secretion protein HlyD family protein  34.29 
 
 		 333 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.70003 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4233  secretion protein HlyD family protein  27.84 
 
 		 287 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4281  secretion protein HlyD family protein  27.84 
 
 		 287 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3278  secretion protein HlyD family protein  34.29 
 
 		 333 aa  73.6  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5441  secretion protein HlyD  27.2 
 
 		 321 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0649906 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7724  HlyD family secretion protein  33.15 
 
 		 324 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0372  RND family efflux transporter MFP subunit  26.78 
 
 		 372 aa  72.8  0.000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2904  secretion protein HlyD family protein  33.57 
 
 		 329 aa  72.8  0.000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.839486  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2951  secretion protein HlyD family protein  26.49 
 
 		 365 aa  72.4  0.000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6013  RND family efflux transporter MFP subunit  33.15 
 
 		 331 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0466  RND family efflux transporter MFP subunit  27.44 
 
 		 372 aa  72  0.000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.808341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4421  secretion protein HlyD family protein  27.84 
 
 		 287 aa  72  0.000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4866  RND family efflux transporter MFP subunit  29.81 
 
 		 317 aa  72  0.000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.329255 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9216  HlyD family secretion protein  26.12 
 
 		 356 aa  72  0.000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3707  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.89 
 
 		 354 aa  71.6  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1152  secretion protein HlyD family protein  30.16 
 
 		 289 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.633173  normal  0.115972 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4327  HlyD family secretion protein  26.67 
 
 		 372 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0718  hypothetical protein  38.04 
 
 		 99 aa  71.2  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3380  secretion protein HlyD  28.5 
 
 		 294 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00820812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0760  secretion protein HlyD family protein  25.63 
 
 		 363 aa  71.2  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.92181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1186  secretion protein HlyD family protein  30.16 
 
 		 289 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.502575  normal  0.193359 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0892  RND efflux membrane fusion protein precursor  29.88 
 
 		 370 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4265  secretion protein HlyD family protein  29.63 
 
 		 288 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.371072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5505  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.5 
 
 		 375 aa  70.9  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.37122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0706  secretion protein HlyD  29.11 
 
 		 366 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000331728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1999  RND family efflux transporter MFP subunit  30.49 
 
 		 390 aa  70.9  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00132105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3430  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.11 
 
 		 376 aa  71.2  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.516107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8104  secretion protein HlyD family protein  27.18 
 
 		 354 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01444  hypothetical protein  30.38 
 
 		 350 aa  70.1  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1744  secretion protein HlyD family protein  25.51 
 
 		 350 aa  70.5  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00348418 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6659  RND family efflux transporter MFP subunit  32.04 
 
 		 324 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1169  secretion protein HlyD family protein  29.82 
 
 		 288 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.595909  decreased coverage  0.00058772 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5460  RND family efflux transporter MFP subunit  32.6 
 
 		 337 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.421002  normal  0.0498153 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1267  RND family efflux transporter MFP subunit  27.01 
 
 		 355 aa  70.5  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6179  RND family efflux transporter MFP subunit  32.04 
 
 		 324 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.641102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001980  probable RND efflux membrane fusion protein  27.11 
 
 		 367 aa  70.1  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.979341  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0290  putative transporter  27.23 
 
 		 383 aa  69.7  0.00000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.507974  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0276  transporter, putative  27.23 
 
 		 383 aa  69.7  0.00000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1949  secretion protein HlyD family protein  31.71 
 
 		 356 aa  68.9  0.00000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.262528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5769  RND family efflux transporter MFP subunit  32.04 
 
 		 322 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.322532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1586  secretion protein HlyD family protein  30.3 
 
 		 328 aa  68.9  0.00000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.125031  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2916  secretion protein HlyD family protein  25.41 
 
 		 310 aa  68.9  0.00000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.500367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3037  secretion protein HlyD  30.95 
 
 		 344 aa  68.9  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.714598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1194  acriflavin resistance periplasmic protein  29.03 
 
 		 380 aa  68.6  0.00000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7850  HlyD family secretion protein  26.49 
 
 		 334 aa  68.6  0.00000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0800045  normal  0.246605 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>