More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3131 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3131  secretion protein HlyD  100 
 
 		 344 aa  663    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0978227  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0456  secretion protein HlyD family protein  49.04 
 
 		 324 aa  215  9e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.119386  normal  0.109818 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1084  HlyD family secretion protein  45.25 
 
 		 356 aa  209  4e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.335201 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3452  HlyD family secretion protein  40.14 
 
 		 326 aa  201  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.349475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1719  secretion protein HlyD  44.98 
 
 		 315 aa  196  4.0000000000000005e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0706497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0146  auxiliary membrane fusion protein family transporter  38.21 
 
 		 326 aa  192  7e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000237701  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2054  periplasmic component of efflux system  37.54 
 
 		 332 aa  191  2e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0700  putative lipoprotein  41.88 
 
 		 359 aa  189  8e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1342  HlyD family secretion protein  39.07 
 
 		 317 aa  184  3e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0409  secretion protein HlyD  45.99 
 
 		 332 aa  181  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2925  secretion protein HlyD family protein  38.41 
 
 		 314 aa  180  4e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0350  secretion protein HlyD  45.42 
 
 		 320 aa  180  4e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0052  secretion protein HlyD family protein  43.85 
 
 		 324 aa  177  3e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1744  HlyD family secretion protein  41.22 
 
 		 321 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0223446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0055  secretion protein HlyD family protein  43.52 
 
 		 324 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.873688  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0163  lipoprotein  44.19 
 
 		 311 aa  172  6.999999999999999e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0904469  normal  0.961053 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4329  secretion protein HlyD family protein  42.57 
 
 		 327 aa  171  1e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0463  HlyD family secretion protein  36.52 
 
 		 314 aa  164  2.0000000000000002e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0402  HlyD family secretion protein  36.86 
 
 		 314 aa  164  3e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4665  secretion protein HlyD family protein  41.61 
 
 		 328 aa  161  2e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.267783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3691  secretion protein HlyD family protein  43.1 
 
 		 320 aa  159  9e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.951717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4164  secretion protein HlyD family protein  42.76 
 
 		 320 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.571077  normal  0.349969 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4312  hypothetical protein  36.09 
 
 		 267 aa  157  4e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0717  hypothetical protein  34.47 
 
 		 257 aa  149  8e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.369321  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2707  secretion protein HlyD family protein  40.67 
 
 		 328 aa  146  5e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0650452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3668  putative efflux protein  34.25 
 
 		 263 aa  146  6e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.285174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5305  hypothetical protein  34.62 
 
 		 258 aa  142  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.141224 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1792  putative efflux protein  32.46 
 
 		 266 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.0000336857  normal  0.255323 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5057  secretion protein HlyD family protein  38.74 
 
 		 313 aa  128  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3464  secretion protein HlyD  31.13 
 
 		 335 aa  125  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2440  secretion protein HlyD family protein  50 
 
 		 265 aa  125  1e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.41732 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2900  hypothetical protein  32.76 
 
 		 328 aa  124  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.441654  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2812  hypothetical protein  32.76 
 
 		 328 aa  124  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.659594  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0916  secretion protein HlyD family protein  34.54 
 
 		 335 aa  123  5e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1329  hypothetical protein  31.63 
 
 		 328 aa  118  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2942  hypothetical protein  33.22 
 
 		 342 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.495568  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0129  hypothetical protein  33.99 
 
 		 344 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.993938  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8104  secretion protein HlyD family protein  32.54 
 
 		 354 aa  112  9e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2370  secretion protein HlyD  32.65 
 
 		 344 aa  112  9e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.972198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0506  secretion protein HlyD family protein  34.98 
 
 		 317 aa  112  1.0000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2823  HlyD family secretion protein  33.91 
 
 		 329 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1794  secretion protein HlyD family protein  34.51 
 
 		 350 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1286  hypothetical protein  33.1 
 
 		 331 aa  110  3e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1586  secretion protein HlyD family protein  29.17 
 
 		 328 aa  109  6e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.125031  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2861  secretion protein, HlyD family  32.23 
 
 		 345 aa  109  8.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2482  secretion protein HlyD family protein  32.23 
 
 		 345 aa  109  8.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1778  secretion protein HlyD  32.38 
 
 		 339 aa  108  2e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.32933  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0659  secretion protein HlyD  30.38 
 
 		 335 aa  107  4e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0195539 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3037  secretion protein HlyD  32.11 
 
 		 344 aa  105  8e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.714598  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3250  hypothetical protein  33.11 
 
 		 337 aa  105  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3000  hypothetical protein  33.78 
 
 		 337 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4361  secretion protein HlyD family protein  29.27 
 
 		 313 aa  102  8e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2810  secretion protein HlyD family protein  27.06 
 
 		 368 aa  102  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.653473 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1035  secretion protein HlyD  38.28 
 
 		 324 aa  102  1e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.833081  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2446  secretion protein HlyD  26.57 
 
 		 331 aa  102  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0391443  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2390  secretion protein HlyD family protein  30.87 
 
 		 348 aa  102  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.313977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2777  secretion protein HlyD family protein  31.29 
 
 		 323 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.991626  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1189  secretion protein HlyD  31.29 
 
 		 323 aa  100  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.315896  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3589  HlyD family secretion protein  34.59 
 
 		 320 aa  100  5e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1250  hypothetical protein  28.08 
 
 		 322 aa  99.8  7e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.249085  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1493  secretion protein HlyD family protein  31.54 
 
 		 332 aa  99.4  8e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.172966  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0875  secretion protein HlyD family protein  28.22 
 
 		 315 aa  99  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.316135 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2179  secretion protein HlyD family protein  32.28 
 
 		 467 aa  98.6  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1521  hypothetical protein  32.53 
 
 		 342 aa  99  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0176899  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3705  hypothetical protein  32.5 
 
 		 343 aa  99  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2682  secretion protein HlyD family protein  30.95 
 
 		 323 aa  98.2  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430212  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0861  secretion protein HlyD  31.68 
 
 		 330 aa  98.2  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0209949  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3107  secretion protein HlyD family protein  32.4 
 
 		 355 aa  98.6  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.128244  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3537  hypothetical protein  27.92 
 
 		 323 aa  97.1  4e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2420  hypothetical protein  30.72 
 
 		 334 aa  96.3  8e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0441115  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1793  hypothetical protein  31.56 
 
 		 347 aa  95.9  8e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0463341  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2904  secretion protein HlyD family protein  29.11 
 
 		 329 aa  94.7  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.839486  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0317  secretion protein HlyD family protein  31.34 
 
 		 354 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0913  hypothetical protein  32.97 
 
 		 331 aa  93.6  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.16155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0853  hypothetical protein  32.97 
 
 		 331 aa  93.6  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0945  hypothetical protein  32.97 
 
 		 331 aa  93.2  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03337  predicted HlyD family secretion protein  30.69 
 
 		 355 aa  93.2  5e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0227  secretion protein HlyD family protein  30.69 
 
 		 355 aa  93.6  5e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3776  MFP family transporter  30.69 
 
 		 355 aa  93.2  5e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0966  hypothetical protein  32.97 
 
 		 331 aa  93.2  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0881  hypothetical protein  32.97 
 
 		 331 aa  93.2  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.775184  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03289  hypothetical protein  30.69 
 
 		 355 aa  93.2  5e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0228  secretion protein HlyD family protein  30.69 
 
 		 355 aa  93.2  5e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4832  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  30.69 
 
 		 355 aa  93.6  5e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1741  secretion protein HlyD family protein  31.33 
 
 		 336 aa  93.2  6e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1039  secretion protein HlyD  29.14 
 
 		 427 aa  92  1e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0971  secretion protein HlyD family protein  30.3 
 
 		 333 aa  92  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.70003 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3835  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  30.32 
 
 		 355 aa  91.7  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4698  hypothetical protein  31.56 
 
 		 334 aa  90.9  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.528303  normal  0.639413 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3686  MFP family transporter  30.32 
 
 		 355 aa  91.3  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3278  secretion protein HlyD family protein  29.97 
 
 		 333 aa  90.9  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3960  secretion protein HlyD family protein  31.38 
 
 		 355 aa  90.1  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1420  secretion protein HlyD family protein  29.08 
 
 		 332 aa  90.1  5e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0259  secretion protein HlyD  24.26 
 
 		 327 aa  89.4  8e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.689376  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1503  secretion protein HlyD family protein  29.43 
 
 		 357 aa  88.2  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.996003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1422  secretion protein HlyD  32.85 
 
 		 359 aa  88.2  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0497268  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3789  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  30.65 
 
 		 355 aa  87.8  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1705  HlyD family secretion protein  27.92 
 
 		 308 aa  87.8  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0587  hypothetical protein  26.59 
 
 		 314 aa  87  4e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0654708  hitchhiker  0.0000117707 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1549  secretion protein HlyD family protein  29.26 
 
 		 372 aa  87  4e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>