More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4665 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_4665  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 		 328 aa  627  1e-179  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.267783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3131  secretion protein HlyD  41.61 
 
 		 344 aa  186  5e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0978227  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1744  HlyD family secretion protein  42.51 
 
 		 321 aa  176  4e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0223446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3452  HlyD family secretion protein  38.36 
 
 		 326 aa  175  9e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.349475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2925  secretion protein HlyD family protein  40.35 
 
 		 314 aa  174  9.999999999999999e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1084  HlyD family secretion protein  40.68 
 
 		 356 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.335201 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0700  putative lipoprotein  37.17 
 
 		 359 aa  166  5.9999999999999996e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1035  secretion protein HlyD  45.39 
 
 		 324 aa  165  9e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.833081  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3691  secretion protein HlyD family protein  44.95 
 
 		 320 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.951717  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0463  HlyD family secretion protein  39.3 
 
 		 314 aa  164  2.0000000000000002e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0350  secretion protein HlyD  41.5 
 
 		 320 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0402  HlyD family secretion protein  39.65 
 
 		 314 aa  164  3e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0456  secretion protein HlyD family protein  39.06 
 
 		 324 aa  163  3e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.119386  normal  0.109818 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0055  secretion protein HlyD family protein  41.69 
 
 		 324 aa  163  5.0000000000000005e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.873688  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0052  secretion protein HlyD family protein  41.1 
 
 		 324 aa  161  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4164  secretion protein HlyD family protein  44.6 
 
 		 320 aa  162  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.571077  normal  0.349969 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0146  auxiliary membrane fusion protein family transporter  34.34 
 
 		 326 aa  159  8e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000237701  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0163  lipoprotein  42.16 
 
 		 311 aa  158  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0904469  normal  0.961053 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4329  secretion protein HlyD family protein  37.96 
 
 		 327 aa  157  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2054  periplasmic component of efflux system  33.67 
 
 		 332 aa  156  4e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0409  secretion protein HlyD  41.46 
 
 		 332 aa  154  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1719  secretion protein HlyD  35.13 
 
 		 315 aa  149  9e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0706497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1342  HlyD family secretion protein  31.06 
 
 		 317 aa  143  3e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5305  hypothetical protein  30.57 
 
 		 258 aa  139  6e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.141224 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1792  putative efflux protein  30.28 
 
 		 266 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.0000336857  normal  0.255323 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4312  hypothetical protein  29.58 
 
 		 267 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0717  hypothetical protein  28.87 
 
 		 257 aa  126  5e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.369321  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2707  secretion protein HlyD family protein  36.03 
 
 		 328 aa  126  6e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0650452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3668  putative efflux protein  29.72 
 
 		 263 aa  123  3e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.285174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2440  secretion protein HlyD family protein  36.01 
 
 		 265 aa  116  3.9999999999999997e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.41732 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3278  secretion protein HlyD family protein  32.42 
 
 		 333 aa  116  6e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0971  secretion protein HlyD family protein  31.72 
 
 		 333 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.70003 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2904  secretion protein HlyD family protein  28.79 
 
 		 329 aa  113  5e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.839486  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5057  secretion protein HlyD family protein  38.6 
 
 		 313 aa  112  9e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00610  Type I secretion protein, HlyD family  31.79 
 
 		 339 aa  112  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.211465  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0506  secretion protein HlyD family protein  37.5 
 
 		 317 aa  112  1.0000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1777  secretion protein HlyD family protein  32.07 
 
 		 320 aa  108  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0865879  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1586  secretion protein HlyD family protein  26.69 
 
 		 328 aa  105  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.125031  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2823  HlyD family secretion protein  28.82 
 
 		 329 aa  102  7e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0659  secretion protein HlyD  27.38 
 
 		 335 aa  101  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0195539 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2942  hypothetical protein  32.28 
 
 		 342 aa  101  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.495568  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2446  secretion protein HlyD  24.35 
 
 		 331 aa  100  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0391443  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2812  hypothetical protein  28.97 
 
 		 328 aa  100  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.659594  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2900  hypothetical protein  28.97 
 
 		 328 aa  100  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.441654  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8104  secretion protein HlyD family protein  30.45 
 
 		 354 aa  99.4  8e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1422  secretion protein HlyD  27.93 
 
 		 359 aa  97.4  3e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0497268  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3037  secretion protein HlyD  29.51 
 
 		 344 aa  96.7  5e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.714598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1263  hypothetical protein  29.72 
 
 		 315 aa  96.3  6e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00237907  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1778  secretion protein HlyD  27.73 
 
 		 339 aa  94.7  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.32933  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3464  secretion protein HlyD  28.28 
 
 		 335 aa  94.4  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0916  secretion protein HlyD family protein  29.07 
 
 		 335 aa  94  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1480  secretion protein HlyD family protein  22.88 
 
 		 349 aa  94  3e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.785095  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4679  secretion protein HlyD family protein  27.13 
 
 		 425 aa  93.2  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1286  hypothetical protein  30.12 
 
 		 331 aa  93.6  5e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4203  hypothetical protein  26.07 
 
 		 316 aa  93.2  6e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.99855  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2390  secretion protein HlyD family protein  28.7 
 
 		 348 aa  92.8  7e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.313977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3107  secretion protein HlyD family protein  32.07 
 
 		 355 aa  91.3  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.128244  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1329  hypothetical protein  28.52 
 
 		 328 aa  90.5  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2861  secretion protein, HlyD family  31.29 
 
 		 345 aa  90.9  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2482  secretion protein HlyD family protein  31.29 
 
 		 345 aa  90.9  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1705  HlyD family secretion protein  27.24 
 
 		 308 aa  90.5  4e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0259  secretion protein HlyD  24.47 
 
 		 327 aa  90.1  4e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.689376  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1741  secretion protein HlyD family protein  31 
 
 		 336 aa  88.6  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1521  hypothetical protein  32.18 
 
 		 342 aa  87.8  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0176899  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1493  secretion protein HlyD family protein  28.52 
 
 		 332 aa  87.4  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.172966  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4361  secretion protein HlyD family protein  26.67 
 
 		 313 aa  87.4  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2370  secretion protein HlyD  27.67 
 
 		 344 aa  87.8  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.972198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3000  hypothetical protein  30.87 
 
 		 337 aa  87.4  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3420  secretion protein HlyD family protein  28.71 
 
 		 357 aa  87.4  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1147  secretion protein HlyD family protein  27.18 
 
 		 328 aa  87.4  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000143256  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3250  hypothetical protein  30.39 
 
 		 337 aa  85.5  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0587  hypothetical protein  26.3 
 
 		 314 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0654708  hitchhiker  0.0000117707 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1840  hypothetical protein  26.52 
 
 		 332 aa  84.7  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.137202  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1263  efflux transporter  35.19 
 
 		 415 aa  85.1  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.471028  normal  0.778162 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003317  membrane-fusion protein  25.62 
 
 		 326 aa  84.3  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06357  hypothetical protein  26.64 
 
 		 316 aa  84.3  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0506  secretion protein HlyD family protein  28.17 
 
 		 324 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1382  secretion protein HlyD family protein  27.74 
 
 		 340 aa  83.6  0.000000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.396008  hitchhiker  0.000481704 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3705  hypothetical protein  29.6 
 
 		 343 aa  83.6  0.000000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2420  hypothetical protein  30.58 
 
 		 334 aa  82.8  0.000000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0441115  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20080  hypothetical protein  26.43 
 
 		 323 aa  82.8  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0527  secretion protein HlyD family protein  27.86 
 
 		 324 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0568004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0875  secretion protein HlyD family protein  25.95 
 
 		 315 aa  82  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.316135 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0861  secretion protein HlyD  29.13 
 
 		 330 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0209949  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0531  secretion protein HlyD family protein  27.86 
 
 		 324 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4089  HlyD family secretion protein  28.53 
 
 		 324 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0583  secretion protein HlyD family protein  27.8 
 
 		 324 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3589  HlyD family secretion protein  29.07 
 
 		 320 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0129  hypothetical protein  29.83 
 
 		 344 aa  80.9  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.993938  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0853  hypothetical protein  31.48 
 
 		 331 aa  80.1  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0913  hypothetical protein  31.48 
 
 		 331 aa  80.1  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.16155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0169  secretion protein HlyD  28.47 
 
 		 356 aa  80.1  0.00000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0427  hypothetical protein  27.81 
 
 		 317 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0945  hypothetical protein  31.48 
 
 		 331 aa  79.7  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0966  hypothetical protein  31.48 
 
 		 331 aa  79.7  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0881  hypothetical protein  31.48 
 
 		 331 aa  79.7  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.775184  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1250  hypothetical protein  26.19 
 
 		 322 aa  79.3  0.00000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.249085  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1728  hypothetical protein  26.79 
 
 		 323 aa  79  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0534587  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1420  secretion protein HlyD family protein  28.62 
 
 		 332 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3813  secretion protein HlyD family protein  27.55 
 
 		 324 aa  79  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.103325  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>