More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_20080 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_20080  hypothetical protein  100 
 
 		 323 aa  647    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1728  hypothetical protein  96.59 
 
 		 323 aa  629  1e-179  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0534587  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0499  secretion protein HlyD family protein  61.06 
 
 		 323 aa  394  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2703  secretion protein HlyD family protein  37.46 
 
 		 367 aa  200  3e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4808  secretion protein HlyD family protein  39.12 
 
 		 330 aa  191  2e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1026  secretion protein HlyD family protein  32.36 
 
 		 326 aa  186  5e-46  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1189  secretion protein HlyD  38.28 
 
 		 323 aa  179  4e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.315896  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0583  secretion protein HlyD family protein  35.65 
 
 		 324 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2777  secretion protein HlyD family protein  38.28 
 
 		 323 aa  179  7e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.991626  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0478  HlyD family secretion protein  36.39 
 
 		 322 aa  177  2e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.161841 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0506  secretion protein HlyD family protein  35.02 
 
 		 324 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2682  secretion protein HlyD family protein  38.28 
 
 		 323 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430212  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0531  secretion protein HlyD family protein  35.02 
 
 		 324 aa  177  3e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0527  secretion protein HlyD family protein  35.02 
 
 		 324 aa  177  3e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0568004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3639  secretion protein HlyD family protein  35.46 
 
 		 324 aa  177  3e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0488  secretion protein HlyD family protein  35.14 
 
 		 324 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3813  secretion protein HlyD family protein  35.02 
 
 		 324 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.103325  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3463  secretion protein HlyD family protein  35.14 
 
 		 324 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4089  HlyD family secretion protein  34.19 
 
 		 324 aa  168  1e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0412  secretion protein HlyD family protein  33.02 
 
 		 323 aa  166  4e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.604128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1173  secretion protein HlyD family protein  37.84 
 
 		 337 aa  164  2.0000000000000002e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.628109 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0567  secretion protein HlyD family protein  33.64 
 
 		 323 aa  163  3e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.142155 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003317  membrane-fusion protein  32.05 
 
 		 326 aa  163  3e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0653  secretion protein HlyD family protein  30.12 
 
 		 357 aa  162  6e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1212  hypothetical protein  33.12 
 
 		 324 aa  162  1e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000214097  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0604  secretion protein HlyD family protein  35.99 
 
 		 326 aa  160  3e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3745  secretion protein HlyD family protein  33.87 
 
 		 323 aa  159  7e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0477  hypothetical protein  32.08 
 
 		 332 aa  155  1e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4393  secretion protein HlyD family protein  32.43 
 
 		 323 aa  154  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0150137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4571  secretion protein HlyD family protein  35.79 
 
 		 349 aa  154  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.707913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1039  secretion protein HlyD  30.5 
 
 		 427 aa  153  4e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0396  secretion protein HlyD family protein  31.45 
 
 		 330 aa  153  5e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3729  secretion protein HlyD family protein  29.87 
 
 		 329 aa  150  2e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1840  hypothetical protein  30.7 
 
 		 332 aa  148  1.0000000000000001e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.137202  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0093  HlyD family secretion protein  31.75 
 
 		 331 aa  147  2.0000000000000003e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0320304 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0618  putative secretion protein, HlyD family  30.74 
 
 		 326 aa  144  2e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02435  hypothetical protein  32.36 
 
 		 326 aa  141  9.999999999999999e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2701  secretion protein HlyD family protein  32.5 
 
 		 333 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1925  secretion protein HlyD family protein  28.16 
 
 		 328 aa  125  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0178624 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3060  secretion protein HlyD family protein  28.38 
 
 		 353 aa  108  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3464  secretion protein HlyD  29.07 
 
 		 335 aa  108  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4577  secretion protein HlyD  29.28 
 
 		 354 aa  104  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.231546  normal  0.47776 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3037  secretion protein HlyD  27.12 
 
 		 344 aa  102  7e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.714598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2054  periplasmic component of efflux system  26.6 
 
 		 332 aa  99.8  5e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0700  putative lipoprotein  30.66 
 
 		 359 aa  97.8  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3278  secretion protein HlyD family protein  30.03 
 
 		 333 aa  97.8  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1744  secretion protein HlyD family protein  32.46 
 
 		 350 aa  96.3  7e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00348418 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0146  auxiliary membrane fusion protein family transporter  26.88 
 
 		 326 aa  95.9  9e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000237701  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4150  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.07 
 
 		 397 aa  94.7  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00923789  hitchhiker  0.000000297953 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0971  secretion protein HlyD family protein  30.1 
 
 		 333 aa  94.4  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.70003 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1133  secretion protein HlyD  25.57 
 
 		 371 aa  93.6  4e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1938  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.63 
 
 		 462 aa  92  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000755017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0179  secretion protein HlyD  24.55 
 
 		 334 aa  92.4  1e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.235811  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1357  multidrug efflux pump (emrA)  28.21 
 
 		 467 aa  91.3  2e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0943753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69090  hypothetical protein  32.7 
 
 		 357 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1586  secretion protein HlyD family protein  25.95 
 
 		 328 aa  90.1  5e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.125031  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5975  hypothetical protein  31.97 
 
 		 382 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4248  secretion protein HlyD family protein  28.02 
 
 		 397 aa  87.8  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0400018  normal  0.0754484 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0875  secretion protein HlyD family protein  27.23 
 
 		 315 aa  87  4e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.316135 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4203  hypothetical protein  26.22 
 
 		 316 aa  87  4e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.99855  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0097  secretion protein HlyD family protein  28.19 
 
 		 354 aa  86.7  5e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1008  secretion protein HlyD  26.71 
 
 		 463 aa  85.9  0.000000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.387294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1263  efflux transporter  31.03 
 
 		 415 aa  85.1  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.471028  normal  0.778162 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0452  secretion protein HlyD family protein  29.51 
 
 		 375 aa  85.5  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0535  secretion protein HlyD family protein  31.43 
 
 		 339 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.482241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2942  hypothetical protein  26.69 
 
 		 342 aa  85.1  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.495568  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2446  secretion protein HlyD  23.96 
 
 		 331 aa  84.7  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0391443  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0499  secretion protein HlyD family protein  30.48 
 
 		 343 aa  84.3  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.841099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0866  multidrug resistance protein A  25.65 
 
 		 331 aa  83.6  0.000000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0564  secretion protein HlyD family protein  30.48 
 
 		 343 aa  83.6  0.000000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1777  secretion protein HlyD family protein  29.41 
 
 		 320 aa  82.8  0.000000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0865879  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3420  secretion protein HlyD family protein  29.26 
 
 		 357 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1481  multidrug resistance protein, putative  28.52 
 
 		 372 aa  82  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.318452  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0017  secretion protein HlyD family protein  28.67 
 
 		 332 aa  82  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1150  multidrug resistance protein A  25.28 
 
 		 331 aa  82  0.00000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8104  secretion protein HlyD family protein  27.84 
 
 		 354 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0472  HlyD family secretion protein  26.12 
 
 		 349 aa  81.3  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.776692  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2858  secretion protein HlyD  28.45 
 
 		 517 aa  81.3  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1286  hypothetical protein  26.95 
 
 		 331 aa  81.6  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0411  HlyD family secretion protein  26.12 
 
 		 349 aa  81.6  0.00000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2339  secretion protein HylD  29.5 
 
 		 357 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.581598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4021  secretion protein HlyD  29.9 
 
 		 345 aa  80.9  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3839  secretion protein HlyD  30.85 
 
 		 439 aa  80.1  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2494  secretion protein HlyD family protein  28.57 
 
 		 377 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.359817 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1327  major facilitator superfamily efflux pump membrane fusion protein  27.15 
 
 		 393 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0719402  normal  0.0222089 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0563  secretion protein HlyD  28.37 
 
 		 456 aa  80.1  0.00000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1611  secretion protein HlyD  29.07 
 
 		 341 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.306933  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3960  secretion protein HlyD family protein  26.91 
 
 		 355 aa  80.1  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2328  secretion protein HlyD  21.88 
 
 		 398 aa  80.1  0.00000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3393  secretion protein HlyD family protein  25.5 
 
 		 350 aa  80.1  0.00000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03337  predicted HlyD family secretion protein  27.6 
 
 		 355 aa  79.7  0.00000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03289  hypothetical protein  27.6 
 
 		 355 aa  79.7  0.00000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4352  multidrug resistance protein MdtN  27.57 
 
 		 349 aa  79.7  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0228  secretion protein HlyD family protein  27.6 
 
 		 355 aa  79.7  0.00000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3776  MFP family transporter  27.6 
 
 		 355 aa  79.7  0.00000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0227  secretion protein HlyD family protein  27.6 
 
 		 355 aa  79.3  0.00000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4446  DevB family ABC exporter membrane fusion protein  29.41 
 
 		 399 aa  79.3  0.00000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00129  probable membrane fusion protein (HlyD family of secretion proteins) linked to ABC efflux pumps  28.57 
 
 		 350 aa  79.3  0.00000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000116655  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1549  secretion protein HlyD family protein  32.38 
 
 		 372 aa  79.3  0.00000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0744  secretion protein HlyD  26.62 
 
 		 363 aa  79.7  0.00000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>