More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0506 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0506  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 
317 aa  607  1e-173  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2925  secretion protein HlyD family protein  35.29 
 
 
314 aa  168  1e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0402  HlyD family secretion protein  34.97 
 
 
314 aa  156  4e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0463  HlyD family secretion protein  34.31 
 
 
314 aa  153  2.9999999999999998e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0163  lipoprotein  36.79 
 
 
311 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0904469  normal  0.961053 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4329  secretion protein HlyD family protein  35.71 
 
 
327 aa  145  9e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0052  secretion protein HlyD family protein  35.36 
 
 
324 aa  142  7e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0055  secretion protein HlyD family protein  35 
 
 
324 aa  142  9e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.873688  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1084  HlyD family secretion protein  35.23 
 
 
356 aa  137  2e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.335201 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1719  secretion protein HlyD  31.85 
 
 
315 aa  137  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0706497  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3691  secretion protein HlyD family protein  34.63 
 
 
320 aa  135  9e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.951717  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1744  HlyD family secretion protein  33 
 
 
321 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0223446  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4164  secretion protein HlyD family protein  34.28 
 
 
320 aa  133  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.571077  normal  0.349969 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0456  secretion protein HlyD family protein  35.84 
 
 
324 aa  131  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.119386  normal  0.109818 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2054  periplasmic component of efflux system  30.61 
 
 
332 aa  127  2.0000000000000002e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0146  auxiliary membrane fusion protein family transporter  30.95 
 
 
326 aa  127  2.0000000000000002e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000237701  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1792  putative efflux protein  30.56 
 
 
266 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.0000336857  normal  0.255323 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0350  secretion protein HlyD  32.99 
 
 
320 aa  124  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3131  secretion protein HlyD  35.31 
 
 
344 aa  123  5e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0978227  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4312  hypothetical protein  30.47 
 
 
267 aa  122  7e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0409  secretion protein HlyD  31.42 
 
 
332 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1342  HlyD family secretion protein  30.07 
 
 
317 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0700  putative lipoprotein  32.21 
 
 
359 aa  115  6.9999999999999995e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3668  putative efflux protein  29.29 
 
 
263 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.285174  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5057  secretion protein HlyD family protein  42.96 
 
 
313 aa  111  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5305  hypothetical protein  28.66 
 
 
258 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.141224 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3452  HlyD family secretion protein  32.04 
 
 
326 aa  110  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.349475  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2707  secretion protein HlyD family protein  37.04 
 
 
328 aa  104  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0650452  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0717  hypothetical protein  29.29 
 
 
257 aa  104  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.369321  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4203  hypothetical protein  28.85 
 
 
316 aa  103  4e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.99855  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4665  secretion protein HlyD family protein  35.67 
 
 
328 aa  101  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.267783  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3537  hypothetical protein  28.98 
 
 
323 aa  92.8  7e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2904  secretion protein HlyD family protein  30.77 
 
 
329 aa  89.7  6e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.839486  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1705  HlyD family secretion protein  30.63 
 
 
308 aa  87.4  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0971  secretion protein HlyD family protein  31.36 
 
 
333 aa  86.7  5e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.70003 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1250  hypothetical protein  27.92 
 
 
322 aa  84.7  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.249085  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1420  secretion protein HlyD family protein  30.63 
 
 
332 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0351  secretion protein HlyD  27.37 
 
 
326 aa  81.6  0.00000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3278  secretion protein HlyD family protein  30.31 
 
 
333 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1513  secretion protein HlyD family protein  28.91 
 
 
384 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3037  secretion protein HlyD  31.36 
 
 
344 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.714598  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1549  secretion protein HlyD family protein  29.03 
 
 
372 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2833  secretion protein HlyD family protein  29.39 
 
 
383 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.121026  normal  0.828234 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2440  secretion protein HlyD family protein  36.59 
 
 
265 aa  76.6  0.0000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.41732 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3464  secretion protein HlyD  26.1 
 
 
335 aa  76.3  0.0000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0129  hypothetical protein  30.82 
 
 
344 aa  76.3  0.0000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.993938  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8104  secretion protein HlyD family protein  29.52 
 
 
354 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0659  secretion protein HlyD  28.35 
 
 
335 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0195539 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4361  secretion protein HlyD family protein  25.82 
 
 
313 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3420  secretion protein HlyD family protein  29.51 
 
 
357 aa  73.2  0.000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0587  hypothetical protein  27.46 
 
 
314 aa  73.6  0.000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0654708  hitchhiker  0.0000117707 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2810  secretion protein HlyD family protein  23.01 
 
 
368 aa  73.2  0.000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.653473 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2823  HlyD family secretion protein  29.92 
 
 
329 aa  73.2  0.000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1522  secretion protein HlyD family protein  28.52 
 
 
378 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1189  secretion protein HlyD  30.42 
 
 
323 aa  71.6  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.315896  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3705  hypothetical protein  29.45 
 
 
343 aa  71.6  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2777  secretion protein HlyD family protein  30.98 
 
 
323 aa  71.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.991626  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2682  secretion protein HlyD family protein  30.98 
 
 
323 aa  70.5  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430212  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2115  secretion protein HlyD family protein  22.88 
 
 
334 aa  70.1  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.441068  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1263  hypothetical protein  26.15 
 
 
315 aa  70.1  0.00000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00237907  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3969  secretion protein HlyD family protein  27.5 
 
 
352 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3787  secretion protein HlyD family protein  27.5 
 
 
352 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3843  secretion protein HlyD family protein  27.5 
 
 
352 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3107  secretion protein HlyD family protein  30.42 
 
 
355 aa  69.7  0.00000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.128244  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0482  secretion protein HlyD family protein  27.5 
 
 
352 aa  69.7  0.00000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2446  secretion protein HlyD  26.28 
 
 
331 aa  69.3  0.00000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0391443  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5332  secretion protein HlyD family protein  28.82 
 
 
347 aa  69.3  0.00000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.588118 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0875  secretion protein HlyD family protein  23.36 
 
 
315 aa  69.3  0.00000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.316135 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1382  secretion protein HlyD family protein  28.33 
 
 
340 aa  69.3  0.00000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.396008  hitchhiker  0.000481704 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0499  secretion protein HlyD family protein  29.49 
 
 
364 aa  69.3  0.00000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4698  hypothetical protein  32.27 
 
 
334 aa  69.3  0.00000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.528303  normal  0.639413 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2642  secretion protein HlyD family protein  30 
 
 
337 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3000  hypothetical protein  31.87 
 
 
337 aa  68.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0427  hypothetical protein  28.12 
 
 
317 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1035  secretion protein HlyD  40.21 
 
 
324 aa  68.2  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.833081  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3250  hypothetical protein  31.42 
 
 
337 aa  68.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0916  secretion protein HlyD family protein  30.98 
 
 
335 aa  67.4  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1793  hypothetical protein  30.28 
 
 
347 aa  67.4  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0463341  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2339  secretion protein HylD  28.57 
 
 
357 aa  67  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.581598  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0259  secretion protein HlyD  22.18 
 
 
327 aa  67  0.0000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.689376  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2861  secretion protein, HlyD family  29.35 
 
 
345 aa  67  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2482  secretion protein HlyD family protein  29.35 
 
 
345 aa  67  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3589  HlyD family secretion protein  29.03 
 
 
320 aa  67  0.0000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2575  secretion protein HlyD family protein  29.6 
 
 
337 aa  66.2  0.0000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2750  secretion protein HlyD family protein  29.2 
 
 
337 aa  65.9  0.0000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0807  secretion protein HlyD family protein  27.1 
 
 
310 aa  64.7  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1902  secretion protein HlyD  25.67 
 
 
395 aa  65.1  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0432629  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4521  secretion protein HlyD family protein  26.75 
 
 
351 aa  64.7  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.170966 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0452  secretion protein HlyD family protein  27.04 
 
 
352 aa  63.9  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6207  secretion protein HlyD family protein  27.84 
 
 
357 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.19774 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1020  hypothetical protein  28.75 
 
 
345 aa  63.2  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1938  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.66 
 
 
462 aa  63.2  0.000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000755017  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1147  secretion protein HlyD family protein  29.76 
 
 
328 aa  63.2  0.000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000143256  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0412  secretion protein HlyD family protein  26.37 
 
 
323 aa  62.8  0.000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.604128  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0523  secretion protein HlyD family protein  25.71 
 
 
351 aa  62.8  0.000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0317  secretion protein HlyD family protein  27.05 
 
 
354 aa  62.4  0.000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1777  secretion protein HlyD family protein  30.6 
 
 
320 aa  62.4  0.000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0865879  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5882  secretion protein HlyD family protein  27.84 
 
 
357 aa  62  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1286  hypothetical protein  25.91 
 
 
331 aa  61.2  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1305  hypothetical protein  31.39 
 
 
346 aa  61.6  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.126611  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>