More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2115 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2115  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 		 334 aa  678    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.441068  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0916  secretion protein HlyD family protein  31.95 
 
 		 335 aa  117  3.9999999999999997e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0659  secretion protein HlyD  25.62 
 
 		 335 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0195539 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2823  HlyD family secretion protein  29.02 
 
 		 329 aa  107  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1147  secretion protein HlyD family protein  30.42 
 
 		 328 aa  103  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000143256  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1586  secretion protein HlyD family protein  26.59 
 
 		 328 aa  102  8e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.125031  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2904  secretion protein HlyD family protein  29.81 
 
 		 329 aa  100  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.839486  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3037  secretion protein HlyD  27.18 
 
 		 344 aa  97.1  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.714598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8104  secretion protein HlyD family protein  30.24 
 
 		 354 aa  97.1  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4698  hypothetical protein  31.63 
 
 		 334 aa  96.3  6e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.528303  normal  0.639413 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2446  secretion protein HlyD  29.02 
 
 		 331 aa  95.1  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0391443  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0129  hypothetical protein  28.72 
 
 		 344 aa  93.6  4e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.993938  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2482  secretion protein HlyD family protein  29.76 
 
 		 345 aa  93.2  5e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2861  secretion protein, HlyD family  29.76 
 
 		 345 aa  93.2  5e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2810  secretion protein HlyD family protein  25.6 
 
 		 368 aa  92.8  7e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.653473 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3464  secretion protein HlyD  27.93 
 
 		 335 aa  88.6  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1902  secretion protein HlyD  27.06 
 
 		 395 aa  89  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0432629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1794  secretion protein HlyD family protein  28.62 
 
 		 350 aa  88.2  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3107  secretion protein HlyD family protein  29.74 
 
 		 355 aa  88.2  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.128244  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3000  hypothetical protein  29.59 
 
 		 337 aa  87.8  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1082  putative ABC transport system, lipoprotein  25.69 
 
 		 302 aa  87  4e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2370  secretion protein HlyD  29.82 
 
 		 344 aa  87  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.972198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3278  secretion protein HlyD family protein  29.31 
 
 		 333 aa  86.3  7e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1329  hypothetical protein  27.17 
 
 		 328 aa  86.3  7e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2390  secretion protein HlyD family protein  27.76 
 
 		 348 aa  86.3  7e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.313977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1793  hypothetical protein  30.26 
 
 		 347 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0463341  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2900  hypothetical protein  26.73 
 
 		 328 aa  85.1  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.441654  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2812  hypothetical protein  26.73 
 
 		 328 aa  85.1  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.659594  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3250  hypothetical protein  30.04 
 
 		 337 aa  84  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0971  secretion protein HlyD family protein  29.31 
 
 		 333 aa  84  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.70003 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1382  secretion protein HlyD family protein  27.84 
 
 		 340 aa  83.2  0.000000000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.396008  hitchhiker  0.000481704 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1777  secretion protein HlyD family protein  28.18 
 
 		 320 aa  82.8  0.000000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0865879  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1513  secretion protein HlyD family protein  29.66 
 
 		 384 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1549  secretion protein HlyD family protein  29.66 
 
 		 372 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2420  hypothetical protein  26.57 
 
 		 334 aa  79.7  0.00000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0441115  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0456  secretion protein HlyD family protein  24.77 
 
 		 324 aa  79  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.119386  normal  0.109818 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00610  Type I secretion protein, HlyD family  28.19 
 
 		 339 aa  78.6  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.211465  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1778  secretion protein HlyD  27.96 
 
 		 339 aa  77.8  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.32933  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1480  secretion protein HlyD family protein  25.49 
 
 		 349 aa  77.8  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.785095  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0861  secretion protein HlyD  28.9 
 
 		 330 aa  77  0.0000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0209949  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0807  secretion protein HlyD family protein  27.79 
 
 		 310 aa  76.6  0.0000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1263  efflux transporter  32.89 
 
 		 415 aa  76.3  0.0000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.471028  normal  0.778162 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1286  hypothetical protein  24.74 
 
 		 331 aa  75.9  0.0000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7009  secretion protein HlyD family protein  27.04 
 
 		 361 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.159202  normal  0.765528 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4577  secretion protein HlyD  24.93 
 
 		 354 aa  75.5  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.231546  normal  0.47776 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2833  secretion protein HlyD family protein  28.97 
 
 		 383 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.121026  normal  0.828234 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1497  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.96 
 
 		 407 aa  74.7  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.30393  hitchhiker  0.00778895 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1515  secretion protein HlyD family protein  25.07 
 
 		 365 aa  75.1  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1744  secretion protein HlyD family protein  27.33 
 
 		 350 aa  73.6  0.000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00348418 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1420  secretion protein HlyD family protein  28.81 
 
 		 332 aa  73.6  0.000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2858  secretion protein HlyD  27.55 
 
 		 517 aa  73.2  0.000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0351  secretion protein HlyD  26.07 
 
 		 326 aa  72.4  0.000000000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1819  secretion protein HlyD family protein  27.42 
 
 		 383 aa  72.4  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.333627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1522  secretion protein HlyD family protein  29.56 
 
 		 378 aa  72  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0881  hypothetical protein  24.74 
 
 		 331 aa  71.2  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.775184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1040  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.07 
 
 		 500 aa  71.6  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0913  hypothetical protein  24.74 
 
 		 331 aa  71.2  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.16155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0966  hypothetical protein  24.74 
 
 		 331 aa  71.2  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1305  hypothetical protein  27.72 
 
 		 346 aa  71.2  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.126611  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0945  hypothetical protein  24.74 
 
 		 331 aa  71.2  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0853  hypothetical protein  24.74 
 
 		 331 aa  71.2  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1493  secretion protein HlyD family protein  24.45 
 
 		 332 aa  70.5  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.172966  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1422  secretion protein HlyD  27.53 
 
 		 359 aa  70.5  0.00000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0497268  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00762  hypothetical protein  25.34 
 
 		 332 aa  70.1  0.00000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0943  hypothetical protein  25.34 
 
 		 331 aa  70.1  0.00000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2557  hypothetical protein  25.34 
 
 		 331 aa  70.1  0.00000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2848  hypothetical protein  25.34 
 
 		 331 aa  70.1  0.00000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0314529 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0818  hypothetical protein  25.34 
 
 		 331 aa  70.1  0.00000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00779  hypothetical protein  25.34 
 
 		 332 aa  70.1  0.00000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0849  hypothetical protein  25.34 
 
 		 331 aa  70.1  0.00000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0860  hypothetical protein  25.34 
 
 		 331 aa  70.1  0.00000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2847  secretion protein HlyD family protein  25.34 
 
 		 331 aa  69.7  0.00000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0875  secretion protein HlyD family protein  28.47 
 
 		 315 aa  69.3  0.00000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.316135 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1705  HlyD family secretion protein  26.79 
 
 		 308 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1398  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.99 
 
 		 504 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3589  HlyD family secretion protein  26.77 
 
 		 320 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2942  hypothetical protein  25.83 
 
 		 342 aa  67.8  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.495568  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1332  secretion protein HlyD family protein  28.94 
 
 		 342 aa  67.8  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.729441  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6769  secretion protein HlyD family protein  26.61 
 
 		 393 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.238192  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5332  secretion protein HlyD family protein  26.39 
 
 		 347 aa  67.4  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.588118 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1133  secretion protein HlyD  25.51 
 
 		 371 aa  67.4  0.0000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3415  secretion protein HlyD family protein  29.01 
 
 		 406 aa  67.4  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.297812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2322  secretion protein HlyD  26.61 
 
 		 399 aa  67  0.0000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000756014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4061  secretion protein HlyD family protein  26.75 
 
 		 354 aa  66.2  0.0000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3960  secretion protein HlyD family protein  25.44 
 
 		 355 aa  66.2  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3420  secretion protein HlyD family protein  23.3 
 
 		 357 aa  66.2  0.0000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3686  MFP family transporter  24.56 
 
 		 355 aa  65.9  0.0000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03337  predicted HlyD family secretion protein  24.26 
 
 		 355 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0228  secretion protein HlyD family protein  24.26 
 
 		 355 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03289  hypothetical protein  24.26 
 
 		 355 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3776  MFP family transporter  24.26 
 
 		 355 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3537  hypothetical protein  24.11 
 
 		 323 aa  65.9  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0737  hypothetical protein  30.17 
 
 		 190 aa  64.7  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2054  periplasmic component of efflux system  25.3 
 
 		 332 aa  64.7  0.000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1938  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.59 
 
 		 462 aa  64.7  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000755017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4832  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  24.26 
 
 		 355 aa  64.3  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0146  auxiliary membrane fusion protein family transporter  25.6 
 
 		 326 aa  64.3  0.000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000237701  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2020  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.46 
 
 		 414 aa  63.9  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.152554 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0227  secretion protein HlyD family protein  23.96 
 
 		 355 aa  63.9  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2777  RND family efflux transporter MFP subunit  26.37 
 
 		 489 aa  63.5  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000975793  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>