More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_7009 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_7009  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 		 361 aa  719    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.159202  normal  0.765528 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5888  secretion protein HlyD family protein  74.52 
 
 		 361 aa  481  1e-135  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.998521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0446  membrane protein  70.56 
 
 		 361 aa  472  1e-132  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.210333  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5590  secretion protein HlyD family protein  69.53 
 
 		 361 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.753958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2767  MFP family transporter  72.22 
 
 		 361 aa  457  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0174  MFP family transporter  71.67 
 
 		 361 aa  455  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2624  MFP family transporter  71.94 
 
 		 361 aa  457  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0148  membrane protein  71.94 
 
 		 361 aa  457  1e-127  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1032  ABC-type export system, membrane fusion protein  71.94 
 
 		 361 aa  456  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1319  MFP family transporter  71.94 
 
 		 361 aa  457  1e-127  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1295  secretion protein HlyD family protein  59.56 
 
 		 361 aa  437  9.999999999999999e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1503  secretion protein HlyD  55.43 
 
 		 395 aa  413  1e-114  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.289067  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4556  secretion protein HlyD family protein  58.06 
 
 		 361 aa  397  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.241944  normal  0.0605665 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4423  secretion protein HlyD family protein  58.06 
 
 		 361 aa  397  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.045905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1224  secretion protein HlyD  59.5 
 
 		 362 aa  366  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.343602  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0311  secretion protein HlyD family protein  45.3 
 
 		 361 aa  327  3e-88  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0146421  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0100  hypothetical protein  49.17 
 
 		 361 aa  317  2e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0102  secretion protein HlyD family protein  49.17 
 
 		 361 aa  317  2e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0008  secretion protein HlyD family protein  45 
 
 		 363 aa  306  3e-82  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000302217  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0471  secretion protein HlyD family protein  31.98 
 
 		 414 aa  151  1e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1115  secretion protein HlyD family protein  33.33 
 
 		 347 aa  124  2e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.719605  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0165  secretion protein HlyD family protein  32.12 
 
 		 411 aa  101  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1810  hypothetical protein  32.31 
 
 		 326 aa  97.4  4e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.516711  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2112  secretion protein HlyD family protein  30.3 
 
 		 372 aa  89  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  unclonable  0.0000000135214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0963  hypothetical protein  31.02 
 
 		 307 aa  89.4  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1396  secretion protein HlyD family protein  29.44 
 
 		 310 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0504775  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3085  secretion protein HlyD family protein  30.09 
 
 		 353 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.22636  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3037  secretion protein HlyD  35.09 
 
 		 344 aa  82  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.714598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2115  secretion protein HlyD family protein  27.47 
 
 		 334 aa  80.9  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.441068  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1628  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.72 
 
 		 383 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.37 
 
 		 377 aa  72.8  0.000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.69897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1480  secretion protein HlyD family protein  25.52 
 
 		 349 aa  72.4  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.785095  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0129  hypothetical protein  29.18 
 
 		 344 aa  72  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.993938  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1283  secretion protein HlyD  34.16 
 
 		 475 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.277079  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6548  secretion protein HlyD family protein  34.16 
 
 		 475 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6154  secretion protein HlyD family protein  34.16 
 
 		 470 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.18096 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4021  secretion protein HlyD  24.51 
 
 		 345 aa  70.1  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2858  secretion protein HlyD  26.59 
 
 		 517 aa  69.7  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3000  hypothetical protein  30.14 
 
 		 337 aa  69.3  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0259  secretion protein HlyD  24.14 
 
 		 327 aa  68.2  0.0000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.689376  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6274  secretion protein HlyD family protein  35.5 
 
 		 460 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0399198 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6560  secretion protein HlyD family protein  35.5 
 
 		 460 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.21193  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3250  hypothetical protein  30.14 
 
 		 337 aa  66.6  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8104  secretion protein HlyD family protein  28.94 
 
 		 354 aa  66.2  0.0000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5245  secretion protein HlyD family protein  32.67 
 
 		 333 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1263  efflux transporter  32.34 
 
 		 415 aa  65.9  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.471028  normal  0.778162 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2904  secretion protein HlyD family protein  26.22 
 
 		 329 aa  65.9  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.839486  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2949  RND family efflux transporter MFP subunit  26.21 
 
 		 376 aa  64.7  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0795  RND family efflux transporter MFP subunit  28.77 
 
 		 411 aa  63.9  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1793  hypothetical protein  30 
 
 		 347 aa  63.5  0.000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0463341  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1728  hypothetical protein  29.8 
 
 		 323 aa  63.5  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0534587  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20080  hypothetical protein  28.81 
 
 		 323 aa  63.5  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5521  secretion protein HlyD family protein  32.85 
 
 		 468 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0734962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1339  RND family efflux transporter MFP subunit  28.03 
 
 		 384 aa  62.4  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.611384  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4698  hypothetical protein  31.1 
 
 		 334 aa  61.6  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.528303  normal  0.639413 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1398  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.36 
 
 		 504 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1431  secretion protein HlyD  29.07 
 
 		 361 aa  61.6  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4735  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.8 
 
 		 432 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0659148 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003056  multidrug resistance efflux pump  30.73 
 
 		 354 aa  61.6  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1286  hypothetical protein  24.64 
 
 		 331 aa  61.6  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3839  secretion protein HlyD  27.96 
 
 		 439 aa  61.2  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3163  efflux pump membrane protein  29.08 
 
 		 390 aa  60.8  0.00000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2557  hypothetical protein  26.52 
 
 		 331 aa  60.5  0.00000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00610  Type I secretion protein, HlyD family  29.97 
 
 		 339 aa  60.5  0.00000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.211465  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0659  secretion protein HlyD  26.16 
 
 		 335 aa  60.5  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0195539 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00762  hypothetical protein  26.52 
 
 		 332 aa  59.7  0.00000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2847  secretion protein HlyD family protein  26.52 
 
 		 331 aa  59.7  0.00000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0860  hypothetical protein  26.52 
 
 		 331 aa  59.7  0.00000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1778  secretion protein HlyD  26.8 
 
 		 339 aa  59.7  0.00000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.32933  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00779  hypothetical protein  26.52 
 
 		 332 aa  59.7  0.00000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0146  auxiliary membrane fusion protein family transporter  25 
 
 		 326 aa  59.7  0.00000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000237701  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2848  hypothetical protein  26.52 
 
 		 331 aa  59.7  0.00000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0314529 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0818  hypothetical protein  26.52 
 
 		 331 aa  59.7  0.00000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1327  major facilitator superfamily efflux pump membrane fusion protein  30.54 
 
 		 393 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0719402  normal  0.0222089 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0943  hypothetical protein  26.52 
 
 		 331 aa  59.7  0.00000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2054  periplasmic component of efflux system  25 
 
 		 332 aa  59.3  0.00000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0849  hypothetical protein  26.52 
 
 		 331 aa  59.7  0.00000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1080  MacA  23.53 
 
 		 394 aa  59.3  0.0000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1422  secretion protein HlyD  29.59 
 
 		 359 aa  59.3  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0497268  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1839  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.99 
 
 		 420 aa  58.9  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0573  macrolide secretion protein MacA  29.78 
 
 		 455 aa  58.2  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.00000000000123833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2812  hypothetical protein  26.69 
 
 		 328 aa  58.2  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.659594  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0456  secretion protein HlyD family protein  30.91 
 
 		 324 aa  58.5  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.119386  normal  0.109818 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2900  hypothetical protein  26.69 
 
 		 328 aa  58.2  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.441654  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0653  secretion protein HlyD family protein  26.69 
 
 		 357 aa  57.8  0.0000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2997  multidrug resistance protein A  29.36 
 
 		 390 aa  57.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138717 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3883  secretion protein HlyD  28.23 
 
 		 424 aa  57.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.135938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0853  hypothetical protein  26.16 
 
 		 331 aa  57.4  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0913  hypothetical protein  26.16 
 
 		 331 aa  57.4  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.16155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0351  secretion protein HlyD  25.71 
 
 		 326 aa  57.8  0.0000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3120  multidrug resistance protein A  29.36 
 
 		 390 aa  57.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0308659 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1064  macrolide-specific efflux protein macA  25.33 
 
 		 390 aa  57.8  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0267322  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3014  multidrug resistance protein A  29.36 
 
 		 390 aa  57.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193784 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0945  hypothetical protein  26.16 
 
 		 331 aa  57.4  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0966  hypothetical protein  26.16 
 
 		 331 aa  57.4  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0881  hypothetical protein  26.16 
 
 		 331 aa  57.4  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.775184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2931  multidrug resistance protein A  30.7 
 
 		 390 aa  56.6  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2962  multidrug resistance protein A  30.7 
 
 		 390 aa  56.6  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.832708  hitchhiker  0.00715907 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1833  RND family efflux transporter MFP subunit  28.79 
 
 		 464 aa  56.6  0.0000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.36059  unclonable  0.000000000906287 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0563  secretion protein HlyD  29.33 
 
 		 456 aa  56.2  0.0000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>