More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMASAVP1_1319 on replicon NC_008784
Organism: Burkholderia mallei SAVP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009079  BMA10247_A0174  MFP family transporter  99.72 
 
 		 361 aa  714    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2767  MFP family transporter  99.45 
 
 		 361 aa  711    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0148  membrane protein  100 
 
 		 361 aa  714    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1032  ABC-type export system, membrane fusion protein  99.72 
 
 		 361 aa  712    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2624  MFP family transporter  100 
 
 		 361 aa  714    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1319  MFP family transporter  100 
 
 		 361 aa  714    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0446  membrane protein  87.5 
 
 		 361 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.210333  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7009  secretion protein HlyD family protein  71.94 
 
 		 361 aa  489  1e-137  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.159202  normal  0.765528 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5888  secretion protein HlyD family protein  76.94 
 
 		 361 aa  487  1e-136  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.998521  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5590  secretion protein HlyD family protein  68.98 
 
 		 361 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.753958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1295  secretion protein HlyD family protein  59.05 
 
 		 361 aa  437  1e-121  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1503  secretion protein HlyD  57.78 
 
 		 395 aa  418  1e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.289067  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4556  secretion protein HlyD family protein  58.94 
 
 		 361 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.241944  normal  0.0605665 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4423  secretion protein HlyD family protein  58.94 
 
 		 361 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.045905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1224  secretion protein HlyD  62.67 
 
 		 362 aa  374  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.343602  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0100  hypothetical protein  52.91 
 
 		 361 aa  342  7e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0102  secretion protein HlyD family protein  52.91 
 
 		 361 aa  342  7e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0311  secretion protein HlyD family protein  44.01 
 
 		 361 aa  319  5e-86  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0146421  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0008  secretion protein HlyD family protein  45.59 
 
 		 363 aa  307  2.0000000000000002e-82  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000302217  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0471  secretion protein HlyD family protein  31.69 
 
 		 414 aa  139  6e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0165  secretion protein HlyD family protein  32.6 
 
 		 411 aa  104  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1115  secretion protein HlyD family protein  31.87 
 
 		 347 aa  105  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.719605  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1810  hypothetical protein  30.56 
 
 		 326 aa  90.1  5e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.516711  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0963  hypothetical protein  29.94 
 
 		 307 aa  85.9  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2112  secretion protein HlyD family protein  29.83 
 
 		 372 aa  82.4  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  unclonable  0.0000000135214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1396  secretion protein HlyD family protein  28.21 
 
 		 310 aa  82  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0504775  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1628  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.57 
 
 		 383 aa  76.3  0.0000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.12 
 
 		 377 aa  74.3  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.69897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3085  secretion protein HlyD family protein  28.12 
 
 		 353 aa  72  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.22636  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3839  secretion protein HlyD  28.93 
 
 		 439 aa  67.4  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3037  secretion protein HlyD  29.6 
 
 		 344 aa  67.4  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.714598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1283  secretion protein HlyD  33.33 
 
 		 475 aa  66.2  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.277079  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6548  secretion protein HlyD family protein  33.33 
 
 		 475 aa  66.2  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6154  secretion protein HlyD family protein  33.33 
 
 		 470 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.18096 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6274  secretion protein HlyD family protein  34.31 
 
 		 460 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0399198 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6560  secretion protein HlyD family protein  34.31 
 
 		 460 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.21193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2355  secretion protein HlyD  29.11 
 
 		 509 aa  64.7  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0694634 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2054  periplasmic component of efflux system  25.32 
 
 		 332 aa  64.3  0.000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0259  secretion protein HlyD  22.68 
 
 		 327 aa  63.9  0.000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.689376  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8104  secretion protein HlyD family protein  27.6 
 
 		 354 aa  62.8  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2904  secretion protein HlyD family protein  24.59 
 
 		 329 aa  62.8  0.000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.839486  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3303  RND family efflux transporter MFP subunit  27.66 
 
 		 418 aa  62.4  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.3496  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2115  secretion protein HlyD family protein  24.61 
 
 		 334 aa  61.2  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.441068  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0146  auxiliary membrane fusion protein family transporter  25 
 
 		 326 aa  61.6  0.00000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000237701  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1480  secretion protein HlyD family protein  22.03 
 
 		 349 aa  61.6  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.785095  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1902  secretion protein HlyD  24.48 
 
 		 395 aa  61.2  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0432629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4698  hypothetical protein  31.03 
 
 		 334 aa  61.2  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.528303  normal  0.639413 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3000  hypothetical protein  29.34 
 
 		 337 aa  60.8  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2823  HlyD family secretion protein  26.14 
 
 		 329 aa  60.5  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1921  RND family efflux transporter MFP subunit  40 
 
 		 340 aa  59.7  0.00000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00271277  normal  0.413551 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2557  hypothetical protein  29.26 
 
 		 331 aa  58.9  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2847  secretion protein HlyD family protein  29.26 
 
 		 331 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5521  secretion protein HlyD family protein  33.5 
 
 		 468 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0734962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1833  RND family efflux transporter MFP subunit  25.72 
 
 		 464 aa  58.5  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.36059  unclonable  0.000000000906287 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00762  hypothetical protein  29.26 
 
 		 332 aa  57.8  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0849  hypothetical protein  29.26 
 
 		 331 aa  57.8  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0943  hypothetical protein  29.26 
 
 		 331 aa  57.8  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0860  hypothetical protein  29.26 
 
 		 331 aa  57.8  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0818  hypothetical protein  29.26 
 
 		 331 aa  57.8  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2848  hypothetical protein  29.26 
 
 		 331 aa  57.8  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0314529 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00779  hypothetical protein  29.26 
 
 		 332 aa  57.8  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2858  secretion protein HlyD  27.45 
 
 		 517 aa  57.4  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0861  secretion protein HlyD  29.28 
 
 		 330 aa  57.4  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0209949  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2492  RND family efflux transporter subunit MFP  31.36 
 
 		 437 aa  56.6  0.0000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.311613  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4226  secretion protein HlyD family protein  27.07 
 
 		 411 aa  56.6  0.0000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1286  hypothetical protein  27.31 
 
 		 331 aa  56.2  0.0000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3892  secretion protein HlyD family protein  27.53 
 
 		 352 aa  56.2  0.0000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003056  multidrug resistance efflux pump  27.98 
 
 		 354 aa  56.2  0.0000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1839  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.64 
 
 		 420 aa  55.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1382  secretion protein HlyD family protein  27.08 
 
 		 340 aa  55.8  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.396008  hitchhiker  0.000481704 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1204  secretion protein HlyD  41.94 
 
 		 395 aa  55.8  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.377097  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0351  secretion protein HlyD  23.17 
 
 		 326 aa  55.8  0.000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1830  secretion protein HlyD  26.81 
 
 		 449 aa  55.5  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1748  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.28 
 
 		 388 aa  55.5  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1847  putative efflux transporter  28.42 
 
 		 421 aa  55.1  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3883  secretion protein HlyD  26.91 
 
 		 424 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.135938  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0919  AcrA/AcrE family efflux protein  23.26 
 
 		 377 aa  54.3  0.000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1064  macrolide-specific efflux protein macA  25.99 
 
 		 390 aa  54.3  0.000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0267322  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1863  RND family efflux transporter MFP subunit  26.9 
 
 		 393 aa  54.3  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4608  secretion protein HlyD  30.37 
 
 		 364 aa  53.9  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0635  macrolide-specific efflux protein macA  23.79 
 
 		 390 aa  53.9  0.000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0167041  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5486  secretion protein HlyD family protein  30.27 
 
 		 363 aa  53.9  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.707329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3755  secretion protein HlyD family protein  30.37 
 
 		 364 aa  53.9  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.178549  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2812  hypothetical protein  25.59 
 
 		 328 aa  53.9  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.659594  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4545  secretion protein HlyD family protein  23.37 
 
 		 335 aa  53.9  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0511236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3768  secretion protein HlyD family protein  30.27 
 
 		 364 aa  53.9  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.20986 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2900  hypothetical protein  25.59 
 
 		 328 aa  53.9  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.441654  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1774  secretion protein HlyD family protein  28.98 
 
 		 355 aa  53.5  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1057  RND family efflux transporter MFP subunit  30.49 
 
 		 373 aa  53.5  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.347653 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0966  hypothetical protein  29.52 
 
 		 331 aa  53.5  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0945  hypothetical protein  29.52 
 
 		 331 aa  53.5  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0881  hypothetical protein  29.52 
 
 		 331 aa  53.5  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.775184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2446  secretion protein HlyD  24.61 
 
 		 331 aa  53.1  0.000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0391443  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1080  MacA  22.45 
 
 		 394 aa  53.1  0.000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3104  secretion protein HlyD family protein  28.34 
 
 		 407 aa  53.1  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.599645  normal  0.0169498 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20080  hypothetical protein  29.59 
 
 		 323 aa  53.1  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2750  secretion protein HlyD family protein  34.91 
 
 		 337 aa  53.1  0.000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2642  secretion protein HlyD family protein  34.91 
 
 		 337 aa  53.1  0.000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0573  macrolide secretion protein MacA  29.84 
 
 		 455 aa  52.8  0.000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.00000000000123833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1778  secretion protein HlyD  28.87 
 
 		 339 aa  52.8  0.000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.32933  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>