More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0311 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0311  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 		 361 aa  723    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0146421  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0008  secretion protein HlyD family protein  82.16 
 
 		 363 aa  582  1.0000000000000001e-165  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000302217  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1503  secretion protein HlyD  49.86 
 
 		 395 aa  359  4e-98  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.289067  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1295  secretion protein HlyD family protein  51.81 
 
 		 361 aa  359  4e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0100  hypothetical protein  47.24 
 
 		 361 aa  329  4e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0102  secretion protein HlyD family protein  47.24 
 
 		 361 aa  329  4e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4556  secretion protein HlyD family protein  44.88 
 
 		 361 aa  327  3e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.241944  normal  0.0605665 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4423  secretion protein HlyD family protein  44.88 
 
 		 361 aa  327  3e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.045905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7009  secretion protein HlyD family protein  45.45 
 
 		 361 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.159202  normal  0.765528 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5888  secretion protein HlyD family protein  45.58 
 
 		 361 aa  298  1e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.998521  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5590  secretion protein HlyD family protein  46.8 
 
 		 361 aa  298  1e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.753958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0446  membrane protein  46.24 
 
 		 361 aa  296  5e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.210333  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1224  secretion protein HlyD  45.71 
 
 		 362 aa  293  3e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.343602  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2767  MFP family transporter  44.29 
 
 		 361 aa  285  7e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0148  membrane protein  44.01 
 
 		 361 aa  285  8e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2624  MFP family transporter  44.01 
 
 		 361 aa  285  8e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1319  MFP family transporter  44.01 
 
 		 361 aa  285  8e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1032  ABC-type export system, membrane fusion protein  44.01 
 
 		 361 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0174  MFP family transporter  43.73 
 
 		 361 aa  279  4e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0471  secretion protein HlyD family protein  30.47 
 
 		 414 aa  125  2e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1115  secretion protein HlyD family protein  28.89 
 
 		 347 aa  117  3.9999999999999997e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.719605  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1810  hypothetical protein  26.2 
 
 		 326 aa  98.2  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.516711  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1396  secretion protein HlyD family protein  25.77 
 
 		 310 aa  96.7  5e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0504775  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0165  secretion protein HlyD family protein  27.46 
 
 		 411 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0963  hypothetical protein  25.14 
 
 		 307 aa  93.6  5e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2112  secretion protein HlyD family protein  26.72 
 
 		 372 aa  93.6  5e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  unclonable  0.0000000135214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1628  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.62 
 
 		 383 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3085  secretion protein HlyD family protein  26.43 
 
 		 353 aa  82.8  0.000000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.22636  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1382  secretion protein HlyD family protein  27.67 
 
 		 340 aa  70.5  0.00000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.396008  hitchhiker  0.000481704 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2082  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.26 
 
 		 416 aa  68.6  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0563  secretion protein HlyD  25.18 
 
 		 456 aa  68.2  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1440  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.16 
 
 		 374 aa  68.2  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.266014  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0831  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.1 
 
 		 372 aa  67.8  0.0000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0273609  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1422  secretion protein HlyD  26.29 
 
 		 359 aa  64.7  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0497268  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1830  secretion protein HlyD  25.31 
 
 		 449 aa  64.7  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4021  secretion protein HlyD  24.08 
 
 		 345 aa  64.7  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0573  macrolide secretion protein MacA  25.88 
 
 		 455 aa  64.3  0.000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.00000000000123833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1480  secretion protein HlyD family protein  24.88 
 
 		 349 aa  64.3  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.785095  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1040  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.17 
 
 		 500 aa  64.3  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2949  RND family efflux transporter MFP subunit  24.53 
 
 		 376 aa  62.8  0.000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8104  secretion protein HlyD family protein  26.05 
 
 		 354 aa  62.8  0.000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.58 
 
 		 377 aa  61.6  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.69897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0875  secretion protein HlyD family protein  27 
 
 		 315 aa  62  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.316135 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3037  secretion protein HlyD  23.65 
 
 		 344 aa  61.6  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.714598  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2825  RND family efflux transporter subunit MFP  29.45 
 
 		 500 aa  61.2  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.708608  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2193  multidrug resistance protein MdtN  26.07 
 
 		 350 aa  60.5  0.00000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5189  secretion protein HlyD family protein  23.41 
 
 		 409 aa  60.5  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.484438  normal  0.367271 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0402  HlyD family secretion protein  23.27 
 
 		 314 aa  60.1  0.00000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2925  secretion protein HlyD family protein  22.33 
 
 		 314 aa  59.7  0.00000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2010  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.89 
 
 		 412 aa  59.3  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.2279  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0838  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.03 
 
 		 432 aa  59.3  0.00000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0659  secretion protein HlyD  25.22 
 
 		 335 aa  58.9  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0195539 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0463  HlyD family secretion protein  23.58 
 
 		 314 aa  58.5  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0516  secretion protein HlyD family protein  26.2 
 
 		 389 aa  58.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003056  multidrug resistance efflux pump  32.58 
 
 		 354 aa  58.2  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1286  hypothetical protein  24.04 
 
 		 331 aa  58.2  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2117  secretion protein HlyD  27.51 
 
 		 428 aa  58.2  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.893928 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1794  secretion protein HlyD family protein  26.92 
 
 		 350 aa  58.2  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1067  secretion protein HlyD  25 
 
 		 364 aa  57.4  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.133207 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1039  secretion protein HlyD  25.18 
 
 		 427 aa  56.6  0.0000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0259  secretion protein HlyD  29.58 
 
 		 327 aa  56.6  0.0000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.689376  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0782  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.1 
 
 		 428 aa  56.2  0.0000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00204407  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02789  putative efflux pump protein  31.61 
 
 		 344 aa  55.8  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2843  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.81 
 
 		 496 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1204  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.73 
 
 		 471 aa  55.5  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2812  hypothetical protein  23.16 
 
 		 328 aa  55.5  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.659594  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2861  secretion protein, HlyD family  27.14 
 
 		 345 aa  55.1  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0926  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.37 
 
 		 490 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1870  secretion protein HlyD  25.12 
 
 		 427 aa  55.5  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2900  hypothetical protein  23.16 
 
 		 328 aa  55.5  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.441654  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3415  secretion protein HlyD family protein  29.08 
 
 		 406 aa  54.7  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.297812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2482  secretion protein HlyD family protein  27.14 
 
 		 345 aa  55.1  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3518  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.15 
 
 		 379 aa  54.3  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.224234  normal  0.212959 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3561  secretion protein HlyD  24.87 
 
 		 413 aa  54.3  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.398677 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4521  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.83 
 
 		 379 aa  54.7  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0267  RND family efflux transporter MFP subunit  26 
 
 		 586 aa  54.3  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117926 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0906  secretion protein HlyD  21.46 
 
 		 449 aa  54.3  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.101628  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0663  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.51 
 
 		 453 aa  54.3  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2492  RND family efflux transporter subunit MFP  23.1 
 
 		 437 aa  53.9  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.311613  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1493  secretion protein HlyD family protein  23.61 
 
 		 332 aa  53.9  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.172966  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0270  putative MacA-like membrane transport protein  24.02 
 
 		 417 aa  53.5  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00610  Type I secretion protein, HlyD family  26.54 
 
 		 339 aa  53.5  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.211465  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0487  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.62 
 
 		 360 aa  53.5  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0129  hypothetical protein  22.54 
 
 		 344 aa  53.1  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.993938  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2831  syringolide efflux protein SyfC  27.75 
 
 		 383 aa  53.1  0.000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.580145  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2104  secretion protein HlyD family protein  27.5 
 
 		 541 aa  53.1  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1902  secretion protein HlyD  23.96 
 
 		 395 aa  52.8  0.000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0432629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1189  secretion protein HlyD  20.43 
 
 		 323 aa  53.1  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.315896  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1532  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.18 
 
 		 415 aa  53.1  0.000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3930  multidrug resistance protein A  24.88 
 
 		 394 aa  52.8  0.000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.725166 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3253  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.89 
 
 		 496 aa  52.8  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0696  secretion protein HlyD family protein  22.25 
 
 		 353 aa  52.8  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.24713 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2617  secretion protein HlyD  23.77 
 
 		 385 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000106145  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44200  multidrug efflux pump membrane fusion protein  22.4 
 
 		 377 aa  52  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.2451  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1863  RND family efflux transporter MFP subunit  25.71 
 
 		 393 aa  52  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1868  secretion protein HlyD  23.48 
 
 		 405 aa  52.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3522  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.14 
 
 		 421 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1431  secretion protein HlyD  26.72 
 
 		 361 aa  51.6  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2249  secretion protein HlyD  26.28 
 
 		 399 aa  51.6  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0210413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1398  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.57 
 
 		 504 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.463842 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>