186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_0100 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_0102  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 		 361 aa  724    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0100  hypothetical protein  100 
 
 		 361 aa  724    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1295  secretion protein HlyD family protein  58.84 
 
 		 361 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1503  secretion protein HlyD  54.7 
 
 		 395 aa  382  1e-105  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.289067  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4423  secretion protein HlyD family protein  50.7 
 
 		 361 aa  342  4e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.045905  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4556  secretion protein HlyD family protein  50.7 
 
 		 361 aa  342  4e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.241944  normal  0.0605665 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0311  secretion protein HlyD family protein  47.24 
 
 		 361 aa  342  4e-93  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0146421  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5590  secretion protein HlyD family protein  53.2 
 
 		 361 aa  334  2e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.753958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0008  secretion protein HlyD family protein  48.4 
 
 		 363 aa  331  1e-89  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000302217  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0446  membrane protein  51.94 
 
 		 361 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.210333  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0174  MFP family transporter  52.63 
 
 		 361 aa  323  2e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2767  MFP family transporter  53.33 
 
 		 361 aa  323  3e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7009  secretion protein HlyD family protein  49.17 
 
 		 361 aa  323  3e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.159202  normal  0.765528 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0148  membrane protein  53.06 
 
 		 361 aa  322  4e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1319  MFP family transporter  53.06 
 
 		 361 aa  322  4e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2624  MFP family transporter  53.06 
 
 		 361 aa  322  4e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1032  ABC-type export system, membrane fusion protein  53.06 
 
 		 361 aa  322  5e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5888  secretion protein HlyD family protein  50.83 
 
 		 361 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.998521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1224  secretion protein HlyD  51.39 
 
 		 362 aa  317  3e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.343602  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0471  secretion protein HlyD family protein  32.65 
 
 		 414 aa  152  1e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1810  hypothetical protein  30.68 
 
 		 326 aa  114  3e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.516711  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1115  secretion protein HlyD family protein  30.07 
 
 		 347 aa  109  6e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.719605  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0165  secretion protein HlyD family protein  28.61 
 
 		 411 aa  100  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2112  secretion protein HlyD family protein  28.19 
 
 		 372 aa  92.8  9e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  unclonable  0.0000000135214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0963  hypothetical protein  27.51 
 
 		 307 aa  85.9  9e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1628  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.41 
 
 		 383 aa  84  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3085  secretion protein HlyD family protein  26.55 
 
 		 353 aa  82  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.22636  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1396  secretion protein HlyD family protein  25.98 
 
 		 310 aa  80.1  0.00000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0504775  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0696  secretion protein HlyD family protein  25.14 
 
 		 353 aa  63.2  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.24713 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4021  secretion protein HlyD  22.76 
 
 		 345 aa  61.2  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2949  RND family efflux transporter MFP subunit  24.21 
 
 		 376 aa  60.1  0.00000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1204  secretion protein HlyD  38.3 
 
 		 395 aa  58.2  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.377097  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0259  secretion protein HlyD  24.32 
 
 		 327 aa  58.2  0.0000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.689376  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.74 
 
 		 377 aa  57.4  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.69897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1189  secretion protein HlyD  27.08 
 
 		 323 aa  57.4  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.315896  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2904  secretion protein HlyD family protein  22.31 
 
 		 329 aa  56.6  0.0000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.839486  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3131  secretion protein HlyD  27.78 
 
 		 344 aa  55.8  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0978227  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1398  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.15 
 
 		 504 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1902  secretion protein HlyD  25.4 
 
 		 395 aa  54.7  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0432629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2777  secretion protein HlyD family protein  27.08 
 
 		 323 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.991626  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1863  RND family efflux transporter MFP subunit  29.22 
 
 		 393 aa  55.1  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2682  secretion protein HlyD family protein  27.08 
 
 		 323 aa  54.7  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430212  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1532  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.91 
 
 		 415 aa  53.9  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2492  RND family efflux transporter subunit MFP  29.34 
 
 		 437 aa  53.9  0.000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.311613  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2825  RND family efflux transporter subunit MFP  22.56 
 
 		 500 aa  53.1  0.000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.708608  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8250  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.3 
 
 		 368 aa  53.1  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.673804  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0563  secretion protein HlyD  26.24 
 
 		 456 aa  53.1  0.000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1586  secretion protein HlyD family protein  25.39 
 
 		 328 aa  53.1  0.000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.125031  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0573  macrolide secretion protein MacA  26.24 
 
 		 455 aa  52.8  0.00001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.00000000000123833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3839  secretion protein HlyD  27.09 
 
 		 439 aa  52.4  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1480  secretion protein HlyD family protein  22.68 
 
 		 349 aa  52.8  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.785095  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2249  secretion protein HlyD  25.09 
 
 		 399 aa  52  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0210413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2355  secretion protein HlyD  28.51 
 
 		 509 aa  52  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0694634 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4521  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.14 
 
 		 379 aa  50.8  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2900  hypothetical protein  24.91 
 
 		 328 aa  51.2  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.441654  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2812  hypothetical protein  24.91 
 
 		 328 aa  51.2  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.659594  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07032  hypothetical protein  25 
 
 		 349 aa  50.8  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0129  hypothetical protein  29.03 
 
 		 344 aa  50.8  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.993938  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2016  secretion protein HlyD family protein  32.11 
 
 		 517 aa  50.4  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2100  secretion protein HlyD family protein  27.22 
 
 		 351 aa  50.8  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.528355 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2225  secretion protein HlyD family protein  27.22 
 
 		 351 aa  50.4  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.670197 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1874  secretion protein HlyD family protein  27.22 
 
 		 351 aa  50.4  0.00005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.982887 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3801  ABC exporter membrane fusion protein, DevB family  26.21 
 
 		 438 aa  50.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1283  secretion protein HlyD  30.24 
 
 		 475 aa  50.1  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.277079  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6548  secretion protein HlyD family protein  30.24 
 
 		 475 aa  50.1  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6154  secretion protein HlyD family protein  30.24 
 
 		 470 aa  50.1  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.18096 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1833  RND family efflux transporter MFP subunit  27.78 
 
 		 464 aa  50.1  0.00006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.36059  unclonable  0.000000000906287 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3752  ABC exporter membrane fusion protein, DevB family  28.79 
 
 		 438 aa  50.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2360  secretion protein HlyD family protein  29.73 
 
 		 344 aa  49.3  0.00009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2026  secretion protein HlyD family protein  27.18 
 
 		 401 aa  48.9  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.705126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1830  secretion protein HlyD  28.05 
 
 		 449 aa  49.3  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1286  hypothetical protein  27.35 
 
 		 331 aa  48.9  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6274  secretion protein HlyD family protein  31.37 
 
 		 460 aa  48.5  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0399198 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0146  auxiliary membrane fusion protein family transporter  26.98 
 
 		 326 aa  48.1  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000237701  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1357  multidrug efflux pump (emrA)  26.59 
 
 		 467 aa  48.9  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0943753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4736  secretion protein HlyD  23.56 
 
 		 510 aa  48.1  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.325985  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3037  secretion protein HlyD  28.15 
 
 		 344 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.714598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2843  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.05 
 
 		 496 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6560  secretion protein HlyD family protein  31.37 
 
 		 460 aa  48.1  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.21193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2304  RND family efflux transporter MFP subunit  29.78 
 
 		 396 aa  48.1  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1080  MacA  29.25 
 
 		 394 aa  48.5  0.0002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2054  periplasmic component of efflux system  26.98 
 
 		 332 aa  48.5  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5537  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.17 
 
 		 375 aa  47.8  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.728308  normal  0.481729 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0119  secretion protein HlyD family protein  32.28 
 
 		 287 aa  47.8  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.940377  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1921  RND family efflux transporter MFP subunit  32 
 
 		 340 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00271277  normal  0.413551 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2858  secretion protein HlyD  23.81 
 
 		 517 aa  47.4  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3000  hypothetical protein  29.12 
 
 		 337 aa  47.4  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3253  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.58 
 
 		 496 aa  47.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4645  HlyD family secretion protein  28.16 
 
 		 404 aa  47  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.109619  normal  0.493066 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003056  multidrug resistance efflux pump  26.32 
 
 		 354 aa  47  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1950  secretion protein HlyD family protein  23.68 
 
 		 360 aa  47  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1748  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.37 
 
 		 388 aa  46.6  0.0006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1575  RND membrane fusion protein AcrA  26.01 
 
 		 448 aa  47  0.0006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.853878 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0659  secretion protein HlyD  23.78 
 
 		 335 aa  47  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0195539 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3484  secretion protein HlyD  27.17 
 
 		 354 aa  46.6  0.0006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.956784  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0468  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25 
 
 		 445 aa  46.6  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2737  drug resistance MFS transporter, membrane fusion protein (MFP) subunit EmrK  26.03 
 
 		 387 aa  46.6  0.0007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.778541  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1440  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.21 
 
 		 374 aa  46.6  0.0008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.266014  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4233  secretion protein HlyD family protein  32.77 
 
 		 287 aa  46.2  0.0008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1117  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.61 
 
 		 376 aa  46.2  0.0008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0140148  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>