More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_2082 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_2082  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 
416 aa  833    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4678  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.27 
 
 
442 aa  184  3e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00314415  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2455  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.79 
 
 
391 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.035635  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2062  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.34 
 
 
419 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0208015  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1477  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.06 
 
 
396 aa  119  7e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.153552  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2322  secretion protein HlyD  25.46 
 
 
399 aa  113  7.000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000756014  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2872  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.59 
 
 
387 aa  112  9e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1943  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.94 
 
 
450 aa  112  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1916  RND family efflux transporter MFP subunit  24.65 
 
 
401 aa  107  3e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1762  RND family efflux transporter MFP subunit  26.26 
 
 
421 aa  103  4e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0464275  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1713  multidrug resistance efflux pump-like protein  24.73 
 
 
392 aa  103  6e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.254154  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1011  RND family efflux transporter MFP subunit  23.02 
 
 
402 aa  103  8e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1477  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.08 
 
 
390 aa  99.4  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1573  RND family efflux transporter MFP subunit  32.2 
 
 
399 aa  98.6  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2586  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.82 
 
 
388 aa  97.1  6e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000121955  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2928  RND family efflux transporter MFP subunit  24.55 
 
 
431 aa  95.1  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00603978  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4150  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.1 
 
 
397 aa  91.3  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00923789  hitchhiker  0.000000297953 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1938  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.12 
 
 
462 aa  90.9  4e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000755017  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1210  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.68 
 
 
389 aa  90.5  4e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00968103 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0468  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.86 
 
 
445 aa  90.1  6e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1571  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.38 
 
 
435 aa  90.1  7e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.334008  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2658  secretion protein HlyD  28.14 
 
 
393 aa  89.4  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.253454  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1550  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.12 
 
 
413 aa  89  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0505882  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1385  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.8 
 
 
380 aa  89.4  1e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0605754  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2959  RND family efflux transporter MFP subunit  29.15 
 
 
393 aa  88.2  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1908  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.28 
 
 
407 aa  88.6  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1702  secretion protein HlyD  25.55 
 
 
398 aa  87.8  3e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.16483  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2100  RND family efflux transporter MFP subunit  24.45 
 
 
379 aa  87.4  4e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0493506  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1054  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.78 
 
 
400 aa  87  5e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.153115  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0218  hypothetical protein  25.63 
 
 
392 aa  85.1  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1581  secretion protein HlyD  27.78 
 
 
396 aa  85.5  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0301644  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2949  RND family efflux transporter MFP subunit  21.89 
 
 
376 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1847  putative efflux transporter  23.19 
 
 
421 aa  85.5  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2456  hypothetical protein  23.9 
 
 
431 aa  84.7  0.000000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1507  RND family efflux transporter MFP subunit  24 
 
 
393 aa  84.3  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.679392  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02540  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.73 
 
 
481 aa  84.7  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0229793  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4266  RND family efflux transporter MFP subunit  23.31 
 
 
407 aa  82.8  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.35 
 
 
377 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.69897  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1830  secretion protein HlyD  20.76 
 
 
449 aa  82  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223746  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5375  HlyD family secretion protein  28.34 
 
 
399 aa  80.9  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.288749  normal  0.0889869 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1267  RND family efflux transporter MFP subunit  22.92 
 
 
355 aa  80.9  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0326  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.72 
 
 
438 aa  80.5  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.856716 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1281  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.6 
 
 
387 aa  80.1  0.00000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000959286  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1147  RND family efflux transporter MFP subunit  24.58 
 
 
395 aa  79  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0505  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.89 
 
 
349 aa  79  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1040  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.04 
 
 
500 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0078  putative secretion protein HlyD  31.77 
 
 
409 aa  78.2  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.36335 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4850  RND family efflux transporter MFP subunit  23.21 
 
 
385 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2370  secretion protein HlyD  25.07 
 
 
405 aa  77.8  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000467489 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3585  RND family efflux transporter MFP subunit  20.9 
 
 
389 aa  77  0.0000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2843  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.9 
 
 
393 aa  76.6  0.0000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2283  RND family efflux transporter MFP subunit  26.1 
 
 
398 aa  76.3  0.0000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.181226  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2069  HlyD family secretion protein  29.41 
 
 
404 aa  76.3  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.473909 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2749  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.9 
 
 
393 aa  76.3  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.130988  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2954  RND family efflux transporter MFP subunit  22.12 
 
 
364 aa  75.9  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000249187  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1101  RND family efflux transporter MFP subunit  23.62 
 
 
414 aa  75.1  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.402678  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3438  putative secretion protein HlyD precursor  22.58 
 
 
399 aa  75.1  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0583205  normal  0.262777 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2304  RND family efflux transporter MFP subunit  22.25 
 
 
396 aa  75.5  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1940  secretion protein HlyD  23.6 
 
 
395 aa  74.7  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.345824  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4226  RND family efflux transporter MFP subunit  22.67 
 
 
426 aa  74.3  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.499264  normal  0.926991 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1001  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.15 
 
 
424 aa  72.8  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00336631 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1419  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23 
 
 
387 aa  72.4  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.267588  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1672  RND family efflux transporter MFP subunit  22.07 
 
 
429 aa  71.6  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5171  secretion protein HlyD  23.32 
 
 
395 aa  72  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.345793  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1123  secretion protein HlyD  23.1 
 
 
401 aa  72  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.18847  normal  0.38508 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0067  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.71 
 
 
453 aa  71.6  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1936  transporter, putative  21.71 
 
 
349 aa  71.6  0.00000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0644  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25 
 
 
425 aa  71.2  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0200148  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0838  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.54 
 
 
432 aa  71.6  0.00000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0307  RND family efflux transporter MFP subunit  21.68 
 
 
413 aa  71.2  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.240103  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1263  efflux transporter  23.1 
 
 
415 aa  70.9  0.00000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.471028  normal  0.778162 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2316  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.26 
 
 
379 aa  70.9  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.144925 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0308  secretion protein HlyD  20.83 
 
 
421 aa  70.9  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.742688 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2117  secretion protein HlyD  22.07 
 
 
428 aa  70.9  0.00000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.893928 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1339  RND family efflux transporter MFP subunit  21.88 
 
 
384 aa  70.9  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.611384  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4163  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.14 
 
 
350 aa  70.1  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000250075  normal  0.807389 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0311  secretion protein HlyD family protein  22.26 
 
 
361 aa  70.1  0.00000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0146421  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1700  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.47 
 
 
346 aa  69.7  0.00000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.116912  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0748  putative PAS/PAC sensor protein  22.25 
 
 
607 aa  70.1  0.00000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2036  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.47 
 
 
346 aa  69.7  0.00000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0261077  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0926  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.62 
 
 
490 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2046  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.85 
 
 
442 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0008  secretion protein HlyD family protein  24.15 
 
 
363 aa  69.3  0.0000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000302217  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0567  RND family efflux transporter MFP subunit  27.05 
 
 
335 aa  68.2  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2204  RND family efflux transporter MFP subunit  24.74 
 
 
411 aa  68.2  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0311908 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05040  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.07 
 
 
509 aa  68.9  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00959096  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0463  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.48 
 
 
414 aa  68.2  0.0000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1178  RND family efflux transporter MFP subunit  23.96 
 
 
390 aa  68.6  0.0000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0300  RND family efflux transporter MFP subunit  30.35 
 
 
407 aa  68.6  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0225  RND family efflux transporter MFP subunit  21.93 
 
 
461 aa  68.2  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.540049  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0582  RND family efflux transporter MFP subunit  27.05 
 
 
335 aa  68.2  0.0000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1759  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.48 
 
 
457 aa  67.8  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4211  RND family efflux transporter MFP subunit  26 
 
 
398 aa  67.8  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.342556  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2000  efflux transporter, RND family, MFP subunit  20.9 
 
 
360 aa  67.8  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.461729  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2367  efflux transporter, RND family, MFP subunit  20.9 
 
 
360 aa  67.8  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2818  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.42 
 
 
349 aa  67.4  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0549  secretion protein HlyD  24.74 
 
 
407 aa  67.4  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0275  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.16 
 
 
381 aa  67  0.0000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0901  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.91 
 
 
351 aa  67  0.0000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.470272  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0270  putative MacA-like membrane transport protein  22.67 
 
 
417 aa  66.6  0.0000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>