More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1916 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_1916  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 		 401 aa  757    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1477  efflux transporter, RND family, MFP subunit  57.84 
 
 		 396 aa  368  1e-101  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.153552  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1573  RND family efflux transporter MFP subunit  54.16 
 
 		 399 aa  300  3e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1011  RND family efflux transporter MFP subunit  45.9 
 
 		 402 aa  298  2e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1702  secretion protein HlyD  45.8 
 
 		 398 aa  279  6e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.16483  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2062  efflux transporter, RND family, MFP subunit  43.26 
 
 		 419 aa  271  2e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0208015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1581  secretion protein HlyD  45.32 
 
 		 396 aa  250  3e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0301644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1054  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.97 
 
 		 400 aa  246  6e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.153115  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1210  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.86 
 
 		 389 aa  243  5e-63  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00968103 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4266  RND family efflux transporter MFP subunit  40.26 
 
 		 407 aa  239  5e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2204  RND family efflux transporter MFP subunit  41.87 
 
 		 411 aa  235  9e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0311908 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1477  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.5 
 
 		 390 aa  235  1.0000000000000001e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1281  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.58 
 
 		 387 aa  229  5e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000959286  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1419  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.63 
 
 		 387 aa  227  3e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.267588  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5375  HlyD family secretion protein  38.34 
 
 		 399 aa  226  4e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.288749  normal  0.0889869 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3438  putative secretion protein HlyD precursor  36.65 
 
 		 399 aa  226  7e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0583205  normal  0.262777 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2304  RND family efflux transporter MFP subunit  38.2 
 
 		 396 aa  223  6e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1507  RND family efflux transporter MFP subunit  37.93 
 
 		 393 aa  220  3.9999999999999997e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.679392  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6250  RND family efflux transporter MFP subunit  39.1 
 
 		 388 aa  218  1e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0326  efflux transporter, RND family, MFP subunit  42.13 
 
 		 438 aa  218  2e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.856716 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2069  HlyD family secretion protein  39.9 
 
 		 404 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.473909 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2283  RND family efflux transporter MFP subunit  38.73 
 
 		 398 aa  213  3.9999999999999995e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.181226  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0218  hypothetical protein  33.94 
 
 		 392 aa  209  7e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4499  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.7 
 
 		 391 aa  207  2e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.345717  normal  0.0635316 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4367  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.7 
 
 		 391 aa  207  2e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.122634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0078  putative secretion protein HlyD  35.86 
 
 		 409 aa  206  5e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.36335 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0064  RND family efflux transporter MFP subunit  41.35 
 
 		 522 aa  204  2e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1940  secretion protein HlyD  34.84 
 
 		 395 aa  204  2e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.345824  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2959  RND family efflux transporter MFP subunit  40.11 
 
 		 393 aa  192  6e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0300  RND family efflux transporter MFP subunit  37.41 
 
 		 407 aa  191  2e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1123  secretion protein HlyD  38.37 
 
 		 401 aa  187  2e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.18847  normal  0.38508 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3585  RND family efflux transporter MFP subunit  35.8 
 
 		 389 aa  177  2e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5171  secretion protein HlyD  37.14 
 
 		 395 aa  170  5e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.345793  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4211  RND family efflux transporter MFP subunit  36.6 
 
 		 398 aa  165  1.0000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.342556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2658  secretion protein HlyD  44.79 
 
 		 393 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.253454  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2843  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.04 
 
 		 393 aa  146  7.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2749  efflux transporter, RND family, MFP subunit  43.75 
 
 		 393 aa  135  9e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.130988  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2082  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.35 
 
 		 416 aa  119  9.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1713  multidrug resistance efflux pump-like protein  27.64 
 
 		 392 aa  103  7e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.254154  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2455  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.17 
 
 		 391 aa  100  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.035635  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1147  RND family efflux transporter MFP subunit  35.2 
 
 		 395 aa  97.4  4e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0549  secretion protein HlyD  28.21 
 
 		 407 aa  90.9  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2949  RND family efflux transporter MFP subunit  24.32 
 
 		 376 aa  90.1  6e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2831  syringolide efflux protein SyfC  26.86 
 
 		 383 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.580145  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1259  RND family efflux transporter MFP subunit  25.68 
 
 		 415 aa  82.8  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1163  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.42 
 
 		 377 aa  82.4  0.00000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00317162  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.1 
 
 		 377 aa  82  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.69897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1617  secretion protein HlyD  27.02 
 
 		 408 aa  82  0.00000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0160623  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4563  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.05 
 
 		 426 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1184  secretion protein HlyD  26.49 
 
 		 396 aa  80.9  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1671  HlyD family secretion protein  26.74 
 
 		 408 aa  80.5  0.00000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0635  macrolide-specific efflux protein macA  20.97 
 
 		 390 aa  80.1  0.00000000000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0167041  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0775  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.47 
 
 		 479 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3461  secretion protein HlyD  29.77 
 
 		 384 aa  78.2  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03344  acriflavin resistance protein  26.26 
 
 		 417 aa  79  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3476  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.16 
 
 		 382 aa  77.8  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1389  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.14 
 
 		 374 aa  77.8  0.0000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000158934  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1857  secretion protein HlyD  26.08 
 
 		 390 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2100  RND family efflux transporter MFP subunit  27.49 
 
 		 379 aa  77.8  0.0000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0493506  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3711  RND family efflux transporter MFP subunit  24.82 
 
 		 383 aa  77.4  0.0000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2872  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.94 
 
 		 387 aa  76.3  0.0000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1908  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.4 
 
 		 407 aa  76.3  0.0000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2617  secretion protein HlyD  25.89 
 
 		 385 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000106145  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2046  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.75 
 
 		 442 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1339  RND family efflux transporter MFP subunit  25.57 
 
 		 384 aa  75.9  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.611384  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1597  macrolide transporter subunit MacA  24.62 
 
 		 370 aa  75.1  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0308  secretion protein HlyD  25.6 
 
 		 421 aa  75.1  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.742688 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2954  RND family efflux transporter MFP subunit  22.25 
 
 		 364 aa  74.7  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000249187  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2696  macrolide transporter subunit MacA  24.62 
 
 		 370 aa  75.1  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.761507  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0916  efflux transporter  27.41 
 
 		 396 aa  74.7  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.987196  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0709  macrolide-specific efflux protein macA  20.92 
 
 		 390 aa  74.7  0.000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0254  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.1 
 
 		 417 aa  74.3  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.513446 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2611  macrolide transporter subunit MacA  24.62 
 
 		 370 aa  74.7  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1298  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.04 
 
 		 410 aa  74.3  0.000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.61066  normal  0.83964 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3533  RND family efflux transporter MFP subunit  26.12 
 
 		 409 aa  73.9  0.000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.722317 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2584  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.39 
 
 		 421 aa  73.9  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3531  secretion protein HlyD  23.72 
 
 		 400 aa  73.9  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1571  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.68 
 
 		 435 aa  73.6  0.000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.334008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1064  macrolide-specific efflux protein macA  20.47 
 
 		 390 aa  73.2  0.000000000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0267322  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3522  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.39 
 
 		 421 aa  73.2  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0225  RND family efflux transporter MFP subunit  27.59 
 
 		 461 aa  72.8  0.000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.540049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1672  RND family efflux transporter MFP subunit  22.03 
 
 		 429 aa  72.8  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2456  hypothetical protein  24.68 
 
 		 431 aa  72.4  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3456  RND family efflux transporter MFP subunit  24.26 
 
 		 409 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000285815  normal  0.0164702 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2603  secretion protein HlyD  25.97 
 
 		 389 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.22725  normal  0.133946 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1047  RND family efflux transporter subunit MFP  25 
 
 		 461 aa  71.6  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0423833  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0725  HlyD family secretion protein  27.17 
 
 		 397 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.897812  normal  0.118835 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2825  RND family efflux transporter subunit MFP  22.53 
 
 		 500 aa  71.2  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.708608  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1456  RND family efflux transporter MFP subunit  26.3 
 
 		 405 aa  71.6  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2042  secretion protein HlyD  24.62 
 
 		 414 aa  70.9  0.00000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.617858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2322  secretion protein HlyD  25.7 
 
 		 399 aa  70.9  0.00000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000756014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2849  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.2 
 
 		 421 aa  70.9  0.00000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0325844 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1550  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.69 
 
 		 413 aa  70.5  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0505882  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2928  RND family efflux transporter MFP subunit  23.16 
 
 		 431 aa  69.7  0.00000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00603978  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5104  RND family efflux transporter MFP subunit  33.71 
 
 		 427 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2837  RND family efflux transporter MFP subunit  26.93 
 
 		 406 aa  69.3  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0025637 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2214  secretion protein HlyD  25.68 
 
 		 382 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1583  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.81 
 
 		 564 aa  68.9  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.936512  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2586  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.3 
 
 		 388 aa  68.9  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000121955  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0768  acriflavin resistance periplasmic protein  21.46 
 
 		 348 aa  68.9  0.0000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.69171  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>