More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_3476 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_3476  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 		 382 aa  746    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3461  secretion protein HlyD  62.17 
 
 		 384 aa  452  1.0000000000000001e-126  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0950  secretion protein HlyD  56.42 
 
 		 384 aa  363  3e-99  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.57805  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3711  RND family efflux transporter MFP subunit  47.06 
 
 		 383 aa  351  1e-95  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2062  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.27 
 
 		 419 aa  110  5e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0208015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1515  RND family efflux transporter MFP subunit  31.71 
 
 		 405 aa  107  3e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1671  HlyD family secretion protein  27.47 
 
 		 408 aa  107  4e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1617  secretion protein HlyD  27.47 
 
 		 408 aa  106  5e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0160623  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3265  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.85 
 
 		 404 aa  104  3e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1161  RND family efflux transporter MFP subunit  32.11 
 
 		 404 aa  103  4e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0203325  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2011  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.32 
 
 		 361 aa  103  5e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03344  acriflavin resistance protein  29.02 
 
 		 417 aa  101  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0986  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.65 
 
 		 405 aa  101  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.831389 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0166  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.85 
 
 		 379 aa  100  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2456  hypothetical protein  27.79 
 
 		 431 aa  100  4e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5132  RND family efflux transporter MFP subunit  31.86 
 
 		 445 aa  99.4  9e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1361  RND efflux membrane protein  33.6 
 
 		 383 aa  98.2  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3531  secretion protein HlyD  29.39 
 
 		 400 aa  98.2  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1791  secretion protein HlyD  31.43 
 
 		 402 aa  97.4  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0795  RND family efflux transporter MFP subunit  27.67 
 
 		 411 aa  97.1  4e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1259  RND family efflux transporter MFP subunit  25.93 
 
 		 415 aa  95.1  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2408  secretion protein HlyD  28.79 
 
 		 404 aa  94.7  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000198894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2519  secretion protein HlyD  27.62 
 
 		 382 aa  95.5  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000015375  normal  0.24357 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1621  secretion protein HlyD  26.36 
 
 		 407 aa  95.1  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0558  secretion protein HlyD  27.3 
 
 		 360 aa  94.4  3e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.177986  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1281  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.82 
 
 		 357 aa  94.4  3e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.036609  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1456  RND family efflux transporter MFP subunit  28.92 
 
 		 405 aa  94.4  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1326  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.91 
 
 		 398 aa  93.6  5e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0997151  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0480  RND family efflux transporter MFP subunit  27.11 
 
 		 363 aa  93.2  6e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0753  secretion protein HlyD  29.21 
 
 		 370 aa  93.2  7e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0285  RND family efflux transporter MFP subunit  33.62 
 
 		 401 aa  92.8  9e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.140483  hitchhiker  0.000000766037 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1965  secretion protein HlyD  27.71 
 
 		 388 aa  90.5  4e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.455875 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0254  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.94 
 
 		 417 aa  90.9  4e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.513446 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1385  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.51 
 
 		 380 aa  90.1  5e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0605754  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2213  secretion protein HlyD  31.01 
 
 		 407 aa  89.4  9e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0223  RND family efflux transporter MFP subunit  31.45 
 
 		 401 aa  89.4  9e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00883  macrolide transporter subunit, membrane fusion protein (MFP) component  26.78 
 
 		 371 aa  89  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2764  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.78 
 
 		 371 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.161658  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1504  RND family efflux transporter MFP subunit  32.9 
 
 		 397 aa  89  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0583737 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2877  secretion protein HlyD  27.17 
 
 		 383 aa  89  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00889  hypothetical protein  26.78 
 
 		 371 aa  89  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0231  RND family efflux transporter MFP subunit  31.45 
 
 		 401 aa  89.4  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000683509 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0951  macrolide transporter subunit MacA  26.78 
 
 		 371 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0557503  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2718  macrolide transporter subunit MacA  26.78 
 
 		 371 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2374  RND family efflux transporter MFP subunit  28.57 
 
 		 395 aa  88.2  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.347836 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1916  RND family efflux transporter MFP subunit  32.71 
 
 		 401 aa  88.2  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2954  RND family efflux transporter MFP subunit  28.38 
 
 		 364 aa  88.6  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000249187  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5856  secretion protein HlyD  30 
 
 		 425 aa  88.2  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.249167  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1039  macrolide transporter subunit MacA  26.78 
 
 		 371 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.184306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2451  macrolide transporter subunit MacA  26.78 
 
 		 371 aa  88.6  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00913289  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1695  secretion protein HlyD  25.97 
 
 		 360 aa  88.6  2e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0982  macrolide transporter subunit MacA  26.78 
 
 		 371 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.44834  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2802  secretion protein HlyD  34.04 
 
 		 401 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0304  RND family efflux transporter MFP subunit  34.04 
 
 		 401 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0944915  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1925  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.8 
 
 		 396 aa  88.2  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.588537  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2665  RND family efflux transporter MFP subunit  27.04 
 
 		 386 aa  87.8  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3403  HlyD family secretion protein  30.61 
 
 		 401 aa  87.8  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00376035  normal  0.420161 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0207  RND family efflux transporter MFP subunit  33.62 
 
 		 400 aa  87.8  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000100142 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3834  RND family efflux transporter MFP subunit  29.54 
 
 		 383 aa  87.8  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3851  RND family efflux transporter MFP subunit  29.54 
 
 		 383 aa  87.8  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1919  RND family efflux transporter MFP subunit  29.54 
 
 		 383 aa  87.8  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0631  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.82 
 
 		 432 aa  87.4  4e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.137352 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1440  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.4 
 
 		 374 aa  87.4  4e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.266014  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3712  RND family efflux transporter MFP subunit  29.68 
 
 		 450 aa  87.4  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.40893 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2520  RND family efflux transporter MFP subunit  30.53 
 
 		 406 aa  87.4  4e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2282  macrolide transporter subunit MacA  26.78 
 
 		 371 aa  87  5e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000339116  normal  0.0134871 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1685  RND family efflux transporter MFP subunit  25.64 
 
 		 387 aa  87  5e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3650  secretion protein HlyD  26.76 
 
 		 397 aa  87  5e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.521212 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4005  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.87 
 
 		 387 aa  87  5e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2685  RND family efflux transporter MFP subunit  29.27 
 
 		 383 aa  87  6e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.133522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2938  RND family efflux transporter MFP subunit  29.06 
 
 		 444 aa  86.7  6e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1298  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.72 
 
 		 410 aa  86.7  7e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.61066  normal  0.83964 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0145  RND family efflux transporter MFP subunit  29.67 
 
 		 383 aa  86.7  7e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0200  secretion protein HlyD  27.19 
 
 		 365 aa  85.5  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0768  acriflavin resistance periplasmic protein  24.23 
 
 		 348 aa  85.9  0.000000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.69171  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1251  RND family efflux transporter MFP subunit  29.27 
 
 		 383 aa  85.5  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0652431  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2837  RND family efflux transporter MFP subunit  28.85 
 
 		 406 aa  85.1  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0025637 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0321  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.01 
 
 		 386 aa  85.1  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1666  RND family efflux transporter MFP subunit  25.66 
 
 		 418 aa  85.1  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0913  hypothetical protein  25.63 
 
 		 338 aa  84.3  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0882  hypothetical protein  25.42 
 
 		 338 aa  84.7  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1857  secretion protein HlyD  25.06 
 
 		 390 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1011  RND family efflux transporter MFP subunit  28.12 
 
 		 402 aa  84.7  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0764  RND family efflux transporter MFP subunit  25.33 
 
 		 385 aa  84.3  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3595  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.87 
 
 		 404 aa  84  0.000000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0852698  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08701  membrane fusion protein  26.54 
 
 		 392 aa  84  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1045  RND family efflux transporter MFP subunit  29.74 
 
 		 397 aa  84  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2928  RND family efflux transporter MFP subunit  28.14 
 
 		 431 aa  83.6  0.000000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00603978  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0694  secretion protein HlyD  30.56 
 
 		 417 aa  83.6  0.000000000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.459164  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1059  macrolide transporter subunit MacA  26.61 
 
 		 372 aa  83.6  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.75011  normal  0.992508 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0942  macrolide transporter subunit MacA  27.42 
 
 		 372 aa  83.2  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1039  macrolide transporter subunit MacA  27.42 
 
 		 372 aa  83.2  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.303516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2871  hypothetical protein  24.68 
 
 		 391 aa  83.2  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.518674  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1636  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.91 
 
 		 383 aa  82.8  0.000000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.372421  normal  0.934491 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1983  RND family efflux transporter MFP subunit  29.47 
 
 		 416 aa  82.8  0.000000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1007  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.8 
 
 		 398 aa  82.8  0.000000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2777  RND family efflux transporter MFP subunit  27.36 
 
 		 489 aa  82.8  0.000000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000975793  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0976  macrolide transporter subunit MacA  27.42 
 
 		 372 aa  82.8  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1477  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.2 
 
 		 390 aa  82.8  0.000000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1184  secretion protein HlyD  29.6 
 
 		 396 aa  82.8  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>