More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0166 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_0166  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 		 379 aa  743    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0816  RND family efflux transporter MFP subunit  70.05 
 
 		 385 aa  501  1e-141  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2665  RND family efflux transporter MFP subunit  67.67 
 
 		 386 aa  478  1e-134  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2519  secretion protein HlyD  66.76 
 
 		 382 aa  474  1e-132  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000015375  normal  0.24357 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4005  efflux transporter, RND family, MFP subunit  58.54 
 
 		 387 aa  422  1e-117  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0764  RND family efflux transporter MFP subunit  40.57 
 
 		 385 aa  247  3e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1636  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.1 
 
 		 383 aa  141  1.9999999999999998e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.372421  normal  0.934491 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4150  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.61 
 
 		 397 aa  133  6e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00923789  hitchhiker  0.000000297953 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3467  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.92 
 
 		 376 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00013135  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0161  RND family efflux transporter MFP subunit  34.46 
 
 		 380 aa  130  6e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0753  secretion protein HlyD  30.66 
 
 		 370 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.87 
 
 		 377 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.69897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2275  RND family efflux transporter MFP subunit  27.84 
 
 		 354 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0060878  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1621  secretion protein HlyD  28.85 
 
 		 407 aa  120  4.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1421  HlyD family secretion protein  25.89 
 
 		 354 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0100677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0225  secretion protein HlyD  32.03 
 
 		 380 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.34961  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0396  RND family efflux transporter MFP subunit  30.52 
 
 		 413 aa  117  3e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2949  RND family efflux transporter MFP subunit  28.03 
 
 		 376 aa  117  3e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1385  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.94 
 
 		 380 aa  117  3e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0605754  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001980  probable RND efflux membrane fusion protein  25.52 
 
 		 367 aa  117  3e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.979341  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0962  secretion protein HlyD  30.16 
 
 		 405 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.255558  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1704  RND family efflux transporter MFP subunit  27.79 
 
 		 354 aa  116  7.999999999999999e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3707  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.12 
 
 		 354 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0429  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.52 
 
 		 413 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1879  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.81 
 
 		 363 aa  114  3e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0247  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.96 
 
 		 380 aa  114  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1554  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.81 
 
 		 363 aa  114  3e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0484603  hitchhiker  0.00000015248 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01077  HlyD family secretion protein  26.08 
 
 		 376 aa  114  4.0000000000000004e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2700  secretion protein HlyD  28.49 
 
 		 403 aa  113  5e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1349  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.35 
 
 		 409 aa  112  8.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0580213 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2781  RND family efflux transporter MFP subunit  28.72 
 
 		 372 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00032103  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1649  RND family efflux transporter MFP subunit  27.47 
 
 		 354 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.499517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1119  RND family efflux transporter MFP subunit  28.46 
 
 		 369 aa  112  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000371819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3855  RND family efflux transporter MFP subunit  28.41 
 
 		 438 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.336679  normal  0.260987 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1650  secretion protein HlyD  26.78 
 
 		 397 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5381  RND family efflux transporter MFP subunit  29.71 
 
 		 364 aa  111  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.996751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4164  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.41 
 
 		 438 aa  111  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.444201  normal  0.22934 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5104  RND family efflux transporter MFP subunit  31.4 
 
 		 427 aa  111  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2100  RND family efflux transporter MFP subunit  28.93 
 
 		 379 aa  110  3e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0493506  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4314  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.7 
 
 		 438 aa  111  3e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.544766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4226  RND family efflux transporter MFP subunit  29.89 
 
 		 426 aa  110  5e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.499264  normal  0.926991 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2514  RND family efflux transporter MFP subunit  28.88 
 
 		 354 aa  110  5e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000208657  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1629  RND family efflux transporter MFP subunit  27.22 
 
 		 358 aa  110  5e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.185382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1704  RND family efflux transporter MFP subunit  27.22 
 
 		 358 aa  110  5e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.271919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1439  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.36 
 
 		 380 aa  109  6e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0465471  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2634  RND family efflux transporter MFP subunit  29.16 
 
 		 354 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.182724  normal  0.987528 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1830  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.88 
 
 		 354 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000238284  normal  0.23398 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2521  RND family efflux transporter MFP subunit  28.88 
 
 		 354 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.199325  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1815  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.41 
 
 		 388 aa  109  8.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.100454  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2237  secretion protein HlyD  28.41 
 
 		 377 aa  109  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2808  membrane fusion protein; cation efflux system protein  25.67 
 
 		 353 aa  109  9.000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3475  secretion protein HlyD-like protein  25.32 
 
 		 373 aa  108  1e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.555415 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1925  HlyD family secretion protein  27.25 
 
 		 354 aa  109  1e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00481  hypothetical protein  24.16 
 
 		 368 aa  108  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2738  putative RND efflux membrane fusion protein  26.8 
 
 		 371 aa  109  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.254191  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3233  RND family efflux transporter MFP subunit  28.87 
 
 		 405 aa  108  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000196171  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1921  RND family efflux transporter MFP subunit  28.25 
 
 		 340 aa  107  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00271277  normal  0.413551 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1830  RND family efflux transporter MFP subunit  27.42 
 
 		 359 aa  107  3e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.495597  normal  0.102007 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2492  RND family efflux transporter subunit MFP  27.85 
 
 		 437 aa  107  3e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.311613  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2381  RND family efflux transporter MFP subunit  26.95 
 
 		 357 aa  107  4e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2284  secretion protein HlyD  28.21 
 
 		 403 aa  106  5e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.831641  normal  0.154042 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3463  HlyD family secretion protein  26.97 
 
 		 378 aa  107  5e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2229  RND family efflux transporter MFP subunit  25.55 
 
 		 405 aa  107  5e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2243  RND family efflux transporter MFP subunit  27.27 
 
 		 376 aa  106  6e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1666  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.08 
 
 		 396 aa  106  7e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0854593  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2374  RND family efflux transporter MFP subunit  27.38 
 
 		 395 aa  105  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.347836 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0465  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.23 
 
 		 413 aa  105  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.254107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1023  RND family efflux transporter MFP subunit  28.03 
 
 		 378 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.866452  normal  0.121232 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1781  RND family efflux transporter MFP subunit  27.72 
 
 		 368 aa  105  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.253325  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3700  secretion protein HlyD  28.29 
 
 		 381 aa  105  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2192  secretion protein HlyD  28.16 
 
 		 352 aa  105  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0308  secretion protein HlyD  26.57 
 
 		 421 aa  105  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.742688 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0428  RND family efflux transporter MFP subunit  31.21 
 
 		 408 aa  105  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0182364 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1389  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.59 
 
 		 374 aa  105  2e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000158934  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2553  hypothetical protein  24.42 
 
 		 368 aa  104  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000355433  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3595  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.52 
 
 		 404 aa  105  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0852698  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4033  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.08 
 
 		 396 aa  104  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2820  RND family efflux transporter MFP subunit  27.59 
 
 		 363 aa  104  3e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0120499  normal  0.368522 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3461  secretion protein HlyD  27.24 
 
 		 384 aa  104  3e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1204  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.4 
 
 		 471 aa  104  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0307  RND family efflux transporter MFP subunit  29.58 
 
 		 413 aa  103  4e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0899354  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3883  secretion protein HlyD  28.57 
 
 		 424 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.135938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2282  secretion protein HlyD  27.22 
 
 		 467 aa  103  4e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0236  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.82 
 
 		 379 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.94922  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2011  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.43 
 
 		 361 aa  103  4e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1839  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.45 
 
 		 420 aa  103  5e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1814  RND family efflux transporter MFP subunit  30.08 
 
 		 432 aa  103  7e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2952  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.65 
 
 		 374 aa  102  8e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2203  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.37 
 
 		 419 aa  102  9e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0539  RND family efflux transporter MFP subunit  25.8 
 
 		 350 aa  102  1e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2777  RND family efflux transporter MFP subunit  27.86 
 
 		 489 aa  102  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000975793  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3826  RND family efflux transporter MFP subunit  30.14 
 
 		 385 aa  102  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2041  secretion protein HlyD  26.5 
 
 		 398 aa  101  2e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2024  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.83 
 
 		 419 aa  101  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000305818 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0460  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.98 
 
 		 380 aa  100  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0767  RND family efflux transporter MFP subunit  28.53 
 
 		 372 aa  100  4e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00075698  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1672  RND family efflux transporter MFP subunit  25.72 
 
 		 429 aa  100  5e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3808  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.22 
 
 		 398 aa  99.8  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0283024  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2360  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.11 
 
 		 380 aa  99.4  8e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.347608  normal  0.0362221 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0782  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.16 
 
 		 428 aa  99.4  9e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00204407  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>