More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2685 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_1919  RND family efflux transporter MFP subunit  97.65 
 
 		 383 aa  712    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2685  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 		 383 aa  756    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.133522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3851  RND family efflux transporter MFP subunit  97.65 
 
 		 383 aa  712    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3834  RND family efflux transporter MFP subunit  97.65 
 
 		 383 aa  712    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1251  RND family efflux transporter MFP subunit  97.65 
 
 		 383 aa  711    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0652431  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1361  RND efflux membrane protein  76.5 
 
 		 383 aa  583  1.0000000000000001e-165  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0145  RND family efflux transporter MFP subunit  69.71 
 
 		 383 aa  522  1e-147  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1685  efflux transporter, RND family, MFP subunit  69.11 
 
 		 383 aa  486  1e-136  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1834  RND family efflux transporter MFP subunit  69.11 
 
 		 383 aa  483  1e-135  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.41663  normal  0.322468 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2877  secretion protein HlyD  63.76 
 
 		 383 aa  471  1e-132  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1916  efflux transporter, RND family, MFP subunit  62.01 
 
 		 384 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1046  efflux transporter, RND family, MFP subunit  59.79 
 
 		 378 aa  422  1e-117  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0357289  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1045  RND family efflux transporter MFP subunit  56.71 
 
 		 397 aa  412  1e-114  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0871  secretion protein HlyD  51.94 
 
 		 406 aa  381  1e-104  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.75327  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1925  efflux transporter, RND family, MFP subunit  53.16 
 
 		 396 aa  368  1e-100  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.588537  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1326  efflux transporter, RND family, MFP subunit  51.5 
 
 		 398 aa  349  5e-95  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0997151  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1241  RND family efflux transporter MFP subunit  50.14 
 
 		 398 aa  339  4e-92  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2837  RND family efflux transporter MFP subunit  48.51 
 
 		 406 aa  323  3e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0025637 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1184  secretion protein HlyD  49.08 
 
 		 396 aa  313  3.9999999999999997e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3253  RND family efflux transporter MFP subunit  51.47 
 
 		 397 aa  308  1.0000000000000001e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1673  secretion protein HlyD  45.43 
 
 		 396 aa  300  2e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.801945 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3623  secretion protein HlyD  46.59 
 
 		 398 aa  272  7e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0728465  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3408  RND family efflux transporter MFP subunit  31.13 
 
 		 389 aa  157  3e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0128497  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0830  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.68 
 
 		 390 aa  155  9e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3711  RND family efflux transporter MFP subunit  30.11 
 
 		 389 aa  152  8e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0949  RND family efflux transporter MFP subunit  32.06 
 
 		 390 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0225  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.4 
 
 		 347 aa  145  9e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.175978  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3303  RND family efflux transporter MFP subunit  32.82 
 
 		 418 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.3496  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1281  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.27 
 
 		 357 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.036609  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3301  RND family efflux transporter MFP subunit  30.91 
 
 		 381 aa  110  5e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.446472 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0382  RND family efflux transporter MFP subunit  28.8 
 
 		 396 aa  108  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.410142  normal  0.745706 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1362  secretion protein HlyD  27.48 
 
 		 381 aa  103  7e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.27807  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25 
 
 		 377 aa  99.4  9e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.69897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1695  secretion protein HlyD  27.79 
 
 		 360 aa  98.6  2e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1921  RND family efflux transporter MFP subunit  28.65 
 
 		 340 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00271277  normal  0.413551 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3461  secretion protein HlyD  28.69 
 
 		 384 aa  97.4  4e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0431  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.04 
 
 		 368 aa  95.5  1e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3467  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.63 
 
 		 376 aa  94.4  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00013135  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2370  secretion protein HlyD  27.48 
 
 		 405 aa  94.4  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000467489 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1462  RND family efflux transporter MFP subunit  28.83 
 
 		 418 aa  92  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3711  RND family efflux transporter MFP subunit  28.37 
 
 		 383 aa  91.7  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0225  secretion protein HlyD  29.43 
 
 		 380 aa  90.5  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.34961  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0950  secretion protein HlyD  28.3 
 
 		 384 aa  90.5  5e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.57805  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01979  multidrug efflux system, subunit A  28.93 
 
 		 415 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01971  hypothetical protein  28.93 
 
 		 415 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2366  multidrug efflux system subunit MdtA  28.93 
 
 		 415 aa  87.8  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3894  RND efflux membrane fusion protein precursor  28.87 
 
 		 385 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0247  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.97 
 
 		 380 aa  87.8  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1567  multidrug efflux system subunit MdtA  28.93 
 
 		 455 aa  87.4  4e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.331208 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1582  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.93 
 
 		 415 aa  87  5e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0117238  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2216  multidrug efflux system subunit MdtA  28.93 
 
 		 415 aa  87  5e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3014  multidrug efflux system subunit MdtA  28.65 
 
 		 415 aa  86.7  6e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.105913 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1159  multidrug efflux system subunit MdtA  28.65 
 
 		 415 aa  86.7  6e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0487  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.76 
 
 		 360 aa  86.7  7e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14330  Secretion protein HlyD family  27.84 
 
 		 401 aa  85.5  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.774042  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0986  multidrug efflux system subunit MdtA  28.93 
 
 		 415 aa  85.9  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.607592 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1617  secretion protein HlyD  26.22 
 
 		 408 aa  84.7  0.000000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0160623  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3169  RND family efflux transporter MFP subunit  26.45 
 
 		 369 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000222351  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2372  secretion protein HlyD  27.84 
 
 		 392 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.753301 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3170  RND family efflux transporter MFP subunit  26.45 
 
 		 369 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000721535  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2010  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.01 
 
 		 412 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.2279  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0078  putative secretion protein HlyD  25.91 
 
 		 409 aa  84.3  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.36335 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1234  RND family efflux transporter MFP subunit  27.46 
 
 		 359 aa  84  0.000000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.580475  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2786  RND family efflux transporter MFP subunit  25.07 
 
 		 372 aa  84  0.000000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000125206  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2214  putative component of multidrug efflux system  27.18 
 
 		 368 aa  83.6  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.082194  normal  0.474627 
 
 
-
 
NC_004310  BR1671  HlyD family secretion protein  26.22 
 
 		 408 aa  83.2  0.000000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004022  membrane-fusion protein  24 
 
 		 369 aa  83.2  0.000000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000160707  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45910  putative RND efflux membrane fusion protein precursor  27.38 
 
 		 385 aa  83.6  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.170535  normal  0.980017 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4209  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.94 
 
 		 392 aa  83.2  0.000000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.122721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3313  RND family efflux transporter MFP subunit  25.65 
 
 		 369 aa  83.2  0.000000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000984298  normal  0.15916 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1201  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.65 
 
 		 369 aa  83.2  0.000000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000118856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0467  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.58 
 
 		 360 aa  82.4  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1715  putative cation efflux system transmembrane protein  27.19 
 
 		 500 aa  82.8  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0232855  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2520  RND family efflux transporter MFP subunit  26.61 
 
 		 406 aa  81.6  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3361  RND efflux system membrane fusion protein  28.89 
 
 		 395 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0631452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2171  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.39 
 
 		 357 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.434682  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01960  putative RND efflux membrane fusion protein precursor  27.92 
 
 		 356 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.496395 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2100  RND family efflux transporter MFP subunit  28.36 
 
 		 379 aa  80.9  0.00000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0493506  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3689  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.84 
 
 		 414 aa  81.3  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6327  RND family efflux transporter MFP subunit  25.48 
 
 		 478 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0452278  normal  0.980568 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3781  RND family efflux transporter MFP subunit  28.75 
 
 		 407 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1502  secretion protein HlyD  25.48 
 
 		 478 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.184777  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0539  RND family efflux transporter MFP subunit  26.11 
 
 		 350 aa  80.5  0.00000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4297  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.11 
 
 		 397 aa  80.5  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.430357  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0200  secretion protein HlyD  25.3 
 
 		 365 aa  80.5  0.00000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2684  multidrug efflux system subunit MdtA  27.25 
 
 		 411 aa  80.5  0.00000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6991  RND family efflux transporter MFP subunit  25.48 
 
 		 472 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.231557 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0078  hypothetical protein  27.22 
 
 		 381 aa  80.1  0.00000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3476  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.95 
 
 		 382 aa  80.1  0.00000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2040  RND family mulitdrug efflux protein  27.93 
 
 		 358 aa  80.1  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.428821  normal  0.886334 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2220  RND family efflux transporter MFP subunit  25.45 
 
 		 399 aa  80.1  0.00000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0288  RND family efflux transporter MFP subunit  29.47 
 
 		 355 aa  79.7  0.00000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.527133 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1685  RND family efflux transporter MFP subunit  28.14 
 
 		 387 aa  79.7  0.00000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2663  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.17 
 
 		 352 aa  79.7  0.00000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3523  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.36 
 
 		 438 aa  79.7  0.00000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.51854  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2552  secretion protein HlyD  25.08 
 
 		 451 aa  79.7  0.00000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.603084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1863  RND family efflux transporter MFP subunit  25.07 
 
 		 393 aa  79.3  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3235  secretion protein HlyD  23.4 
 
 		 391 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.185962  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3561  secretion protein HlyD  28.44 
 
 		 413 aa  79  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.398677 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2097  RND family efflux transporter MFP subunit  27.96 
 
 		 391 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.902105  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>