More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1241 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1241  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 		 398 aa  792    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1326  efflux transporter, RND family, MFP subunit  72.86 
 
 		 398 aa  533  1e-150  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0997151  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0871  secretion protein HlyD  59.74 
 
 		 406 aa  450  1e-125  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.75327  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1045  RND family efflux transporter MFP subunit  53.73 
 
 		 397 aa  376  1e-103  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1361  RND efflux membrane protein  52.04 
 
 		 383 aa  378  1e-103  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3834  RND family efflux transporter MFP subunit  51.28 
 
 		 383 aa  365  1e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3851  RND family efflux transporter MFP subunit  51.28 
 
 		 383 aa  365  1e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1919  RND family efflux transporter MFP subunit  51.28 
 
 		 383 aa  365  1e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2877  secretion protein HlyD  50.9 
 
 		 383 aa  364  2e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1251  RND family efflux transporter MFP subunit  50.51 
 
 		 383 aa  358  9.999999999999999e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0652431  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1685  efflux transporter, RND family, MFP subunit  51.41 
 
 		 383 aa  356  3.9999999999999996e-97  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2685  RND family efflux transporter MFP subunit  50.26 
 
 		 383 aa  356  3.9999999999999996e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.133522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1834  RND family efflux transporter MFP subunit  51.41 
 
 		 383 aa  354  1e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.41663  normal  0.322468 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1916  efflux transporter, RND family, MFP subunit  49.36 
 
 		 384 aa  348  1e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1046  efflux transporter, RND family, MFP subunit  50.96 
 
 		 378 aa  335  1e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0357289  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0145  RND family efflux transporter MFP subunit  47.81 
 
 		 383 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2837  RND family efflux transporter MFP subunit  45.01 
 
 		 406 aa  315  9.999999999999999e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0025637 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1184  secretion protein HlyD  44.25 
 
 		 396 aa  313  2.9999999999999996e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1925  efflux transporter, RND family, MFP subunit  48.19 
 
 		 396 aa  303  5.000000000000001e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.588537  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3253  RND family efflux transporter MFP subunit  46.03 
 
 		 397 aa  261  1e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3623  secretion protein HlyD  43.41 
 
 		 398 aa  261  2e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0728465  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1673  secretion protein HlyD  40.1 
 
 		 396 aa  256  7e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.801945 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0830  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.65 
 
 		 390 aa  150  5e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3408  RND family efflux transporter MFP subunit  30.31 
 
 		 389 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0128497  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0949  RND family efflux transporter MFP subunit  31.23 
 
 		 390 aa  146  6e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0225  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.97 
 
 		 347 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.175978  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3303  RND family efflux transporter MFP subunit  31.49 
 
 		 418 aa  136  6.0000000000000005e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.3496  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3711  RND family efflux transporter MFP subunit  25 
 
 		 389 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3301  RND family efflux transporter MFP subunit  30.34 
 
 		 381 aa  119  7e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.446472 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0382  RND family efflux transporter MFP subunit  28.69 
 
 		 396 aa  110  5e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.410142  normal  0.745706 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1362  secretion protein HlyD  25.76 
 
 		 381 aa  100  4e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.27807  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1281  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.93 
 
 		 357 aa  91.7  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.036609  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2456  hypothetical protein  27.85 
 
 		 431 aa  90.5  5e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2370  secretion protein HlyD  27.12 
 
 		 405 aa  88.2  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000467489 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0915  secretion protein, putative  27.04 
 
 		 368 aa  88.2  3e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1870  secretion protein HlyD  29.64 
 
 		 427 aa  87.8  3e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1309  efflux protein  28.06 
 
 		 364 aa  87.4  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3467  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.94 
 
 		 376 aa  86.3  9e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00013135  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0795  RND family efflux transporter MFP subunit  26.34 
 
 		 411 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3091  secretion protein HlyD family protein  25.44 
 
 		 334 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4709  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.98 
 
 		 383 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.04 
 
 		 377 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.69897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1863  RND family efflux transporter MFP subunit  25.25 
 
 		 393 aa  84  0.000000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1100  RND family efflux transporter MFP subunit  28.99 
 
 		 361 aa  84  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.204612 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4340  RND family efflux transporter MFP subunit  27.4 
 
 		 387 aa  83.2  0.000000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.625227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4857  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.25 
 
 		 384 aa  83.2  0.000000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.231948  normal  0.491578 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1908  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.39 
 
 		 407 aa  82.4  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4164  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.71 
 
 		 438 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.444201  normal  0.22934 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3855  RND family efflux transporter MFP subunit  27.71 
 
 		 438 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.336679  normal  0.260987 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0962  secretion protein HlyD  26.61 
 
 		 405 aa  82  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.255558  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2552  secretion protein HlyD  26.61 
 
 		 451 aa  82  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.603084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1462  RND efflux membrane fusion protein precursor  27.64 
 
 		 367 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0105  RND family efflux transporter MFP subunit  25.59 
 
 		 348 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2630  secretion protein HlyD family protein  29.15 
 
 		 366 aa  80.9  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0794256  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16800  putative efflux transmembrane protein  27.56 
 
 		 367 aa  80.5  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0868415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1695  secretion protein HlyD  26.84 
 
 		 360 aa  80.1  0.00000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2781  RND family efflux transporter MFP subunit  28.85 
 
 		 364 aa  79.7  0.00000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3533  RND family efflux transporter MFP subunit  25.88 
 
 		 409 aa  79.7  0.00000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.722317 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1621  secretion protein HlyD  26.15 
 
 		 407 aa  79.7  0.00000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1545  HlyD family heavy metal efflux pump  23.67 
 
 		 415 aa  79  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.453732  normal  0.148664 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2954  RND family efflux transporter MFP subunit  26.04 
 
 		 364 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000249187  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01960  putative RND efflux membrane fusion protein precursor  26.63 
 
 		 356 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.496395 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5088  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.12 
 
 		 361 aa  79.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.857117  normal  0.0828727 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2543  secretion protein HlyD  26.43 
 
 		 471 aa  78.6  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.467529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3522  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.66 
 
 		 421 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1605  secretion protein HlyD family protein  29.15 
 
 		 366 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4314  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.1 
 
 		 438 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.544766  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1047  RND family efflux transporter subunit MFP  26.07 
 
 		 461 aa  77.8  0.0000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0423833  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0067  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.5 
 
 		 453 aa  77.4  0.0000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3718  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.62 
 
 		 353 aa  77.4  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.30257  normal  0.0568343 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4150  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.54 
 
 		 397 aa  77.4  0.0000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00923789  hitchhiker  0.000000297953 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2584  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.4 
 
 		 421 aa  77  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2811  RND family efflux transporter MFP subunit  27.49 
 
 		 444 aa  76.6  0.0000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1481  multidrug resistance protein, putative  25.27 
 
 		 372 aa  76.6  0.0000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.318452  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4563  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.33 
 
 		 426 aa  76.6  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1526  RND family efflux transporter MFP subunit  25.2 
 
 		 423 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.692168  normal  0.0164989 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2956  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.75 
 
 		 430 aa  76.3  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.232515 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3781  RND family efflux transporter MFP subunit  26.29 
 
 		 407 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2949  RND family efflux transporter MFP subunit  23.8 
 
 		 376 aa  75.5  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0069  secretion protein HlyD family protein  27.2 
 
 		 331 aa  75.1  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0235  RND efflux membrane fusion protein precursor  25.81 
 
 		 356 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1375  secretion protein HlyD  28.38 
 
 		 374 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0634631  hitchhiker  0.000428617 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2041  secretion protein HlyD  23.7 
 
 		 398 aa  74.7  0.000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0429  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.06 
 
 		 413 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1520  RND family efflux transporter MFP subunit  27.25 
 
 		 370 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.289277 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4288  RND family efflux transporter MFP subunit  25.46 
 
 		 349 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4014  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.78 
 
 		 362 aa  74.3  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0181773  normal  0.127593 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1079  secretion protein HlyD  26.48 
 
 		 366 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.984606 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2774  RND family efflux transporter MFP subunit  27.17 
 
 		 337 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000348854  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1177  RND family efflux transporter MFP subunit  23.74 
 
 		 417 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2100  RND family efflux transporter MFP subunit  27.07 
 
 		 379 aa  74.7  0.000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0493506  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0396  RND family efflux transporter MFP subunit  27.78 
 
 		 413 aa  74.3  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0487  efflux transporter, RND family, MFP subunit  20.93 
 
 		 360 aa  74.3  0.000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1515  RND family efflux transporter MFP subunit  27.71 
 
 		 405 aa  73.9  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2688  RND family efflux transporter MFP subunit  25.97 
 
 		 353 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000000261317  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0809  secretion protein HlyD family protein  28.25 
 
 		 351 aa  73.9  0.000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4209  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.33 
 
 		 392 aa  73.9  0.000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.122721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1857  secretion protein HlyD  24.13 
 
 		 390 aa  73.9  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3351  RND family efflux transporter MFP subunit  26.15 
 
 		 367 aa  73.9  0.000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1385  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.09 
 
 		 380 aa  73.9  0.000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0605754  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>