More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2011 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_2011  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 		 361 aa  724    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0480  RND family efflux transporter MFP subunit  70.34 
 
 		 363 aa  513  1e-144  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0487  efflux transporter, RND family, MFP subunit  65.92 
 
 		 360 aa  478  1e-134  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1695  secretion protein HlyD  64.57 
 
 		 360 aa  447  1.0000000000000001e-124  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0558  secretion protein HlyD  55.65 
 
 		 360 aa  409  1e-113  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.177986  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0467  efflux transporter, RND family, MFP subunit  56.55 
 
 		 360 aa  406  1.0000000000000001e-112  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0431  efflux transporter, RND family, MFP subunit  56.39 
 
 		 368 aa  387  1e-106  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1636  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.63 
 
 		 383 aa  135  9.999999999999999e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.372421  normal  0.934491 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3883  secretion protein HlyD  29.49 
 
 		 424 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.135938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1469  secretion protein HlyD  29.26 
 
 		 421 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.910926 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1839  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.02 
 
 		 420 aa  116  6e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2977  RND family efflux transporter MFP subunit  28.12 
 
 		 401 aa  112  7.000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.540318  normal  0.494242 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0913  hypothetical protein  28.43 
 
 		 338 aa  107  2e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0882  hypothetical protein  27.49 
 
 		 338 aa  108  2e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1186  RND family efflux transporter MFP subunit  25.87 
 
 		 374 aa  105  1e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.425099  normal  0.0297054 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3475  secretion protein HlyD-like protein  26.65 
 
 		 373 aa  104  2e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.555415 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001980  probable RND efflux membrane fusion protein  26.38 
 
 		 367 aa  104  3e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.979341  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00481  hypothetical protein  26.07 
 
 		 368 aa  103  3e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3711  RND family efflux transporter MFP subunit  27.55 
 
 		 383 aa  103  6e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3711  RND family efflux transporter MFP subunit  25.94 
 
 		 389 aa  103  6e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0830  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.33 
 
 		 390 aa  102  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0779  RND family efflux transporter MFP subunit  25.45 
 
 		 415 aa  101  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.521132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0753  secretion protein HlyD  27.63 
 
 		 370 aa  100  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0836  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.71 
 
 		 363 aa  99  1e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0935853  normal  0.864756 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0768  acriflavin resistance periplasmic protein  23.84 
 
 		 348 aa  98.6  2e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.69171  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0166  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.43 
 
 		 379 aa  98.2  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4150  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.46 
 
 		 397 aa  98.2  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00923789  hitchhiker  0.000000297953 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2533  RND family efflux transporter MFP subunit  30.32 
 
 		 343 aa  97.4  3e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.66716  normal  0.672833 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1580  RND family efflux transporter MFP subunit  30.57 
 
 		 365 aa  97.1  4e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.610408  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3461  secretion protein HlyD  27.07 
 
 		 384 aa  97.1  4e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1496  RND family efflux transporter MFP subunit  30.57 
 
 		 365 aa  97.1  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0950  secretion protein HlyD  27.32 
 
 		 384 aa  97.4  4e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.57805  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0031  RND family efflux transporter MFP subunit  30.57 
 
 		 365 aa  96.3  7e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1201  RND family efflux transporter MFP subunit  30.57 
 
 		 365 aa  96.3  7e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0341767  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1044  RND family efflux transporter MFP subunit  30.57 
 
 		 365 aa  96.3  7e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0078  RND family efflux transporter MFP subunit  30.57 
 
 		 365 aa  96.3  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1739  RND family efflux transporter MFP subunit  25.14 
 
 		 366 aa  96.3  7e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0383  RND family efflux transporter MFP subunit  30.57 
 
 		 365 aa  96.3  7e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0161  RND family efflux transporter MFP subunit  26.17 
 
 		 380 aa  96.3  7e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0747  secretion protein HlyD  26.44 
 
 		 357 aa  96.3  8e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.554021  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0225  secretion protein HlyD  29.66 
 
 		 380 aa  96.3  8e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.34961  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3939  RND family efflux transporter MFP subunit  26.45 
 
 		 367 aa  95.9  9e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.407918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0080  RND family efflux transporter MFP subunit  23.81 
 
 		 414 aa  95.5  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.95759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0090  putative multidrug transporter, HlyD family  25.77 
 
 		 368 aa  95.5  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1999  RND family efflux transporter MFP subunit  24.66 
 
 		 390 aa  95.5  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00132105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3700  secretion protein HlyD  26.71 
 
 		 381 aa  95.9  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2553  hypothetical protein  25.61 
 
 		 368 aa  95.5  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000355433  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3127  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.05 
 
 		 416 aa  95.9  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4226  RND family efflux transporter MFP subunit  26.96 
 
 		 426 aa  95.1  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.499264  normal  0.926991 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1288  RND family efflux transporter MFP subunit  29.94 
 
 		 365 aa  94.7  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01077  HlyD family secretion protein  25.46 
 
 		 376 aa  94.7  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15871  membrane fusion protein  27.01 
 
 		 357 aa  95.1  2e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3476  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.32 
 
 		 382 aa  94  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1815  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.23 
 
 		 388 aa  94  4e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.100454  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0962  secretion protein HlyD  26.69 
 
 		 405 aa  93.2  7e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.255558  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1161  RND family efflux transporter MFP subunit  26.13 
 
 		 404 aa  92.8  8e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0203325  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3467  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.45 
 
 		 376 aa  92.8  8e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00013135  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3561  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.25 
 
 		 420 aa  92.8  8e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.306068  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3749  RND family efflux transporter MFP subunit  28.47 
 
 		 340 aa  92.8  9e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0946  RND family efflux transporter MFP subunit  26.92 
 
 		 382 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3408  RND family efflux transporter MFP subunit  27.16 
 
 		 389 aa  92.4  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0128497  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1621  secretion protein HlyD  23.88 
 
 		 407 aa  92.4  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0907  RND efflux membrane fusion protein-related protein  26.41 
 
 		 406 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1672  RND family efflux transporter MFP subunit  23.57 
 
 		 429 aa  91.3  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0703  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.95 
 
 		 355 aa  91.3  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1847  putative efflux transporter  26.11 
 
 		 421 aa  91.7  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2393  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.48 
 
 		 369 aa  91.3  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.355185  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2954  RND family efflux transporter MFP subunit  26.23 
 
 		 364 aa  90.9  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000249187  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03344  acriflavin resistance protein  27.44 
 
 		 417 aa  90.5  4e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1921  RND family efflux transporter MFP subunit  25.08 
 
 		 340 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00271277  normal  0.413551 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1550  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.17 
 
 		 413 aa  90.5  4e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0505882  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0247  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.97 
 
 		 380 aa  90.1  6e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1571  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.95 
 
 		 435 aa  89.7  7e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.334008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2481  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.83 
 
 		 367 aa  89  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3803  RND family efflux transporter MFP subunit  26.79 
 
 		 376 aa  89  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591559 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2825  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.2 
 
 		 476 aa  89.4  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.292175  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00325  cation efflux system protein  33.33 
 
 		 244 aa  89  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.888841  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2316  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.78 
 
 		 379 aa  89  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.144925 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3531  secretion protein HlyD  25.42 
 
 		 400 aa  89.4  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0870  acriflavin resistance periplasmic protein  25.16 
 
 		 351 aa  89  1e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4943  RND efflux membrane fusion protein precursor  27.58 
 
 		 375 aa  89  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0949  RND family efflux transporter MFP subunit  25.58 
 
 		 390 aa  88.2  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3412  secretion protein HlyD  26.37 
 
 		 443 aa  88.6  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0866166  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1908  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.86 
 
 		 407 aa  88.2  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4041  hypothetical protein  25.08 
 
 		 366 aa  88.2  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0513022 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1146  RND family efflux transporter MFP subunit  24.84 
 
 		 351 aa  87.8  3e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0930  RND family efflux transporter MFP subunit  24.46 
 
 		 366 aa  87.4  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3361  RND family efflux transporter MFP subunit  26.62 
 
 		 410 aa  87.8  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0372  RND family efflux transporter MFP subunit  23.82 
 
 		 372 aa  87.4  3e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4149  RND family efflux transporter MFP subunit  26.88 
 
 		 372 aa  87.4  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.815582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1791  secretion protein HlyD  26.39 
 
 		 402 aa  87  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3002  membrane-fusion protein, component of multidrug efflux system  24.76 
 
 		 367 aa  87  5e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2100  RND family efflux transporter MFP subunit  25.59 
 
 		 379 aa  86.7  6e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0493506  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3927  RND family efflux transporter MFP subunit  26.8 
 
 		 392 aa  86.7  6e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56880  putative membrane fusion protein  26.36 
 
 		 376 aa  85.9  9e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2034  RND family efflux transporter MFP subunit  27.87 
 
 		 403 aa  85.9  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13031  membrane fusion protein  23.55 
 
 		 353 aa  85.1  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.560639  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4327  HlyD family secretion protein  23.57 
 
 		 372 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1209  RND family efflux transporter MFP subunit  25 
 
 		 381 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.421019  normal  0.31825 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2370  secretion protein HlyD  25.98 
 
 		 405 aa  84.7  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000467489 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>