More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_2658 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_2658  secretion protein HlyD  100 
 
 
393 aa  704    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.253454  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2843  efflux transporter, RND family, MFP subunit  90.08 
 
 
393 aa  478  1e-134  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2749  efflux transporter, RND family, MFP subunit  90.84 
 
 
393 aa  470  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.130988  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2959  RND family efflux transporter MFP subunit  55.31 
 
 
393 aa  268  2e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1281  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.78 
 
 
387 aa  238  1e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000959286  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1477  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.27 
 
 
390 aa  234  3e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3438  putative secretion protein HlyD precursor  40.87 
 
 
399 aa  229  8e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0583205  normal  0.262777 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1940  secretion protein HlyD  39.02 
 
 
395 aa  228  1e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.345824  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2304  RND family efflux transporter MFP subunit  42.16 
 
 
396 aa  226  5.0000000000000005e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4266  RND family efflux transporter MFP subunit  41.22 
 
 
407 aa  222  9.999999999999999e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1210  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.21 
 
 
389 aa  219  5e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00968103 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5375  HlyD family secretion protein  40.59 
 
 
399 aa  219  8.999999999999998e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.288749  normal  0.0889869 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1477  efflux transporter, RND family, MFP subunit  43.97 
 
 
396 aa  218  2e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.153552  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4211  RND family efflux transporter MFP subunit  44.88 
 
 
398 aa  217  2.9999999999999998e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.342556  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2204  RND family efflux transporter MFP subunit  40.36 
 
 
411 aa  212  7e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0311908 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1054  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.64 
 
 
400 aa  212  9e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.153115  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1507  RND family efflux transporter MFP subunit  36.19 
 
 
393 aa  212  9e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.679392  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1419  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.2 
 
 
387 aa  210  3e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.267588  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1581  secretion protein HlyD  43.4 
 
 
396 aa  210  4e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0301644  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2062  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.14 
 
 
419 aa  207  3e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0208015  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2069  HlyD family secretion protein  43.35 
 
 
404 aa  206  6e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.473909 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0078  putative secretion protein HlyD  38.67 
 
 
409 aa  205  9e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.36335 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1123  secretion protein HlyD  40.85 
 
 
401 aa  204  3e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.18847  normal  0.38508 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2283  RND family efflux transporter MFP subunit  39.57 
 
 
398 aa  202  6e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.181226  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0326  efflux transporter, RND family, MFP subunit  44.33 
 
 
438 aa  201  1.9999999999999998e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.856716 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3585  RND family efflux transporter MFP subunit  40.15 
 
 
389 aa  199  9e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5171  secretion protein HlyD  41.3 
 
 
395 aa  195  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.345793  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1916  RND family efflux transporter MFP subunit  39.67 
 
 
401 aa  194  2e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1011  RND family efflux transporter MFP subunit  36.11 
 
 
402 aa  194  2e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4499  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.16 
 
 
391 aa  194  3e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.345717  normal  0.0635316 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1573  RND family efflux transporter MFP subunit  44.81 
 
 
399 aa  194  3e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4367  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.16 
 
 
391 aa  194  3e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.122634  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6250  RND family efflux transporter MFP subunit  38.66 
 
 
388 aa  193  5e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1702  secretion protein HlyD  38.32 
 
 
398 aa  189  9e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.16483  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0218  hypothetical protein  30.34 
 
 
392 aa  184  3e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0064  RND family efflux transporter MFP subunit  40.52 
 
 
522 aa  182  1e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0300  RND family efflux transporter MFP subunit  41.56 
 
 
407 aa  177  2e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2455  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.79 
 
 
391 aa  109  9.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.035635  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1713  multidrug resistance efflux pump-like protein  28.87 
 
 
392 aa  109  1e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.254154  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2872  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.21 
 
 
387 aa  108  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1571  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.8 
 
 
435 aa  107  5e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.334008  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2082  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.41 
 
 
416 aa  105  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0871  secretion protein HlyD  31.13 
 
 
406 aa  89  1e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.75327  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1147  RND family efflux transporter MFP subunit  36.73 
 
 
395 aa  84.7  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.88 
 
 
377 aa  84.3  0.000000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.69897  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4678  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.49 
 
 
442 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00314415  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2586  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.12 
 
 
388 aa  82  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000121955  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1550  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.45 
 
 
413 aa  80.5  0.00000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0505882  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2456  hypothetical protein  27.71 
 
 
431 aa  79  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2837  RND family efflux transporter MFP subunit  31.51 
 
 
406 aa  78.2  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0025637 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3463  HlyD family secretion protein  25.73 
 
 
378 aa  78.6  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1361  RND efflux membrane protein  31.37 
 
 
383 aa  77.8  0.0000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1204  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.84 
 
 
471 aa  75.5  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3467  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.24 
 
 
376 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00013135  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1672  RND family efflux transporter MFP subunit  23.44 
 
 
429 aa  75.1  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2370  secretion protein HlyD  29.78 
 
 
405 aa  74.3  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000467489 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3265  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.95 
 
 
404 aa  74.3  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1045  RND family efflux transporter MFP subunit  31.93 
 
 
397 aa  73.6  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2100  RND family efflux transporter MFP subunit  29.35 
 
 
379 aa  73.6  0.000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0493506  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0795  RND family efflux transporter MFP subunit  27.01 
 
 
411 aa  73.6  0.000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0986  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.16 
 
 
405 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.831389 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2202  RND family efflux transporter MFP subunit  25.3 
 
 
407 aa  72.4  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2217  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.54 
 
 
356 aa  72.4  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0743158  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0753  secretion protein HlyD  29.91 
 
 
370 aa  72  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0382  RND family efflux transporter MFP subunit  27.91 
 
 
396 aa  71.6  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.410142  normal  0.745706 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1830  secretion protein HlyD  27 
 
 
449 aa  71.2  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223746  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1908  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.14 
 
 
407 aa  71.2  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2466  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.27 
 
 
396 aa  70.9  0.00000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2928  RND family efflux transporter MFP subunit  25.65 
 
 
431 aa  70.1  0.00000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00603978  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1326  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.57 
 
 
398 aa  69.7  0.00000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0997151  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2865  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.14 
 
 
478 aa  69.7  0.00000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0716848 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1983  RND family efflux transporter MFP subunit  26.78 
 
 
416 aa  69.7  0.00000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0962  secretion protein HlyD  28.41 
 
 
405 aa  68.9  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.255558  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1067  secretion protein HlyD  24 
 
 
364 aa  68.6  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.133207 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4563  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.13 
 
 
426 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2949  RND family efflux transporter MFP subunit  23.01 
 
 
376 aa  68.6  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0283  RND family efflux transporter MFP subunit  25.14 
 
 
416 aa  67.8  0.0000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1046  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.63 
 
 
378 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0357289  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0454  secretion protein HlyD  21.29 
 
 
373 aa  67.8  0.0000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.63564  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2097  RND family efflux transporter MFP subunit  29.07 
 
 
391 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.902105  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0471  secretion protein HlyD family protein  28.69 
 
 
414 aa  67.8  0.0000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1834  RND family efflux transporter MFP subunit  28.29 
 
 
383 aa  67  0.0000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.41663  normal  0.322468 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4033  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.42 
 
 
396 aa  67  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1916  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.41 
 
 
384 aa  67  0.0000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2617  secretion protein HlyD  24.93 
 
 
385 aa  66.2  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000106145  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2854  cation efflux transporter  30.11 
 
 
386 aa  66.6  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.405755  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1666  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.49 
 
 
396 aa  66.6  0.0000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0854593  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0739  efflux transporter, RND family, MFP subunit  19.8 
 
 
362 aa  65.9  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.941037  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4150  efflux transporter, RND family, MFP subunit  20.87 
 
 
397 aa  65.9  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00923789  hitchhiker  0.000000297953 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0663  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.17 
 
 
453 aa  65.9  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1685  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.01 
 
 
383 aa  65.9  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1184  secretion protein HlyD  28.25 
 
 
396 aa  66.2  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3888  Fis family transcriptional regulator  31.65 
 
 
389 aa  65.9  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0700006  normal  0.958295 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1673  secretion protein HlyD  25.37 
 
 
396 aa  65.5  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.801945 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0635  macrolide-specific efflux protein macA  19.24 
 
 
390 aa  65.1  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0167041  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0308  secretion protein HlyD  26.81 
 
 
421 aa  65.1  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.742688 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0067  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25 
 
 
453 aa  64.7  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3711  RND family efflux transporter MFP subunit  24.69 
 
 
383 aa  64.7  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0635  RND family efflux transporter MFP subunit  24.15 
 
 
406 aa  64.7  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.320707  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4108  putative secretion protein (HlyD)  31.03 
 
 
391 aa  64.7  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.331978  normal  0.146318 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>