More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_2872 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_2872  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 		 387 aa  762    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1713  multidrug resistance efflux pump-like protein  41.44 
 
 		 392 aa  259  5.0000000000000005e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.254154  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1830  secretion protein HlyD  30.9 
 
 		 449 aa  130  3e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2455  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.98 
 
 		 391 aa  126  8.000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.035635  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0308  secretion protein HlyD  30.3 
 
 		 421 aa  122  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.742688 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2370  secretion protein HlyD  28.57 
 
 		 405 aa  117  3e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000467489 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1550  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.22 
 
 		 413 aa  116  6.9999999999999995e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0505882  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2082  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.59 
 
 		 416 aa  112  9e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4678  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.49 
 
 		 442 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00314415  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1477  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.87 
 
 		 390 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2062  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.21 
 
 		 419 aa  108  1e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0208015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1672  RND family efflux transporter MFP subunit  27.32 
 
 		 429 aa  107  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.12 
 
 		 377 aa  105  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.69897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1573  RND family efflux transporter MFP subunit  28.49 
 
 		 399 aa  105  1e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1507  RND family efflux transporter MFP subunit  26.44 
 
 		 393 aa  105  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.679392  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2949  RND family efflux transporter MFP subunit  27.58 
 
 		 376 aa  104  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0463  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.93 
 
 		 414 aa  103  6e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1281  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.6 
 
 		 387 aa  103  6e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000959286  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3585  RND family efflux transporter MFP subunit  27.39 
 
 		 389 aa  102  1e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3265  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.96 
 
 		 404 aa  101  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2072  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.06 
 
 		 379 aa  101  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2586  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.29 
 
 		 388 aa  100  3e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000121955  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1419  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.82 
 
 		 387 aa  100  4e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.267588  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1123  secretion protein HlyD  27.47 
 
 		 401 aa  100  6e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.18847  normal  0.38508 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1571  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.5 
 
 		 435 aa  98.6  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.334008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1634  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.32 
 
 		 417 aa  96.3  8e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4521  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.43 
 
 		 379 aa  95.5  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2928  RND family efflux transporter MFP subunit  28.23 
 
 		 431 aa  95.5  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00603978  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0986  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.78 
 
 		 405 aa  93.6  6e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.831389 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4041  hypothetical protein  24.37 
 
 		 366 aa  92.8  8e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0513022 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0218  hypothetical protein  25.41 
 
 		 392 aa  91.7  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1477  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.5 
 
 		 396 aa  90.5  5e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.153552  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3939  RND family efflux transporter MFP subunit  25.39 
 
 		 367 aa  89.7  8e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.407918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1695  secretion protein HlyD  25.34 
 
 		 360 aa  89.4  1e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2020  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.53 
 
 		 414 aa  88.2  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.152554 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0963  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.28 
 
 		 451 aa  88.6  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0174638  normal  0.124893 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1940  secretion protein HlyD  27.47 
 
 		 395 aa  88.2  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.345824  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01965  Secretion protein HlyD  25.75 
 
 		 401 aa  88.6  2e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.303602  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2304  RND family efflux transporter MFP subunit  27.24 
 
 		 396 aa  87.8  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4150  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.69 
 
 		 397 aa  87.4  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00923789  hitchhiker  0.000000297953 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2283  RND family efflux transporter MFP subunit  26.24 
 
 		 398 aa  87.8  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.181226  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1762  RND family efflux transporter MFP subunit  26.1 
 
 		 421 aa  87.4  4e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0464275  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1702  secretion protein HlyD  32.03 
 
 		 398 aa  86.3  9e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.16483  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1210  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.62 
 
 		 389 aa  85.9  0.000000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00968103 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1666  RND family efflux transporter MFP subunit  24.63 
 
 		 418 aa  85.9  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1334  secretion protein HlyD  26.87 
 
 		 410 aa  85.5  0.000000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2322  secretion protein HlyD  25.59 
 
 		 399 aa  84.7  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000756014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1483  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.32 
 
 		 419 aa  84.3  0.000000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.377405 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1936  transporter, putative  26.73 
 
 		 349 aa  83.6  0.000000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1440  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.13 
 
 		 374 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.266014  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2069  HlyD family secretion protein  27.3 
 
 		 404 aa  82.4  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.473909 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1339  RND family efflux transporter MFP subunit  26.82 
 
 		 384 aa  81.3  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.611384  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3323  secretion protein HlyD  24.05 
 
 		 459 aa  81.6  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.665109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1204  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.42 
 
 		 471 aa  81.3  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1532  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.51 
 
 		 415 aa  80.5  0.00000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1385  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.44 
 
 		 380 aa  80.5  0.00000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0605754  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0972  secretion protein HlyD  25.75 
 
 		 353 aa  80.5  0.00000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2663  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.74 
 
 		 352 aa  80.1  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0883  RND family efflux transporter MFP subunit  28.72 
 
 		 363 aa  80.5  0.00000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0212  secretion protein HlyD  25.34 
 
 		 364 aa  80.1  0.00000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.59943 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4563  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.96 
 
 		 426 aa  79.7  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4367  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.71 
 
 		 391 aa  79  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.122634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0064  RND family efflux transporter MFP subunit  25.38 
 
 		 522 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0040  secretion protein HlyD  27.25 
 
 		 389 aa  79  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0838  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.01 
 
 		 432 aa  79  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2100  RND family efflux transporter MFP subunit  24.79 
 
 		 379 aa  79.3  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0493506  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4499  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.71 
 
 		 391 aa  79  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.345717  normal  0.0635316 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0987  secretion protein HlyD  23.08 
 
 		 419 aa  78.6  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4005  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.06 
 
 		 387 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0454  secretion protein HlyD  23.56 
 
 		 373 aa  77.8  0.0000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.63564  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6250  RND family efflux transporter MFP subunit  24.79 
 
 		 388 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0319  RND family efflux transporter MFP subunit  23.93 
 
 		 417 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0067  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.57 
 
 		 453 aa  77.4  0.0000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31990  cobalt/zinc/cadmium efflux RND transporter, membrane fusion protein, CzcB famil  27.39 
 
 		 484 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5171  secretion protein HlyD  23.63 
 
 		 395 aa  77  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.345793  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4266  RND family efflux transporter MFP subunit  26.61 
 
 		 407 aa  77  0.0000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0539  RND family efflux transporter MFP subunit  23.31 
 
 		 350 aa  76.3  0.000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0753  secretion protein HlyD  24.63 
 
 		 370 aa  75.9  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0764  RND family efflux transporter MFP subunit  22.73 
 
 		 385 aa  75.5  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2584  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.45 
 
 		 421 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4163  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.93 
 
 		 350 aa  74.7  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000250075  normal  0.807389 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0468  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.5 
 
 		 445 aa  74.7  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1234  RND family efflux transporter MFP subunit  25.73 
 
 		 359 aa  74.3  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.580475  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2543  secretion protein HlyD  23.8 
 
 		 471 aa  74.3  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.467529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2374  RND family efflux transporter MFP subunit  24.81 
 
 		 395 aa  74.3  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.347836 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1748  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.86 
 
 		 388 aa  74.7  0.000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2253  secretion protein HlyD  27.48 
 
 		 398 aa  73.9  0.000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.706134 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0385  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.19 
 
 		 409 aa  73.9  0.000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2456  hypothetical protein  24.18 
 
 		 431 aa  73.9  0.000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2928  RND family efflux transporter MFP subunit  28.92 
 
 		 455 aa  73.9  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2409  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcB, putative  27.02 
 
 		 404 aa  73.6  0.000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.228901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3286  RND family efflux transporter MFP subunit  27.02 
 
 		 404 aa  73.6  0.000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.522349 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3559  RND family efflux transporter MFP subunit  24.37 
 
 		 396 aa  73.6  0.000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0492868  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0607  RND family efflux transporter MFP subunit  24.07 
 
 		 406 aa  73.6  0.000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3522  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.19 
 
 		 421 aa  73.2  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0635  RND family efflux transporter MFP subunit  24.07 
 
 		 406 aa  73.2  0.000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.320707  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0680  RND family efflux transporter MFP subunit  25.37 
 
 		 417 aa  73.2  0.000000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0364598 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1840  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.08 
 
 		 365 aa  72.8  0.000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.772932 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1715  putative cation efflux system transmembrane protein  24.93 
 
 		 500 aa  72.8  0.000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0232855  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0088  RND family efflux transporter MFP subunit  29.58 
 
 		 468 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>