More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3585 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009427  Saro_3585  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 		 389 aa  746    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2283  RND family efflux transporter MFP subunit  40.69 
 
 		 398 aa  231  2e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.181226  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1581  secretion protein HlyD  39.43 
 
 		 396 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0301644  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4499  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.04 
 
 		 391 aa  219  7.999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.345717  normal  0.0635316 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4367  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.04 
 
 		 391 aa  219  7.999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.122634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2062  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.67 
 
 		 419 aa  217  2e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0208015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1281  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.38 
 
 		 387 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000959286  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6250  RND family efflux transporter MFP subunit  40.48 
 
 		 388 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1477  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.29 
 
 		 390 aa  215  9.999999999999999e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1210  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.36 
 
 		 389 aa  212  1e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00968103 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0078  putative secretion protein HlyD  38.24 
 
 		 409 aa  210  3e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.36335 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1054  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.18 
 
 		 400 aa  209  6e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.153115  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1507  RND family efflux transporter MFP subunit  38.11 
 
 		 393 aa  207  2e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.679392  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3438  putative secretion protein HlyD precursor  39.95 
 
 		 399 aa  207  3e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0583205  normal  0.262777 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1940  secretion protein HlyD  38.58 
 
 		 395 aa  206  4e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.345824  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1702  secretion protein HlyD  38.36 
 
 		 398 aa  204  2e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.16483  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2959  RND family efflux transporter MFP subunit  41.08 
 
 		 393 aa  204  2e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1419  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.29 
 
 		 387 aa  204  2e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.267588  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0326  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.57 
 
 		 438 aa  204  3e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.856716 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0064  RND family efflux transporter MFP subunit  39.53 
 
 		 522 aa  203  3e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0218  hypothetical protein  35.06 
 
 		 392 aa  199  9e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5375  HlyD family secretion protein  40 
 
 		 399 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.288749  normal  0.0889869 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1477  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.17 
 
 		 396 aa  196  5.000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.153552  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2204  RND family efflux transporter MFP subunit  35.89 
 
 		 411 aa  196  6e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0311908 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4266  RND family efflux transporter MFP subunit  36.76 
 
 		 407 aa  192  7e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1011  RND family efflux transporter MFP subunit  32.93 
 
 		 402 aa  190  5e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1123  secretion protein HlyD  38.04 
 
 		 401 aa  189  7e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.18847  normal  0.38508 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1916  RND family efflux transporter MFP subunit  36.81 
 
 		 401 aa  185  1.0000000000000001e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5171  secretion protein HlyD  36.07 
 
 		 395 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.345793  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4211  RND family efflux transporter MFP subunit  41.55 
 
 		 398 aa  184  2.0000000000000003e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.342556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2843  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.69 
 
 		 393 aa  181  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2304  RND family efflux transporter MFP subunit  36.56 
 
 		 396 aa  177  2e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2069  HlyD family secretion protein  37.76 
 
 		 404 aa  176  6e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.473909 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0300  RND family efflux transporter MFP subunit  38.64 
 
 		 407 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1573  RND family efflux transporter MFP subunit  35.62 
 
 		 399 aa  165  1.0000000000000001e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2749  efflux transporter, RND family, MFP subunit  47.47 
 
 		 393 aa  162  1e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.130988  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2658  secretion protein HlyD  45.69 
 
 		 393 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.253454  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2872  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.79 
 
 		 387 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1713  multidrug resistance efflux pump-like protein  27.02 
 
 		 392 aa  115  2.0000000000000002e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.254154  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2455  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.2 
 
 		 391 aa  112  8.000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.035635  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1571  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.99 
 
 		 435 aa  100  6e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.334008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2082  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.93 
 
 		 416 aa  93.6  6e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1147  RND family efflux transporter MFP subunit  33.61 
 
 		 395 aa  90.9  3e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3461  secretion protein HlyD  27.15 
 
 		 384 aa  88.2  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2928  RND family efflux transporter MFP subunit  25.27 
 
 		 431 aa  87.4  4e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00603978  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1550  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.23 
 
 		 413 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0505882  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2072  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.89 
 
 		 379 aa  77  0.0000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0635  RND family efflux transporter MFP subunit  25.95 
 
 		 406 aa  77  0.0000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.320707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1385  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.57 
 
 		 380 aa  76.6  0.0000000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0605754  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1762  RND family efflux transporter MFP subunit  26.52 
 
 		 421 aa  76.3  0.0000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0464275  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0954  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.94 
 
 		 415 aa  76.3  0.0000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2954  RND family efflux transporter MFP subunit  25.26 
 
 		 364 aa  75.9  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000249187  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0607  RND family efflux transporter MFP subunit  25.7 
 
 		 406 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2217  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.48 
 
 		 356 aa  76.3  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0743158  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4678  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.88 
 
 		 442 aa  75.9  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00314415  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2837  RND family efflux transporter MFP subunit  29.03 
 
 		 406 aa  76.3  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0025637 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0949  RND family efflux transporter MFP subunit  28.93 
 
 		 390 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0916  efflux transporter  30.22 
 
 		 396 aa  74.7  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.987196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4415  RND family efflux transporter MFP subunit  24.79 
 
 		 458 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.553493  normal  0.934455 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1868  secretion protein HlyD  28.07 
 
 		 405 aa  74.7  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2825  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.18 
 
 		 476 aa  74.7  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.292175  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3476  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.65 
 
 		 382 aa  74.7  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2586  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.37 
 
 		 388 aa  74.3  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000121955  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0820  HlyD family secretion protein  27.76 
 
 		 405 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1671  HlyD family secretion protein  26.53 
 
 		 408 aa  73.9  0.000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3456  RND family efflux transporter MFP subunit  26.91 
 
 		 409 aa  72.8  0.000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000285815  normal  0.0164702 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1439  RND family efflux transporter MFP subunit  27.7 
 
 		 390 aa  72.4  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0228236 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1617  secretion protein HlyD  26.18 
 
 		 408 aa  72.4  0.00000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0160623  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2854  cation efflux transporter  27.7 
 
 		 386 aa  71.6  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.405755  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0800  RND family efflux transporter MFP subunit  26.39 
 
 		 416 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000642362  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0463  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.8 
 
 		 414 aa  71.6  0.00000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2696  macrolide transporter subunit MacA  25.94 
 
 		 370 aa  71.2  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.761507  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1597  macrolide transporter subunit MacA  25.94 
 
 		 370 aa  71.2  0.00000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0832  RND family efflux transporter MFP subunit  26.4 
 
 		 416 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000487508  normal  0.99457 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0161  RND family efflux transporter MFP subunit  31.39 
 
 		 380 aa  70.5  0.00000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2611  macrolide transporter subunit MacA  25.67 
 
 		 370 aa  70.1  0.00000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1362  secretion protein HlyD  23.28 
 
 		 381 aa  69.7  0.00000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.27807  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3235  secretion protein HlyD  28.61 
 
 		 391 aa  69.7  0.00000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.185962  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0825  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.13 
 
 		 410 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000019827  hitchhiker  0.00000000236896 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3536  RND family efflux transporter MFP subunit  26.4 
 
 		 416 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000721535  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1510  secretion protein HlyD  25.36 
 
 		 395 aa  68.6  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1504  RND family efflux transporter MFP subunit  26 
 
 		 397 aa  68.6  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0583737 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1007  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.93 
 
 		 398 aa  67.8  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3559  RND family efflux transporter MFP subunit  26.09 
 
 		 396 aa  67.4  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0492868  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2533  RND family efflux transporter MFP subunit  27.03 
 
 		 343 aa  67.4  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.66716  normal  0.672833 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2938  RND family efflux transporter MFP subunit  28.21 
 
 		 444 aa  67  0.0000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0768  acriflavin resistance periplasmic protein  24.17 
 
 		 348 aa  66.6  0.0000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.69171  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3171  RND family efflux transporter MFP subunit  27.53 
 
 		 416 aa  66.6  0.0000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000224755  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1748  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.48 
 
 		 388 aa  66.2  0.0000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2764  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.32 
 
 		 371 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.161658  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3522  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23 
 
 		 421 aa  66.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2718  macrolide transporter subunit MacA  25.32 
 
 		 371 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3463  HlyD family secretion protein  27.93 
 
 		 378 aa  65.9  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0725  HlyD family secretion protein  27.56 
 
 		 397 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.897812  normal  0.118835 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0982  macrolide transporter subunit MacA  25.32 
 
 		 371 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.44834  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4151  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.8 
 
 		 451 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0426406  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2451  macrolide transporter subunit MacA  25.32 
 
 		 371 aa  65.9  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00913289  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1715  acriflavin resistance periplasmic protein  23.1 
 
 		 357 aa  65.5  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000921401  normal  0.0591325 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1339  RND family efflux transporter MFP subunit  26.69 
 
 		 384 aa  65.9  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.611384  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0951  macrolide transporter subunit MacA  25.32 
 
 		 371 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0557503  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>