More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_2843 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_2843  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 		 393 aa  711    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2749  efflux transporter, RND family, MFP subunit  96.69 
 
 		 393 aa  500  1e-140  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.130988  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2658  secretion protein HlyD  90.08 
 
 		 393 aa  469  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.253454  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2959  RND family efflux transporter MFP subunit  55.71 
 
 		 393 aa  266  7e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1477  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.79 
 
 		 390 aa  244  3e-63  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3438  putative secretion protein HlyD precursor  41.69 
 
 		 399 aa  238  1e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0583205  normal  0.262777 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1281  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.06 
 
 		 387 aa  236  4e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000959286  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1210  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.59 
 
 		 389 aa  225  9e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00968103 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5375  HlyD family secretion protein  41.13 
 
 		 399 aa  224  3e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.288749  normal  0.0889869 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1940  secretion protein HlyD  37.94 
 
 		 395 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.345824  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1581  secretion protein HlyD  44.3 
 
 		 396 aa  219  5e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0301644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2304  RND family efflux transporter MFP subunit  41.89 
 
 		 396 aa  219  7.999999999999999e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4211  RND family efflux transporter MFP subunit  44.72 
 
 		 398 aa  217  4e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.342556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4266  RND family efflux transporter MFP subunit  42.48 
 
 		 407 aa  216  8e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3585  RND family efflux transporter MFP subunit  41.18 
 
 		 389 aa  214  1.9999999999999998e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1419  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.22 
 
 		 387 aa  214  2.9999999999999995e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.267588  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1123  secretion protein HlyD  41.69 
 
 		 401 aa  211  3e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.18847  normal  0.38508 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1507  RND family efflux transporter MFP subunit  35.62 
 
 		 393 aa  207  2e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.679392  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2069  HlyD family secretion protein  43.01 
 
 		 404 aa  206  4e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.473909 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2204  RND family efflux transporter MFP subunit  39.23 
 
 		 411 aa  206  5e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0311908 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1054  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.34 
 
 		 400 aa  206  8e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.153115  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1477  efflux transporter, RND family, MFP subunit  42.96 
 
 		 396 aa  203  5e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.153552  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0078  putative secretion protein HlyD  38.24 
 
 		 409 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.36335 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0326  efflux transporter, RND family, MFP subunit  43.33 
 
 		 438 aa  198  1.0000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.856716 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1702  secretion protein HlyD  40.65 
 
 		 398 aa  196  6e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.16483  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2062  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.78 
 
 		 419 aa  195  9e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0208015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2283  RND family efflux transporter MFP subunit  39.02 
 
 		 398 aa  196  9e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.181226  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4499  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.43 
 
 		 391 aa  191  2e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.345717  normal  0.0635316 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4367  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.43 
 
 		 391 aa  191  2e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.122634  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0218  hypothetical protein  30.87 
 
 		 392 aa  188  1e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6250  RND family efflux transporter MFP subunit  38.38 
 
 		 388 aa  189  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0064  RND family efflux transporter MFP subunit  40.29 
 
 		 522 aa  187  3e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5171  secretion protein HlyD  39.25 
 
 		 395 aa  182  6e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.345793  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1573  RND family efflux transporter MFP subunit  42.9 
 
 		 399 aa  182  7e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1916  RND family efflux transporter MFP subunit  38.59 
 
 		 401 aa  182  9.000000000000001e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1011  RND family efflux transporter MFP subunit  34.95 
 
 		 402 aa  178  1e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0300  RND family efflux transporter MFP subunit  39.8 
 
 		 407 aa  167  4e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1713  multidrug resistance efflux pump-like protein  28.95 
 
 		 392 aa  115  1.0000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.254154  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2455  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.23 
 
 		 391 aa  108  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.035635  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2872  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.89 
 
 		 387 aa  105  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1571  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.53 
 
 		 435 aa  103  7e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.334008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2082  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.43 
 
 		 416 aa  92.4  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2837  RND family efflux transporter MFP subunit  32.71 
 
 		 406 aa  87.8  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0025637 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1550  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.23 
 
 		 413 aa  87  5e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0505882  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1147  RND family efflux transporter MFP subunit  37.17 
 
 		 395 aa  87  6e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2586  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.5 
 
 		 388 aa  83.2  0.000000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000121955  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0871  secretion protein HlyD  30.73 
 
 		 406 aa  81.3  0.00000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.75327  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4678  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25 
 
 		 442 aa  80.5  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00314415  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0795  RND family efflux transporter MFP subunit  28.12 
 
 		 411 aa  79.3  0.00000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1045  RND family efflux transporter MFP subunit  31.44 
 
 		 397 aa  76.3  0.0000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2217  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.22 
 
 		 356 aa  75.5  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0743158  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.8 
 
 		 377 aa  73.6  0.000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.69897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2202  RND family efflux transporter MFP subunit  25.89 
 
 		 407 aa  73.6  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1361  RND efflux membrane protein  30.36 
 
 		 383 aa  72.4  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3463  HlyD family secretion protein  24.66 
 
 		 378 aa  72.4  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1748  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.08 
 
 		 388 aa  72.4  0.00000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3265  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.59 
 
 		 404 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0487  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.28 
 
 		 360 aa  72  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1672  RND family efflux transporter MFP subunit  23.27 
 
 		 429 aa  70.9  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1204  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.64 
 
 		 471 aa  71.2  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4563  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.22 
 
 		 426 aa  70.5  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1673  secretion protein HlyD  25.25 
 
 		 396 aa  70.1  0.00000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.801945 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3834  RND family efflux transporter MFP subunit  30.64 
 
 		 383 aa  70.1  0.00000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3851  RND family efflux transporter MFP subunit  30.64 
 
 		 383 aa  70.1  0.00000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1919  RND family efflux transporter MFP subunit  30.64 
 
 		 383 aa  70.1  0.00000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0986  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.88 
 
 		 405 aa  69.7  0.00000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.831389 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2533  RND family efflux transporter MFP subunit  31.75 
 
 		 343 aa  68.9  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.66716  normal  0.672833 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1830  secretion protein HlyD  28 
 
 		 449 aa  69.3  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0468  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.02 
 
 		 445 aa  68.9  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2854  cation efflux transporter  32.42 
 
 		 386 aa  68.2  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.405755  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2977  RND family efflux transporter MFP subunit  34.38 
 
 		 401 aa  68.2  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.540318  normal  0.494242 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4150  efflux transporter, RND family, MFP subunit  20.73 
 
 		 397 aa  68.2  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00923789  hitchhiker  0.000000297953 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1834  RND family efflux transporter MFP subunit  28.85 
 
 		 383 aa  67.8  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.41663  normal  0.322468 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1334  secretion protein HlyD  24.43 
 
 		 410 aa  67  0.0000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1001  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.76 
 
 		 424 aa  67  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336631 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1326  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.13 
 
 		 398 aa  67  0.0000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0997151  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1685  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.19 
 
 		 383 aa  66.6  0.0000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1439  RND family efflux transporter MFP subunit  32.42 
 
 		 390 aa  67  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0228236 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2456  hypothetical protein  27.35 
 
 		 431 aa  67  0.0000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1908  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.89 
 
 		 407 aa  67  0.0000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0635  macrolide-specific efflux protein macA  19.55 
 
 		 390 aa  66.6  0.0000000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0167041  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2949  RND family efflux transporter MFP subunit  22.19 
 
 		 376 aa  66.2  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0382  RND family efflux transporter MFP subunit  27.68 
 
 		 396 aa  65.5  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.410142  normal  0.745706 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0067  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.59 
 
 		 453 aa  64.7  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2865  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.09 
 
 		 478 aa  65.5  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0716848 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4184  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.34 
 
 		 462 aa  64.7  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.267577  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4296  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.34 
 
 		 462 aa  64.7  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0916  efflux transporter  28.05 
 
 		 396 aa  64.7  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.987196  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0830  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.46 
 
 		 390 aa  63.9  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1256  membrane fusion protein (MFP) family auxiliary transport protein  19.89 
 
 		 397 aa  63.9  0.000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0663  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.65 
 
 		 453 aa  63.5  0.000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2928  RND family efflux transporter MFP subunit  25.45 
 
 		 431 aa  63.5  0.000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00603978  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1617  secretion protein HlyD  24.5 
 
 		 408 aa  63.2  0.000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0160623  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1046  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.49 
 
 		 378 aa  63.2  0.000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0357289  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1762  RND family efflux transporter MFP subunit  24.92 
 
 		 421 aa  63.2  0.000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0464275  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0308  secretion protein HlyD  28.86 
 
 		 421 aa  63.2  0.000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.742688 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1184  secretion protein HlyD  28.18 
 
 		 396 aa  62.4  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1462  RND family efflux transporter MFP subunit  28.37 
 
 		 418 aa  62.4  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2685  RND family efflux transporter MFP subunit  29.77 
 
 		 383 aa  61.6  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.133522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3467  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.44 
 
 		 376 aa  62  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00013135  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>