More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0008 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0008  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 		 363 aa  728    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000302217  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0311  secretion protein HlyD family protein  81.39 
 
 		 361 aa  606  9.999999999999999e-173  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0146421  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1503  secretion protein HlyD  51.68 
 
 		 395 aa  362  6e-99  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.289067  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1295  secretion protein HlyD family protein  52.23 
 
 		 361 aa  358  7e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0102  secretion protein HlyD family protein  48.48 
 
 		 361 aa  337  1.9999999999999998e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0100  hypothetical protein  48.48 
 
 		 361 aa  337  1.9999999999999998e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4556  secretion protein HlyD family protein  46.11 
 
 		 361 aa  321  9.999999999999999e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.241944  normal  0.0605665 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4423  secretion protein HlyD family protein  46.11 
 
 		 361 aa  321  9.999999999999999e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.045905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5590  secretion protein HlyD family protein  47.49 
 
 		 361 aa  299  5e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.753958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7009  secretion protein HlyD family protein  44.13 
 
 		 361 aa  296  5e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.159202  normal  0.765528 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5888  secretion protein HlyD family protein  46.26 
 
 		 361 aa  295  1e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.998521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0446  membrane protein  46.65 
 
 		 361 aa  290  3e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.210333  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2767  MFP family transporter  44.97 
 
 		 361 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0148  membrane protein  44.69 
 
 		 361 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1319  MFP family transporter  44.69 
 
 		 361 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2624  MFP family transporter  44.69 
 
 		 361 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1032  ABC-type export system, membrane fusion protein  44.69 
 
 		 361 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0174  MFP family transporter  44.41 
 
 		 361 aa  278  1e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1224  secretion protein HlyD  44.72 
 
 		 362 aa  278  2e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.343602  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0471  secretion protein HlyD family protein  31.18 
 
 		 414 aa  130  4.0000000000000003e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1810  hypothetical protein  28.25 
 
 		 326 aa  108  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.516711  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1115  secretion protein HlyD family protein  27.94 
 
 		 347 aa  107  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.719605  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0963  hypothetical protein  28.01 
 
 		 307 aa  102  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0165  secretion protein HlyD family protein  30.35 
 
 		 411 aa  93.2  6e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1396  secretion protein HlyD family protein  25.82 
 
 		 310 aa  88.6  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0504775  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1628  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.44 
 
 		 383 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2112  secretion protein HlyD family protein  27.56 
 
 		 372 aa  84.3  0.000000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  unclonable  0.0000000135214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3085  secretion protein HlyD family protein  26.39 
 
 		 353 aa  79  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.22636  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2082  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.52 
 
 		 416 aa  75.5  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0563  secretion protein HlyD  26.59 
 
 		 456 aa  73.6  0.000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0573  macrolide secretion protein MacA  25.09 
 
 		 455 aa  72.4  0.00000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.00000000000123833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1480  secretion protein HlyD family protein  25.93 
 
 		 349 aa  71.2  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.785095  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2825  RND family efflux transporter subunit MFP  31.89 
 
 		 500 aa  69.3  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.708608  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1440  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.2 
 
 		 374 aa  67.4  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.266014  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1382  secretion protein HlyD family protein  28.1 
 
 		 340 aa  67  0.0000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.396008  hitchhiker  0.000481704 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1830  secretion protein HlyD  28.51 
 
 		 449 aa  66.6  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1902  secretion protein HlyD  26.46 
 
 		 395 aa  65.5  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0432629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1286  hypothetical protein  25 
 
 		 331 aa  65.9  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.42 
 
 		 377 aa  64.7  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.69897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2812  hypothetical protein  25.26 
 
 		 328 aa  64.3  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.659594  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2900  hypothetical protein  25.26 
 
 		 328 aa  64.3  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.441654  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3163  efflux pump membrane protein  24.23 
 
 		 390 aa  64.7  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2949  RND family efflux transporter MFP subunit  25.94 
 
 		 376 aa  63.5  0.000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2492  RND family efflux transporter subunit MFP  25.93 
 
 		 437 aa  62.4  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.311613  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3014  multidrug resistance protein A  25.77 
 
 		 390 aa  61.6  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193784 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3120  multidrug resistance protein A  25.77 
 
 		 390 aa  61.6  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0308659 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1794  secretion protein HlyD family protein  26.26 
 
 		 350 aa  62  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5245  secretion protein HlyD family protein  27.86 
 
 		 333 aa  62  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2997  multidrug resistance protein A  25.77 
 
 		 390 aa  61.6  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138717 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3930  multidrug resistance protein A  25 
 
 		 394 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.725166 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2026  secretion protein HlyD family protein  29.41 
 
 		 401 aa  60.8  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.705126  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02540  multidrug efflux system  24.61 
 
 		 390 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0999  efflux pump membrane protein  24.61 
 
 		 390 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.486081  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02505  hypothetical protein  24.61 
 
 		 390 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2968  multidrug resistance protein A  24.61 
 
 		 390 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.157313  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2931  multidrug resistance protein A  25.77 
 
 		 390 aa  60.5  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0659  secretion protein HlyD  23.61 
 
 		 335 aa  60.5  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0195539 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1022  efflux pump membrane protein  24.61 
 
 		 390 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.727271  normal  0.0227655 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2962  multidrug resistance protein A  25.77 
 
 		 390 aa  60.5  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.832708  hitchhiker  0.00715907 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2821  multidrug resistance protein A  24.61 
 
 		 390 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0663  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.86 
 
 		 453 aa  60.5  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2807  multidrug resistance protein A  24.61 
 
 		 390 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000414824  hitchhiker  0.00826621 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2004  secretion protein HlyD family protein  28.79 
 
 		 380 aa  60.1  0.00000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0463  HlyD family secretion protein  24.43 
 
 		 314 aa  59.7  0.00000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4967  HlyD family secretion protein  28.36 
 
 		 343 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0119064 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2925  secretion protein HlyD family protein  23.17 
 
 		 314 aa  59.7  0.00000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003056  multidrug resistance efflux pump  29.32 
 
 		 354 aa  59.7  0.00000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3037  secretion protein HlyD  28.11 
 
 		 344 aa  59.3  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.714598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1204  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25 
 
 		 471 aa  59.3  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3191  multidrug resistance protein A  25 
 
 		 390 aa  58.2  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.168067  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0853  hypothetical protein  24.65 
 
 		 331 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0913  hypothetical protein  24.65 
 
 		 331 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.16155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2843  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.74 
 
 		 496 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0906  secretion protein HlyD  24.43 
 
 		 449 aa  58.2  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.101628  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5132  RND family efflux transporter MFP subunit  23.28 
 
 		 445 aa  58.5  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0782  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.27 
 
 		 428 aa  57.8  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00204407  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0966  hypothetical protein  24.65 
 
 		 331 aa  57.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1847  putative efflux transporter  24.73 
 
 		 421 aa  57.8  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0881  hypothetical protein  24.65 
 
 		 331 aa  57.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.775184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2193  multidrug resistance protein MdtN  27.32 
 
 		 350 aa  57.8  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0945  hypothetical protein  24.65 
 
 		 331 aa  57.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07032  hypothetical protein  29.15 
 
 		 349 aa  57.4  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4203  hypothetical protein  27.06 
 
 		 316 aa  57.8  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.99855  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02278  EmrKY-TolC multidrug resistance efflux pump, membrane fusion protein component  27 
 
 		 387 aa  57  0.0000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.29421  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1289  efflux pump membrane protein  27 
 
 		 387 aa  57  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3725  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.61 
 
 		 516 aa  57.4  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.183704 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1398  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.18 
 
 		 504 aa  57.4  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1422  secretion protein HlyD  26.19 
 
 		 359 aa  57.4  0.0000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0497268  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3599  drug resistance MFS transporter, membrane fusion protein (MFP) subunit EmrK  27 
 
 		 387 aa  57.4  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0273562 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02239  hypothetical protein  27 
 
 		 387 aa  57  0.0000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.371729  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1301  efflux pump membrane protein  27 
 
 		 387 aa  57  0.0000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.632829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2518  drug resistance MFS transporter, membrane fusion protein (MFP) subunit EmrK  26.67 
 
 		 387 aa  57.4  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2505  drug resistance MFS transporter, membrane fusion protein (MFP) subunit EmrK  27 
 
 		 387 aa  57  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.012377  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2737  drug resistance MFS transporter, membrane fusion protein (MFP) subunit EmrK  27 
 
 		 387 aa  57  0.0000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.778541  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1493  secretion protein HlyD family protein  24.59 
 
 		 332 aa  57  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.172966  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5189  secretion protein HlyD family protein  23.81 
 
 		 409 aa  56.6  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.484438  normal  0.367271 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3839  secretion protein HlyD  23.98 
 
 		 439 aa  57  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2557  hypothetical protein  25 
 
 		 331 aa  56.6  0.0000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0402  HlyD family secretion protein  23.78 
 
 		 314 aa  56.6  0.0000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2865  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.34 
 
 		 478 aa  56.2  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0716848 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>