More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2112 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2112  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 		 372 aa  748    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  unclonable  0.0000000135214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0165  secretion protein HlyD family protein  58.59 
 
 		 411 aa  370  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1810  hypothetical protein  38.48 
 
 		 326 aa  211  2e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.516711  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0963  hypothetical protein  35.53 
 
 		 307 aa  192  1e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1115  secretion protein HlyD family protein  34.26 
 
 		 347 aa  173  3.9999999999999995e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.719605  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0471  secretion protein HlyD family protein  32.66 
 
 		 414 aa  173  5e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1628  efflux transporter, RND family, MFP subunit  59.23 
 
 		 383 aa  163  4.0000000000000004e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1396  secretion protein HlyD family protein  32.2 
 
 		 310 aa  139  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0504775  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1295  secretion protein HlyD family protein  30.77 
 
 		 361 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3990  secretion protein HlyD family protein  30.94 
 
 		 383 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.302523  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0311  secretion protein HlyD family protein  28.65 
 
 		 361 aa  105  1e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0146421  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3632  secretion protein HlyD family protein  32.73 
 
 		 363 aa  104  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5486  secretion protein HlyD family protein  32.37 
 
 		 363 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.707329  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4556  secretion protein HlyD family protein  31.81 
 
 		 361 aa  99.8  8e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.241944  normal  0.0605665 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4423  secretion protein HlyD family protein  31.81 
 
 		 361 aa  99.8  8e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.045905  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0008  secretion protein HlyD family protein  29.71 
 
 		 363 aa  99.4  9e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000302217  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0736  major facilitator superfamily multidrug efflux pump membrane fusion protein  31.23 
 
 		 375 aa  99  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4975  secretion protein HlyD family protein  32.13 
 
 		 363 aa  99  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.710374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4021  secretion protein HlyD  30.61 
 
 		 345 aa  98.6  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1503  secretion protein HlyD  30.4 
 
 		 395 aa  97.1  4e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.289067  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7473  secretion protein HlyD family protein  36.77 
 
 		 390 aa  97.4  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4608  secretion protein HlyD  31.65 
 
 		 364 aa  96.7  6e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3755  secretion protein HlyD family protein  31.65 
 
 		 364 aa  96.7  6e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.178549  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3768  secretion protein HlyD family protein  31.65 
 
 		 364 aa  96.7  7e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.20986 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2980  secretion protein HlyD family protein  31.42 
 
 		 383 aa  95.9  9e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4416  secretion protein HlyD family protein  35.42 
 
 		 366 aa  94.7  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.401076  normal  0.621386 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7009  secretion protein HlyD family protein  30.98 
 
 		 361 aa  94.7  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.159202  normal  0.765528 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0100  hypothetical protein  28.19 
 
 		 361 aa  94.4  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2344  HlyD family secretion protein  32.01 
 
 		 364 aa  94.4  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0102  secretion protein HlyD family protein  28.19 
 
 		 361 aa  94.4  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4651  HlyD family multidrug resistance protein  36.13 
 
 		 380 aa  94  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.731563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3085  secretion protein HlyD family protein  30.55 
 
 		 353 aa  94  4e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.22636  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5589  HlyD family multidrug resistance protein protein  31.78 
 
 		 346 aa  92.8  8e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.346185 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0312  secretion protein HlyD family protein  36.27 
 
 		 400 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17056  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0954  secretion protein HlyD family protein  30.27 
 
 		 413 aa  91.7  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.702567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6769  secretion protein HlyD family protein  30.13 
 
 		 393 aa  90.5  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.238192  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0402  HlyD family secretion protein  30.88 
 
 		 348 aa  90.1  5e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.111756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0238  secretion protein HlyD  30.36 
 
 		 375 aa  88.6  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3613  secretion protein HlyD family protein  27.24 
 
 		 422 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.281428  hitchhiker  0.00219458 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6188  putative multidrug resistance protein A  33.81 
 
 		 456 aa  87.4  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.650101  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4494  secretion protein HlyD family protein  36.98 
 
 		 374 aa  87.4  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.001486  normal  0.244602 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0552  secretion protein HlyD  29.03 
 
 		 350 aa  87  5e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2180  secretion protein HlyD  36.65 
 
 		 408 aa  86.3  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3442  secretion protein HlyD family protein  29.03 
 
 		 421 aa  85.9  9e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.711294 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3279  secretion protein HlyD  29.12 
 
 		 385 aa  85.9  9e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.119493  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4283  secretion protein HlyD family protein  34.41 
 
 		 365 aa  84.3  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.638187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0744  secretion protein HlyD  32.37 
 
 		 363 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6561  secretion protein HlyD family protein  31.05 
 
 		 397 aa  83.6  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0560581  normal  0.0514365 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1543  secretion protein HlyD family protein  28.97 
 
 		 352 aa  82  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0156  secretion protein HlyD  33.18 
 
 		 390 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1980  secretion protein HlyD  36.61 
 
 		 411 aa  82  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.539609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3509  secretion protein HlyD family protein  29.69 
 
 		 351 aa  80.5  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00899  putative multidrug resistance transmembrane protein  30.95 
 
 		 363 aa  80.1  0.00000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.359729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0522  secretion protein HlyD family protein  30.21 
 
 		 351 aa  80.1  0.00000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.889598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0523  secretion protein HlyD family protein  29.69 
 
 		 351 aa  79.7  0.00000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2360  secretion protein HlyD family protein  32.64 
 
 		 344 aa  79.7  0.00000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4202  hypothetical protein  28.51 
 
 		 355 aa  79.7  0.00000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3991  secretion protein HlyD family protein  31.15 
 
 		 371 aa  79  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.713524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3375  HlyD family membrane fusion protein  29.64 
 
 		 425 aa  79  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0446  membrane protein  29.32 
 
 		 361 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.210333  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1088  MFP family transporter  27.23 
 
 		 368 aa  79  0.0000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.802038  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3021  RND family efflux transporter MFP subunit  29.64 
 
 		 418 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0354964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5888  secretion protein HlyD family protein  28.73 
 
 		 361 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.998521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3843  secretion protein HlyD family protein  29.17 
 
 		 352 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4521  secretion protein HlyD family protein  28.12 
 
 		 351 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.170966 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4682  secretion protein HlyD family protein  31.86 
 
 		 372 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.384444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3787  secretion protein HlyD family protein  29.17 
 
 		 352 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3969  secretion protein HlyD family protein  29.17 
 
 		 352 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0482  secretion protein HlyD family protein  29.17 
 
 		 352 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4261  secretion protein HlyD family protein  26.02 
 
 		 347 aa  77.8  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4545  secretion protein HlyD family protein  25.82 
 
 		 335 aa  77.4  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0511236  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5998  secretion protein HlyD family protein  30.23 
 
 		 394 aa  77.4  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1608  secretion protein HlyD family protein  31.68 
 
 		 414 aa  77.4  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000243495 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6488  secretion protein HlyD family protein  32.7 
 
 		 394 aa  77  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4584  secretion protein HlyD family protein  31.08 
 
 		 402 aa  77  0.0000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2890  ABC exporter membrane fusion protein, DevB family  27.55 
 
 		 399 aa  76.3  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.447222  normal  0.499791 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0472  HlyD family secretion protein  30.95 
 
 		 349 aa  76.6  0.0000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.776692  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3406  secretion protein HlyD family protein  31.25 
 
 		 358 aa  76.6  0.0000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3454  secretion protein HlyD family protein  30.21 
 
 		 380 aa  76.3  0.0000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1211  secretion protein HlyD family protein  30.04 
 
 		 386 aa  75.1  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0109615 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0866  multidrug resistance protein A  28.75 
 
 		 331 aa  75.1  0.000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0834  secretion protein HlyD family protein  31.42 
 
 		 396 aa  75.1  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.541495 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0411  HlyD family secretion protein  30.48 
 
 		 349 aa  75.1  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1992  putative secretion protein  25.1 
 
 		 344 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2114  multidrug resistance protein A  31.08 
 
 		 393 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23530  putative secretion protein  25.1 
 
 		 355 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0127928 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1150  multidrug resistance protein A  28.75 
 
 		 331 aa  75.1  0.000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3892  secretion protein HlyD family protein  28.57 
 
 		 352 aa  74.3  0.000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0795  RND family efflux transporter MFP subunit  25.68 
 
 		 411 aa  74.7  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1976  secretion protein HlyD family protein  28.27 
 
 		 387 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.339437  hitchhiker  0.00926098 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1224  secretion protein HlyD  39.42 
 
 		 362 aa  73.9  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.343602  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3784  secretion protein HlyD family protein  28.27 
 
 		 387 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52274  normal  0.687731 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4248  secretion protein HlyD family protein  33.33 
 
 		 397 aa  73.9  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0400018  normal  0.0754484 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3795  secretion protein HlyD family protein  28.87 
 
 		 373 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.327061 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0696  secretion protein HlyD family protein  28.85 
 
 		 353 aa  73.2  0.000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.24713 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3406  secretion protein HlyD  34.34 
 
 		 419 aa  73.2  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0814588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1507  secretion protein HlyD family protein  27.75 
 
 		 351 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.194742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4226  secretion protein HlyD family protein  26.32 
 
 		 411 aa  72.4  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1040  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.26 
 
 		 500 aa  72  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1332  secretion protein HlyD family protein  28.18 
 
 		 342 aa  71.6  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.729441  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>