More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1224 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A1224  secretion protein HlyD  100 
 
 		 362 aa  723    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.343602  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4423  secretion protein HlyD family protein  68.89 
 
 		 361 aa  489  1e-137  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.045905  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4556  secretion protein HlyD family protein  68.89 
 
 		 361 aa  489  1e-137  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.241944  normal  0.0605665 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1295  secretion protein HlyD family protein  61.84 
 
 		 361 aa  448  1e-125  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1503  secretion protein HlyD  59.05 
 
 		 395 aa  411  1e-113  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.289067  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0446  membrane protein  62.22 
 
 		 361 aa  390  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.210333  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7009  secretion protein HlyD family protein  59.5 
 
 		 361 aa  390  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.159202  normal  0.765528 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2767  MFP family transporter  63.41 
 
 		 361 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1032  ABC-type export system, membrane fusion protein  63.13 
 
 		 361 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5888  secretion protein HlyD family protein  61.11 
 
 		 361 aa  378  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.998521  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0148  membrane protein  62.85 
 
 		 361 aa  376  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2624  MFP family transporter  62.85 
 
 		 361 aa  376  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1319  MFP family transporter  62.85 
 
 		 361 aa  376  1e-103  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0174  MFP family transporter  62.57 
 
 		 361 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5590  secretion protein HlyD family protein  58.38 
 
 		 361 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.753958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0102  secretion protein HlyD family protein  51.39 
 
 		 361 aa  348  1e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0100  hypothetical protein  51.39 
 
 		 361 aa  348  1e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0311  secretion protein HlyD family protein  45.71 
 
 		 361 aa  330  3e-89  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0146421  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0008  secretion protein HlyD family protein  46.06 
 
 		 363 aa  304  2.0000000000000002e-81  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000302217  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0471  secretion protein HlyD family protein  34.3 
 
 		 414 aa  148  2.0000000000000003e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1115  secretion protein HlyD family protein  30.73 
 
 		 347 aa  115  2.0000000000000002e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.719605  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1810  hypothetical protein  29.4 
 
 		 326 aa  99  1e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.516711  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0963  hypothetical protein  31.65 
 
 		 307 aa  93.6  5e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0165  secretion protein HlyD family protein  31.01 
 
 		 411 aa  92  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1628  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.09 
 
 		 383 aa  87.8  3e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2112  secretion protein HlyD family protein  30.19 
 
 		 372 aa  78.6  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  unclonable  0.0000000135214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4021  secretion protein HlyD  25.41 
 
 		 345 aa  69.7  0.00000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3892  secretion protein HlyD family protein  27.61 
 
 		 352 aa  68.2  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0875  secretion protein HlyD family protein  26.69 
 
 		 315 aa  66.2  0.0000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.316135 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8104  secretion protein HlyD family protein  29.48 
 
 		 354 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0259  secretion protein HlyD  24.53 
 
 		 327 aa  65.9  0.000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.689376  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3037  secretion protein HlyD  32.87 
 
 		 344 aa  61.6  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.714598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1586  secretion protein HlyD family protein  25.14 
 
 		 328 aa  60.8  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.125031  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4698  hypothetical protein  28.73 
 
 		 334 aa  60.8  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.528303  normal  0.639413 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0795  RND family efflux transporter MFP subunit  27.48 
 
 		 411 aa  60.1  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3362  secretion protein HlyD family protein  31.58 
 
 		 413 aa  59.7  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00242557 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1493  secretion protein HlyD family protein  28.57 
 
 		 332 aa  59.7  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.172966  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5245  secretion protein HlyD family protein  30.85 
 
 		 333 aa  59.3  0.00000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3000  hypothetical protein  27.74 
 
 		 337 aa  58.9  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1513  secretion protein HlyD family protein  25.57 
 
 		 384 aa  58.5  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1549  secretion protein HlyD family protein  25.57 
 
 		 372 aa  57.8  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0696  secretion protein HlyD family protein  28.45 
 
 		 353 aa  57.4  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.24713 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1863  RND family efflux transporter MFP subunit  26.35 
 
 		 393 aa  57.8  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2115  secretion protein HlyD family protein  32.3 
 
 		 334 aa  57.8  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.441068  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3104  secretion protein HlyD family protein  31.75 
 
 		 407 aa  57.8  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.599645  normal  0.0169498 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2825  RND family efflux transporter subunit MFP  24.75 
 
 		 500 aa  57.8  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.708608  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.9 
 
 		 377 aa  57.4  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.69897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1902  secretion protein HlyD  26.65 
 
 		 395 aa  56.6  0.0000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0432629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2858  secretion protein HlyD  28.01 
 
 		 517 aa  56.6  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2370  secretion protein HlyD  28.43 
 
 		 344 aa  56.6  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.972198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2560  multidrug resistance protein  32.29 
 
 		 410 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.634691  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1382  secretion protein HlyD family protein  28.37 
 
 		 340 aa  55.8  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.396008  hitchhiker  0.000481704 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1774  secretion protein HlyD family protein  30.17 
 
 		 355 aa  55.5  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0270  putative MacA-like membrane transport protein  27.41 
 
 		 417 aa  55.8  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2833  secretion protein HlyD family protein  25.76 
 
 		 383 aa  55.5  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.121026  normal  0.828234 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6154  secretion protein HlyD family protein  30.52 
 
 		 470 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.18096 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2355  secretion protein HlyD  32.43 
 
 		 509 aa  55.8  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0694634 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2949  RND family efflux transporter MFP subunit  28.14 
 
 		 376 aa  55.8  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1283  secretion protein HlyD  30.52 
 
 		 475 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.277079  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1522  secretion protein HlyD family protein  25.76 
 
 		 378 aa  55.8  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6548  secretion protein HlyD family protein  30.52 
 
 		 475 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1286  hypothetical protein  24.83 
 
 		 331 aa  54.7  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6274  secretion protein HlyD family protein  34.27 
 
 		 460 aa  55.1  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0399198 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6560  secretion protein HlyD family protein  34.27 
 
 		 460 aa  55.1  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.21193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003056  multidrug resistance efflux pump  27.81 
 
 		 354 aa  53.9  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1919  multidrug resistance protein  31.25 
 
 		 411 aa  53.9  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.666477  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1744  multidrug resistance protein  31.25 
 
 		 411 aa  53.9  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2750  secretion protein HlyD family protein  26.33 
 
 		 337 aa  53.9  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1767  multidrug resistance protein  31.25 
 
 		 411 aa  53.9  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1057  multidrug resistance protein, putative  31.25 
 
 		 411 aa  53.9  0.000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0394345  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0995  putative multidrug resistance protein  31.25 
 
 		 411 aa  53.9  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0171  putative multidrug resistance protein  31.25 
 
 		 411 aa  53.9  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.152509  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1503  putative multidrug resistance protein  31.25 
 
 		 411 aa  53.9  0.000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0516  secretion protein HlyD family protein  28.31 
 
 		 389 aa  53.5  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4735  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.41 
 
 		 432 aa  53.5  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0659148 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1396  secretion protein HlyD family protein  45.61 
 
 		 310 aa  53.5  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0504775  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4584  secretion protein HlyD family protein  35.38 
 
 		 402 aa  53.5  0.000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1751  efflux pump membrane protein  31.77 
 
 		 407 aa  53.1  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0610226 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2492  RND family efflux transporter subunit MFP  25.46 
 
 		 437 aa  53.1  0.000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.311613  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1833  RND family efflux transporter MFP subunit  28.57 
 
 		 464 aa  52.8  0.000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.36059  unclonable  0.000000000906287 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1386  secretion protein HlyD family protein  31.58 
 
 		 407 aa  52.8  0.000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2973  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.86 
 
 		 448 aa  52.4  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1426  secretion protein HlyD family protein  31.58 
 
 		 405 aa  52.8  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0183071 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4645  HlyD family secretion protein  32.81 
 
 		 404 aa  52.8  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.109619  normal  0.493066 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0350  secretion protein HlyD  26.17 
 
 		 320 aa  52.8  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1024  secretion protein HlyD  32.11 
 
 		 404 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0129  hypothetical protein  29.41 
 
 		 344 aa  52.4  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.993938  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4975  secretion protein HlyD family protein  31.84 
 
 		 363 aa  52.4  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.710374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2575  secretion protein HlyD family protein  25.55 
 
 		 337 aa  52  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1480  secretion protein HlyD family protein  32.11 
 
 		 404 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1504  secretion protein HlyD family protein  32.11 
 
 		 404 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.226713  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1480  secretion protein HlyD family protein  24.67 
 
 		 349 aa  52.4  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.785095  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2847  secretion protein HlyD family protein  27.24 
 
 		 331 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1705  HlyD family secretion protein  25.19 
 
 		 308 aa  52  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3706  secretion protein HlyD family protein  27.94 
 
 		 348 aa  52  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1263  efflux transporter  28.74 
 
 		 415 aa  52  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.471028  normal  0.778162 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4226  RND family efflux transporter MFP subunit  29.56 
 
 		 426 aa  52  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.499264  normal  0.926991 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1532  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.94 
 
 		 415 aa  52  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5897  multidrug resistance protein  25.61 
 
 		 400 aa  52  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0468  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.82 
 
 		 445 aa  51.6  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>