More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_1522 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_1513  secretion protein HlyD family protein  94.53 
 
 
384 aa  641    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2833  secretion protein HlyD family protein  95.3 
 
 
383 aa  665    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.121026  normal  0.828234 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1522  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 
378 aa  752    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1549  secretion protein HlyD family protein  95.15 
 
 
372 aa  623  1e-177  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1420  secretion protein HlyD family protein  89.13 
 
 
332 aa  536  1e-151  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1705  HlyD family secretion protein  78.55 
 
 
308 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2750  secretion protein HlyD family protein  81.76 
 
 
337 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2575  secretion protein HlyD family protein  81.63 
 
 
337 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2642  secretion protein HlyD family protein  81.97 
 
 
337 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3589  HlyD family secretion protein  57.89 
 
 
320 aa  302  6.000000000000001e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0875  secretion protein HlyD family protein  52.19 
 
 
315 aa  300  3e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.316135 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1250  hypothetical protein  41.56 
 
 
322 aa  226  7e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.249085  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4203  hypothetical protein  37.99 
 
 
316 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.99855  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4361  secretion protein HlyD family protein  37.75 
 
 
313 aa  211  1e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06357  hypothetical protein  40.97 
 
 
316 aa  212  1e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0587  hypothetical protein  39.93 
 
 
314 aa  204  1e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0654708  hitchhiker  0.0000117707 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1263  hypothetical protein  38.14 
 
 
315 aa  205  1e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00237907  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3537  hypothetical protein  37.94 
 
 
323 aa  204  3e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001404  membrane-fusion protein  39.68 
 
 
315 aa  199  7e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0427  hypothetical protein  38.31 
 
 
317 aa  188  1e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1354  secretion protein HlyD family protein  41.06 
 
 
316 aa  163  5.0000000000000005e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000149353  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2904  secretion protein HlyD family protein  31.47 
 
 
329 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.839486  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0659  secretion protein HlyD  30.58 
 
 
335 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0195539 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2823  HlyD family secretion protein  29.31 
 
 
329 aa  108  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3278  secretion protein HlyD family protein  30.95 
 
 
333 aa  108  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0971  secretion protein HlyD family protein  30.61 
 
 
333 aa  102  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.70003 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0916  secretion protein HlyD family protein  32.47 
 
 
335 aa  102  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1147  secretion protein HlyD family protein  31.23 
 
 
328 aa  100  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000143256  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3037  secretion protein HlyD  28.86 
 
 
344 aa  100  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.714598  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2054  periplasmic component of efflux system  30.03 
 
 
332 aa  100  6e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0146  auxiliary membrane fusion protein family transporter  30.03 
 
 
326 aa  99.4  1e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000237701  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3464  secretion protein HlyD  26.55 
 
 
335 aa  97.4  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1286  hypothetical protein  25.73 
 
 
331 aa  95.5  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2446  secretion protein HlyD  26.47 
 
 
331 aa  94  4e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0391443  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1480  secretion protein HlyD family protein  24.45 
 
 
349 aa  92.8  9e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.785095  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1586  secretion protein HlyD family protein  26.41 
 
 
328 aa  91.3  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.125031  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2942  hypothetical protein  29.63 
 
 
342 aa  91.7  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.495568  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2370  secretion protein HlyD  28.32 
 
 
344 aa  91.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.972198  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2847  secretion protein HlyD family protein  28.18 
 
 
331 aa  89  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0860  hypothetical protein  28.18 
 
 
331 aa  89  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0913  hypothetical protein  27.4 
 
 
331 aa  89  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.16155  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0881  hypothetical protein  27.4 
 
 
331 aa  88.6  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.775184  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0966  hypothetical protein  27.4 
 
 
331 aa  88.6  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0853  hypothetical protein  27.4 
 
 
331 aa  89  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0945  hypothetical protein  27.4 
 
 
331 aa  88.6  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0259  secretion protein HlyD  23.51 
 
 
327 aa  89.4  1e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.689376  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00762  hypothetical protein  28.18 
 
 
332 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2848  hypothetical protein  28.18 
 
 
331 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0314529 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0943  hypothetical protein  28.18 
 
 
331 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0849  hypothetical protein  28.18 
 
 
331 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00779  hypothetical protein  28.18 
 
 
332 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1793  hypothetical protein  30.14 
 
 
347 aa  88.6  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0463341  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0129  hypothetical protein  28.87 
 
 
344 aa  88.2  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.993938  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20080  hypothetical protein  31.9 
 
 
323 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0818  hypothetical protein  28.18 
 
 
331 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2557  hypothetical protein  28.28 
 
 
331 aa  88.2  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4698  hypothetical protein  31.85 
 
 
334 aa  87.8  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.528303  normal  0.639413 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1115  secretion protein HlyD family protein  32.46 
 
 
347 aa  87.4  4e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.719605  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0499  secretion protein HlyD family protein  33.01 
 
 
323 aa  87.4  4e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1728  hypothetical protein  32.38 
 
 
323 aa  86.7  6e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0534587  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2115  secretion protein HlyD family protein  29.02 
 
 
334 aa  86.3  7e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.441068  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3253  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.88 
 
 
496 aa  86.3  9e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2420  hypothetical protein  27.52 
 
 
334 aa  85.1  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0441115  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3000  hypothetical protein  30.82 
 
 
337 aa  83.6  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2843  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.57 
 
 
496 aa  83.6  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0700  putative lipoprotein  28.87 
 
 
359 aa  83.2  0.000000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0351  secretion protein HlyD  28.24 
 
 
326 aa  82.4  0.00000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1741  secretion protein HlyD family protein  30.07 
 
 
336 aa  81.3  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0409  secretion protein HlyD  26.95 
 
 
332 aa  81.3  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1521  hypothetical protein  29.29 
 
 
342 aa  80.9  0.00000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0176899  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3131  secretion protein HlyD  29.68 
 
 
344 aa  80.9  0.00000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0978227  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1329  hypothetical protein  26.33 
 
 
328 aa  80.5  0.00000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8104  secretion protein HlyD family protein  29.81 
 
 
354 aa  80.5  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1164  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.43 
 
 
467 aa  79.7  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.748472 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1039  secretion protein HlyD  28.51 
 
 
427 aa  79.7  0.00000000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2900  hypothetical protein  25.94 
 
 
328 aa  79.3  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.441654  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1422  secretion protein HlyD  27.52 
 
 
359 aa  79.3  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0497268  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2812  hypothetical protein  25.94 
 
 
328 aa  79.3  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.659594  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1342  HlyD family secretion protein  27.78 
 
 
317 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3250  hypothetical protein  29.45 
 
 
337 aa  76.3  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1305  hypothetical protein  32.25 
 
 
346 aa  76.3  0.0000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.126611  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1778  secretion protein HlyD  27.19 
 
 
339 aa  75.9  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.32933  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1493  secretion protein HlyD family protein  28.01 
 
 
332 aa  75.9  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.172966  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3415  secretion protein HlyD family protein  29.63 
 
 
406 aa  75.9  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.297812  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2511  hypothetical protein  27.45 
 
 
334 aa  75.1  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.607384  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3705  hypothetical protein  28.47 
 
 
343 aa  75.5  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1382  secretion protein HlyD family protein  29.53 
 
 
340 aa  74.3  0.000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.396008  hitchhiker  0.000481704 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2920  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.37 
 
 
505 aa  74.3  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.214189 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3713  secretion protein HlyD family protein  29.26 
 
 
404 aa  73.9  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.598746 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1794  secretion protein HlyD family protein  30.66 
 
 
350 aa  73.9  0.000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3107  secretion protein HlyD family protein  30.77 
 
 
355 aa  73.6  0.000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.128244  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1943  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.17 
 
 
450 aa  73.6  0.000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1719  secretion protein HlyD  27.4 
 
 
315 aa  73.2  0.000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0706497  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4226  secretion protein HlyD family protein  28.76 
 
 
411 aa  73.2  0.000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2810  secretion protein HlyD family protein  25 
 
 
368 aa  72.8  0.000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.653473 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0163  lipoprotein  27.74 
 
 
311 aa  72.4  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0904469  normal  0.961053 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0052  secretion protein HlyD family protein  27.68 
 
 
324 aa  72.8  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0108  HlyD family secretion protein  29.92 
 
 
413 aa  72.4  0.00000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.736551  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3091  secretion protein HlyD family protein  26.34 
 
 
334 aa  72  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4061  secretion protein HlyD family protein  28.23 
 
 
354 aa  71.6  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>