More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4545 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4545  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 		 335 aa  669    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0511236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2645  hypothetical protein  46.73 
 
 		 310 aa  273  4.0000000000000004e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4021  secretion protein HlyD  26.18 
 
 		 345 aa  90.9  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3085  secretion protein HlyD family protein  27.88 
 
 		 353 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.22636  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1857  secretion protein HlyD  27.5 
 
 		 390 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0696  secretion protein HlyD family protein  25.92 
 
 		 353 aa  80.1  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.24713 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1685  RND family efflux transporter MFP subunit  27.47 
 
 		 387 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2112  secretion protein HlyD family protein  26.95 
 
 		 372 aa  77  0.0000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  unclonable  0.0000000135214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2543  secretion protein HlyD  24.44 
 
 		 471 aa  76.3  0.0000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.467529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6769  secretion protein HlyD family protein  26.6 
 
 		 393 aa  72.8  0.000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.238192  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4209  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.78 
 
 		 392 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.122721  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2160  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.02 
 
 		 390 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.337788  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1868  secretion protein HlyD  28.25 
 
 		 405 aa  71.6  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6201  putative accessory protein to ABC-type macrolide transport protein MacB  27.88 
 
 		 430 aa  70.9  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.655632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1298  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.7 
 
 		 410 aa  70.5  0.00000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.61066  normal  0.83964 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1970  secretion protein HlyD  27.5 
 
 		 390 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0699832  normal  0.38447 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0659  secretion protein HlyD  26.89 
 
 		 335 aa  70.1  0.00000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0195539 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2587  secretion protein HlyD  23.68 
 
 		 400 aa  69.3  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.897533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3781  RND family efflux transporter MFP subunit  29.05 
 
 		 407 aa  69.3  0.00000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4150  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.9 
 
 		 397 aa  67.8  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00923789  hitchhiker  0.000000297953 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33770  hypothetical protein  27.37 
 
 		 391 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.127582  hitchhiker  0.00383681 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3531  secretion protein HlyD  24.05 
 
 		 400 aa  67.4  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445744  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1047  RND family efflux transporter subunit MFP  24.92 
 
 		 461 aa  67.4  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0423833  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0096  putative macrolide-specific efflux protein MacA  27.39 
 
 		 399 aa  67.8  0.0000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3522  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.79 
 
 		 421 aa  67  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1101  RND family efflux transporter MFP subunit  28.57 
 
 		 414 aa  67  0.0000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.402678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1713  multidrug resistance efflux pump-like protein  28.06 
 
 		 392 aa  67  0.0000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.254154  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2584  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.79 
 
 		 421 aa  66.6  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2705  secretion protein HlyD family protein  25.51 
 
 		 368 aa  66.2  0.0000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2871  hypothetical protein  27.37 
 
 		 391 aa  65.9  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.518674  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0913  hypothetical protein  24.79 
 
 		 338 aa  65.9  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3038  secretion protein HlyD  28.99 
 
 		 403 aa  65.5  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000167095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1224  ABC-transporter membrane fusion protein  25.36 
 
 		 366 aa  65.5  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.677987 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0010  ABC exporter membrane fusion protein, DevB family  25.25 
 
 		 439 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.860595 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3340  secretion protein HlyD family protein  26.33 
 
 		 334 aa  65.5  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3533  RND family efflux transporter MFP subunit  26.18 
 
 		 409 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.722317 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0882  hypothetical protein  24.79 
 
 		 338 aa  64.7  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3640  heterocyst specific ABC-transporter, membrane fusion protein DevB  29.27 
 
 		 434 aa  64.3  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.800892  normal  0.900704 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1462  RND efflux membrane fusion protein precursor  24.81 
 
 		 367 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16591  ABC transporter  25.08 
 
 		 294 aa  65.1  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.501795 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1833  RND family efflux transporter MFP subunit  24.27 
 
 		 464 aa  64.7  0.000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.36059  unclonable  0.000000000906287 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1339  RND family efflux transporter MFP subunit  24.35 
 
 		 384 aa  65.1  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.611384  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4521  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.65 
 
 		 379 aa  64.3  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16800  putative efflux transmembrane protein  25.7 
 
 		 367 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0868415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2236  secretion protein HlyD  25.66 
 
 		 404 aa  63.2  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1256  membrane fusion protein (MFP) family auxiliary transport protein  27.33 
 
 		 397 aa  63.2  0.000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3608  secretion protein HlyD  26.61 
 
 		 400 aa  62.8  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.221607  normal  0.363906 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1621  secretion protein HlyD  25.54 
 
 		 407 aa  62.8  0.000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6561  secretion protein HlyD family protein  26.24 
 
 		 397 aa  62.4  0.000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0560581  normal  0.0514365 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1613  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.8 
 
 		 346 aa  62.8  0.000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3489  RND family efflux transporter MFP subunit  25.22 
 
 		 381 aa  62  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.234911 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1516  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.9 
 
 		 440 aa  62.4  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2452  RND family efflux transporter MFP subunit  26.58 
 
 		 428 aa  62  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.591296 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1695  secretion protein HlyD  24.77 
 
 		 360 aa  62  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4102  secretion protein HlyD family protein  26.69 
 
 		 401 aa  62  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.60829 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1632  secretion protein HlyD family protein  27.87 
 
 		 368 aa  62.4  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.201734  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3456  RND family efflux transporter MFP subunit  24.09 
 
 		 409 aa  62.4  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000285815  normal  0.0164702 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1839  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.09 
 
 		 420 aa  62  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4584  secretion protein HlyD family protein  25.62 
 
 		 402 aa  62  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1810  hypothetical protein  22.52 
 
 		 326 aa  62  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.516711  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3559  RND family efflux transporter MFP subunit  27.19 
 
 		 396 aa  61.2  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0492868  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02661  membrane-fusion protein  23.36 
 
 		 375 aa  61.2  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.489029 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0393  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.44 
 
 		 397 aa  61.6  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1908  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.51 
 
 		 407 aa  62  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001980  probable RND efflux membrane fusion protein  25.11 
 
 		 367 aa  60.8  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.979341  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2042  secretion protein HlyD  26.81 
 
 		 414 aa  60.8  0.00000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.617858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1247  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.46 
 
 		 389 aa  60.5  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.374762  normal  0.534332 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1362  secretion protein HlyD  25.48 
 
 		 381 aa  60.5  0.00000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.27807  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3235  secretion protein HlyD  27.56 
 
 		 391 aa  60.5  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.185962  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2466  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.09 
 
 		 396 aa  60.1  0.00000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4470  secretion protein HlyD family protein  26.33 
 
 		 401 aa  59.7  0.00000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3463  HlyD family secretion protein  26.32 
 
 		 378 aa  59.7  0.00000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0319  RND family efflux transporter MFP subunit  24.7 
 
 		 417 aa  59.3  0.00000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0680  RND family efflux transporter MFP subunit  23.8 
 
 		 417 aa  59.3  0.00000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0364598 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2831  syringolide efflux protein SyfC  26.32 
 
 		 383 aa  59.3  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.580145  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1842  secretion protein HlyD family protein  28.02 
 
 		 330 aa  59.3  0.00000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0372122  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3415  secretion protein HlyD family protein  26.71 
 
 		 406 aa  58.5  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.297812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3523  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.65 
 
 		 438 aa  58.9  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.51854  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10151  ABC transporter  23.4 
 
 		 339 aa  59.3  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.279055  normal  0.0324657 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0635  RND family efflux transporter MFP subunit  24.22 
 
 		 406 aa  58.5  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.320707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1396  secretion protein HlyD family protein  24.34 
 
 		 310 aa  58.5  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0504775  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3883  secretion protein HlyD  26.19 
 
 		 424 aa  59.3  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.135938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1040  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.17 
 
 		 500 aa  58.9  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4616  secretion protein HlyD  24.77 
 
 		 414 aa  58.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4837  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.09 
 
 		 415 aa  58.9  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2630  secretion protein HlyD family protein  25.32 
 
 		 366 aa  58.5  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0794256  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0607  RND family efflux transporter MFP subunit  24.22 
 
 		 406 aa  58.5  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3171  RND family efflux transporter MFP subunit  26.05 
 
 		 416 aa  58.9  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000224755  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0636  secretion protein HlyD family protein  27.84 
 
 		 329 aa  58.9  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0903899  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01671  membrane-fusion protein  26.95 
 
 		 366 aa  58.9  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0152  DevB-like secretion protein  24.01 
 
 		 305 aa  58.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0725  HlyD family secretion protein  25.23 
 
 		 397 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.897812  normal  0.118835 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1082  putative ABC transport system, lipoprotein  25.37 
 
 		 302 aa  58.5  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1115  secretion protein HlyD family protein  23.15 
 
 		 347 aa  58.2  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.719605  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1892  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.65 
 
 		 430 aa  58.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.133123 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0535  secretion protein HlyD  22.45 
 
 		 366 aa  57.8  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1658  secretion protein HlyD family protein  28.57 
 
 		 330 aa  58.2  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.51372  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2220  RND family efflux transporter MFP subunit  27.94 
 
 		 399 aa  57.8  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3233  RND family efflux transporter MFP subunit  24.38 
 
 		 405 aa  58.5  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000196171  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1088  MFP family transporter  24.91 
 
 		 368 aa  58.5  0.0000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.802038  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>