239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3537 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_3537  hypothetical protein  100 
 
 		 323 aa  651    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4361  secretion protein HlyD family protein  61.22 
 
 		 313 aa  366  1e-100  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0587  hypothetical protein  60.26 
 
 		 314 aa  358  7e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0654708  hitchhiker  0.0000117707 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0427  hypothetical protein  63.49 
 
 		 317 aa  339  4e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06357  hypothetical protein  54.88 
 
 		 316 aa  313  1.9999999999999998e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001404  membrane-fusion protein  53.29 
 
 		 315 aa  306  3e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1263  hypothetical protein  51.36 
 
 		 315 aa  283  3.0000000000000004e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00237907  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4203  hypothetical protein  47.9 
 
 		 316 aa  281  7.000000000000001e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.99855  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1250  hypothetical protein  46.93 
 
 		 322 aa  277  2e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.249085  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0875  secretion protein HlyD family protein  39.26 
 
 		 315 aa  211  1e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.316135 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1420  secretion protein HlyD family protein  38.44 
 
 		 332 aa  204  2e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1549  secretion protein HlyD family protein  38.51 
 
 		 372 aa  203  4e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2833  secretion protein HlyD family protein  38.26 
 
 		 383 aa  202  7e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.121026  normal  0.828234 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1513  secretion protein HlyD family protein  38.59 
 
 		 384 aa  202  9e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1705  HlyD family secretion protein  36.89 
 
 		 308 aa  196  6e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1522  secretion protein HlyD family protein  38.46 
 
 		 378 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3589  HlyD family secretion protein  38.75 
 
 		 320 aa  191  1e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2750  secretion protein HlyD family protein  39.26 
 
 		 337 aa  188  1e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2575  secretion protein HlyD family protein  38.26 
 
 		 337 aa  181  2e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2642  secretion protein HlyD family protein  38.26 
 
 		 337 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1354  secretion protein HlyD family protein  40.2 
 
 		 316 aa  160  4e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000149353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3037  secretion protein HlyD  31.65 
 
 		 344 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.714598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0916  secretion protein HlyD family protein  29.67 
 
 		 335 aa  107  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2446  secretion protein HlyD  26.96 
 
 		 331 aa  100  3e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0391443  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3131  secretion protein HlyD  27.92 
 
 		 344 aa  100  5e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0978227  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3464  secretion protein HlyD  27.07 
 
 		 335 aa  96.3  6e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3278  secretion protein HlyD family protein  27.08 
 
 		 333 aa  93.6  4e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2925  secretion protein HlyD family protein  29.49 
 
 		 314 aa  90.9  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2823  HlyD family secretion protein  27.82 
 
 		 329 aa  90.9  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1382  secretion protein HlyD family protein  29.37 
 
 		 340 aa  89.7  6e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.396008  hitchhiker  0.000481704 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2904  secretion protein HlyD family protein  25 
 
 		 329 aa  89.4  8e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.839486  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0971  secretion protein HlyD family protein  27.82 
 
 		 333 aa  89  9e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.70003 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2370  secretion protein HlyD  28.22 
 
 		 344 aa  89  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.972198  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0463  HlyD family secretion protein  28.97 
 
 		 314 aa  86.3  6e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0129  hypothetical protein  28.95 
 
 		 344 aa  86.3  6e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.993938  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3250  hypothetical protein  30.83 
 
 		 337 aa  85.9  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0402  HlyD family secretion protein  28.97 
 
 		 314 aa  85.9  9e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1778  secretion protein HlyD  28.89 
 
 		 339 aa  84  0.000000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.32933  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2054  periplasmic component of efflux system  24.37 
 
 		 332 aa  83.6  0.000000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0146  auxiliary membrane fusion protein family transporter  24.37 
 
 		 326 aa  83.2  0.000000000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000237701  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1902  secretion protein HlyD  26.49 
 
 		 395 aa  82.8  0.000000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0432629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1084  HlyD family secretion protein  27.95 
 
 		 356 aa  80.5  0.00000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.335201 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3705  hypothetical protein  29.5 
 
 		 343 aa  80.5  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1741  secretion protein HlyD family protein  29.08 
 
 		 336 aa  80.1  0.00000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1794  secretion protein HlyD family protein  29.74 
 
 		 350 aa  79.7  0.00000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1493  secretion protein HlyD family protein  27.27 
 
 		 332 aa  79.3  0.00000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.172966  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1286  hypothetical protein  28.03 
 
 		 331 aa  78.2  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1147  secretion protein HlyD family protein  26.97 
 
 		 328 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000143256  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8104  secretion protein HlyD family protein  26.74 
 
 		 354 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2900  hypothetical protein  27.34 
 
 		 328 aa  77  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.441654  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2812  hypothetical protein  27.34 
 
 		 328 aa  77  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.659594  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3000  hypothetical protein  29.21 
 
 		 337 aa  76.6  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1586  secretion protein HlyD family protein  23.97 
 
 		 328 aa  76.6  0.0000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.125031  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2861  secretion protein, HlyD family  28.09 
 
 		 345 aa  75.5  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0659  secretion protein HlyD  24.71 
 
 		 335 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0195539 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2482  secretion protein HlyD family protein  28.09 
 
 		 345 aa  75.5  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1777  secretion protein HlyD family protein  29.41 
 
 		 320 aa  75.1  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0865879  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2115  secretion protein HlyD family protein  24.11 
 
 		 334 aa  73.9  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.441068  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0456  secretion protein HlyD family protein  27.91 
 
 		 324 aa  73.9  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.119386  normal  0.109818 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20080  hypothetical protein  27.46 
 
 		 323 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1728  hypothetical protein  28.57 
 
 		 323 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0534587  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2390  secretion protein HlyD family protein  25.34 
 
 		 348 aa  72.4  0.000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.313977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0506  secretion protein HlyD family protein  28.78 
 
 		 317 aa  72.4  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2839  secretion protein HlyD family protein  27.55 
 
 		 377 aa  70.1  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4061  secretion protein HlyD family protein  28.33 
 
 		 354 aa  69.7  0.00000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1305  hypothetical protein  31.11 
 
 		 346 aa  69.3  0.00000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.126611  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0700  putative lipoprotein  24.03 
 
 		 359 aa  68.6  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1480  secretion protein HlyD family protein  23.08 
 
 		 349 aa  68.2  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.785095  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4698  hypothetical protein  27.78 
 
 		 334 aa  68.2  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.528303  normal  0.639413 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3892  secretion protein HlyD family protein  28.25 
 
 		 352 aa  68.2  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0259  secretion protein HlyD  25 
 
 		 327 aa  68.6  0.0000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.689376  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1329  hypothetical protein  26.14 
 
 		 328 aa  67.8  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1020  hypothetical protein  30.42 
 
 		 345 aa  67  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1793  hypothetical protein  28.2 
 
 		 347 aa  66.6  0.0000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0463341  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4665  secretion protein HlyD family protein  25.08 
 
 		 328 aa  66.6  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.267783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3107  secretion protein HlyD family protein  28.46 
 
 		 355 aa  66.6  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.128244  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1040  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.16 
 
 		 500 aa  65.5  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1422  secretion protein HlyD  24.57 
 
 		 359 aa  65.1  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0497268  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4021  secretion protein HlyD  25.76 
 
 		 345 aa  65.5  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0825  hypothetical protein  31.11 
 
 		 364 aa  64.7  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0499  secretion protein HlyD family protein  27.21 
 
 		 323 aa  64.7  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1039  secretion protein HlyD  27.45 
 
 		 427 aa  64.7  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0853  hypothetical protein  27.27 
 
 		 331 aa  64.3  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0913  hypothetical protein  27.27 
 
 		 331 aa  64.3  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.16155  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1115  secretion protein HlyD family protein  27.31 
 
 		 347 aa  64.3  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.719605  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0966  hypothetical protein  27.27 
 
 		 331 aa  64.3  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0945  hypothetical protein  27.27 
 
 		 331 aa  64.3  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0881  hypothetical protein  27.27 
 
 		 331 aa  64.3  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.775184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2810  secretion protein HlyD family protein  21.69 
 
 		 368 aa  63.9  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.653473 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00610  Type I secretion protein, HlyD family  26.46 
 
 		 339 aa  63.5  0.000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.211465  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1719  secretion protein HlyD  24.34 
 
 		 315 aa  63.5  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0706497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3452  HlyD family secretion protein  26.58 
 
 		 326 aa  63.2  0.000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.349475  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1342  HlyD family secretion protein  24.35 
 
 		 317 aa  63.2  0.000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1398  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.57 
 
 		 504 aa  63.2  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0409  secretion protein HlyD  25 
 
 		 332 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0892  secretion protein HlyD family protein  27.91 
 
 		 347 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.707751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2942  hypothetical protein  26.05 
 
 		 342 aa  60.8  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.495568  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2420  hypothetical protein  24.44 
 
 		 334 aa  60.5  0.00000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0441115  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0807  secretion protein HlyD family protein  33.33 
 
 		 310 aa  60.1  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3085  secretion protein HlyD family protein  27.27 
 
 		 353 aa  60.1  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.22636  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>