More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AnaeK_2393 on replicon NC_011145
Organism: Anaeromyxobacter sp. K



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_2393  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 
369 aa  696    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.355185  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2481  efflux transporter, RND family, MFP subunit  92.93 
 
 
367 aa  632  1e-180  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1475  secretion protein HlyD  91.03 
 
 
368 aa  605  9.999999999999999e-173  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2981  RND family efflux transporter MFP subunit  42.63 
 
 
369 aa  179  8e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1186  RND family efflux transporter MFP subunit  34.28 
 
 
374 aa  121  1.9999999999999998e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.425099  normal  0.0297054 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1462  RND family efflux transporter MFP subunit  30.48 
 
 
418 aa  106  5e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2100  RND family efflux transporter MFP subunit  31.27 
 
 
379 aa  106  6e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0493506  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.51 
 
 
377 aa  103  5e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.69897  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6521  RND family efflux transporter MFP subunit  31.09 
 
 
410 aa  102  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.745567  normal  0.0817001 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2903  RND family efflux transporter MFP subunit  35.09 
 
 
383 aa  101  3e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2949  RND family efflux transporter MFP subunit  27.49 
 
 
376 aa  100  5e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0753  secretion protein HlyD  32.47 
 
 
370 aa  99  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1695  secretion protein HlyD  29.36 
 
 
360 aa  97.8  2e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0438  hypothetical protein  28.48 
 
 
352 aa  98.2  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000466929  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4150  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.63 
 
 
397 aa  98.6  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00923789  hitchhiker  0.000000297953 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3467  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.37 
 
 
376 aa  97.1  4e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00013135  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0109  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.27 
 
 
360 aa  96.3  8e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0110  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.27 
 
 
360 aa  96.3  8e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1462  RND efflux membrane fusion protein precursor  28.79 
 
 
367 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01736  HlyD family secretion protein  27.48 
 
 
349 aa  94.4  3e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0212  secretion protein HlyD  28.04 
 
 
364 aa  94.4  3e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.59943 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1440  secretion protein HlyD  33.02 
 
 
376 aa  94.4  3e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0942  acriflavine resistance protein E  25.25 
 
 
374 aa  94.4  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16800  putative efflux transmembrane protein  28.79 
 
 
367 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0868415  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3735  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.21 
 
 
362 aa  93.6  5e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2657  cation or acridine efflux membrane fusion protein  23.96 
 
 
357 aa  93.6  5e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1316  secretion protein HlyD  28.62 
 
 
501 aa  93.2  6e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1036  RND family efflux transporter MFP subunit  26.04 
 
 
354 aa  93.2  6e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2559  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.06 
 
 
349 aa  92  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.99545  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3852  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.41 
 
 
365 aa  92.4  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3586  secretion protein HlyD  30.99 
 
 
369 aa  92  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2400  secretion protein HlyD  30.03 
 
 
440 aa  92.4  1e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.705753 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0308  secretion protein HlyD  28.2 
 
 
421 aa  92  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.742688 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1881  HlyD family-like protein  29.41 
 
 
360 aa  91.3  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2071  RND efflux system membrane fusion protein  29.11 
 
 
407 aa  91.7  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.226746  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2011  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.48 
 
 
361 aa  91.7  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5875  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.11 
 
 
407 aa  90.9  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0955286  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1267  RND family efflux transporter MFP subunit  25.56 
 
 
355 aa  90.5  4e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1936  transporter, putative  31.86 
 
 
349 aa  90.1  5e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1704  RND family efflux transporter MFP subunit  29.77 
 
 
361 aa  90.1  5e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000249801  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1636  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.07 
 
 
383 aa  90.1  5e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.372421  normal  0.934491 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0901  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.55 
 
 
351 aa  89.7  7e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.470272  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0431  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.57 
 
 
368 aa  89.4  8e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0539  RND family efflux transporter MFP subunit  27.52 
 
 
350 aa  89  1e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0176  RND family efflux transporter MFP subunit  30.87 
 
 
353 aa  88.6  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.371241 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3936  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.85 
 
 
365 aa  89  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00117548 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3255  RND family efflux transporter MFP subunit  25.42 
 
 
388 aa  89.4  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2562  RND family efflux transporter MFP subunit  25 
 
 
389 aa  87.4  4e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.718255  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3539  RND family efflux transporter MFP subunit  28.15 
 
 
392 aa  87  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0056  secretion protein HlyD  24.92 
 
 
354 aa  87.4  4e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0454  secretion protein HlyD  24.73 
 
 
373 aa  87.4  4e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.63564  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2338  RND family efflux transporter MFP subunit  28.76 
 
 
360 aa  87.4  4e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00136978  hitchhiker  0.0000141161 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2410  RND family efflux transporter MFP subunit  28.76 
 
 
360 aa  87.4  4e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000315716  hitchhiker  0.00636413 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2665  RND family efflux transporter MFP subunit  29.03 
 
 
360 aa  87  5e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000267288  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4015  hypothetical protein  25.2 
 
 
435 aa  87  5e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1796  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.03 
 
 
360 aa  87  5e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000436323  hitchhiker  0.00000011193 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2550  RND family efflux transporter MFP subunit  29.03 
 
 
360 aa  87  5e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000229958  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1658  RND family efflux transporter MFP subunit  28.76 
 
 
360 aa  86.7  6e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000232607  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3735  RND family efflux transporter MFP subunit  25.07 
 
 
410 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3014  multidrug efflux system subunit MdtA  25.93 
 
 
415 aa  85.9  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.105913 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2939  RND family efflux transporter MFP subunit  25.81 
 
 
352 aa  85.9  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0067677  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2367  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.25 
 
 
360 aa  85.5  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1159  multidrug efflux system subunit MdtA  25.93 
 
 
415 aa  85.9  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0467  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.28 
 
 
360 aa  85.9  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1567  multidrug efflux system subunit MdtA  25.93 
 
 
455 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.331208 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3429  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.65 
 
 
399 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2000  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.25 
 
 
360 aa  85.5  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.461729  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1582  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.93 
 
 
415 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0117238  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0870  acriflavin resistance periplasmic protein  27.85 
 
 
351 aa  84.7  0.000000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0567  RND family efflux transporter MFP subunit  29.68 
 
 
424 aa  85.1  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2588  RND family efflux transporter MFP subunit  29.03 
 
 
360 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000707575  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2366  multidrug efflux system subunit MdtA  25.93 
 
 
415 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3304  secretion protein HlyD  29.3 
 
 
396 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0742  secretion protein HlyD  28.48 
 
 
400 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.460648 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3362  RND family efflux transporter MFP subunit  29.71 
 
 
358 aa  84.7  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004022  membrane-fusion protein  25.89 
 
 
369 aa  84.7  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000160707  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0266  RND family efflux transporter MFP subunit  28.93 
 
 
375 aa  85.1  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.987776 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2216  multidrug efflux system subunit MdtA  25.93 
 
 
415 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1908  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.98 
 
 
407 aa  84.7  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1906  HlyD family-like protein  30 
 
 
361 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000977353  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0015  secretion protein, HlyD family  26.15 
 
 
372 aa  84.3  0.000000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03982  membrane fusion protein  26.98 
 
 
414 aa  84.3  0.000000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3002  membrane-fusion protein, component of multidrug efflux system  31.91 
 
 
367 aa  84.3  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1515  RND family efflux transporter MFP subunit  29.55 
 
 
405 aa  84  0.000000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0880  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.24 
 
 
397 aa  84  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.995952  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1125  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.55 
 
 
417 aa  84  0.000000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0255605  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01979  multidrug efflux system, subunit A  25.62 
 
 
415 aa  83.6  0.000000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1596  HlyD family multidrug efflux protein  29.72 
 
 
371 aa  83.6  0.000000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.616153  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01971  hypothetical protein  25.62 
 
 
415 aa  83.6  0.000000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0650  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.54 
 
 
410 aa  83.6  0.000000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0627  RND family efflux transporter MFP subunit  24.54 
 
 
405 aa  83.6  0.000000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1621  secretion protein HlyD  26.72 
 
 
407 aa  83.6  0.000000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4005  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.66 
 
 
387 aa  83.6  0.000000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0791  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.65 
 
 
373 aa  83.2  0.000000000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3927  RND family efflux transporter MFP subunit  25.7 
 
 
392 aa  83.6  0.000000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1206  RND family efflux transporter MFP subunit  31.61 
 
 
385 aa  83.2  0.000000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.427148 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0535  secretion protein HlyD  22.15 
 
 
366 aa  83.6  0.000000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2928  secretion protein HlyD  28.83 
 
 
347 aa  83.6  0.000000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.7039  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2584  CzcB subfamily membrane fusion protein  27.16 
 
 
409 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2615  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.41 
 
 
380 aa  83.2  0.000000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.909785  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>