More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_1475 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_1475  secretion protein HlyD  100 
 
 		 368 aa  688    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2393  efflux transporter, RND family, MFP subunit  91.03 
 
 		 369 aa  616  1e-175  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.355185  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2481  efflux transporter, RND family, MFP subunit  91.3 
 
 		 367 aa  613  9.999999999999999e-175  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2981  RND family efflux transporter MFP subunit  43.91 
 
 		 369 aa  182  8.000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1186  RND family efflux transporter MFP subunit  34.29 
 
 		 374 aa  124  3e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.425099  normal  0.0297054 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.96 
 
 		 377 aa  107  5e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.69897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2903  RND family efflux transporter MFP subunit  35.36 
 
 		 383 aa  102  1e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1462  RND family efflux transporter MFP subunit  31.99 
 
 		 418 aa  99.8  7e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0438  hypothetical protein  27.71 
 
 		 352 aa  99.8  8e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000466929  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1695  secretion protein HlyD  28.33 
 
 		 360 aa  98.6  1e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2949  RND family efflux transporter MFP subunit  26.59 
 
 		 376 aa  99  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4150  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.88 
 
 		 397 aa  97.8  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00923789  hitchhiker  0.000000297953 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0110  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.11 
 
 		 360 aa  97.1  5e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0109  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.11 
 
 		 360 aa  97.1  5e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1036  RND family efflux transporter MFP subunit  26.75 
 
 		 354 aa  97.1  5e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2100  RND family efflux transporter MFP subunit  30.03 
 
 		 379 aa  96.7  6e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0493506  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0753  secretion protein HlyD  31.17 
 
 		 370 aa  96.3  7e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6521  RND family efflux transporter MFP subunit  30.03 
 
 		 410 aa  94.7  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.745567  normal  0.0817001 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0535  secretion protein HlyD  23.98 
 
 		 366 aa  94.7  2e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1316  secretion protein HlyD  29.25 
 
 		 501 aa  94.7  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0212  secretion protein HlyD  27.73 
 
 		 364 aa  93.2  6e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.59943 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2400  secretion protein HlyD  29.5 
 
 		 440 aa  93.2  6e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.705753 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2657  cation or acridine efflux membrane fusion protein  24.92 
 
 		 357 aa  93.2  6e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1267  RND family efflux transporter MFP subunit  25.88 
 
 		 355 aa  92.8  8e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1881  HlyD family-like protein  29.41 
 
 		 360 aa  92.4  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3002  membrane-fusion protein, component of multidrug efflux system  34.04 
 
 		 367 aa  92  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0942  acriflavine resistance protein E  24.66 
 
 		 374 aa  92.4  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0539  RND family efflux transporter MFP subunit  28.88 
 
 		 350 aa  91.3  2e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1704  RND family efflux transporter MFP subunit  29.35 
 
 		 361 aa  91.7  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000249801  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2559  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.06 
 
 		 349 aa  90.9  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.99545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3255  RND family efflux transporter MFP subunit  25.42 
 
 		 388 aa  90.5  4e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3467  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.49 
 
 		 376 aa  89.7  7e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00013135  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1455  RND family efflux transporter MFP subunit  30.68 
 
 		 345 aa  89.4  8e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0746  AcrA/E family efflux transporter MFP subunit  26.59 
 
 		 366 aa  89.4  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.339879  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2011  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.7 
 
 		 361 aa  89  1e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01736  HlyD family secretion protein  25.88 
 
 		 349 aa  89  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1159  multidrug efflux system subunit MdtA  26.25 
 
 		 415 aa  89  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3014  multidrug efflux system subunit MdtA  26.25 
 
 		 415 aa  89  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.105913 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0901  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.9 
 
 		 351 aa  88.6  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.470272  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0431  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.42 
 
 		 368 aa  88.6  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3735  RND family efflux transporter MFP subunit  25 
 
 		 410 aa  88.2  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1582  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.25 
 
 		 415 aa  87.8  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0117238  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4015  hypothetical protein  25.45 
 
 		 435 aa  87.4  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3429  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.97 
 
 		 399 aa  87.4  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0650  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.54 
 
 		 410 aa  87.4  3e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2216  multidrug efflux system subunit MdtA  26.25 
 
 		 415 aa  87.8  3e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2366  multidrug efflux system subunit MdtA  26.25 
 
 		 415 aa  87.4  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0308  secretion protein HlyD  27.01 
 
 		 421 aa  87.8  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.742688 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004022  membrane-fusion protein  26.34 
 
 		 369 aa  87.4  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000160707  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1567  multidrug efflux system subunit MdtA  26.25 
 
 		 455 aa  87.8  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.331208 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0627  RND family efflux transporter MFP subunit  25 
 
 		 405 aa  87.8  3e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2071  RND efflux system membrane fusion protein  27.62 
 
 		 407 aa  87  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.226746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3735  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.27 
 
 		 362 aa  87  5e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0654  RND family efflux transporter MFP subunit  25 
 
 		 410 aa  87  5e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3586  secretion protein HlyD  29.39 
 
 		 369 aa  87  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0742  secretion protein HlyD  28.44 
 
 		 400 aa  86.7  5e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.460648 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01979  multidrug efflux system, subunit A  25.94 
 
 		 415 aa  86.7  6e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2558  secretion protein HlyD  28.28 
 
 		 451 aa  86.7  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0355119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2338  RND family efflux transporter MFP subunit  28.76 
 
 		 360 aa  86.7  6e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00136978  hitchhiker  0.0000141161 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2410  RND family efflux transporter MFP subunit  28.76 
 
 		 360 aa  86.7  6e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000315716  hitchhiker  0.00636413 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01971  hypothetical protein  25.94 
 
 		 415 aa  86.7  6e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1462  RND efflux membrane fusion protein precursor  28.48 
 
 		 367 aa  86.3  7e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0671  secretion protein HlyD  26.99 
 
 		 432 aa  86.3  7e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16800  putative efflux transmembrane protein  28.48 
 
 		 367 aa  86.3  7e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0868415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5875  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.62 
 
 		 407 aa  86.3  7e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0955286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3539  RND family efflux transporter MFP subunit  28.89 
 
 		 392 aa  86.7  7e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1658  RND family efflux transporter MFP subunit  28.76 
 
 		 360 aa  86.3  7e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000232607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0791  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.66 
 
 		 373 aa  86.3  8e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0870  acriflavin resistance periplasmic protein  27.53 
 
 		 351 aa  85.9  0.000000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0454  secretion protein HlyD  24.19 
 
 		 373 aa  85.5  0.000000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.63564  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1596  HlyD family multidrug efflux protein  28.35 
 
 		 371 aa  84.7  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.616153  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0986  multidrug efflux system subunit MdtA  25.94 
 
 		 415 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.607592 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0176  RND family efflux transporter MFP subunit  30.13 
 
 		 353 aa  85.1  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.371241 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3304  secretion protein HlyD  28.66 
 
 		 396 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03982  membrane fusion protein  26.67 
 
 		 414 aa  84.7  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1440  secretion protein HlyD  31.43 
 
 		 376 aa  85.1  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0467  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.62 
 
 		 360 aa  84.7  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3852  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.42 
 
 		 365 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2550  RND family efflux transporter MFP subunit  28.48 
 
 		 360 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000229958  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1796  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.48 
 
 		 360 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000436323  hitchhiker  0.00000011193 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2665  RND family efflux transporter MFP subunit  28.48 
 
 		 360 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000267288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3552  multidrug efflux system subunit MdtA  24.92 
 
 		 413 aa  84  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5137  RND family efflux transporter MFP subunit  29.41 
 
 		 427 aa  84  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259338 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0565  CmeA  22.98 
 
 		 354 aa  84  0.000000000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000015665  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3889  RND family efflux transporter MFP subunit  29.45 
 
 		 364 aa  83.6  0.000000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000654  putative efflux protein  24.29 
 
 		 360 aa  83.6  0.000000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1146  RND family efflux transporter MFP subunit  27.22 
 
 		 351 aa  83.2  0.000000000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1559  RND efflux system, membrane fusion protein CmeA  23.03 
 
 		 365 aa  83.2  0.000000000000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0513  RND family efflux transporter MFP subunit  26.9 
 
 		 435 aa  83.6  0.000000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.497794  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2562  RND family efflux transporter MFP subunit  24.7 
 
 		 389 aa  83.2  0.000000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.718255  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0166  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.37 
 
 		 379 aa  83.2  0.000000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2361  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.1 
 
 		 372 aa  83.2  0.000000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.320362 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3927  RND family efflux transporter MFP subunit  25.94 
 
 		 392 aa  82.8  0.000000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2036  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.79 
 
 		 346 aa  82.8  0.000000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0261077  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1700  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.79 
 
 		 346 aa  82.8  0.000000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.116912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4005  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.66 
 
 		 387 aa  82.8  0.000000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3495  RND family efflux transporter MFP subunit  27.37 
 
 		 365 aa  82.8  0.000000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1206  multidrug efflux system subunit MdtA  25.93 
 
 		 419 aa  82.4  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0570202  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2966  multidrug efflux system subunit MdtA  25.65 
 
 		 413 aa  82  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.874422  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1636  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30 
 
 		 383 aa  82.4  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.372421  normal  0.934491 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>