More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2903 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_2903  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 
383 aa  730    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.93 
 
 
377 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.69897  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2275  RND family efflux transporter MFP subunit  28.34 
 
 
354 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0060878  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1943  secretion protein HlyD  29.82 
 
 
523 aa  124  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.354822  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1421  HlyD family secretion protein  28.12 
 
 
354 aa  122  9e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0100677  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1704  RND family efflux transporter MFP subunit  26.88 
 
 
354 aa  120  3e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1629  RND family efflux transporter MFP subunit  26.34 
 
 
358 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.185382  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2949  RND family efflux transporter MFP subunit  28.62 
 
 
376 aa  117  3e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1704  RND family efflux transporter MFP subunit  26.34 
 
 
358 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.271919  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2814  RND family efflux transporter MFP subunit  30.32 
 
 
370 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1372  secretion protein HlyD  31.52 
 
 
405 aa  116  7.999999999999999e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.203736  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2532  secretion protein HlyD  33.94 
 
 
359 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.19676  normal  0.860631 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2381  RND family efflux transporter MFP subunit  25.6 
 
 
357 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2100  RND family efflux transporter MFP subunit  31.65 
 
 
379 aa  109  8.000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0493506  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2634  RND family efflux transporter MFP subunit  27.15 
 
 
354 aa  109  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.182724  normal  0.987528 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1925  HlyD family secretion protein  26.61 
 
 
354 aa  108  1e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2521  RND family efflux transporter MFP subunit  27.42 
 
 
354 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.199325  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1830  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.42 
 
 
354 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000238284  normal  0.23398 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3214  putative efflux protein  25.4 
 
 
367 aa  108  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1660  RND family efflux transporter MFP subunit  28.38 
 
 
361 aa  107  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1649  RND family efflux transporter MFP subunit  27.69 
 
 
354 aa  107  4e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.499517  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2514  RND family efflux transporter MFP subunit  27.15 
 
 
354 aa  106  5e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000208657  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3539  RND family efflux transporter MFP subunit  29.27 
 
 
392 aa  106  8e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1660  RND family efflux transporter MFP subunit  28.49 
 
 
369 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0454  secretion protein HlyD  26.41 
 
 
373 aa  105  1e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.63564  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3470  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.67 
 
 
379 aa  104  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.430372  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0671  secretion protein HlyD  26.84 
 
 
432 aa  104  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2557  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.78 
 
 
356 aa  104  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000000027885  normal  0.211023 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1830  RND family efflux transporter MFP subunit  26.47 
 
 
359 aa  103  4e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.495597  normal  0.102007 
 
 
-
 
NC_002950  PG0539  RND family efflux transporter MFP subunit  28.73 
 
 
350 aa  103  5e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2192  secretion protein HlyD  28.69 
 
 
352 aa  103  6e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3773  RND family efflux transporter MFP subunit  29.32 
 
 
384 aa  102  9e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.265534  normal  0.799504 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0308  secretion protein HlyD  26.17 
 
 
421 aa  102  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.742688 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4521  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.57 
 
 
379 aa  101  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3758  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.44 
 
 
379 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2393  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.09 
 
 
369 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.355185  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0188  RND family efflux transporter MFP subunit  28.12 
 
 
369 aa  102  2e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0056  secretion protein HlyD  22.63 
 
 
354 aa  101  3e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1739  RND family efflux transporter MFP subunit  27.79 
 
 
369 aa  101  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.357806  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6340  secretion protein HlyD  27.79 
 
 
369 aa  101  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.900675  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1752  RND family efflux transporter MFP subunit  27.2 
 
 
369 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2289  RND family efflux transporter MFP subunit  29.18 
 
 
371 aa  100  4e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.412391  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2000  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.72 
 
 
360 aa  100  5e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.461729  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2367  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.72 
 
 
360 aa  100  5e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2781  RND family efflux transporter MFP subunit  30.24 
 
 
364 aa  100  5e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5035  HlyD family secretion protein  26.37 
 
 
396 aa  100  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.611497 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1462  RND efflux membrane fusion protein precursor  28.65 
 
 
367 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2954  RND family efflux transporter MFP subunit  23.61 
 
 
364 aa  98.6  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000249187  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0177  hypothetical protein  24.73 
 
 
406 aa  99  1e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3002  membrane-fusion protein, component of multidrug efflux system  28.95 
 
 
367 aa  99  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0225  secretion protein HlyD  33.53 
 
 
380 aa  99  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.34961  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2752  RND family efflux transporter MFP subunit  30.84 
 
 
365 aa  99  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.239628  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0175  hypothetical protein  31.6 
 
 
380 aa  99  1e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.109936  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1916  putative efflux protein  26.08 
 
 
370 aa  97.8  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.164957 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0247  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.53 
 
 
380 aa  97.8  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5559  secretion protein HlyD  31.52 
 
 
366 aa  97.8  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2234  RND family efflux transporter MFP subunit  23.86 
 
 
407 aa  97.8  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.282252  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1100  RND family efflux transporter MFP subunit  33.03 
 
 
361 aa  97.4  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.204612 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3130  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.22 
 
 
377 aa  97.4  4e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.645496  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2820  RND family efflux transporter MFP subunit  25.64 
 
 
363 aa  96.7  7e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0120499  normal  0.368522 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0859  HlyD family secretion protein  27.58 
 
 
372 aa  96.7  7e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.585057  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16800  putative efflux transmembrane protein  28.83 
 
 
367 aa  96.3  9e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0868415  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0212  secretion protein HlyD  29.53 
 
 
364 aa  95.9  9e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.59943 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1452  RND family efflux transporter MFP subunit  29.44 
 
 
369 aa  96.3  9e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0187105  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0916  HlyD family secretion protein  27.58 
 
 
372 aa  95.5  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3495  RND family efflux transporter MFP subunit  29.45 
 
 
365 aa  95.5  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0230  secretion protein HlyD  29.92 
 
 
367 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4180  RND family efflux transporter MFP subunit  31.52 
 
 
366 aa  95.9  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.249201  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1475  secretion protein HlyD  34.45 
 
 
368 aa  95.9  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1781  RND family efflux transporter MFP subunit  25.39 
 
 
368 aa  95.9  1e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.253325  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0200  secretion protein HlyD  25 
 
 
365 aa  94.7  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0915  secretion protein, putative  30.05 
 
 
368 aa  94.4  3e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0880  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.39 
 
 
397 aa  94.4  3e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.995952  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2103  RND family efflux transporter MFP subunit  26.96 
 
 
403 aa  94.7  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0796794  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3467  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.85 
 
 
376 aa  94  4e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00013135  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5211  HlyD family secretion protein  27.85 
 
 
358 aa  93.6  5e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1924  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.68 
 
 
352 aa  93.2  7e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.896235 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1610  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.96 
 
 
372 aa  92.8  9e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1861  RND family efflux transporter MFP subunit  25.53 
 
 
370 aa  92.8  9e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.680929  hitchhiker  0.00126667 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2117  RND family efflux transporter MFP subunit  25.53 
 
 
370 aa  92.8  9e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00784562 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1520  RND family efflux transporter MFP subunit  26.98 
 
 
370 aa  92.4  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.289277 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3664  RND family efflux transporter MFP subunit  24.18 
 
 
370 aa  92.4  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1057  RND family efflux transporter MFP subunit  30.51 
 
 
373 aa  92.4  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.347653 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1555  secretion protein HlyD  29.44 
 
 
394 aa  92  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3522  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.92 
 
 
421 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2584  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.92 
 
 
421 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1614  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.43 
 
 
358 aa  91.3  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1216  RND family efflux transporter MFP subunit  26.61 
 
 
379 aa  92  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.152303  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0746  AcrA/E family efflux transporter MFP subunit  24.54 
 
 
366 aa  91.3  3e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.339879  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1281  RND family efflux transporter MFP subunit  29.95 
 
 
386 aa  91.3  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0104305 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2481  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.5 
 
 
367 aa  91.3  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1462  RND family efflux transporter MFP subunit  28.42 
 
 
418 aa  90.5  4e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2253  secretion protein HlyD  31.63 
 
 
398 aa  90.5  5e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.706134 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4563  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.54 
 
 
426 aa  90.5  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0954  RND family efflux transporter MFP subunit  26.96 
 
 
371 aa  90.1  6e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2559  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.86 
 
 
349 aa  90.1  6e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.99545  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2295  RND family efflux transporter MFP subunit  26.96 
 
 
371 aa  90.1  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2162  RND family efflux transporter MFP subunit  26.96 
 
 
371 aa  90.1  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4857  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.93 
 
 
384 aa  89.7  7e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.231948  normal  0.491578 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2808  membrane fusion protein; cation efflux system protein  25.52 
 
 
353 aa  89.7  8e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>