More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1575 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_1575  RND membrane fusion protein AcrA  100 
 
 		 448 aa  890    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.853878 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1757  secretion protein HlyD  96.88 
 
 		 448 aa  790    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.071428 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0889  RND family efflux transporter MFP subunit  61.32 
 
 		 469 aa  488  1e-136  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118198 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3601  secretion protein HlyD  41.97 
 
 		 386 aa  278  2e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.804898  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0809  secretion protein HlyD  40.32 
 
 		 392 aa  273  6e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.165865 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1849  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.42 
 
 		 422 aa  270  4e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00425578 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2369  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.05 
 
 		 433 aa  266  5e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.137399  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0525  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexA precursor  40.05 
 
 		 442 aa  265  1e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.106985  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05530  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexA precursor  40.05 
 
 		 383 aa  263  4e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1011  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.85 
 
 		 395 aa  263  4.999999999999999e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.279031  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2697  multidrug resistance protein  40.71 
 
 		 400 aa  258  2e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1418  secretion protein HlyD  42.26 
 
 		 400 aa  257  3e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2880  multidrug efflux protein  39.63 
 
 		 388 aa  257  3e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.876487 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3207  RND family efflux transporter MFP subunit  39.63 
 
 		 395 aa  257  3e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.474787  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3067  acriflavine resistance protein A  39.63 
 
 		 395 aa  257  3e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.018659  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4303  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40 
 
 		 386 aa  256  5e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4007  secretion protein HlyD  39.82 
 
 		 386 aa  256  5e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.430649  normal  0.0665893 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3715  RND family efflux transporter MFP subunit  40.09 
 
 		 382 aa  256  7e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.970475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1127  RND family efflux transporter MFP subunit  38.64 
 
 		 395 aa  256  7e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.295973  unclonable  0.0000000230672 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3553  multidrug resistance protein AcrA/AcrE family  43.39 
 
 		 378 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0395  acriflavine resistance protein A  39.73 
 
 		 409 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3680  secretion protein HlyD family protein  38.85 
 
 		 405 aa  254  2.0000000000000002e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00414  multidrug efflux system  39.5 
 
 		 397 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3147  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.5 
 
 		 397 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.035839  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0553  acriflavine resistance protein A  39.5 
 
 		 409 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0539  acriflavine resistance protein A  39.5 
 
 		 397 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3153  RND family efflux transporter MFP subunit  39.5 
 
 		 397 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0497  acriflavine resistance protein A  39.5 
 
 		 397 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0031  RND family efflux transporter MFP subunit  40.29 
 
 		 386 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000318769  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00419  hypothetical protein  39.5 
 
 		 397 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0506  acriflavine resistance protein A  39.73 
 
 		 409 aa  253  5.000000000000001e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.951175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4212  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.15 
 
 		 381 aa  251  1e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4427  RND family efflux transporter MFP subunit  40.71 
 
 		 384 aa  252  1e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.123796 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4251  RND family efflux transporter MFP subunit  40.15 
 
 		 381 aa  251  1e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.397426  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0287  acridine efflux pump  38.32 
 
 		 394 aa  250  4e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3648  acriflavine resistance protein E  38.15 
 
 		 385 aa  250  4e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.444601  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4582  acriflavine resistance protein E  38.15 
 
 		 385 aa  250  4e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.153462  normal  0.314671 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3800  RND family efflux transporter MFP subunit  37.56 
 
 		 404 aa  249  6e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.582867  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1026  RND family efflux transporter MFP subunit  40.24 
 
 		 384 aa  249  9e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.933063 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0441  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.91 
 
 		 385 aa  249  1e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1386  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.48 
 
 		 384 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.178254 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4385  RND family efflux transporter MFP subunit  39.71 
 
 		 381 aa  249  1e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.912914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3458  acriflavine resistance protein E  37.91 
 
 		 385 aa  249  1e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000310651  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0441  RND family efflux transporter MFP subunit  37.91 
 
 		 385 aa  249  1e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.693626 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3750  acriflavine resistance protein E  37.91 
 
 		 385 aa  249  1e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00329123  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3560  acriflavine resistance protein E  37.39 
 
 		 385 aa  248  2e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0550362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3435  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.91 
 
 		 399 aa  248  2e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.169321  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3930  RND family efflux transporter MFP subunit  40.69 
 
 		 382 aa  248  2e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3499  RND family efflux transporter MFP subunit  39.61 
 
 		 395 aa  248  2e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0344164  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4046  RND family efflux transporter MFP subunit  40.64 
 
 		 382 aa  248  2e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3837  RND family efflux transporter MFP subunit  40.69 
 
 		 382 aa  247  3e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4337  RND family efflux transporter MFP subunit  40.24 
 
 		 384 aa  247  3e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.235617 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0331  RND family efflux transporter MFP subunit  38.42 
 
 		 394 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.109026  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03123  cytoplasmic membrane lipoprotein  37.68 
 
 		 385 aa  246  6.999999999999999e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03074  hypothetical protein  37.68 
 
 		 385 aa  246  6.999999999999999e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01888  drug efflux lipoprotein  41.99 
 
 		 409 aa  245  9.999999999999999e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.524066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4090  secretion protein HlyD  38.61 
 
 		 386 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0504  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.01 
 
 		 399 aa  243  7e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.196433  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0090  RND family efflux transporter MFP subunit  40.39 
 
 		 381 aa  243  7e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1870  secretion protein HlyD  37.86 
 
 		 428 aa  242  7.999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3863  RND family efflux transporter MFP subunit  38.5 
 
 		 382 aa  242  9e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0152  RND family efflux transporter MFP subunit  38.85 
 
 		 385 aa  242  1e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4693  multidrug resistance protein AcrA/AcrE family  39.76 
 
 		 382 aa  241  2e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1018  RND family efflux transporter MFP subunit  39.39 
 
 		 420 aa  241  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0315  RND family efflux transporter MFP subunit  39.39 
 
 		 420 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0854  multidrug efflux periplasmic linker protein BpeA  39.39 
 
 		 420 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.719076  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2445  multidrug efflux periplasmic linker protein BpeA  39.39 
 
 		 420 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4061  RND family efflux transporter MFP subunit  38.07 
 
 		 383 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000265031  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0058  multidrug efflux periplasmic linker protein BpeA  39.39 
 
 		 420 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0523497  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0610  multidrug efflux periplasmic linker protein BpeA  39.39 
 
 		 420 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.80065  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0943  RND family efflux transporter MFP subunit  37.91 
 
 		 397 aa  241  2.9999999999999997e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2894  RND family efflux transporter MFP subunit  37.61 
 
 		 397 aa  240  4e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.781676  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1836  multidrug efflux transport protein EefA  38.85 
 
 		 373 aa  240  4e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000609578 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0859  multidrug efflux periplasmic linker protein BpeA  39.15 
 
 		 420 aa  240  4e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01880  Secretion protein HlyD  38.14 
 
 		 383 aa  239  6.999999999999999e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5837  secretion protein HlyD  39.47 
 
 		 412 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.91911  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6204  RND family efflux transporter MFP subunit  39.47 
 
 		 412 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.103192  hitchhiker  0.00610274 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0501  RND family efflux transporter MFP subunit  40 
 
 		 430 aa  239  9e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3582  acriflavine resistance protein E  36.01 
 
 		 385 aa  238  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.372723  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3699  RND family efflux transporter MFP subunit  40.25 
 
 		 390 aa  239  1e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2238  secretion protein HlyD  37.53 
 
 		 431 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3468  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.6 
 
 		 393 aa  238  1e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.143252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3655  acriflavine resistance protein E  36.01 
 
 		 385 aa  238  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.369196 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3689  acriflavine resistance protein E  36.01 
 
 		 385 aa  238  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.10776 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5940  HlyD family secretion protein  37.38 
 
 		 425 aa  238  2e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.591185  normal  0.295801 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2050  secretion protein HlyD  37.22 
 
 		 426 aa  238  2e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003895  membrane fusion protein of RND family multidrug efflux pump  37.11 
 
 		 379 aa  238  2e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00341624  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3923  multidrug efflux system protein  39.85 
 
 		 387 aa  238  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3047  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.74 
 
 		 396 aa  238  2e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.376069  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3241  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.24 
 
 		 398 aa  237  3e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1886  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.4 
 
 		 379 aa  237  3e-61  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0158662  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6607  HlyD family secretion protein  38.71 
 
 		 418 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.032922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1193  HlyD family secretion protein  36.02 
 
 		 386 aa  236  8e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000622308  normal  0.342064 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3493  RND family efflux transporter MFP subunit  38.84 
 
 		 381 aa  235  9e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3399  RND family efflux transporter MFP subunit  37.36 
 
 		 406 aa  235  1.0000000000000001e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.852955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2614  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.19 
 
 		 405 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.34834  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2066  secretion protein HlyD  37.25 
 
 		 428 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.567226  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6680  RND family efflux transporter MFP subunit  39.45 
 
 		 412 aa  234  3e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231623  normal  0.121297 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3843  RND family efflux transporter MFP subunit  40.41 
 
 		 397 aa  233  4.0000000000000004e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3704  RND family efflux transporter MFP subunit  35.56 
 
 		 379 aa  233  5e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.596756 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>