More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_3313 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_3313  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 		 363 aa  709    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0454  secretion protein HlyD  27.02 
 
 		 373 aa  112  9e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.63564  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4150  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.13 
 
 		 397 aa  107  3e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00923789  hitchhiker  0.000000297953 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2814  RND family efflux transporter MFP subunit  32.53 
 
 		 370 aa  103  7e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2715  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.55 
 
 		 366 aa  102  7e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.37732  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0880  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.28 
 
 		 397 aa  102  7e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.995952  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1715  acriflavin resistance periplasmic protein  29.77 
 
 		 357 aa  101  3e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000921401  normal  0.0591325 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1924  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.7 
 
 		 352 aa  97.1  4e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.896235 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3340  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.11 
 
 		 379 aa  96.3  7e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000654  putative efflux protein  26.02 
 
 		 360 aa  95.5  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1325  RND family efflux transporter MFP subunit  27.45 
 
 		 370 aa  94.7  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.784041  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0056  secretion protein HlyD  27.27 
 
 		 354 aa  94.4  2e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1704  secretion protein HlyD  29.48 
 
 		 345 aa  94  4e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000161104  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2426  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.49 
 
 		 365 aa  93.2  6e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.54628  hitchhiker  0.0000000883837 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0859  HlyD family secretion protein  27.03 
 
 		 372 aa  93.2  6e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.585057  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0916  HlyD family secretion protein  27.03 
 
 		 372 aa  92.8  7e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1310  secretion protein HlyD  30.69 
 
 		 379 aa  92.8  9e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.673983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01875  hypothetical protein  29.02 
 
 		 343 aa  92.4  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6178  RND family efflux transporter MFP subunit  30.59 
 
 		 367 aa  92.4  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.19288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2574  RND family efflux transporter MFP subunit  30.09 
 
 		 416 aa  92.4  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0205378 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003811  membrane-fusion protein  28 
 
 		 343 aa  91.3  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0034  secretion protein, HlyD family  24.81 
 
 		 369 aa  90.5  4e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3758  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.52 
 
 		 379 aa  89.7  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0815  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.95 
 
 		 386 aa  88.2  2e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1916  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.39 
 
 		 388 aa  88.2  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.631291  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1163  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.57 
 
 		 377 aa  88.2  2e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00317162  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1309  efflux protein  31.07 
 
 		 364 aa  88.6  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2342  secretion protein HlyD  27.73 
 
 		 370 aa  87.8  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.588824 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2234  RND family efflux transporter MFP subunit  27.97 
 
 		 407 aa  87.4  4e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.282252  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1748  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.08 
 
 		 388 aa  86.7  6e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1280  putative multidrug resistance protein  29.22 
 
 		 343 aa  86.3  7e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000228  membrane-fusion protein  28.93 
 
 		 357 aa  85.9  9e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2000  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.21 
 
 		 360 aa  85.5  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.461729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2367  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.21 
 
 		 360 aa  85.5  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1125  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.58 
 
 		 417 aa  85.9  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0255605  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0942  acriflavine resistance protein E  23.9 
 
 		 374 aa  85.9  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02664  putative multidrug resistance protein (substrate binding lipoprotein)  30.09 
 
 		 359 aa  84.7  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0150101  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1462  RND family efflux transporter MFP subunit  29.23 
 
 		 418 aa  84.7  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3081  secretion protein HlyD  32.42 
 
 		 377 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000964041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0671  secretion protein HlyD  25.96 
 
 		 432 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1354  HlyD family secretion protein  26.67 
 
 		 364 aa  85.1  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000336467  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1455  RND family efflux transporter MFP subunit  31.28 
 
 		 345 aa  85.1  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05965  hypothetical protein  28.62 
 
 		 357 aa  85.1  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0674  periplasmic linker protein  27.58 
 
 		 358 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0581  RND family efflux transporter MFP subunit  26.32 
 
 		 417 aa  84.7  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.669798  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0915  secretion protein, putative  27.96 
 
 		 368 aa  84.3  0.000000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1943  secretion protein HlyD  28.97 
 
 		 523 aa  84.3  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.354822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2020  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.91 
 
 		 414 aa  84  0.000000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.152554 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2530  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.32 
 
 		 430 aa  84  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.559583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0188  RND family efflux transporter MFP subunit  27.45 
 
 		 369 aa  84  0.000000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3233  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25 
 
 		 361 aa  84  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1278  secretion protein HlyD  26.03 
 
 		 370 aa  83.6  0.000000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0363804  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1312  RND family efflux transporter MFP subunit  26.21 
 
 		 371 aa  83.2  0.000000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1289  putative transport/efflux transmembrane protein  31.03 
 
 		 378 aa  83.2  0.000000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.173538 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0467  RND family efflux transporter MFP subunit  26.63 
 
 		 360 aa  83.2  0.000000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.949455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1861  RND family efflux transporter MFP subunit  27.97 
 
 		 370 aa  82.8  0.000000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.680929  hitchhiker  0.00126667 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2117  RND family efflux transporter MFP subunit  27.97 
 
 		 370 aa  82.8  0.000000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00784562 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2987  RND family efflux transporter MFP subunit  26.54 
 
 		 368 aa  82.8  0.000000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.331807  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3799  RND family efflux transporter MFP subunit  30.87 
 
 		 361 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0505  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.77 
 
 		 349 aa  81.6  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1316  secretion protein HlyD  29.11 
 
 		 501 aa  81.6  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0045  RND family efflux transporter MFP subunit  28.25 
 
 		 356 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1570  RND family efflux transporter MFP subunit  29.1 
 
 		 375 aa  82  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.628485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1148  RND family efflux transporter MFP subunit  26.75 
 
 		 373 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4314  RND family efflux transporter MFP subunit  27.01 
 
 		 360 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00180968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1390  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.27 
 
 		 368 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3778  hypothetical protein  31.83 
 
 		 383 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.748326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0288  RND family efflux transporter MFP subunit  27.65 
 
 		 355 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.527133 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02529  putative multidrug resistance protein (substrate binding lipoprotein)  27.32 
 
 		 403 aa  80.5  0.00000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1452  RND family efflux transporter MFP subunit  27.04 
 
 		 369 aa  80.5  0.00000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0187105  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4122  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.54 
 
 		 361 aa  80.5  0.00000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2973  RND family efflux transporter MFP subunit  29.91 
 
 		 368 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.388324  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4768  RND family efflux transporter MFP subunit  25.97 
 
 		 362 aa  80.1  0.00000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000176985 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1389  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.45 
 
 		 374 aa  80.5  0.00000000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000158934  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3130  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.13 
 
 		 377 aa  80.1  0.00000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.645496  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3470  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.85 
 
 		 379 aa  79.7  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.430372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1201  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.58 
 
 		 369 aa  79.7  0.00000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000118856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6002  RND family efflux transporter MFP subunit  30.19 
 
 		 363 aa  79.3  0.00000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.249457  normal  0.124375 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3313  RND family efflux transporter MFP subunit  27.58 
 
 		 369 aa  79.7  0.00000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000984298  normal  0.15916 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2635  RND family efflux transporter MFP subunit  26.32 
 
 		 370 aa  79.3  0.00000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0171634  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1206  RND family efflux transporter MFP subunit  30.12 
 
 		 385 aa  79.3  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.427148 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3399  RND family efflux transporter MFP subunit  26.87 
 
 		 406 aa  79  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.852955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1908  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.42 
 
 		 407 aa  79  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3214  putative efflux protein  26.02 
 
 		 367 aa  79  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000227  periplasmic linker protein  25.63 
 
 		 353 aa  79  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3170  RND family efflux transporter MFP subunit  27.58 
 
 		 369 aa  79  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000721535  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1818  RND family efflux transporter MFP subunit  27.38 
 
 		 352 aa  79.3  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000224471  normal  0.900766 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3468  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.72 
 
 		 393 aa  78.6  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.143252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003810  linker protein putative  30.66 
 
 		 365 aa  78.2  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3278  hypothetical protein  25.45 
 
 		 374 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1462  RND efflux membrane fusion protein precursor  27.5 
 
 		 367 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1279  HlyD family secretion protein  26.42 
 
 		 359 aa  78.2  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3002  membrane-fusion protein, component of multidrug efflux system  27.67 
 
 		 367 aa  78.6  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5088  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.26 
 
 		 361 aa  78.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.857117  normal  0.0828727 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3414  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.54 
 
 		 1462 aa  78.2  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3992  RND efflux system membrane fusion protein  27.64 
 
 		 366 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3169  RND family efflux transporter MFP subunit  27.58 
 
 		 369 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000222351  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3131  RND family efflux transporter MFP subunit  25.94 
 
 		 368 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.419387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2781  RND family efflux transporter MFP subunit  29.16 
 
 		 364 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1133  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.75 
 
 		 391 aa  77.8  0.0000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0793831  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>