More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02529 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_02529  putative multidrug resistance protein (substrate binding lipoprotein)  100 
 
 
403 aa  834    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1418  RND family efflux transporter MFP subunit  48.52 
 
 
384 aa  354  2e-96  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.267918  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4314  RND family efflux transporter MFP subunit  34.92 
 
 
360 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00180968  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1435  RND family efflux transporter MFP subunit  36.36 
 
 
359 aa  193  4e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3643  RND family efflux transporter MFP subunit  34.78 
 
 
360 aa  192  1e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3513  RND family efflux transporter MFP subunit  34.78 
 
 
360 aa  192  1e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0849  RND family efflux transporter MFP subunit  34.78 
 
 
360 aa  192  1e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.880012  normal  0.445386 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0467  RND family efflux transporter MFP subunit  34.11 
 
 
360 aa  186  6e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.949455  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3664  RND family efflux transporter MFP subunit  32.56 
 
 
370 aa  182  1e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0630  RND family efflux transporter MFP subunit  33.88 
 
 
364 aa  178  1e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3695  RND family efflux transporter MFP subunit  30.72 
 
 
360 aa  171  2e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.101272  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3571  RND family efflux transporter MFP subunit  32.85 
 
 
360 aa  171  3e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.239658  normal  0.276589 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2567  RND family efflux transporter MFP subunit  31.37 
 
 
331 aa  169  6e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.17029 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3401  RND family efflux transporter MFP subunit  32.27 
 
 
360 aa  169  8e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.392528  hitchhiker  0.00103818 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0551  RND family efflux transporter MFP subunit  32.27 
 
 
360 aa  169  8e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.139954 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0673  multidrug resistance protein  34.3 
 
 
354 aa  169  8e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3712  RND family efflux transporter MFP subunit  34.19 
 
 
367 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.975013  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0641  RND family efflux transporter MFP subunit  34.29 
 
 
360 aa  166  8e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0664  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.29 
 
 
360 aa  166  8e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0668  RND family efflux transporter MFP subunit  34.01 
 
 
360 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3992  RND efflux system membrane fusion protein  32.42 
 
 
366 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0671  secretion protein HlyD  28.83 
 
 
432 aa  162  1e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0697  RND family efflux transporter MFP subunit  32.27 
 
 
359 aa  160  3e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4143  RND family efflux transporter MFP subunit  31.17 
 
 
343 aa  160  4e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.478516 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05965  hypothetical protein  29.79 
 
 
357 aa  159  1e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000228  membrane-fusion protein  29.68 
 
 
357 aa  158  2e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1730  RND family efflux transporter MFP subunit  30.25 
 
 
368 aa  154  2e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.674972  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1511  secretion protein HlyD  30.43 
 
 
357 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1280  putative multidrug resistance protein  29.19 
 
 
343 aa  146  6e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01875  hypothetical protein  27.99 
 
 
343 aa  146  7.0000000000000006e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2871  RND family efflux transporter MFP subunit  27.99 
 
 
357 aa  144  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1351  putative multidrug resistance protein precursor  29.63 
 
 
357 aa  142  8e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3848  RND family efflux transporter MFP subunit  27.79 
 
 
361 aa  140  3e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.918542  normal  0.711455 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1352  organic solvent efflux pump precursor (periplasmic linker protein component)  30.31 
 
 
359 aa  140  3.9999999999999997e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.896212  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1354  HlyD family secretion protein  28.49 
 
 
364 aa  132  2.0000000000000002e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000336467  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003811  membrane-fusion protein  27.1 
 
 
343 aa  130  4.0000000000000003e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1916  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.18 
 
 
388 aa  129  7.000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.631291  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1715  acriflavin resistance periplasmic protein  27.79 
 
 
357 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000921401  normal  0.0591325 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0056  secretion protein HlyD  28.53 
 
 
354 aa  127  3e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0674  periplasmic linker protein  25.84 
 
 
358 aa  126  7e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2562  RND family efflux transporter MFP subunit  28.42 
 
 
389 aa  125  2e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.718255  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000227  periplasmic linker protein  28.66 
 
 
353 aa  124  3e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0034  secretion protein, HlyD family  26.19 
 
 
369 aa  122  9e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1279  HlyD family secretion protein  26.68 
 
 
359 aa  122  9.999999999999999e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1510  secretion protein HlyD  27.89 
 
 
357 aa  119  7e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4144  RND family efflux transporter MFP subunit  27.64 
 
 
365 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.473768 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1462  RND family efflux transporter MFP subunit  25.95 
 
 
418 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003810  linker protein putative  27.46 
 
 
365 aa  114  3e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2115  RND family efflux transporter MFP subunit  28.53 
 
 
358 aa  113  5e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.243289  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3002  membrane-fusion protein, component of multidrug efflux system  29.7 
 
 
367 aa  112  9e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3214  putative efflux protein  24.93 
 
 
367 aa  110  5e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0793  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.91 
 
 
390 aa  109  8.000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2690  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.49 
 
 
360 aa  109  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6002  RND family efflux transporter MFP subunit  31 
 
 
363 aa  108  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.249457  normal  0.124375 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5035  HlyD family secretion protein  25.37 
 
 
396 aa  107  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.611497 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1289  putative transport/efflux transmembrane protein  27.86 
 
 
378 aa  107  5e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.173538 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2870  RND family efflux transporter MFP subunit  26.23 
 
 
351 aa  106  8e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.551784  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1660  RND family efflux transporter MFP subunit  26.58 
 
 
369 aa  106  8e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1943  secretion protein HlyD  27.03 
 
 
523 aa  105  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.354822  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01876  hypothetical protein  26.74 
 
 
359 aa  105  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1968  multidrug efflux pump, membrane fusion protein CzcB subfamily  27.55 
 
 
394 aa  103  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0347448 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2715  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.94 
 
 
366 aa  103  7e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.37732  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1372  secretion protein HlyD  27.41 
 
 
405 aa  102  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.203736  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1752  RND family efflux transporter MFP subunit  26.19 
 
 
369 aa  101  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6340  secretion protein HlyD  26.12 
 
 
369 aa  101  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.900675  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1739  RND family efflux transporter MFP subunit  26.12 
 
 
369 aa  101  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.357806  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4857  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.53 
 
 
384 aa  100  4e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.231948  normal  0.491578 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3340  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.4 
 
 
379 aa  100  5e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4709  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.21 
 
 
383 aa  99.8  7e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2103  RND family efflux transporter MFP subunit  26.54 
 
 
403 aa  99  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0796794  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1660  RND family efflux transporter MFP subunit  25.82 
 
 
361 aa  98.6  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3351  RND family efflux transporter MFP subunit  28.07 
 
 
367 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0630  secretion protein HlyD  27.52 
 
 
357 aa  98.6  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0232449  normal  0.116732 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0429  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.25 
 
 
361 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3223  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.37 
 
 
381 aa  97.8  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1079  secretion protein HlyD  29.17 
 
 
366 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.984606 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2292  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.25 
 
 
383 aa  97.8  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.516168  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3539  RND family efflux transporter MFP subunit  28.11 
 
 
392 aa  98.2  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4207  RND family efflux transporter MFP subunit  30.51 
 
 
366 aa  97.1  5e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.647045 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1122  RND family efflux transporter MFP subunit  30.21 
 
 
366 aa  97.1  5e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1516  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.21 
 
 
366 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1520  RND family efflux transporter MFP subunit  25.19 
 
 
370 aa  95.9  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.289277 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1462  RND efflux membrane fusion protein precursor  27.65 
 
 
367 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2289  RND family efflux transporter MFP subunit  26.2 
 
 
371 aa  95.9  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.412391  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2426  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.41 
 
 
365 aa  95.5  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.54628  hitchhiker  0.0000000883837 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3758  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.45 
 
 
379 aa  94.7  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4340  RND family efflux transporter MFP subunit  27.14 
 
 
387 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.625227  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1861  RND family efflux transporter MFP subunit  27.52 
 
 
370 aa  95.5  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.680929  hitchhiker  0.00126667 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2117  RND family efflux transporter MFP subunit  27.52 
 
 
370 aa  95.5  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00784562 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16800  putative efflux transmembrane protein  27.94 
 
 
367 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0868415  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1451  RND family efflux transporter MFP subunit  26.3 
 
 
369 aa  94.4  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.513769  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0916  HlyD family secretion protein  29.61 
 
 
372 aa  94  5e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0859  HlyD family secretion protein  29.61 
 
 
372 aa  94  5e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.585057  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2293  RND family efflux transporter MFP subunit  27.07 
 
 
371 aa  94  5e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2778  RND family efflux transporter MFP subunit  24.05 
 
 
359 aa  94  5e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.223876 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5274  RND family efflux transporter MFP subunit  27.18 
 
 
377 aa  93.2  7e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0726879  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2040  RND family mulitdrug efflux protein  27.42 
 
 
358 aa  92.4  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.428821  normal  0.886334 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3130  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.84 
 
 
377 aa  92.4  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.645496  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3470  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.2 
 
 
379 aa  92.4  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.430372  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4438  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.45 
 
 
363 aa  91.7  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>