More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_2715 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_2715  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 		 366 aa  694    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.37732  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1715  acriflavin resistance periplasmic protein  35.54 
 
 		 357 aa  227  2e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000921401  normal  0.0591325 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1354  HlyD family secretion protein  35.63 
 
 		 364 aa  205  1e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000336467  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0034  secretion protein, HlyD family  31.06 
 
 		 369 aa  201  1.9999999999999998e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0467  RND family efflux transporter MFP subunit  35.53 
 
 		 360 aa  176  7e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.949455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1916  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.68 
 
 		 388 aa  172  5.999999999999999e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.631291  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0671  secretion protein HlyD  33.51 
 
 		 432 aa  171  1e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0056  secretion protein HlyD  30.18 
 
 		 354 aa  168  1e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3848  RND family efflux transporter MFP subunit  29.78 
 
 		 361 aa  151  2e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.918542  normal  0.711455 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003810  linker protein putative  31.51 
 
 		 365 aa  148  2.0000000000000003e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4314  RND family efflux transporter MFP subunit  32.39 
 
 		 360 aa  146  5e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00180968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1279  HlyD family secretion protein  31.37 
 
 		 359 aa  145  2e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3643  RND family efflux transporter MFP subunit  31.99 
 
 		 360 aa  144  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3513  RND family efflux transporter MFP subunit  31.99 
 
 		 360 aa  144  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0849  RND family efflux transporter MFP subunit  31.99 
 
 		 360 aa  144  3e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.880012  normal  0.445386 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2562  RND family efflux transporter MFP subunit  27.51 
 
 		 389 aa  144  4e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.718255  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2115  RND family efflux transporter MFP subunit  32.79 
 
 		 358 aa  143  5e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.243289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3992  RND efflux system membrane fusion protein  30.56 
 
 		 366 aa  143  6e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3695  RND family efflux transporter MFP subunit  30.77 
 
 		 360 aa  140  3e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.101272  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1613  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.07 
 
 		 469 aa  139  7e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1418  RND family efflux transporter MFP subunit  32.63 
 
 		 384 aa  139  1e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.267918  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3664  RND family efflux transporter MFP subunit  29.51 
 
 		 370 aa  138  2e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01876  hypothetical protein  29.28 
 
 		 359 aa  137  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0668  RND family efflux transporter MFP subunit  31.92 
 
 		 360 aa  136  7.000000000000001e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3712  RND family efflux transporter MFP subunit  31.7 
 
 		 367 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.975013  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0630  RND family efflux transporter MFP subunit  31.4 
 
 		 364 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0793  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.95 
 
 		 390 aa  134  3.9999999999999996e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1352  organic solvent efflux pump precursor (periplasmic linker protein component)  28.61 
 
 		 359 aa  133  6e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.896212  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0641  RND family efflux transporter MFP subunit  31.5 
 
 		 360 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0664  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.5 
 
 		 360 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1730  RND family efflux transporter MFP subunit  28.37 
 
 		 368 aa  130  3e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.674972  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0697  RND family efflux transporter MFP subunit  32.47 
 
 		 359 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3401  RND family efflux transporter MFP subunit  30.92 
 
 		 360 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.392528  hitchhiker  0.00103818 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1435  RND family efflux transporter MFP subunit  31.82 
 
 		 359 aa  129  9.000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0551  RND family efflux transporter MFP subunit  30.64 
 
 		 360 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.139954 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2814  RND family efflux transporter MFP subunit  35.01 
 
 		 370 aa  127  3e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3571  RND family efflux transporter MFP subunit  31.21 
 
 		 360 aa  126  5e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.239658  normal  0.276589 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01875  hypothetical protein  28.28 
 
 		 343 aa  124  3e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02664  putative multidrug resistance protein (substrate binding lipoprotein)  28.61 
 
 		 359 aa  122  7e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0150101  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1511  secretion protein HlyD  25.14 
 
 		 357 aa  122  8e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003811  membrane-fusion protein  27.99 
 
 		 343 aa  118  9.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2234  RND family efflux transporter MFP subunit  26.96 
 
 		 407 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.282252  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1924  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.7 
 
 		 352 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.896235 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05965  hypothetical protein  27.61 
 
 		 357 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1280  putative multidrug resistance protein  28.73 
 
 		 343 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2000  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.97 
 
 		 360 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.461729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000228  membrane-fusion protein  27.84 
 
 		 357 aa  118  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2367  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.97 
 
 		 360 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3313  RND family efflux transporter MFP subunit  33.33 
 
 		 363 aa  117  3e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1351  putative multidrug resistance protein precursor  27.68 
 
 		 357 aa  117  3e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1263  efflux transporter  29.75 
 
 		 415 aa  116  6.9999999999999995e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.471028  normal  0.778162 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2871  RND family efflux transporter MFP subunit  29.32 
 
 		 357 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1462  RND family efflux transporter MFP subunit  32.87 
 
 		 418 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3214  putative efflux protein  27.58 
 
 		 367 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3493  RND family efflux transporter MFP subunit  31.62 
 
 		 381 aa  110  3e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2567  RND family efflux transporter MFP subunit  28.66 
 
 		 331 aa  111  3e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.17029 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2050  secretion protein HlyD  31.09 
 
 		 426 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0730  RND family efflux transporter MFP subunit  32.97 
 
 		 350 aa  110  4.0000000000000004e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.13685  normal  0.700394 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2778  RND family efflux transporter MFP subunit  32.17 
 
 		 359 aa  110  6e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.223876 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004022  membrane-fusion protein  26.54 
 
 		 369 aa  109  7.000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000160707  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4143  RND family efflux transporter MFP subunit  28.94 
 
 		 343 aa  109  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.478516 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0746  AcrA/E family efflux transporter MFP subunit  27.88 
 
 		 366 aa  108  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.339879  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2559  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.78 
 
 		 349 aa  108  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.99545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1163  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.11 
 
 		 377 aa  106  6e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00317162  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4007  secretion protein HlyD  30.4 
 
 		 386 aa  106  8e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.430649  normal  0.0665893 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4144  RND family efflux transporter MFP subunit  24.86 
 
 		 365 aa  106  8e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.473768 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1943  secretion protein HlyD  29.13 
 
 		 523 aa  105  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.354822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3362  RND family efflux transporter MFP subunit  29.09 
 
 		 358 aa  104  3e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3700  secretion protein HlyD  32.37 
 
 		 381 aa  103  3e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3340  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.13 
 
 		 379 aa  104  3e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02529  putative multidrug resistance protein (substrate binding lipoprotein)  25.38 
 
 		 403 aa  104  3e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2532  secretion protein HlyD  35.87 
 
 		 359 aa  103  4e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.19676  normal  0.860631 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000654  putative efflux protein  25.67 
 
 		 360 aa  102  9e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4427  RND family efflux transporter MFP subunit  28.31 
 
 		 384 aa  102  9e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.123796 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0777  RND family efflux transporter MFP subunit  29.76 
 
 		 384 aa  102  9e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4303  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.34 
 
 		 386 aa  102  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1026  RND family efflux transporter MFP subunit  30.34 
 
 		 384 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.933063 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2426  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.79 
 
 		 365 aa  102  1e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.54628  hitchhiker  0.0000000883837 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51550  multidrug efflux pump membrane fusion protein  31.51 
 
 		 383 aa  102  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1386  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.31 
 
 		 384 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.178254 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2867  RND family efflux transporter MFP subunit  30.39 
 
 		 401 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.966 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1963  putative secretion protein, HlyD family  25.62 
 
 		 390 aa  101  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000072673  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0689  secretion protein HlyD  29.74 
 
 		 411 aa  101  2e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0327  RND family efflux transporter MFP subunit  31.63 
 
 		 376 aa  101  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.270074 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1122  RND family efflux transporter MFP subunit  33.23 
 
 		 366 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4337  RND family efflux transporter MFP subunit  28.31 
 
 		 384 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.235617 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0674  periplasmic linker protein  31.17 
 
 		 358 aa  101  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1660  RND family efflux transporter MFP subunit  30.56 
 
 		 369 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2818  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.73 
 
 		 349 aa  101  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0581  RND family efflux transporter MFP subunit  27.71 
 
 		 417 aa  100  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.669798  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0673  multidrug resistance protein  27.83 
 
 		 354 aa  101  3e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2293  RND family efflux transporter MFP subunit  32.36 
 
 		 371 aa  101  3e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1177  RND family efflux transporter MFP subunit  26.9 
 
 		 417 aa  100  4e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0630  secretion protein HlyD  27.41 
 
 		 357 aa  100  5e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0232449  normal  0.116732 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1636  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.8 
 
 		 383 aa  100  5e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.372421  normal  0.934491 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0942  acriflavine resistance protein E  26.68 
 
 		 374 aa  100  6e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0438  hypothetical protein  28.15 
 
 		 352 aa  99.4  8e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000466929  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3495  RND family efflux transporter MFP subunit  29.87 
 
 		 365 aa  99.4  8e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1372  secretion protein HlyD  30.56 
 
 		 405 aa  98.6  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.203736  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1206  multidrug efflux system subunit MdtA  27.87 
 
 		 419 aa  98.2  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0570202  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>