More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_0327 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_0327  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 		 376 aa  753    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.270074 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2867  RND family efflux transporter MFP subunit  52.27 
 
 		 401 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.966 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51550  multidrug efflux pump membrane fusion protein  58.16 
 
 		 383 aa  364  1e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3715  RND family efflux transporter MFP subunit  55.28 
 
 		 382 aa  359  5e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.970475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3493  RND family efflux transporter MFP subunit  53.02 
 
 		 381 aa  356  3.9999999999999996e-97  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05530  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexA precursor  53.39 
 
 		 383 aa  340  2e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0809  secretion protein HlyD  51.51 
 
 		 392 aa  339  5e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.165865 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0525  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexA precursor  53.11 
 
 		 442 aa  338  9e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.106985  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4427  RND family efflux transporter MFP subunit  50.68 
 
 		 384 aa  335  5.999999999999999e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.123796 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1193  HlyD family secretion protein  54.22 
 
 		 386 aa  334  2e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000622308  normal  0.342064 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1026  RND family efflux transporter MFP subunit  50.55 
 
 		 384 aa  334  2e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.933063 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1386  efflux transporter, RND family, MFP subunit  50.14 
 
 		 384 aa  332  9e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.178254 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4337  RND family efflux transporter MFP subunit  49.45 
 
 		 384 aa  332  1e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.235617 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4007  secretion protein HlyD  50.14 
 
 		 386 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.430649  normal  0.0665893 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1849  efflux transporter, RND family, MFP subunit  49.17 
 
 		 422 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00425578 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1280  secretion protein HlyD  53.03 
 
 		 385 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0347794  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01880  Secretion protein HlyD  52.84 
 
 		 383 aa  326  3e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2697  multidrug resistance protein  52.57 
 
 		 400 aa  326  4.0000000000000003e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2557  secretion protein HlyD  54.04 
 
 		 379 aa  326  4.0000000000000003e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2369  efflux transporter, RND family, MFP subunit  49.16 
 
 		 433 aa  326  4.0000000000000003e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.137399  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4303  efflux transporter, RND family, MFP subunit  49.86 
 
 		 386 aa  325  6e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3435  efflux transporter, RND family, MFP subunit  50.82 
 
 		 399 aa  324  1e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.169321  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0287  acridine efflux pump  50.29 
 
 		 394 aa  317  2e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3680  secretion protein HlyD family protein  46.92 
 
 		 405 aa  315  9.999999999999999e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0331  RND family efflux transporter MFP subunit  49.72 
 
 		 394 aa  312  5.999999999999999e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.109026  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3499  RND family efflux transporter MFP subunit  52.89 
 
 		 395 aa  309  5.9999999999999995e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0344164  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003895  membrane fusion protein of RND family multidrug efflux pump  47.31 
 
 		 379 aa  308  1.0000000000000001e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00341624  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0441  efflux transporter, RND family, MFP subunit  46.4 
 
 		 385 aa  306  3e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0441  RND family efflux transporter MFP subunit  46.4 
 
 		 385 aa  306  3e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.693626 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3458  acriflavine resistance protein E  46.4 
 
 		 385 aa  306  3e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000310651  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3750  acriflavine resistance protein E  46.4 
 
 		 385 aa  306  3e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00329123  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4582  acriflavine resistance protein E  46.4 
 
 		 385 aa  306  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.153462  normal  0.314671 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3923  multidrug efflux system protein  50.88 
 
 		 387 aa  305  6e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3648  acriflavine resistance protein E  46.13 
 
 		 385 aa  305  8.000000000000001e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.444601  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03123  cytoplasmic membrane lipoprotein  46.13 
 
 		 385 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03074  hypothetical protein  46.13 
 
 		 385 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0569  RND family efflux transporter MFP subunit  50.55 
 
 		 381 aa  303  3.0000000000000004e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3560  acriflavine resistance protein E  45.93 
 
 		 385 aa  303  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0550362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3689  acriflavine resistance protein E  49.3 
 
 		 385 aa  302  5.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.10776 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3655  acriflavine resistance protein E  49.3 
 
 		 385 aa  302  5.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.369196 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3583  acriflavine resistance protein E  49.02 
 
 		 385 aa  302  5.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3582  acriflavine resistance protein E  49.3 
 
 		 385 aa  302  5.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.372723  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0553  acriflavine resistance protein A  48.85 
 
 		 409 aa  302  6.000000000000001e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4090  secretion protein HlyD  49.86 
 
 		 386 aa  302  7.000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0506  acriflavine resistance protein A  49.14 
 
 		 409 aa  302  8.000000000000001e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.951175  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00414  multidrug efflux system  49.14 
 
 		 397 aa  301  9e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3147  efflux transporter, RND family, MFP subunit  49.14 
 
 		 397 aa  301  9e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.035839  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3153  RND family efflux transporter MFP subunit  49.14 
 
 		 397 aa  301  9e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0497  acriflavine resistance protein A  49.14 
 
 		 397 aa  301  9e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00419  hypothetical protein  49.14 
 
 		 397 aa  301  9e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0539  acriflavine resistance protein A  49.14 
 
 		 397 aa  301  9e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0395  acriflavine resistance protein A  48.85 
 
 		 409 aa  301  2e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1127  RND family efflux transporter MFP subunit  47.45 
 
 		 395 aa  300  3e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.295973  unclonable  0.0000000230672 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4046  RND family efflux transporter MFP subunit  48.98 
 
 		 382 aa  300  4e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4061  RND family efflux transporter MFP subunit  46.45 
 
 		 383 aa  299  5e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000265031  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3704  RND family efflux transporter MFP subunit  47.38 
 
 		 379 aa  299  6e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.596756 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3837  RND family efflux transporter MFP subunit  46.72 
 
 		 382 aa  299  6e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3468  efflux transporter, RND family, MFP subunit  47.37 
 
 		 393 aa  298  7e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.143252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2894  RND family efflux transporter MFP subunit  45.92 
 
 		 397 aa  298  1e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.781676  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1011  efflux transporter, RND family, MFP subunit  46.03 
 
 		 395 aa  298  1e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.279031  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3930  RND family efflux transporter MFP subunit  46.72 
 
 		 382 aa  298  1e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3863  RND family efflux transporter MFP subunit  45.62 
 
 		 382 aa  298  1e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0526  acriflavine resistance protein A  51.02 
 
 		 397 aa  297  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0579  acriflavine resistance protein A  51.02 
 
 		 397 aa  297  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0884843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0520  acriflavine resistance protein A  51.02 
 
 		 397 aa  297  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0763854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0517  acriflavine resistance protein A  51.02 
 
 		 397 aa  297  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3601  secretion protein HlyD  46.17 
 
 		 386 aa  297  2e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.804898  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0536  acriflavine resistance protein A  51.02 
 
 		 397 aa  297  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0547  efflux transporter, RND family, MFP subunit  49.16 
 
 		 410 aa  297  2e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4212  efflux transporter, RND family, MFP subunit  46.13 
 
 		 381 aa  296  5e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4251  RND family efflux transporter MFP subunit  46.13 
 
 		 381 aa  296  5e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.397426  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01755  hypothetical protein  48.83 
 
 		 378 aa  295  1e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01888  drug efflux lipoprotein  52.13 
 
 		 409 aa  293  3e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.524066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0551  efflux transporter, RND family, MFP subunit  49.58 
 
 		 411 aa  293  3e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.856573  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4385  RND family efflux transporter MFP subunit  45.86 
 
 		 381 aa  293  4e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.912914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1418  secretion protein HlyD  48.8 
 
 		 400 aa  293  4e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3207  RND family efflux transporter MFP subunit  48.24 
 
 		 395 aa  293  4e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.474787  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3067  acriflavine resistance protein A  48.24 
 
 		 395 aa  293  4e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.018659  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2880  multidrug efflux protein  48.24 
 
 		 388 aa  293  4e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.876487 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0943  RND family efflux transporter MFP subunit  50.29 
 
 		 397 aa  292  6e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3241  efflux transporter, RND family, MFP subunit  47.09 
 
 		 398 aa  292  6e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0090  RND family efflux transporter MFP subunit  45.05 
 
 		 381 aa  291  9e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2050  secretion protein HlyD  46.88 
 
 		 426 aa  291  1e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0518  secretion protein HlyD  50 
 
 		 412 aa  290  4e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0011  acriflavin resistance lipoprotein A precursor  48.4 
 
 		 398 aa  289  7e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.511373  normal  0.0259122 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2836  RND family efflux transporter MFP subunit  47.31 
 
 		 446 aa  287  2e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.113713  normal  0.378923 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0131  RND family efflux transporter MFP subunit  47.19 
 
 		 383 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000302028  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4693  multidrug resistance protein AcrA/AcrE family  45.9 
 
 		 382 aa  286  5e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1070  efflux transporter, RND family, MFP subunit  48.63 
 
 		 397 aa  285  7e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00558937  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2325  efflux transporter, RND family, MFP subunit  47.03 
 
 		 446 aa  285  1.0000000000000001e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.116121  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3699  RND family efflux transporter MFP subunit  47.93 
 
 		 390 aa  285  1.0000000000000001e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3047  efflux transporter, RND family, MFP subunit  43.72 
 
 		 396 aa  281  2e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.376069  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0152  RND family efflux transporter MFP subunit  44.7 
 
 		 385 aa  280  3e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2066  secretion protein HlyD  47.27 
 
 		 428 aa  278  8e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.567226  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3399  RND family efflux transporter MFP subunit  45.05 
 
 		 406 aa  278  8e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.852955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0031  RND family efflux transporter MFP subunit  47.66 
 
 		 386 aa  278  1e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000318769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0123  efflux transporter, RND family, MFP subunit  44.03 
 
 		 384 aa  277  2e-73  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3586  RND family efflux transporter MFP subunit  45.76 
 
 		 386 aa  276  4e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3492  RND family efflux transporter MFP subunit  46.11 
 
 		 405 aa  276  6e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.474299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0777  RND family efflux transporter MFP subunit  44.86 
 
 		 384 aa  275  7e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>