More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_2635 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_2635  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 		 370 aa  755    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0171634  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3278  hypothetical protein  73.67 
 
 		 374 aa  555  1e-157  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1296  RND family efflux transporter MFP subunit  73.44 
 
 		 373 aa  554  1e-157  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00794293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2987  RND family efflux transporter MFP subunit  75.48 
 
 		 368 aa  553  1e-156  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.331807  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2973  RND family efflux transporter MFP subunit  75.21 
 
 		 368 aa  551  1e-156  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.388324  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1246  RND family efflux transporter MFP subunit  73.17 
 
 		 373 aa  551  1e-156  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1390  efflux transporter, RND family, MFP subunit  75.48 
 
 		 368 aa  553  1e-156  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3131  RND family efflux transporter MFP subunit  74.25 
 
 		 368 aa  549  1e-155  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.419387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1316  RND family efflux transporter MFP subunit  72.09 
 
 		 373 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0457326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1570  RND family efflux transporter MFP subunit  58.36 
 
 		 375 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.628485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1278  secretion protein HlyD  56.86 
 
 		 370 aa  412  1e-114  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0363804  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3112  RND family efflux transporter MFP subunit  57.56 
 
 		 374 aa  412  1e-114  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1148  RND family efflux transporter MFP subunit  56.46 
 
 		 373 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1325  RND family efflux transporter MFP subunit  56.45 
 
 		 370 aa  402  1e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.784041  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2342  secretion protein HlyD  54.02 
 
 		 370 aa  379  1e-104  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.588824 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1312  RND family efflux transporter MFP subunit  53.82 
 
 		 371 aa  377  1e-103  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00487  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.12 
 
 		 379 aa  176  4e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0251  efflux transporter  32.02 
 
 		 383 aa  162  1e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1310  secretion protein HlyD  28.92 
 
 		 379 aa  150  4e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.673983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4736  secretion protein HlyD  30.8 
 
 		 510 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.325985  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3758  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.72 
 
 		 379 aa  101  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1916  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.33 
 
 		 388 aa  98.2  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.631291  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3300  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.79 
 
 		 395 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.512251  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2071  RND efflux system membrane fusion protein  29.33 
 
 		 407 aa  95.5  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.226746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1079  secretion protein HlyD  25.91 
 
 		 366 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.984606 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5875  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.53 
 
 		 407 aa  94  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0955286  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2690  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.71 
 
 		 360 aa  94  4e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1593  RND family efflux transporter MFP subunit  30.42 
 
 		 631 aa  93.6  5e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.351482  normal  0.814117 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3130  secretion protein HlyD  28.25 
 
 		 395 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3470  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.86 
 
 		 379 aa  92  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.430372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1372  secretion protein HlyD  26.98 
 
 		 405 aa  90.5  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.203736  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3340  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.67 
 
 		 379 aa  90.5  5e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2214  putative component of multidrug efflux system  26.05 
 
 		 368 aa  89.7  7e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.082194  normal  0.474627 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1063  hypothetical protein  31.12 
 
 		 262 aa  89.4  8e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2584  CzcB subfamily membrane fusion protein  29.96 
 
 		 409 aa  89  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4902  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.72 
 
 		 368 aa  88.2  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3351  RND family efflux transporter MFP subunit  26.8 
 
 		 367 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0915  secretion protein, putative  24.93 
 
 		 368 aa  87.4  3e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4363  RND efflux system membrane fusion protein  26.6 
 
 		 467 aa  87.8  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.234106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6292  RND family efflux transporter MFP subunit  27.33 
 
 		 369 aa  87  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.585328  hitchhiker  0.00894017 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3773  RND family efflux transporter MFP subunit  26.07 
 
 		 384 aa  87  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.265534  normal  0.799504 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4222  secretion protein HlyD  26.05 
 
 		 368 aa  86.7  6e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.163749 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1893  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.56 
 
 		 402 aa  86.7  6e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.227434 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1564  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.56 
 
 		 402 aa  86.7  6e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.18238  normal  0.253617 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6521  RND family efflux transporter MFP subunit  27.66 
 
 		 410 aa  86.7  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.745567  normal  0.0817001 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4943  RND efflux membrane fusion protein precursor  27.49 
 
 		 375 aa  86.3  7e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0078  hypothetical protein  31.02 
 
 		 381 aa  86.3  8e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0288  RND family efflux transporter MFP subunit  25.64 
 
 		 355 aa  86.3  8e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.527133 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1924  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.87 
 
 		 352 aa  86.3  8e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.896235 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3902  RND family efflux transporter MFP subunit  27.12 
 
 		 392 aa  85.9  9e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.538028 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4492  secretion protein HlyD  28.39 
 
 		 382 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0226833 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1462  RND efflux membrane fusion protein precursor  24.65 
 
 		 367 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16800  putative efflux transmembrane protein  24.84 
 
 		 367 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0868415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4074  secretion protein HlyD  26.44 
 
 		 368 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56880  putative membrane fusion protein  28.07 
 
 		 376 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2797  secretion protein HlyD  24.45 
 
 		 367 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.798419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1048  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.19 
 
 		 367 aa  85.1  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0768467 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1715  acriflavin resistance periplasmic protein  24.53 
 
 		 357 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000921401  normal  0.0591325 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6578  RND family efflux transporter MFP subunit  27.33 
 
 		 369 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.845685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0450  RND family efflux transporter MFP subunit  23.4 
 
 		 407 aa  84.3  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.825026 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1967  RND family efflux transporter MFP subunit  31.76 
 
 		 391 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0310111  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3320  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.23 
 
 		 371 aa  84  0.000000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.591091  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3495  RND family efflux transporter MFP subunit  23.12 
 
 		 365 aa  84.3  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0225  secretion protein HlyD  26.07 
 
 		 380 aa  84.3  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.34961  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1555  secretion protein HlyD  25.82 
 
 		 394 aa  84.7  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4362  RND family efflux transporter MFP subunit  25.62 
 
 		 373 aa  84  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3214  putative efflux protein  24.86 
 
 		 367 aa  84  0.000000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0591  RND family efflux transporter MFP subunit  26.82 
 
 		 350 aa  84  0.000000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2426  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.15 
 
 		 365 aa  83.6  0.000000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.54628  hitchhiker  0.0000000883837 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0247  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.59 
 
 		 380 aa  83.6  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1749  secretion protein HlyD  25.58 
 
 		 398 aa  83.6  0.000000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.145441 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2097  RND family efflux transporter MFP subunit  31.37 
 
 		 391 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.902105  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2814  RND family efflux transporter MFP subunit  28.68 
 
 		 370 aa  83.6  0.000000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6002  RND family efflux transporter MFP subunit  28.26 
 
 		 363 aa  83.2  0.000000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.249457  normal  0.124375 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1943  secretion protein HlyD  25.87 
 
 		 523 aa  83.2  0.000000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.354822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2293  RND family efflux transporter MFP subunit  23.71 
 
 		 371 aa  83.6  0.000000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5192  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.96 
 
 		 356 aa  82.8  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0231  secretion protein HlyD  25.81 
 
 		 354 aa  82.8  0.000000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0901  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.68 
 
 		 351 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.470272  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2657  cation or acridine efflux membrane fusion protein  26.5 
 
 		 357 aa  82.8  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3130  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.48 
 
 		 377 aa  81.6  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.645496  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0809  hypothetical protein  24.12 
 
 		 360 aa  81.6  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.244326 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6327  RND family efflux transporter MFP subunit  28.75 
 
 		 478 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0452278  normal  0.980568 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4313  RND family efflux transporter MFP subunit  28.25 
 
 		 409 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.583259 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1502  secretion protein HlyD  28.75 
 
 		 478 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.184777  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0916  efflux transporter  25.16 
 
 		 396 aa  81.3  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.987196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1209  RND family efflux transporter MFP subunit  28.75 
 
 		 381 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.421019  normal  0.31825 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1921  RND family efflux transporter MFP subunit  26.23 
 
 		 340 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00271277  normal  0.413551 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3233  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.52 
 
 		 361 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1653  putative transport/efflux transmembrane protein  25.24 
 
 		 402 aa  81.3  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.493931 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6991  RND family efflux transporter MFP subunit  28.75 
 
 		 472 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.231557 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2778  RND family efflux transporter MFP subunit  25.53 
 
 		 359 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.223876 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2818  secretion protein HlyD  23.55 
 
 		 376 aa  81.3  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.68617  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3301  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.31 
 
 		 366 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.168698  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2849  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.03 
 
 		 421 aa  80.5  0.00000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0325844 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3547  RND family efflux transporter MFP subunit  26.27 
 
 		 371 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1962  RND family efflux transporter MFP subunit  26.84 
 
 		 393 aa  80.1  0.00000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1392  RND efflux system membrane fusion protein  25.16 
 
 		 419 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0449025  normal  0.0986293 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0533  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.15 
 
 		 381 aa  80.1  0.00000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4857  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.71 
 
 		 384 aa  80.1  0.00000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.231948  normal  0.491578 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>