287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1593 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_1593  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 		 631 aa  1238    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.351482  normal  0.814117 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4736  secretion protein HlyD  38.49 
 
 		 510 aa  322  1.9999999999999998e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.325985  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1441  RND family efflux transporter MFP subunit  28.24 
 
 		 634 aa  143  9e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00487  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.41 
 
 		 379 aa  124  8e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1148  RND family efflux transporter MFP subunit  30.77 
 
 		 373 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1325  RND family efflux transporter MFP subunit  33.04 
 
 		 370 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.784041  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3112  RND family efflux transporter MFP subunit  34.05 
 
 		 374 aa  114  6e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2342  secretion protein HlyD  35.06 
 
 		 370 aa  114  6e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.588824 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1278  secretion protein HlyD  30.87 
 
 		 370 aa  108  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0363804  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2987  RND family efflux transporter MFP subunit  29.9 
 
 		 368 aa  105  3e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.331807  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1390  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.55 
 
 		 368 aa  103  7e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3131  RND family efflux transporter MFP subunit  29.9 
 
 		 368 aa  103  7e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.419387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3253  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.46 
 
 		 496 aa  103  9e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2973  RND family efflux transporter MFP subunit  29.55 
 
 		 368 aa  100  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.388324  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1570  RND family efflux transporter MFP subunit  32.53 
 
 		 375 aa  97.4  6e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.628485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1312  RND family efflux transporter MFP subunit  31.74 
 
 		 371 aa  97.4  7e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2843  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.96 
 
 		 496 aa  97.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3278  hypothetical protein  30.66 
 
 		 374 aa  95.9  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1246  RND family efflux transporter MFP subunit  30.42 
 
 		 373 aa  95.5  3e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2858  secretion protein HlyD  24.88 
 
 		 517 aa  94.4  6e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1296  RND family efflux transporter MFP subunit  33.51 
 
 		 373 aa  94  7e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00794293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2635  RND family efflux transporter MFP subunit  30.42 
 
 		 370 aa  93.6  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0171634  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05040  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.02 
 
 		 509 aa  92.4  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00959096  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1316  RND family efflux transporter MFP subunit  30.42 
 
 		 373 aa  92.4  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0457326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0251  efflux transporter  30 
 
 		 383 aa  92  3e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1398  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.6 
 
 		 504 aa  87.8  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1164  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.5 
 
 		 467 aa  87  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.748472 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1439  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.75 
 
 		 380 aa  84.3  0.000000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0465471  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2825  RND family efflux transporter subunit MFP  27.54 
 
 		 500 aa  83.6  0.000000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.708608  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1310  secretion protein HlyD  29.76 
 
 		 379 aa  83.2  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.673983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2861  secretion protein HlyD  28.48 
 
 		 489 aa  79  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1602  RND family efflux transporter MFP subunit  24.2 
 
 		 641 aa  78.2  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2532  secretion protein HlyD  29.72 
 
 		 359 aa  73.9  0.000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.19676  normal  0.860631 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1675  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.64 
 
 		 608 aa  71.6  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1064  hypothetical protein  37.5 
 
 		 110 aa  67.8  0.0000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.423327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2377  RND family efflux transporter MFP subunit  24.69 
 
 		 609 aa  67  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.40782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0259  secretion protein HlyD  25.56 
 
 		 327 aa  65.5  0.000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.689376  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2657  cation or acridine efflux membrane fusion protein  25.83 
 
 		 357 aa  64.7  0.000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1040  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.61 
 
 		 500 aa  62.8  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3213  multidrug resistance efflux pump-like protein  26.05 
 
 		 502 aa  62.8  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.108943 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0555  RND family efflux transporter MFP subunit  28 
 
 		 433 aa  62.4  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0500  secretion protein HlyD family protein  26.22 
 
 		 502 aa  62.4  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2508  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.28 
 
 		 397 aa  62  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0267  RND family efflux transporter MFP subunit  29.71 
 
 		 586 aa  61.6  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117926 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16800  putative efflux transmembrane protein  29.32 
 
 		 367 aa  61.2  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0868415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0901  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.36 
 
 		 351 aa  60.5  0.00000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.470272  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2949  RND family efflux transporter MFP subunit  25.99 
 
 		 376 aa  60.5  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3638  secretion protein HlyD family protein  27.99 
 
 		 503 aa  60.5  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.266214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1586  secretion protein HlyD  23.81 
 
 		 377 aa  60.1  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000231295  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1451  RND family efflux transporter MFP subunit  29.46 
 
 		 369 aa  60.1  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.513769  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0364  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.61 
 
 		 362 aa  60.5  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.405995  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2823  HlyD family secretion protein  27.15 
 
 		 329 aa  59.3  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3892  secretion protein HlyD family protein  34.82 
 
 		 352 aa  58.9  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1462  RND efflux membrane fusion protein precursor  27.71 
 
 		 367 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20080  hypothetical protein  29.35 
 
 		 323 aa  59.7  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2939  RND family efflux transporter MFP subunit  28.57 
 
 		 352 aa  59.7  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0067677  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1613  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.79 
 
 		 469 aa  59.3  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1705  HlyD family secretion protein  40.4 
 
 		 308 aa  58.9  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2355  secretion protein HlyD  28.4 
 
 		 509 aa  58.5  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0694634 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1704  RND family efflux transporter MFP subunit  26.24 
 
 		 358 aa  57.8  0.0000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.271919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1629  RND family efflux transporter MFP subunit  26.24 
 
 		 358 aa  57.8  0.0000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.185382  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3461  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.32 
 
 		 370 aa  57.8  0.0000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2027  secretion protein HlyD  29.74 
 
 		 390 aa  57.8  0.0000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.423658  normal  0.283543 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.34 
 
 		 377 aa  57.4  0.0000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.69897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1728  hypothetical protein  28.93 
 
 		 323 aa  57.4  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0534587  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0859  HlyD family secretion protein  28.93 
 
 		 372 aa  56.6  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.585057  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4229  RND family efflux transporter MFP subunit  26.77 
 
 		 371 aa  56.2  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0271349  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3301  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.06 
 
 		 366 aa  56.2  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.168698  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3208  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.91 
 
 		 357 aa  56.2  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0146448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2925  secretion protein HlyD family protein  28.78 
 
 		 314 aa  55.1  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0916  HlyD family secretion protein  28.64 
 
 		 372 aa  55.1  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3131  secretion protein HlyD  30.85 
 
 		 363 aa  55.5  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.735534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1544  secretion protein HlyD family protein  25.2 
 
 		 504 aa  55.1  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1513  secretion protein HlyD family protein  39.39 
 
 		 384 aa  54.7  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4577  secretion protein HlyD  32.14 
 
 		 354 aa  54.7  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.231546  normal  0.47776 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0505  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25 
 
 		 349 aa  54.7  0.000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1549  secretion protein HlyD family protein  39.39 
 
 		 372 aa  54.7  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1516  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.27 
 
 		 366 aa  54.3  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1925  HlyD family secretion protein  26.85 
 
 		 354 aa  54.7  0.000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2812  hypothetical protein  27.16 
 
 		 328 aa  54.7  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.659594  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2900  hypothetical protein  27.16 
 
 		 328 aa  54.7  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.441654  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1522  secretion protein HlyD family protein  39.39 
 
 		 378 aa  54.3  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2833  secretion protein HlyD family protein  39.39 
 
 		 383 aa  54.7  0.000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.121026  normal  0.828234 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1263  efflux transporter  33.12 
 
 		 415 aa  54.3  0.000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.471028  normal  0.778162 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3248  RND family efflux transporter MFP subunit  23.67 
 
 		 375 aa  54.3  0.000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000122145  hitchhiker  0.000539204 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1462  RND family efflux transporter MFP subunit  25.68 
 
 		 418 aa  54.3  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2960  RND family efflux transporter MFP subunit  29.13 
 
 		 387 aa  54.7  0.000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.147665  hitchhiker  0.0025793 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1201  RND family efflux transporter MFP subunit  24.9 
 
 		 365 aa  54.3  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0341767  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1044  RND family efflux transporter MFP subunit  24.9 
 
 		 365 aa  54.3  0.000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0078  RND family efflux transporter MFP subunit  24.9 
 
 		 365 aa  54.3  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1496  RND family efflux transporter MFP subunit  24.9 
 
 		 365 aa  54.3  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0031  RND family efflux transporter MFP subunit  24.9 
 
 		 365 aa  54.3  0.000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1580  RND family efflux transporter MFP subunit  24.9 
 
 		 365 aa  54.3  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.610408  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8104  secretion protein HlyD family protein  28.57 
 
 		 354 aa  54.3  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4207  RND family efflux transporter MFP subunit  27.27 
 
 		 366 aa  54.3  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.647045 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0383  RND family efflux transporter MFP subunit  24.9 
 
 		 365 aa  54.3  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4082  RND family efflux transporter MFP subunit  29.38 
 
 		 455 aa  53.9  0.000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2810  secretion protein HlyD family protein  24.09 
 
 		 368 aa  53.9  0.000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.653473 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3037  secretion protein HlyD  27.75 
 
 		 344 aa  53.5  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.714598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1081  secretion protein HlyD  29.13 
 
 		 374 aa  53.5  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.157732  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>