More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1209 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_1209  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 		 418 aa  786    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148727  normal  0.199065 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1569  RND family efflux transporter MFP subunit  50.73 
 
 		 415 aa  350  2e-95  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0259  RND family efflux transporter MFP subunit  47.95 
 
 		 412 aa  307  2.0000000000000002e-82  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2937  secretion protein HlyD  42.51 
 
 		 418 aa  303  4.0000000000000003e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1732  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.67 
 
 		 439 aa  251  2e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54968  normal  0.756916 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0307  RND family efflux transporter MFP subunit  34.56 
 
 		 413 aa  195  1e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.240103  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0242  secretion protein HlyD  30.07 
 
 		 414 aa  193  5e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000372515  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3065  secretion protein HlyD  28.86 
 
 		 487 aa  82.4  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.757879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3080  efflux transporter  29.92 
 
 		 487 aa  79  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0764  RND family efflux transporter MFP subunit  27.67 
 
 		 385 aa  78.6  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2316  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.13 
 
 		 379 aa  77.8  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.144925 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0838  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.78 
 
 		 432 aa  76.3  0.0000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1757  RND family efflux transporter MFP subunit  26.6 
 
 		 443 aa  75.1  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0654458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0139  secretion protein HlyD  33.18 
 
 		 356 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0275  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.69 
 
 		 381 aa  74.3  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0379  hypothetical protein  22.75 
 
 		 439 aa  73.2  0.000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1497  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.03 
 
 		 407 aa  72.8  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.30393  hitchhiker  0.00778895 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1058  RND family efflux transporter MFP subunit  30.4 
 
 		 455 aa  72.8  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0206  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.35 
 
 		 386 aa  71.6  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1562  RND family efflux transporter MFP subunit  24.57 
 
 		 451 aa  72  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4226  secretion protein HlyD family protein  25.42 
 
 		 411 aa  68.6  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0108  HlyD family secretion protein  25.09 
 
 		 413 aa  68.6  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.736551  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1133  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.16 
 
 		 391 aa  67.8  0.0000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0793831  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0916  efflux transporter  30.84 
 
 		 396 aa  67.4  0.0000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.987196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3899  secretion protein HlyD  27.21 
 
 		 485 aa  67  0.0000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.553223 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4053  RND family efflux transporter MFP subunit  27.15 
 
 		 414 aa  66.6  0.0000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0212  secretion protein HlyD  28.57 
 
 		 364 aa  66.2  0.0000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.59943 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000654  putative efflux protein  24.02 
 
 		 360 aa  66.2  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0045  RND family efflux transporter MFP subunit  28.51 
 
 		 356 aa  65.1  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0156  secretion protein HlyD  28 
 
 		 390 aa  65.5  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1515  RND family efflux transporter MFP subunit  29.55 
 
 		 405 aa  65.1  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1992  secretion protein HlyD  25.39 
 
 		 374 aa  63.9  0.000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.121396  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1636  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.39 
 
 		 383 aa  63.9  0.000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.372421  normal  0.934491 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06540  hypothetical protein  22.17 
 
 		 442 aa  63.5  0.000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4376  RND family efflux transporter MFP subunit  28.76 
 
 		 370 aa  63.5  0.000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.349604 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1129  secretion protein HlyD  25.47 
 
 		 368 aa  63.5  0.000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.827247  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2684  multidrug efflux system subunit MdtA  24.44 
 
 		 411 aa  63.2  0.000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0080  RND family efflux transporter MFP subunit  30.16 
 
 		 414 aa  62.8  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.95759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2322  secretion protein HlyD  24.9 
 
 		 399 aa  62.4  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000756014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0225  secretion protein HlyD  31.67 
 
 		 380 aa  62.8  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.34961  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2117  secretion protein HlyD  26.85 
 
 		 428 aa  62.8  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.893928 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2492  RND family efflux transporter subunit MFP  25.72 
 
 		 437 aa  62.8  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.311613  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1395  macrolide transporter subunit MacA  25.35 
 
 		 371 aa  62  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.458807  normal  0.0347786 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0508  secretion protein HlyD family protein  23.39 
 
 		 444 aa  62.4  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000010598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0861  secretion protein HlyD  26.67 
 
 		 330 aa  60.8  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0209949  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01614  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  23.02 
 
 		 285 aa  60.5  0.00000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.880107  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3566  RND family efflux transporter MFP subunit  28.24 
 
 		 435 aa  60.5  0.00000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.338138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1836  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  23.02 
 
 		 285 aa  60.5  0.00000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.182346  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0753  secretion protein HlyD  26.97 
 
 		 370 aa  60.8  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0748  putative PAS/PAC sensor protein  22.05 
 
 		 607 aa  60.5  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2356  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  23.77 
 
 		 285 aa  60.8  0.00000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000721779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1855  MFP family transporter  23.02 
 
 		 285 aa  60.5  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0284898  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01604  hypothetical protein  23.02 
 
 		 285 aa  60.5  0.00000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.787651  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1721  MFP family transporter  23.77 
 
 		 285 aa  60.5  0.00000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.336288  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1996  secretion protein HlyD family protein  23.77 
 
 		 285 aa  60.5  0.00000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000694745  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0031  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.63 
 
 		 392 aa  60.1  0.00000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000323168  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1985  secretion protein HlyD family protein  23.77 
 
 		 285 aa  60.5  0.00000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.172504  hitchhiker  0.00138161 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0107  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.44 
 
 		 415 aa  60.1  0.00000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1554  MFP family transporter  23.77 
 
 		 285 aa  60.1  0.00000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.602347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1841  secretion protein HlyD  24.94 
 
 		 410 aa  60.1  0.00000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1757  secretion protein HlyD  24.16 
 
 		 448 aa  60.1  0.00000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.071428 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000105  membrane-fusion protein  24.61 
 
 		 351 aa  59.7  0.00000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.860226  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1575  RND membrane fusion protein AcrA  24.56 
 
 		 448 aa  59.7  0.00000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.853878 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0161  RND family efflux transporter MFP subunit  33.8 
 
 		 380 aa  59.3  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1904  secretion protein, HlyD family  29.05 
 
 		 373 aa  59.3  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.382262  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3839  secretion protein HlyD  26.03 
 
 		 439 aa  59.3  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0452  secretion protein HlyD family protein  24.78 
 
 		 352 aa  59.3  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5231  HlyD family secretion protein  29.7 
 
 		 426 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1748  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.85 
 
 		 388 aa  58.9  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0644  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.94 
 
 		 425 aa  59.3  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0200148  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1582  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.02 
 
 		 415 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0117238  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3552  multidrug efflux system subunit MdtA  24.8 
 
 		 413 aa  58.9  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2216  multidrug efflux system subunit MdtA  24.02 
 
 		 415 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1082  putative ABC transport system, lipoprotein  27.44 
 
 		 302 aa  58.2  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0558  secretion protein HlyD  26.96 
 
 		 360 aa  58.5  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.177986  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5576  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.68 
 
 		 353 aa  58.5  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.110033 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1567  multidrug efflux system subunit MdtA  23.18 
 
 		 455 aa  58.9  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.331208 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2178  RND family efflux transporter MFP subunit  24.9 
 
 		 397 aa  58.9  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.569446  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1510  secretion protein HlyD  24.64 
 
 		 357 aa  58.5  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2778  RND family efflux transporter MFP subunit  27.85 
 
 		 359 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.223876 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0807  secretion protein HlyD family protein  28.7 
 
 		 310 aa  58.9  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3738  HlyD family secretion protein  27.09 
 
 		 265 aa  58.5  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2870  RND family efflux transporter MFP subunit  24.05 
 
 		 351 aa  58.2  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.551784  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1839  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.56 
 
 		 420 aa  58.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1550  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.57 
 
 		 413 aa  58.2  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0505882  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0487  secretion protein HlyD  26.96 
 
 		 387 aa  58.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0299578  normal  0.132982 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3415  secretion protein HlyD family protein  29.81 
 
 		 406 aa  58.2  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.297812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0247  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.34 
 
 		 380 aa  58.2  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3475  secretion protein HlyD-like protein  24.24 
 
 		 373 aa  57.8  0.0000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.555415 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0782  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.93 
 
 		 428 aa  57.4  0.0000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00204407  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2916  RND family efflux transporter MFP subunit  26.57 
 
 		 449 aa  57.8  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.266604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3467  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.09 
 
 		 376 aa  57.8  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00013135  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1216  RND family efflux transporter MFP subunit  24.2 
 
 		 379 aa  57.4  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.152303  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60760  hypothetical protein  29.9 
 
 		 425 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68130  multidrug resistance protein  27.48 
 
 		 394 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00130699  normal  0.0310617 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1209  RND family efflux transporter MFP subunit  24.55 
 
 		 381 aa  57  0.0000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.421019  normal  0.31825 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2366  multidrug efflux system subunit MdtA  23.74 
 
 		 415 aa  57  0.0000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2149  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.15 
 
 		 409 aa  56.6  0.0000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.111795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2167  RND family efflux transporter MFP subunit  23.53 
 
 		 396 aa  56.6  0.0000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01971  hypothetical protein  23.46 
 
 		 415 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>