More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2178 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_2178  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 		 397 aa  802    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.569446  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2167  RND family efflux transporter MFP subunit  73.8 
 
 		 396 aa  610  1e-173  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2468  RND family efflux transporter MFP subunit  73.8 
 
 		 397 aa  608  1e-173  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.17063  normal  0.298309 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1930  RND family efflux transporter MFP subunit  65.15 
 
 		 395 aa  547  1e-154  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000000699486  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1711  secretion protein HlyD  64.18 
 
 		 402 aa  542  1e-153  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000765458  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2010  RND family efflux transporter MFP subunit  66.25 
 
 		 395 aa  541  1e-153  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.397997  normal  0.117138 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4484  RND family efflux transporter MFP subunit  54.95 
 
 		 410 aa  442  1e-123  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.878232  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3096  membrane-fusion protein  43.48 
 
 		 398 aa  316  4e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.651787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0766  RND family efflux transporter MFP subunit  42.57 
 
 		 407 aa  301  2e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0817385 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0659  RND family efflux transporter MFP subunit  42.18 
 
 		 399 aa  285  9e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0801  RND family efflux transporter MFP subunit  42.47 
 
 		 419 aa  272  7e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2743  hypothetical protein  41.11 
 
 		 408 aa  270  2e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3337  RND family efflux transporter MFP subunit  40.1 
 
 		 405 aa  261  1e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3234  RND family efflux transporter MFP subunit  40.1 
 
 		 405 aa  259  4e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.704192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0789  RND family efflux transporter MFP subunit  40.1 
 
 		 405 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0889  RND family efflux transporter MFP subunit  46.98 
 
 		 405 aa  258  1e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.436675 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3528  RND family efflux transporter MFP subunit  43.7 
 
 		 403 aa  257  2e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0886  RND family efflux transporter MFP subunit  42.42 
 
 		 403 aa  256  3e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0891  RND family efflux transporter MFP subunit  43.14 
 
 		 404 aa  256  5e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00999  Membrane-fusion protein  40.21 
 
 		 410 aa  256  6e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.341025  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3453  efflux transporter, RND family, MFP subunit  43.42 
 
 		 403 aa  256  7e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0839  RND family efflux transporter MFP subunit  43.7 
 
 		 403 aa  256  7e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0946  hypothetical protein  41.53 
 
 		 375 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3647  RND family efflux transporter MFP subunit  43.42 
 
 		 403 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0404  RND family efflux transporter MFP subunit  36.19 
 
 		 387 aa  238  1e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0540732  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02659  putative multidrug resistance protein  35.97 
 
 		 379 aa  232  7.000000000000001e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.196626  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1841  secretion protein HlyD  33.69 
 
 		 410 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000669  membrane-fusion protein  34.2 
 
 		 385 aa  210  3e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06546  hypothetical protein  36.26 
 
 		 385 aa  210  4e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0476  RND family efflux transporter MFP subunit  35.31 
 
 		 422 aa  184  2.0000000000000003e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.189255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0329  HlyD family secretion protein  37.59 
 
 		 289 aa  182  7e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0875281  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4647  RND family efflux transporter MFP subunit  30.69 
 
 		 426 aa  178  1e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0668  Acr family membrane-fusion protein  30.67 
 
 		 393 aa  172  6.999999999999999e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2268  membrane-fusion protein  30.14 
 
 		 423 aa  164  2.0000000000000002e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.250456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2379  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.6 
 
 		 410 aa  159  1e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2361  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.46 
 
 		 393 aa  155  1e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.506027  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3678  RND family efflux transporter MFP subunit  30.4 
 
 		 406 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1448  RND family efflux transporter MFP subunit  31.41 
 
 		 388 aa  130  3e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00133129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1976  RND family efflux transporter MFP subunit  30.46 
 
 		 412 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.912402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6347  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.2 
 
 		 454 aa  125  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3933  ATP synthase F1, beta subunit  28.97 
 
 		 395 aa  125  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3598  RND family efflux transporter MFP subunit  29.39 
 
 		 413 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1894  RND family efflux transporter MFP subunit  23.19 
 
 		 398 aa  102  8e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229485 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1849  putative RND efflux system protein, MFP subunit  24.46 
 
 		 372 aa  98.2  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4863  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.26 
 
 		 448 aa  98.2  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.298467 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2385  RND family efflux transporter MFP subunit  23.57 
 
 		 443 aa  92.8  9e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.471992  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1939  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.6 
 
 		 370 aa  87.8  3e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.128072 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2448  membrane-fusion protein-like  31.25 
 
 		 359 aa  88.2  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.674132  normal  0.332439 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06540  hypothetical protein  25 
 
 		 442 aa  87  6e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3095  RND family efflux transporter MFP subunit  24.16 
 
 		 440 aa  86.3  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1757  RND family efflux transporter MFP subunit  24.36 
 
 		 443 aa  82  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0654458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1672  RND family efflux transporter MFP subunit  29.01 
 
 		 429 aa  80.5  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3902  RND family efflux transporter MFP subunit  25.07 
 
 		 392 aa  80.5  0.00000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.538028 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3187  RND family efflux transporter MFP subunit  23.65 
 
 		 439 aa  77.8  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.230309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0463  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.24 
 
 		 414 aa  77  0.0000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3037  efflux transporter  25.65 
 
 		 402 aa  77  0.0000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.732235  normal  0.830026 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0379  hypothetical protein  23.67 
 
 		 439 aa  77  0.0000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3699  RND family efflux transporter MFP subunit  24.79 
 
 		 390 aa  75.9  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1439  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.55 
 
 		 380 aa  76.3  0.000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0465471  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5678  RND multidrug efflux membrane permease  26.35 
 
 		 386 aa  75.1  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.116092  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0152  RND family efflux transporter MFP subunit  25.81 
 
 		 385 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0015  secretion protein, HlyD family  25.96 
 
 		 372 aa  73.9  0.000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3680  secretion protein HlyD family protein  26.53 
 
 		 405 aa  72.8  0.000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2482  RND family efflux transporter MFP subunit  23.8 
 
 		 391 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2584  CzcB subfamily membrane fusion protein  23.78 
 
 		 409 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3493  RND family efflux transporter MFP subunit  25.41 
 
 		 381 aa  72.4  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01979  multidrug efflux system, subunit A  25.77 
 
 		 415 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1582  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.52 
 
 		 415 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0117238  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0078  hypothetical protein  25.62 
 
 		 381 aa  72  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2916  RND family efflux transporter MFP subunit  23.43 
 
 		 449 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.266604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2216  multidrug efflux system subunit MdtA  25.52 
 
 		 415 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01971  hypothetical protein  25.77 
 
 		 415 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0235  RND efflux membrane fusion protein precursor  24.61 
 
 		 356 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1312  multidrug efflux system subunit MdtA  24.77 
 
 		 410 aa  71.2  0.00000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.164615  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4385  RND family efflux transporter MFP subunit  25.75 
 
 		 381 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.912914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4427  RND family efflux transporter MFP subunit  25.62 
 
 		 384 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.123796 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3103  multidrug efflux system subunit MdtA  25.27 
 
 		 427 aa  70.5  0.00000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0880  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.18 
 
 		 397 aa  70.9  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.995952  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6521  RND family efflux transporter MFP subunit  25.57 
 
 		 410 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.745567  normal  0.0817001 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1332  multidrug efflux system subunit MdtA  25.27 
 
 		 444 aa  70.9  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.713792  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2966  multidrug efflux system subunit MdtA  24.27 
 
 		 413 aa  70.9  0.00000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.874422  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1567  multidrug efflux system subunit MdtA  25.52 
 
 		 455 aa  70.5  0.00000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.331208 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3797  RND family efflux transporter MFP subunit  24.15 
 
 		 376 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1215  multidrug efflux system subunit MdtA  25.27 
 
 		 444 aa  70.5  0.00000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2256  multidrug efflux system subunit MdtA  25.61 
 
 		 413 aa  70.5  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1159  multidrug efflux system subunit MdtA  25.52 
 
 		 415 aa  70.5  0.00000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2472  multidrug efflux system subunit MdtA  25.61 
 
 		 413 aa  70.5  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.957345 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3014  multidrug efflux system subunit MdtA  25.52 
 
 		 415 aa  70.5  0.00000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.105913 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2366  multidrug efflux system subunit MdtA  25.74 
 
 		 415 aa  70.5  0.00000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4642  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.41 
 
 		 383 aa  70.1  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.195012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01960  putative RND efflux membrane fusion protein precursor  24.3 
 
 		 356 aa  70.1  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.496395 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2071  RND efflux system membrane fusion protein  25.67 
 
 		 407 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.226746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1749  secretion protein HlyD  25.71 
 
 		 398 aa  69.7  0.00000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.145441 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0307  RND family efflux transporter MFP subunit  24.12 
 
 		 413 aa  69.7  0.00000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.240103  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2356  multidrug efflux system subunit MdtA  25.34 
 
 		 413 aa  68.9  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.413766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1026  RND family efflux transporter MFP subunit  25.41 
 
 		 384 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.933063 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1386  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.07 
 
 		 384 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.178254 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0535  secretion protein HlyD  27.24 
 
 		 366 aa  68.2  0.0000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2372  secretion protein HlyD  23.85 
 
 		 392 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.753301 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2312  multidrug efflux system subunit MdtA  25.34 
 
 		 413 aa  68.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>