More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_3095 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_3095  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 		 440 aa  879    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1058  RND family efflux transporter MFP subunit  50.48 
 
 		 455 aa  366  1e-100  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2916  RND family efflux transporter MFP subunit  33.64 
 
 		 449 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.266604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06540  hypothetical protein  31.74 
 
 		 442 aa  235  1.0000000000000001e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3187  RND family efflux transporter MFP subunit  35.93 
 
 		 439 aa  233  7.000000000000001e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.230309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0379  hypothetical protein  31.21 
 
 		 439 aa  232  1e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3566  RND family efflux transporter MFP subunit  32.13 
 
 		 435 aa  224  2e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.338138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1757  RND family efflux transporter MFP subunit  30.21 
 
 		 443 aa  201  3e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0654458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1562  RND family efflux transporter MFP subunit  30.24 
 
 		 451 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2205  membrane-fusion protein  29.35 
 
 		 455 aa  179  1e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0668  Acr family membrane-fusion protein  26.47 
 
 		 393 aa  107  3e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06546  hypothetical protein  24.58 
 
 		 385 aa  107  4e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000669  membrane-fusion protein  23.96 
 
 		 385 aa  102  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2379  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.65 
 
 		 410 aa  99.8  8e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4484  RND family efflux transporter MFP subunit  25.34 
 
 		 410 aa  98.6  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.878232  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3598  RND family efflux transporter MFP subunit  25.91 
 
 		 413 aa  99  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4647  RND family efflux transporter MFP subunit  23.04 
 
 		 426 aa  97.4  4e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1930  RND family efflux transporter MFP subunit  23.41 
 
 		 395 aa  97.1  5e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000000699486  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0404  RND family efflux transporter MFP subunit  24.22 
 
 		 387 aa  95.9  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0540732  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1841  secretion protein HlyD  26.17 
 
 		 410 aa  94.7  3e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2167  RND family efflux transporter MFP subunit  23.2 
 
 		 396 aa  94  6e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2468  RND family efflux transporter MFP subunit  23.65 
 
 		 397 aa  92.4  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.17063  normal  0.298309 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0766  RND family efflux transporter MFP subunit  26.14 
 
 		 407 aa  91.3  4e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0817385 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2178  RND family efflux transporter MFP subunit  24.21 
 
 		 397 aa  89.7  8e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.569446  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1976  RND family efflux transporter MFP subunit  24.72 
 
 		 412 aa  89  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.912402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0659  RND family efflux transporter MFP subunit  23.99 
 
 		 399 aa  87.4  4e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2268  membrane-fusion protein  25.52 
 
 		 423 aa  87  6e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.250456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2743  hypothetical protein  23.64 
 
 		 408 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02659  putative multidrug resistance protein  24.93 
 
 		 379 aa  85.5  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.196626  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1711  secretion protein HlyD  24.39 
 
 		 402 aa  84.3  0.000000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000765458  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0107  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.8 
 
 		 415 aa  82  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2010  RND family efflux transporter MFP subunit  23.2 
 
 		 395 aa  82  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.397997  normal  0.117138 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00999  Membrane-fusion protein  30.24 
 
 		 410 aa  79  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.341025  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0329  HlyD family secretion protein  25.82 
 
 		 289 aa  78.2  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0875281  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3678  RND family efflux transporter MFP subunit  26.33 
 
 		 406 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1536  AcrA/E family efflux transporter MFP subunit  23.27 
 
 		 416 aa  77.4  0.0000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0242  secretion protein HlyD  23.74 
 
 		 414 aa  75.1  0.000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000372515  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3037  efflux transporter  24.43 
 
 		 402 aa  74.3  0.000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.732235  normal  0.830026 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0307  RND family efflux transporter MFP subunit  25.23 
 
 		 413 aa  73.9  0.000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.240103  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2684  multidrug efflux system subunit MdtA  24.93 
 
 		 411 aa  73.9  0.000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0801  RND family efflux transporter MFP subunit  24.56 
 
 		 419 aa  73.9  0.000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0476  RND family efflux transporter MFP subunit  29.96 
 
 		 422 aa  73.9  0.000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.189255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3096  membrane-fusion protein  23.46 
 
 		 398 aa  72.8  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.651787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3065  secretion protein HlyD  26.39 
 
 		 487 aa  72.8  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.757879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0886  RND family efflux transporter MFP subunit  23.52 
 
 		 403 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2431  RND family efflux transporter MFP subunit  24.68 
 
 		 435 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0638771  normal  0.904192 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0839  RND family efflux transporter MFP subunit  22.95 
 
 		 403 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1590  RND efflux system, membrane fusion protein CmeA  24.74 
 
 		 367 aa  71.6  0.00000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1569  RND family efflux transporter MFP subunit  33.2 
 
 		 415 aa  71.6  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3647  RND family efflux transporter MFP subunit  22.95 
 
 		 403 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3234  RND family efflux transporter MFP subunit  24.17 
 
 		 405 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.704192  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0416  RND efflux system, membrane fusion protein CmeA  25.17 
 
 		 367 aa  70.9  0.00000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0789  RND family efflux transporter MFP subunit  23.94 
 
 		 405 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3337  RND family efflux transporter MFP subunit  23.46 
 
 		 405 aa  71.2  0.00000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0287  acridine efflux pump  25.23 
 
 		 394 aa  70.5  0.00000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3528  RND family efflux transporter MFP subunit  22.95 
 
 		 403 aa  70.5  0.00000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3453  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.95 
 
 		 403 aa  70.1  0.00000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2922  RND family efflux transporter MFP subunit  24.16 
 
 		 459 aa  70.1  0.00000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.363027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2937  secretion protein HlyD  23.32 
 
 		 418 aa  68.9  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2482  secretion protein HlyD  25.13 
 
 		 434 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.179732  normal  0.227362 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3604  secretion protein HlyD  24.26 
 
 		 422 aa  68.6  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.105186  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5483  HlyD family secretion protein  24.13 
 
 		 396 aa  68.6  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0155996  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0390  RND efflux system, membrane fusion protein CmeA  24.83 
 
 		 367 aa  68.2  0.0000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0689  secretion protein HlyD  25.06 
 
 		 411 aa  68.2  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3080  efflux transporter  26.13 
 
 		 487 aa  68.2  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1757  secretion protein HlyD  23.84 
 
 		 448 aa  68.2  0.0000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.071428 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01979  multidrug efflux system, subunit A  23.88 
 
 		 415 aa  67.4  0.0000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01971  hypothetical protein  23.88 
 
 		 415 aa  67.4  0.0000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1582  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.88 
 
 		 415 aa  67  0.0000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0117238  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2216  multidrug efflux system subunit MdtA  23.88 
 
 		 415 aa  67  0.0000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1567  multidrug efflux system subunit MdtA  23.88 
 
 		 455 aa  66.6  0.0000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.331208 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2753  HlyD family secretion protein  25.19 
 
 		 444 aa  66.6  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1215  multidrug efflux system subunit MdtA  23.65 
 
 		 444 aa  66.6  0.0000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1332  multidrug efflux system subunit MdtA  23.65 
 
 		 444 aa  66.6  0.0000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.713792  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4226  RND family efflux transporter MFP subunit  25.72 
 
 		 426 aa  66.6  0.0000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.499264  normal  0.926991 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2140  RND family efflux transporter MFP subunit  24.25 
 
 		 393 aa  66.2  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2050  secretion protein HlyD  23.15 
 
 		 426 aa  65.9  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3103  multidrug efflux system subunit MdtA  23.65 
 
 		 427 aa  66.2  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2361  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.36 
 
 		 393 aa  66.2  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.506027  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0986  multidrug efflux system subunit MdtA  23.88 
 
 		 415 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.607592 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1159  multidrug efflux system subunit MdtA  23.62 
 
 		 415 aa  65.9  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0946  hypothetical protein  22.89 
 
 		 375 aa  65.5  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1575  RND membrane fusion protein AcrA  22.97 
 
 		 448 aa  65.1  0.000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.853878 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2366  multidrug efflux system subunit MdtA  23.62 
 
 		 415 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2901  RND family efflux transporter MFP subunit  26.17 
 
 		 394 aa  65.1  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4472  RND family efflux transporter MFP subunit  25.63 
 
 		 447 aa  65.9  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0821721 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3014  multidrug efflux system subunit MdtA  23.62 
 
 		 415 aa  65.9  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.105913 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4415  RND family efflux transporter MFP subunit  25.07 
 
 		 458 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.553493  normal  0.934455 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1206  multidrug efflux system subunit MdtA  22.8 
 
 		 419 aa  65.1  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0570202  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2802  RND family efflux transporter MFP subunit  23.66 
 
 		 430 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.662741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3933  ATP synthase F1, beta subunit  24.14 
 
 		 395 aa  64.7  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1593  secretion protein HlyD  24.33 
 
 		 400 aa  65.1  0.000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000034507  unclonable  0.000000261884 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1776  CmeA  21.48 
 
 		 379 aa  64.7  0.000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000125677  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2104  RND family efflux transporter MFP subunit  23.97 
 
 		 450 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0838  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.91 
 
 		 432 aa  64.3  0.000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2878  RND family efflux transporter MFP subunit  23.9 
 
 		 396 aa  64.3  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.247459  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1389  HlyD family secretion protein  25 
 
 		 435 aa  63.9  0.000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.379904  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1559  RND efflux system, membrane fusion protein CmeA  21.74 
 
 		 365 aa  63.9  0.000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2521  secretion protein HlyD  24.3 
 
 		 435 aa  63.5  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.770973  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4112  multidrug resistance protein MdtN  28.37 
 
 		 349 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.718729  normal  0.0575764 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>