185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06540 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06540  hypothetical protein  100 
 
 		 442 aa  886    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0379  hypothetical protein  62.76 
 
 		 439 aa  563  1.0000000000000001e-159  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2916  RND family efflux transporter MFP subunit  46.5 
 
 		 449 aa  411  1e-113  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.266604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3566  RND family efflux transporter MFP subunit  45.1 
 
 		 435 aa  379  1e-104  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.338138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1757  RND family efflux transporter MFP subunit  42.66 
 
 		 443 aa  358  9.999999999999999e-98  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0654458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2205  membrane-fusion protein  42.73 
 
 		 455 aa  351  1e-95  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1562  RND family efflux transporter MFP subunit  41.75 
 
 		 451 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3187  RND family efflux transporter MFP subunit  33.41 
 
 		 439 aa  236  7e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.230309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1058  RND family efflux transporter MFP subunit  35.08 
 
 		 455 aa  223  4.9999999999999996e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3095  RND family efflux transporter MFP subunit  31.74 
 
 		 440 aa  213  5.999999999999999e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0668  Acr family membrane-fusion protein  25.58 
 
 		 393 aa  114  3e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2379  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.07 
 
 		 410 aa  106  1e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1930  RND family efflux transporter MFP subunit  25.75 
 
 		 395 aa  99.8  9e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000000699486  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1711  secretion protein HlyD  26.39 
 
 		 402 aa  90.9  4e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000765458  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2178  RND family efflux transporter MFP subunit  25 
 
 		 397 aa  87  7e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.569446  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2010  RND family efflux transporter MFP subunit  25 
 
 		 395 aa  84  0.000000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.397997  normal  0.117138 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1841  secretion protein HlyD  23.39 
 
 		 410 aa  83.2  0.000000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1732  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.59 
 
 		 439 aa  82.4  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54968  normal  0.756916 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4484  RND family efflux transporter MFP subunit  23.23 
 
 		 410 aa  79.3  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.878232  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3096  membrane-fusion protein  25.44 
 
 		 398 aa  78.6  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.651787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2468  RND family efflux transporter MFP subunit  25 
 
 		 397 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.17063  normal  0.298309 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0766  RND family efflux transporter MFP subunit  21.92 
 
 		 407 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0817385 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000669  membrane-fusion protein  24.24 
 
 		 385 aa  77.4  0.0000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0476  RND family efflux transporter MFP subunit  23.23 
 
 		 422 aa  76.6  0.0000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.189255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6347  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.38 
 
 		 454 aa  76.3  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06546  hypothetical protein  23.97 
 
 		 385 aa  75.1  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0307  RND family efflux transporter MFP subunit  23.33 
 
 		 413 aa  74.7  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.240103  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2743  hypothetical protein  21.24 
 
 		 408 aa  73.6  0.000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0242  secretion protein HlyD  23.93 
 
 		 414 aa  73.2  0.000000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000372515  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2937  secretion protein HlyD  24.94 
 
 		 418 aa  72.8  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3037  efflux transporter  24.8 
 
 		 402 aa  72.4  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.732235  normal  0.830026 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3899  secretion protein HlyD  25 
 
 		 485 aa  70.9  0.00000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.553223 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2167  RND family efflux transporter MFP subunit  24.07 
 
 		 396 aa  70.1  0.00000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1569  RND family efflux transporter MFP subunit  22.6 
 
 		 415 aa  68.6  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00999  Membrane-fusion protein  25.62 
 
 		 410 aa  68.9  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.341025  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0946  hypothetical protein  22.11 
 
 		 375 aa  65.9  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3234  RND family efflux transporter MFP subunit  22.06 
 
 		 405 aa  64.3  0.000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.704192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0659  RND family efflux transporter MFP subunit  21.19 
 
 		 399 aa  64.3  0.000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3080  efflux transporter  24.61 
 
 		 487 aa  64.3  0.000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0789  RND family efflux transporter MFP subunit  21.82 
 
 		 405 aa  63.9  0.000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0838  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.05 
 
 		 432 aa  63.5  0.000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1209  RND family efflux transporter MFP subunit  22.17 
 
 		 418 aa  63.5  0.000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148727  normal  0.199065 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0801  RND family efflux transporter MFP subunit  19.85 
 
 		 419 aa  63.5  0.000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3528  RND family efflux transporter MFP subunit  22.1 
 
 		 403 aa  62.4  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3453  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.1 
 
 		 403 aa  62  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3337  RND family efflux transporter MFP subunit  21.93 
 
 		 405 aa  62  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0886  RND family efflux transporter MFP subunit  21.85 
 
 		 403 aa  62.4  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3327  RND family efflux transporter MFP subunit  23.16 
 
 		 441 aa  61.6  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3651  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.16 
 
 		 441 aa  61.6  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0839  RND family efflux transporter MFP subunit  22.1 
 
 		 403 aa  61.6  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3647  RND family efflux transporter MFP subunit  22.1 
 
 		 403 aa  61.2  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3527  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.66 
 
 		 446 aa  60.5  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3939  RND family efflux transporter MFP subunit  22.62 
 
 		 367 aa  60.1  0.00000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.407918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3699  RND family efflux transporter MFP subunit  24.34 
 
 		 390 aa  59.7  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01888  drug efflux lipoprotein  23.63 
 
 		 409 aa  58.2  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.524066  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3353  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.49 
 
 		 396 aa  57.8  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.462389  normal  0.0123154 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0329  HlyD family secretion protein  22.64 
 
 		 289 aa  57.4  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0875281  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4863  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.59 
 
 		 448 aa  57.4  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.298467 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1672  RND family efflux transporter MFP subunit  25.93 
 
 		 429 aa  57.4  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4061  RND family efflux transporter MFP subunit  23.72 
 
 		 383 aa  57  0.0000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000265031  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3065  secretion protein HlyD  21.76 
 
 		 487 aa  56.6  0.0000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.757879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3706  secretion protein HlyD family protein  26.74 
 
 		 348 aa  56.6  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0889  RND family efflux transporter MFP subunit  21.18 
 
 		 405 aa  56.6  0.0000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.436675 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3601  secretion protein HlyD  25.96 
 
 		 386 aa  55.8  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.804898  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3096  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.2 
 
 		 396 aa  55.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.219805 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3700  secretion protein HlyD  23.5 
 
 		 381 aa  55.5  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0948  secretion protein HlyD  24.3 
 
 		 413 aa  55.1  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.297274  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4385  RND family efflux transporter MFP subunit  24.51 
 
 		 381 aa  55.1  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.912914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2777  RND family efflux transporter MFP subunit  26.38 
 
 		 489 aa  55.5  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000975793  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3678  RND family efflux transporter MFP subunit  21.81 
 
 		 406 aa  54.7  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0259  RND family efflux transporter MFP subunit  22.87 
 
 		 412 aa  54.7  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00182  acriflavine resistance protein a precursor  25 
 
 		 381 aa  54.3  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3454  secretion protein HlyD family protein  28.98 
 
 		 380 aa  54.3  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2653  RND family efflux transporter MFP subunit  25.35 
 
 		 391 aa  53.9  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.399935 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0809  secretion protein HlyD  25 
 
 		 392 aa  53.5  0.000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.165865 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2119  multidrug resistance protein MdtN  25.12 
 
 		 349 aa  53.5  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1849  putative RND efflux system protein, MFP subunit  21.91 
 
 		 372 aa  53.1  0.000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0107  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.68 
 
 		 415 aa  53.1  0.000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1516  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.92 
 
 		 440 aa  52.8  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7637  efflux pump protein  26.99 
 
 		 385 aa  53.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.969695 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5483  HlyD family secretion protein  22.59 
 
 		 396 aa  52.8  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0155996  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0887  secretion protein HlyD  22.13 
 
 		 398 aa  52.4  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1339  RND family efflux transporter MFP subunit  24.33 
 
 		 384 aa  51.6  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.611384  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0516  secretion protein HlyD family protein  27.59 
 
 		 389 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1938  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.7 
 
 		 462 aa  51.2  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000755017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4503  RND family efflux transporter MFP subunit  22.88 
 
 		 384 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.148496 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1976  RND family efflux transporter MFP subunit  22.39 
 
 		 412 aa  51.2  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.912402  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4647  RND family efflux transporter MFP subunit  21.26 
 
 		 426 aa  51.2  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1332  secretion protein HlyD family protein  25.88 
 
 		 342 aa  51.2  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.729441  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1849  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.8 
 
 		 422 aa  51.2  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00425578 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0463  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.96 
 
 		 414 aa  50.8  0.00004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2361  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.07 
 
 		 393 aa  50.8  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.506027  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5151  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.77 
 
 		 385 aa  50.1  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.206378  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02659  putative multidrug resistance protein  21.46 
 
 		 379 aa  50.1  0.00009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.196626  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2268  membrane-fusion protein  21.75 
 
 		 423 aa  49.7  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.250456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2035  secretion protein HlyD  26.61 
 
 		 430 aa  49.7  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.789986  hitchhiker  0.00327746 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0552  secretion protein HlyD  28.74 
 
 		 350 aa  49.3  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2644  RND family efflux transporter MFP subunit  20.72 
 
 		 385 aa  49.3  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0891  RND family efflux transporter MFP subunit  19.39 
 
 		 404 aa  48.9  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0487  secretion protein HlyD  24.42 
 
 		 387 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0299578  normal  0.132982 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>