More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1569 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1569  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 		 415 aa  794    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2937  secretion protein HlyD  48.3 
 
 		 418 aa  363  2e-99  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1209  RND family efflux transporter MFP subunit  50.73 
 
 		 418 aa  350  2e-95  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148727  normal  0.199065 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1732  efflux transporter, RND family, MFP subunit  46.12 
 
 		 439 aa  313  3.9999999999999997e-84  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54968  normal  0.756916 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0259  RND family efflux transporter MFP subunit  41.33 
 
 		 412 aa  252  7e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0242  secretion protein HlyD  34.7 
 
 		 414 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000372515  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0307  RND family efflux transporter MFP subunit  38.48 
 
 		 413 aa  243  5e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.240103  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3065  secretion protein HlyD  29.26 
 
 		 487 aa  92.4  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.757879  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2316  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.37 
 
 		 379 aa  91.7  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.144925 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2361  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.57 
 
 		 393 aa  88.6  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.506027  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0916  efflux transporter  29.25 
 
 		 396 aa  88.2  3e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.987196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0107  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.22 
 
 		 415 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3080  efflux transporter  32.41 
 
 		 487 aa  84.3  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0644  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.3 
 
 		 425 aa  80.1  0.00000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0200148  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3899  secretion protein HlyD  29.71 
 
 		 485 aa  78.2  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.553223 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1757  secretion protein HlyD  29.64 
 
 		 448 aa  77.8  0.0000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.071428 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0838  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.31 
 
 		 432 aa  77  0.0000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1575  RND membrane fusion protein AcrA  29.53 
 
 		 448 aa  75.9  0.000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.853878 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1497  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.25 
 
 		 407 aa  75.5  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.30393  hitchhiker  0.00778895 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1164  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.9 
 
 		 467 aa  73.6  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.748472 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03415  hypothetical protein  25.18 
 
 		 371 aa  71.6  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0476  RND family efflux transporter MFP subunit  34.07 
 
 		 422 aa  72  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.189255  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1536  AcrA/E family efflux transporter MFP subunit  28.98 
 
 		 416 aa  71.6  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0764  RND family efflux transporter MFP subunit  27.05 
 
 		 385 aa  71.2  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4588  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.93 
 
 		 415 aa  69.3  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00044707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1129  secretion protein HlyD  29.8 
 
 		 368 aa  69.7  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.827247  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03344  acriflavin resistance protein  32.3 
 
 		 417 aa  68.9  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002593  membrane-fusion protein  24.87 
 
 		 372 aa  68.2  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00429247  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06540  hypothetical protein  22.6 
 
 		 442 aa  68.6  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1924  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.55 
 
 		 352 aa  68.9  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.896235 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1194  acriflavin resistance periplasmic protein  23.3 
 
 		 380 aa  68.9  0.0000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2900  hypothetical protein  30.77 
 
 		 328 aa  68.9  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.441654  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2812  hypothetical protein  30.77 
 
 		 328 aa  68.9  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.659594  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6178  RND family efflux transporter MFP subunit  27.35 
 
 		 367 aa  68.2  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.19288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2322  secretion protein HlyD  24.37 
 
 		 399 aa  67.4  0.0000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000756014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1515  RND family efflux transporter MFP subunit  30.34 
 
 		 405 aa  66.6  0.0000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5231  HlyD family secretion protein  27.27 
 
 		 426 aa  66.2  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3248  RND family efflux transporter MFP subunit  23.95 
 
 		 375 aa  66.2  0.0000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000122145  hitchhiker  0.000539204 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0161  RND family efflux transporter MFP subunit  29.58 
 
 		 380 aa  65.9  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2379  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.47 
 
 		 410 aa  66.2  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0031  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.28 
 
 		 392 aa  65.1  0.000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000323168  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1636  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.7 
 
 		 383 aa  65.5  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.372421  normal  0.934491 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3613  secretion protein HlyD family protein  30.45 
 
 		 422 aa  64.7  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.281428  hitchhiker  0.00219458 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2431  RND family efflux transporter MFP subunit  28.57 
 
 		 435 aa  65.1  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0638771  normal  0.904192 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0939  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.76 
 
 		 435 aa  64.3  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.961287  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4702  RND family efflux transporter MFP subunit  26.6 
 
 		 431 aa  63.9  0.000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6436  secretion protein HlyD family protein  28.93 
 
 		 392 aa  63.9  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.475078  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1513  secretion protein HlyD  28.4 
 
 		 404 aa  63.9  0.000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.461504  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2634  secretion protein HlyD family protein  31.94 
 
 		 375 aa  63.5  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0156  secretion protein HlyD  30.3 
 
 		 390 aa  63.9  0.000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0521  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.56 
 
 		 394 aa  63.5  0.000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.583395 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1908  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.33 
 
 		 407 aa  63.5  0.000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2777  RND family efflux transporter MFP subunit  32.18 
 
 		 489 aa  63.5  0.000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000975793  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2823  hypothetical protein  31.65 
 
 		 334 aa  63.2  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.159061  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5576  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.46 
 
 		 353 aa  63.2  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.110033 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0328  ABC transporter permease  25.21 
 
 		 434 aa  63.2  0.000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.33045 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1962  RND family efflux transporter MFP subunit  25.19 
 
 		 393 aa  63.2  0.000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3902  RND family efflux transporter MFP subunit  25.51 
 
 		 392 aa  62.4  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.538028 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1309  HlyD family secretion protein  25.07 
 
 		 388 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2285  RND family efflux transporter MFP subunit  25.59 
 
 		 428 aa  62.4  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134622 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1332  secretion protein HlyD family protein  26.32 
 
 		 342 aa  62.4  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.729441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2757  secretion protein HlyD  25.86 
 
 		 376 aa  62.4  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.220243  normal  0.336362 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2117  secretion protein HlyD  29 
 
 		 428 aa  62.8  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.893928 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0266  RND family efflux transporter MFP subunit  28.52 
 
 		 375 aa  62.8  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.987776 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0880  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.44 
 
 		 397 aa  62.8  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.995952  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2781  RND family efflux transporter MFP subunit  26.73 
 
 		 372 aa  61.6  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00032103  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1329  hypothetical protein  27.35 
 
 		 328 aa  62  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2957  secretion protein HlyD  27.54 
 
 		 389 aa  62  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0178504  normal  0.933874 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0108  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.34 
 
 		 458 aa  61.6  0.00000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0838  RND family efflux transporter MFP subunit  25.88 
 
 		 387 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2928  RND family efflux transporter MFP subunit  24.74 
 
 		 431 aa  62  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00603978  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0954  efflux transporter, RND family, MFP subunit  20.47 
 
 		 415 aa  62  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0861  secretion protein HlyD  30.88 
 
 		 330 aa  62  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0209949  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2100  secretion protein HlyD family protein  28.64 
 
 		 351 aa  62  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.528355 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1030  RND family efflux transporter MFP subunit  23.33 
 
 		 365 aa  62  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000000101532  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33220  hypothetical protein  31.19 
 
 		 334 aa  62  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0256894 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28820  secretion protein, HlyD family  27.03 
 
 		 441 aa  61.2  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.20411  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6122  secretion protein HlyD family protein  26.09 
 
 		 347 aa  61.2  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3399  RND family efflux transporter MFP subunit  26.1 
 
 		 406 aa  61.2  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.852955  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2246  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.06 
 
 		 413 aa  61.2  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.489161  normal  0.829342 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1815  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.55 
 
 		 388 aa  61.2  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.100454  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0225  secretion protein HlyD  31.8 
 
 		 380 aa  61.2  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.34961  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03980  HlyD family secretion protein  28.12 
 
 		 297 aa  61.2  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.79966  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0948  secretion protein HlyD  27.56 
 
 		 413 aa  61.6  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.297274  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1874  secretion protein HlyD family protein  28.64 
 
 		 351 aa  61.2  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.982887 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1088  MFP family transporter  27.1 
 
 		 368 aa  61.2  0.00000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.802038  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0206  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.83 
 
 		 386 aa  60.8  0.00000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60760  hypothetical protein  28.91 
 
 		 425 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003314  multidrug resistance efflux pump  29.74 
 
 		 354 aa  60.8  0.00000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4261  secretion protein HlyD family protein  25.43 
 
 		 347 aa  60.5  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2225  secretion protein HlyD family protein  27.47 
 
 		 351 aa  60.5  0.00000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.670197 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3507  RND family efflux transporter MFP subunit  26.05 
 
 		 421 aa  60.5  0.00000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.568774  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4647  RND family efflux transporter MFP subunit  22.6 
 
 		 426 aa  60.1  0.00000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1748  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.47 
 
 		 388 aa  60.1  0.00000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0463  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.7 
 
 		 414 aa  60.5  0.00000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3095  RND family efflux transporter MFP subunit  33.2 
 
 		 440 aa  60.5  0.00000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0659  secretion protein HlyD  29.39 
 
 		 335 aa  60.1  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0195539 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4150  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.95 
 
 		 397 aa  60.1  0.00000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00923789  hitchhiker  0.000000297953 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0212  secretion protein HlyD  30 
 
 		 364 aa  60.1  0.00000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.59943 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2825  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.16 
 
 		 476 aa  60.1  0.00000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.292175  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>