More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_03415 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_03415  hypothetical protein  100 
 
 		 371 aa  746    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002593  membrane-fusion protein  77.69 
 
 		 372 aa  550  1e-155  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00429247  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0157  hypothetical protein  58.59 
 
 		 366 aa  426  1e-118  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2570  hypothetical protein  50.42 
 
 		 370 aa  355  7.999999999999999e-97  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.295981  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4621  RND family efflux transporter MFP subunit  43.58 
 
 		 386 aa  304  2.0000000000000002e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0618  RND family efflux transporter MFP subunit  42.03 
 
 		 387 aa  290  3e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2743  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.31 
 
 		 358 aa  211  2e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.125422  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0868  RND family efflux transporter MFP subunit  32.57 
 
 		 358 aa  206  5e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.231559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1680  RND family efflux transporter MFP subunit  32.66 
 
 		 360 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.560813 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2624  RND family efflux transporter MFP subunit  33.24 
 
 		 357 aa  197  2.0000000000000003e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0171  RND family efflux transporter MFP subunit  31.56 
 
 		 378 aa  186  8e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2511  RND family efflux transporter MFP subunit  31.32 
 
 		 354 aa  180  2.9999999999999997e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0216385  normal  0.245234 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3333  RND family efflux transporter MFP subunit  31.18 
 
 		 377 aa  177  3e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2051  RND family efflux transporter MFP subunit  32.66 
 
 		 364 aa  171  1e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0552963  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0345  RND family efflux transporter MFP subunit  30.32 
 
 		 360 aa  166  5.9999999999999996e-40  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0426386  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0510  RND family efflux transporter MFP subunit  28.24 
 
 		 358 aa  160  3e-38  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0586812  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0520  secretion protein HlyD  27.57 
 
 		 356 aa  160  5e-38  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2113  RND family efflux transporter MFP subunit  29.88 
 
 		 360 aa  152  7e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0988  secretion protein HlyD  27.98 
 
 		 415 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1163  efflux transporter  31.8 
 
 		 383 aa  135  9.999999999999999e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.707562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5198  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.69 
 
 		 366 aa  109  9.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.197197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2197  secretion protein HlyD  25.33 
 
 		 446 aa  108  1e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.378347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0151  RND family efflux transporter MFP subunit  27.02 
 
 		 348 aa  108  2e-22  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.961169  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1999  RND family efflux transporter MFP subunit  26.89 
 
 		 390 aa  98.2  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00132105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2559  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.97 
 
 		 349 aa  97.8  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.99545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2818  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.97 
 
 		 349 aa  96.7  7e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0374  Multidrug resistance efflux pump-like protein  30.37 
 
 		 271 aa  92  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0800097  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0123  RND family efflux transporter MFP subunit  27.81 
 
 		 417 aa  91.7  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.713324 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3707  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.75 
 
 		 354 aa  88.6  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1781  RND family efflux transporter MFP subunit  25.08 
 
 		 368 aa  88.6  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.253325  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0225  secretion protein HlyD  30.86 
 
 		 380 aa  88.6  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.34961  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0318  secretion protein HlyD family protein  29.91 
 
 		 271 aa  87.4  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.844809  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2234  RND family efflux transporter MFP subunit  30.53 
 
 		 407 aa  87.4  4e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.282252  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0883  RND family efflux transporter MFP subunit  30.7 
 
 		 363 aa  87  5e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2367  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.55 
 
 		 360 aa  86.3  8e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2000  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.55 
 
 		 360 aa  86.3  8e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.461729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3362  RND family efflux transporter MFP subunit  25.36 
 
 		 358 aa  85.9  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0247  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.45 
 
 		 380 aa  84  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0944  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.59 
 
 		 356 aa  84  0.000000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0623416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000105  membrane-fusion protein  25.71 
 
 		 351 aa  84  0.000000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.860226  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3992  RND efflux system membrane fusion protein  26.39 
 
 		 366 aa  83.6  0.000000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0207  RND family efflux transporter MFP subunit  28.06 
 
 		 400 aa  82.8  0.000000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000100142 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1511  secretion protein HlyD  26.57 
 
 		 357 aa  82.8  0.000000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0609  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.44 
 
 		 353 aa  82.4  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.593708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2557  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.05 
 
 		 356 aa  82.4  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000000027885  normal  0.211023 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0453  secretion protein HlyD family protein  25.41 
 
 		 287 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3414  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.5 
 
 		 1462 aa  81.3  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0706  secretion protein HlyD  22.71 
 
 		 366 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000331728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0237  RND family efflux transporter MFP subunit  30.32 
 
 		 397 aa  81.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0880  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.42 
 
 		 397 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.995952  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1783  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.75 
 
 		 354 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0177  hypothetical protein  26.3 
 
 		 406 aa  81.3  0.00000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2808  membrane fusion protein; cation efflux system protein  25.99 
 
 		 353 aa  80.9  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1455  RND family efflux transporter MFP subunit  27.12 
 
 		 345 aa  80.9  0.00000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2100  RND family efflux transporter MFP subunit  25.37 
 
 		 379 aa  80.5  0.00000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0493506  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4297  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.12 
 
 		 397 aa  80.1  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.430357  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3513  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.69 
 
 		 398 aa  79.7  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1610  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.34 
 
 		 372 aa  79.7  0.00000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1791  secretion protein HlyD  26.16 
 
 		 402 aa  79.7  0.00000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1830  RND family efflux transporter MFP subunit  24.75 
 
 		 359 aa  79.7  0.00000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.495597  normal  0.102007 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2284  secretion protein HlyD  27.42 
 
 		 403 aa  79.7  0.00000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.831641  normal  0.154042 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2192  secretion protein HlyD  25.79 
 
 		 352 aa  79.7  0.00000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4288  RND family efflux transporter MFP subunit  28.27 
 
 		 349 aa  79.7  0.00000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0870  acriflavin resistance periplasmic protein  24.63 
 
 		 351 aa  79.3  0.00000000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1276  secretion protein HlyD  25.31 
 
 		 553 aa  79  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1288  RND family efflux transporter MFP subunit  24.64 
 
 		 365 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1146  RND family efflux transporter MFP subunit  24.26 
 
 		 351 aa  79  0.0000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0746  AcrA/E family efflux transporter MFP subunit  25.51 
 
 		 366 aa  78.2  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.339879  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3808  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.88 
 
 		 398 aa  77.8  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0283024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1916  putative efflux protein  25 
 
 		 370 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.164957 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1178  RND family efflux transporter MFP subunit  28.51 
 
 		 390 aa  77.8  0.0000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0703  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.52 
 
 		 355 aa  77.4  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1496  RND family efflux transporter MFP subunit  24.16 
 
 		 365 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0791  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.3 
 
 		 373 aa  77.4  0.0000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1580  RND family efflux transporter MFP subunit  24.16 
 
 		 365 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.610408  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1636  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.17 
 
 		 383 aa  77.4  0.0000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.372421  normal  0.934491 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1201  RND family efflux transporter MFP subunit  24.16 
 
 		 365 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0341767  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1044  RND family efflux transporter MFP subunit  24.16 
 
 		 365 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0078  RND family efflux transporter MFP subunit  24.16 
 
 		 365 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0031  RND family efflux transporter MFP subunit  24.16 
 
 		 365 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0383  RND family efflux transporter MFP subunit  24.16 
 
 		 365 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01965  Secretion protein HlyD  24.36 
 
 		 401 aa  76.6  0.0000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.303602  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4313  RND family efflux transporter MFP subunit  28.15 
 
 		 409 aa  76.3  0.0000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.583259 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4428  RND family efflux transporter MFP subunit  26.04 
 
 		 349 aa  76.3  0.0000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0583  HlyD family secretion protein  25.51 
 
 		 334 aa  76.3  0.0000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3608  secretion protein HlyD  23.93 
 
 		 400 aa  76.3  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.221607  normal  0.363906 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2700  secretion protein HlyD  30 
 
 		 403 aa  76.3  0.0000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0539  RND family efflux transporter MFP subunit  29.52 
 
 		 350 aa  75.9  0.000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4484  RND family efflux transporter MFP subunit  27.74 
 
 		 410 aa  75.9  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.878232  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0372  RND family efflux transporter MFP subunit  22.34 
 
 		 372 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4492  secretion protein HlyD  28.43 
 
 		 382 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0226833 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1672  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.28 
 
 		 359 aa  75.9  0.000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3495  RND family efflux transporter MFP subunit  25 
 
 		 365 aa  75.9  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0105  RND family efflux transporter MFP subunit  24.75 
 
 		 348 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0916  efflux transporter  27.8 
 
 		 396 aa  75.5  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.987196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1421  HlyD family secretion protein  26.7 
 
 		 354 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0100677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2663  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.2 
 
 		 352 aa  75.5  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0892  RND efflux membrane fusion protein precursor  26.15 
 
 		 370 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4616  secretion protein HlyD  27.07 
 
 		 414 aa  75.1  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2381  RND family efflux transporter MFP subunit  22.92 
 
 		 357 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>