More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0318 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0318  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 		 271 aa  531  1e-150  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.844809  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0374  Multidrug resistance efflux pump-like protein  91.14 
 
 		 271 aa  454  1e-127  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0800097  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0287  secretion protein HlyD family protein  32.58 
 
 		 275 aa  107  2e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1178  RND family efflux transporter MFP subunit  29.15 
 
 		 390 aa  101  1e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0741  hypothetical protein  32.84 
 
 		 290 aa  97.4  2e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1863  RND family efflux transporter MFP subunit  30.19 
 
 		 393 aa  94  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0385  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.56 
 
 		 409 aa  93.6  3e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3456  RND family efflux transporter MFP subunit  30.99 
 
 		 409 aa  91.7  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000285815  normal  0.0164702 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0820  HlyD family secretion protein  30.52 
 
 		 405 aa  89.7  5e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3127  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.19 
 
 		 416 aa  89  7e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5137  RND family efflux transporter MFP subunit  36.75 
 
 		 427 aa  88.2  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259338 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03415  hypothetical protein  29.91 
 
 		 371 aa  88.6  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1597  macrolide transporter subunit MacA  30.14 
 
 		 370 aa  87  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0365  membrane-fusion protein  31.47 
 
 		 394 aa  87  3e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2696  macrolide transporter subunit MacA  30.14 
 
 		 370 aa  87  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.761507  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5483  HlyD family secretion protein  33.53 
 
 		 396 aa  86.3  5e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0155996  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2611  macrolide transporter subunit MacA  29.67 
 
 		 370 aa  86.3  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2106  RND family efflux transporter MFP subunit  30.73 
 
 		 408 aa  85.9  7e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.553946  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0836  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27 
 
 		 363 aa  85.5  8e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0935853  normal  0.864756 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4233  secretion protein HlyD family protein  27.37 
 
 		 287 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4281  secretion protein HlyD family protein  27.37 
 
 		 287 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2317  RND family efflux transporter MFP subunit  32.8 
 
 		 393 aa  84.7  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.788366  normal  0.425659 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4421  secretion protein HlyD family protein  27.37 
 
 		 287 aa  84  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3579  putative transmembrane multidrug efflux system transmembrane protein  30.52 
 
 		 414 aa  83.6  0.000000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1166  secretion protein HlyD  29.74 
 
 		 412 aa  83.6  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.912906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4362  RND family efflux transporter MFP subunit  33.73 
 
 		 373 aa  83.2  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0119  secretion protein HlyD family protein  27.37 
 
 		 287 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.940377  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1084  MacA  27.32 
 
 		 402 aa  83.2  0.000000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0827  multidrug efflux pump BpeE  29.86 
 
 		 406 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.747872  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0416  multidrug efflux pump BpeE  29.86 
 
 		 406 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2144  multidrug efflux pump BpeE  29.86 
 
 		 406 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4918  RND family efflux transporter MFP subunit  30.33 
 
 		 405 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.890764  normal  0.731397 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3014  secretion protein HlyD  30.33 
 
 		 405 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5352  RND family efflux transporter MFP subunit  30.33 
 
 		 405 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.730017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3171  RND family efflux transporter MFP subunit  28.23 
 
 		 416 aa  82.8  0.000000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000224755  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1466  RND family efflux transporter MFP subunit  29.86 
 
 		 409 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.511584  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1840  RND family efflux transporter MFP subunit  29.86 
 
 		 409 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0996  RND family efflux transporter MFP subunit  27.97 
 
 		 397 aa  82.4  0.000000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0770  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25 
 
 		 399 aa  82.4  0.000000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0433625  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0320  RND family efflux transporter MFP subunit  37.31 
 
 		 407 aa  82.4  0.000000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.841401 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0513  multidrug efflux pump BpeE  29.86 
 
 		 409 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5230  RND family efflux transporter MFP subunit  30.33 
 
 		 405 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0639393  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3445  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.27 
 
 		 403 aa  81.6  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.25741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1886  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.61 
 
 		 379 aa  82  0.00000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0158662  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0825  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.81 
 
 		 410 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000019827  hitchhiker  0.00000000236896 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0800  RND family efflux transporter MFP subunit  29.81 
 
 		 416 aa  82  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000642362  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4699  RND family efflux transporter MFP subunit  30.33 
 
 		 405 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3536  RND family efflux transporter MFP subunit  29.81 
 
 		 416 aa  82  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000721535  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2220  RND family efflux transporter MFP subunit  27.86 
 
 		 399 aa  81.6  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4166  RND family efflux transporter MFP subunit  32.4 
 
 		 427 aa  81.6  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2116  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.91 
 
 		 393 aa  80.9  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.419105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2878  RND family efflux transporter MFP subunit  34.33 
 
 		 396 aa  81.3  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.247459  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1640  CmeA  29.32 
 
 		 386 aa  81.3  0.00000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0295  HlyD family secretion protein  29.82 
 
 		 405 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1007  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25 
 
 		 398 aa  81.3  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0832  RND family efflux transporter MFP subunit  29.81 
 
 		 416 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000487508  normal  0.99457 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1163  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.78 
 
 		 377 aa  80.9  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00317162  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0513  RND family efflux transporter MFP subunit  30.21 
 
 		 435 aa  80.9  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.497794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1776  CmeA  28.78 
 
 		 379 aa  80.9  0.00000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000125677  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3495  RND family efflux transporter MFP subunit  30.18 
 
 		 365 aa  80.5  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3395  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.88 
 
 		 389 aa  79.7  0.00000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3353  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.53 
 
 		 396 aa  80.1  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.462389  normal  0.0123154 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0453  secretion protein HlyD family protein  26.61 
 
 		 287 aa  79.7  0.00000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4941  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.26 
 
 		 419 aa  79.7  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.321445  normal  0.921537 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3096  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.53 
 
 		 396 aa  80.1  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.219805 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3155  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.74 
 
 		 403 aa  79.7  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0715  RND family efflux transporter MFP subunit  32.77 
 
 		 404 aa  79.7  0.00000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00883  macrolide transporter subunit, membrane fusion protein (MFP) component  28.33 
 
 		 371 aa  79.7  0.00000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00889  hypothetical protein  28.33 
 
 		 371 aa  79.7  0.00000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1559  RND efflux system, membrane fusion protein CmeA  29.3 
 
 		 365 aa  79.7  0.00000000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2764  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.33 
 
 		 371 aa  79.3  0.00000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.161658  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0982  macrolide transporter subunit MacA  28.33 
 
 		 371 aa  79.3  0.00000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.44834  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4534  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.22 
 
 		 424 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.452412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1619  AcrB/AcrD/AcrF family mulitdrug efflux protein  34.55 
 
 		 386 aa  79.3  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2568  secretion protein HlyD  28.57 
 
 		 412 aa  79.3  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.807298  normal  0.212557 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2282  macrolide transporter subunit MacA  28.33 
 
 		 371 aa  79.3  0.00000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000339116  normal  0.0134871 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2718  macrolide transporter subunit MacA  28.33 
 
 		 371 aa  79.3  0.00000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0951  macrolide transporter subunit MacA  28.33 
 
 		 371 aa  79.3  0.00000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0557503  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2451  macrolide transporter subunit MacA  28.33 
 
 		 371 aa  79.3  0.00000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00913289  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3233  RND family efflux transporter MFP subunit  29.15 
 
 		 405 aa  79.3  0.00000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000196171  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0664  RND family efflux transporter MFP subunit  26.07 
 
 		 342 aa  79.3  0.00000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.295272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1590  RND efflux system, membrane fusion protein CmeA  27.84 
 
 		 367 aa  79  0.00000000000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0496  RND family efflux transporter MFP subunit  30.15 
 
 		 402 aa  79  0.00000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0849  RND efflux system membrane fusion protein  31.89 
 
 		 418 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.8894  decreased coverage  0.000437743 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03982  membrane fusion protein  31.25 
 
 		 414 aa  79  0.00000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1234  RND family efflux transporter MFP subunit  28.08 
 
 		 359 aa  79  0.00000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.580475  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1791  macrolide efflux protein MacA  28.77 
 
 		 420 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1083  RND family efflux transporter MFP subunit  28.14 
 
 		 359 aa  78.6  0.00000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0380532  normal  0.959663 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0671  secretion protein HlyD  25.82 
 
 		 432 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2562  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.57 
 
 		 416 aa  78.2  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0757424  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2293  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.44 
 
 		 430 aa  78.2  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003895  membrane fusion protein of RND family multidrug efflux pump  28.81 
 
 		 379 aa  78.6  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00341624  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0390  RND efflux system, membrane fusion protein CmeA  26.52 
 
 		 367 aa  77.8  0.0000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0454  secretion protein HlyD  25.73 
 
 		 373 aa  77.4  0.0000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.63564  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6201  putative accessory protein to ABC-type macrolide transport protein MacB  28.57 
 
 		 430 aa  77.4  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.655632  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0416  RND efflux system, membrane fusion protein CmeA  26.52 
 
 		 367 aa  77  0.0000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0607  RND family efflux transporter MFP subunit  26.98 
 
 		 406 aa  77  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0635  RND family efflux transporter MFP subunit  26.98 
 
 		 406 aa  77  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.320707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3595  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.31 
 
 		 404 aa  77  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0852698  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2186  macrolide efflux protein MacA  28.3 
 
 		 428 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>