More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0741 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_0741  hypothetical protein  100 
 
 		 290 aa  573  1.0000000000000001e-163  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0374  Multidrug resistance efflux pump-like protein  36.22 
 
 		 271 aa  104  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0800097  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0287  secretion protein HlyD family protein  33.21 
 
 		 275 aa  103  4e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0318  secretion protein HlyD family protein  31.58 
 
 		 271 aa  94.7  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.844809  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0385  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.46 
 
 		 409 aa  75.1  0.000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1672  RND family efflux transporter MFP subunit  26.88 
 
 		 429 aa  71.2  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2361  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexE precursor  34.29 
 
 		 172 aa  67.8  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.439727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3339  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.45 
 
 		 314 aa  65.1  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.647013 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0463  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.89 
 
 		 414 aa  62.8  0.000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4365  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.81 
 
 		 402 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1166  secretion protein HlyD  25.69 
 
 		 412 aa  59.7  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.912906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2115  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexE precursor  39.1 
 
 		 173 aa  59.7  0.00000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0635  macrolide-specific efflux protein macA  28.23 
 
 		 390 aa  59.7  0.00000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0167041  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4262  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.9 
 
 		 401 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.396806  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6659  RND family efflux transporter MFP subunit  36.11 
 
 		 324 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0758  HlyD family secretion protein  26.71 
 
 		 288 aa  57  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0191383  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3829  secretion protein HlyD  25.39 
 
 		 387 aa  57.4  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.192626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6179  RND family efflux transporter MFP subunit  36.11 
 
 		 324 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.641102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3894  RND family efflux transporter MFP subunit  31.9 
 
 		 425 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.366041 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4731  secretion protein HlyD family protein  31.97 
 
 		 239 aa  56.6  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004022  membrane-fusion protein  30.89 
 
 		 369 aa  55.5  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000160707  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3429  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.46 
 
 		 399 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7724  HlyD family secretion protein  34.25 
 
 		 324 aa  55.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2285  RND family efflux transporter MFP subunit  28.04 
 
 		 428 aa  55.1  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134622 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1064  macrolide-specific efflux protein macA  28.43 
 
 		 390 aa  55.5  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0267322  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1080  MacA  23.36 
 
 		 394 aa  55.1  0.000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0715  RND family efflux transporter MFP subunit  27.75 
 
 		 404 aa  54.7  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0709  macrolide-specific efflux protein macA  28.85 
 
 		 390 aa  54.7  0.000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2603  secretion protein HlyD  27.51 
 
 		 389 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.22725  normal  0.133946 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4866  RND family efflux transporter MFP subunit  34.48 
 
 		 317 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.329255 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1278  secretion protein HlyD  29.59 
 
 		 370 aa  54.3  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0363804  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4935  RND family efflux transporter MFP subunit  31.11 
 
 		 316 aa  54.7  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.659289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1856  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.87 
 
 		 316 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3889  RND family efflux transporter MFP subunit  34.81 
 
 		 364 aa  53.9  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6013  RND family efflux transporter MFP subunit  34.72 
 
 		 331 aa  53.9  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0869  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexE precursor  26.56 
 
 		 409 aa  53.5  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.988771  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3353  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.97 
 
 		 396 aa  53.5  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.462389  normal  0.0123154 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1362  RND family efflux transporter MFP subunit  30.08 
 
 		 418 aa  53.1  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.168892  decreased coverage  0.00389749 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5769  RND family efflux transporter MFP subunit  34.72 
 
 		 322 aa  53.1  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.322532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0067  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.21 
 
 		 453 aa  53.1  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2192  RND family efflux transporter MFP subunit  28.1 
 
 		 408 aa  53.1  0.000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1732  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.89 
 
 		 439 aa  53.1  0.000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54968  normal  0.756916 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1148  RND family efflux transporter MFP subunit  27.78 
 
 		 373 aa  53.1  0.000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4472  RND family efflux transporter MFP subunit  32.56 
 
 		 447 aa  52.8  0.000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0821721 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3127  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.58 
 
 		 416 aa  52.4  0.000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1391  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.26 
 
 		 401 aa  52  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.217202  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4850  RND family efflux transporter MFP subunit  26.54 
 
 		 385 aa  51.6  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0173  secretion protein HlyD  36.72 
 
 		 295 aa  52  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.992888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4427  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.06 
 
 		 394 aa  52.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2562  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.52 
 
 		 416 aa  51.6  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0757424  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3304  secretion protein HlyD  28.73 
 
 		 396 aa  52  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4941  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.85 
 
 		 419 aa  51.6  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.321445  normal  0.921537 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1178  RND family efflux transporter MFP subunit  31.17 
 
 		 390 aa  52.4  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1803  secretion protein HlyD family protein  28.77 
 
 		 286 aa  52  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0117208 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2777  RND family efflux transporter MFP subunit  24.1 
 
 		 489 aa  51.6  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000975793  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6150  RND family efflux transporter MFP subunit  34.72 
 
 		 323 aa  52  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.268318 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2317  RND family efflux transporter MFP subunit  29.1 
 
 		 393 aa  51.6  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.788366  normal  0.425659 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3003  secretion protein HlyD family protein  26.91 
 
 		 288 aa  50.8  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.104161  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0695  hypothetical protein  22.6 
 
 		 281 aa  51.6  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1855  MFP family transporter  25.6 
 
 		 285 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0284898  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3456  RND family efflux transporter MFP subunit  31.51 
 
 		 391 aa  50.8  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5137  RND family efflux transporter MFP subunit  28.86 
 
 		 427 aa  51.6  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259338 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3429  secretion protein HlyD  26.9 
 
 		 411 aa  50.8  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0015  secretion protein, HlyD family  26.85 
 
 		 372 aa  51.2  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01614  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  25.6 
 
 		 285 aa  50.4  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.880107  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4831  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.82 
 
 		 424 aa  50.4  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.630346  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3864  ABC transporter related  30.32 
 
 		 418 aa  50.4  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.606554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1836  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  25.6 
 
 		 285 aa  50.8  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.182346  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01604  hypothetical protein  25.6 
 
 		 285 aa  50.4  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.787651  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1439  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.68 
 
 		 380 aa  50.8  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0465471  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1536  AcrA/E family efflux transporter MFP subunit  28.16 
 
 		 416 aa  50.4  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0800  RND family efflux transporter MFP subunit  26.63 
 
 		 416 aa  50.1  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000642362  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0713  hypothetical protein  22.6 
 
 		 281 aa  50.1  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0285  RND family efflux transporter MFP subunit  32.56 
 
 		 386 aa  50.1  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.884794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0832  RND family efflux transporter MFP subunit  26.63 
 
 		 416 aa  50.1  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000487508  normal  0.99457 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2456  hypothetical protein  24.89 
 
 		 431 aa  50.1  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0825  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.63 
 
 		 410 aa  50.1  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000019827  hitchhiker  0.00000000236896 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3536  RND family efflux transporter MFP subunit  26.63 
 
 		 416 aa  50.4  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000721535  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1206  multidrug efflux system subunit MdtA  28.05 
 
 		 419 aa  49.7  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0570202  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2224  multidrug efflux pump, membrane fusion protein  30.77 
 
 		 388 aa  49.7  0.00005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0900  RND family efflux transporter MFP subunit  31.54 
 
 		 388 aa  50.1  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1963  putative secretion protein, HlyD family  28.02 
 
 		 390 aa  50.1  0.00005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000072673  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2022  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.69 
 
 		 358 aa  50.1  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.105064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5081  RND family efflux transporter MFP subunit  29.88 
 
 		 355 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.167851  normal  0.243186 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1771  RND family efflux transporter MFP subunit  25.68 
 
 		 469 aa  49.7  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.75905 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1828  secretion protein HlyD  29.23 
 
 		 406 aa  49.7  0.00006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0525  hypothetical protein  27.27 
 
 		 168 aa  49.7  0.00006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000120014  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3329  secretion protein HlyD  34.07 
 
 		 386 aa  49.7  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3527  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.23 
 
 		 446 aa  49.7  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0238  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.17 
 
 		 315 aa  49.7  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.187754 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2520  RND family efflux transporter MFP subunit  27.68 
 
 		 406 aa  49.7  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0941  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.57 
 
 		 419 aa  49.7  0.00006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.35175  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4391  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  27.91 
 
 		 311 aa  49.3  0.00007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0537  HlyD family multidrug resistance protein  26.32 
 
 		 381 aa  49.3  0.00008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.996753  normal  0.690705 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3456  RND family efflux transporter MFP subunit  26.63 
 
 		 409 aa  48.9  0.00009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000285815  normal  0.0164702 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0581  RND family efflux transporter MFP subunit  31.33 
 
 		 417 aa  48.9  0.00009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.669798  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5174  RND efflux transporter  29.88 
 
 		 355 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.274772  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0416  RND efflux system, membrane fusion protein CmeA  26.92 
 
 		 367 aa  48.5  0.0001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4802  secretion protein HlyD  27.12 
 
 		 424 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.838463  decreased coverage  0.00074061 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2614  aromatic acid efflux pump, membrane fusion protein  34.38 
 
 		 334 aa  48.9  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>