More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0525 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0525  hypothetical protein  100 
 
 		 168 aa  334  3.9999999999999995e-91  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000120014  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1857  secretion protein HlyD  33.33 
 
 		 390 aa  73.9  0.0000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4209  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.33 
 
 		 392 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.122721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3238  RND family efflux transporter MFP subunit  33.33 
 
 		 368 aa  72.4  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0318  secretion protein HlyD family protein  29.45 
 
 		 271 aa  71.6  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.844809  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0374  Multidrug resistance efflux pump-like protein  29.45 
 
 		 271 aa  70.9  0.000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0800097  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1685  RND family efflux transporter MFP subunit  32.74 
 
 		 387 aa  68.9  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0287  secretion protein HlyD family protein  30.99 
 
 		 275 aa  68.6  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3533  RND family efflux transporter MFP subunit  31.55 
 
 		 409 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.722317 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3758  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.28 
 
 		 379 aa  66.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2871  hypothetical protein  30.81 
 
 		 391 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.518674  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2818  secretion protein HlyD  35.04 
 
 		 376 aa  65.1  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.68617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3470  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.77 
 
 		 379 aa  65.1  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.430372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1256  membrane fusion protein (MFP) family auxiliary transport protein  31.25 
 
 		 397 aa  64.7  0.0000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33770  hypothetical protein  30.23 
 
 		 391 aa  64.7  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.127582  hitchhiker  0.00383681 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1163  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.09 
 
 		 377 aa  63.9  0.0000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00317162  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0454  secretion protein HlyD  30.51 
 
 		 373 aa  63.5  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.63564  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3781  RND family efflux transporter MFP subunit  30.95 
 
 		 407 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1640  CmeA  29.85 
 
 		 386 aa  61.6  0.000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3424  secretion protein HlyD  28.67 
 
 		 412 aa  61.6  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0119  CmeA  30.09 
 
 		 373 aa  61.6  0.000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1339  RND family efflux transporter MFP subunit  30.97 
 
 		 384 aa  60.8  0.000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.611384  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28820  secretion protein, HlyD family  30.97 
 
 		 441 aa  60.5  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.20411  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5483  HlyD family secretion protein  29.84 
 
 		 396 aa  60.1  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0155996  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1080  MacA  28.76 
 
 		 394 aa  60.1  0.00000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1361  HlyD family secretion protein  31.09 
 
 		 387 aa  59.3  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.70378  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0715  RND family efflux transporter MFP subunit  31.54 
 
 		 404 aa  60.1  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3228  RND family efflux transporter MFP subunit  34.15 
 
 		 378 aa  59.3  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4132  RND family efflux transporter MFP subunit  29.03 
 
 		 384 aa  59.3  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2160  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.03 
 
 		 390 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.337788  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1970  secretion protein HlyD  32.03 
 
 		 390 aa  58.5  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0699832  normal  0.38447 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3773  RND family efflux transporter MFP subunit  27.7 
 
 		 384 aa  58.5  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.265534  normal  0.799504 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0581  RND family efflux transporter MFP subunit  30.71 
 
 		 417 aa  58.2  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.669798  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0119  secretion protein HlyD family protein  30.71 
 
 		 287 aa  57.8  0.00000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.940377  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1084  MacA  29.56 
 
 		 402 aa  57.8  0.00000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4642  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.3 
 
 		 383 aa  57.8  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.195012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2186  RND family efflux transporter MFP subunit  32.06 
 
 		 435 aa  57.4  0.00000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1828  secretion protein HlyD  31.97 
 
 		 406 aa  57.8  0.00000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3575  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.03 
 
 		 379 aa  57.4  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0183852  normal  0.158176 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3595  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.29 
 
 		 404 aa  56.6  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0852698  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004022  membrane-fusion protein  33.08 
 
 		 369 aa  57  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000160707  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1204  secretion protein HlyD  31.34 
 
 		 395 aa  57  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.377097  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2568  secretion protein HlyD  30 
 
 		 412 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.807298  normal  0.212557 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3353  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.11 
 
 		 396 aa  57.4  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.462389  normal  0.0123154 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1968  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.09 
 
 		 379 aa  57.4  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000223491  normal  0.235934 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03980  HlyD family secretion protein  34.09 
 
 		 297 aa  57.4  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.79966  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1188  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.03 
 
 		 389 aa  57  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.856123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2802  RND family efflux transporter MFP subunit  31.3 
 
 		 430 aa  57  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.662741  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2562  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.77 
 
 		 416 aa  57  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0757424  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5137  RND family efflux transporter MFP subunit  32.77 
 
 		 427 aa  56.2  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259338 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2681  secretion protein HlyD  33.57 
 
 		 289 aa  56.6  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.879116  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3581  secretion protein HlyD  27.1 
 
 		 407 aa  56.2  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.434034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4281  secretion protein HlyD family protein  30 
 
 		 287 aa  56.2  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4863  RND family efflux transporter MFP subunit  33.33 
 
 		 360 aa  56.6  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.176323  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3096  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.77 
 
 		 396 aa  56.6  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.219805 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4233  secretion protein HlyD family protein  30 
 
 		 287 aa  56.2  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3429  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.34 
 
 		 399 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3304  secretion protein HlyD  30.89 
 
 		 396 aa  55.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0374  secretion protein HlyD  28.46 
 
 		 368 aa  55.5  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0795061 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0463  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.86 
 
 		 414 aa  55.5  0.0000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4407  RND family efflux transporter MFP subunit  32.31 
 
 		 360 aa  55.8  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1178  RND family efflux transporter MFP subunit  30.97 
 
 		 390 aa  55.5  0.0000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4180  RND family efflux transporter MFP subunit  25.71 
 
 		 366 aa  55.5  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.249201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0869  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexE precursor  32.85 
 
 		 409 aa  55.5  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.988771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6592  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.52 
 
 		 378 aa  55.1  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0859  HlyD family secretion protein  30.77 
 
 		 372 aa  55.1  0.0000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.585057  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0916  HlyD family secretion protein  30.77 
 
 		 372 aa  55.1  0.0000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6106  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.26 
 
 		 378 aa  55.1  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5559  secretion protein HlyD  25.71 
 
 		 366 aa  54.7  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1201  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.06 
 
 		 369 aa  54.7  0.0000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000118856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4421  secretion protein HlyD family protein  30 
 
 		 287 aa  54.7  0.0000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1007  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.61 
 
 		 398 aa  54.7  0.0000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0322  RND family efflux transporter MFP subunit  31.97 
 
 		 353 aa  54.7  0.0000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0619651 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3313  RND family efflux transporter MFP subunit  31.06 
 
 		 369 aa  54.7  0.0000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000984298  normal  0.15916 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3169  RND family efflux transporter MFP subunit  31.06 
 
 		 369 aa  54.3  0.0000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000222351  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3170  RND family efflux transporter MFP subunit  31.06 
 
 		 369 aa  54.7  0.0000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000721535  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14330  Secretion protein HlyD family  32 
 
 		 401 aa  54.3  0.0000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.774042  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3340  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.03 
 
 		 371 aa  54.3  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0315517 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0393  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.19 
 
 		 397 aa  53.5  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2329  RND family efflux transporter MFP subunit  30.53 
 
 		 436 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.4455  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01965  Secretion protein HlyD  31.06 
 
 		 401 aa  53.9  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.303602  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0505  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.44 
 
 		 349 aa  53.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2953  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.33 
 
 		 360 aa  53.9  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0380  secretion protein HlyD  26.09 
 
 		 400 aa  53.5  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0742  secretion protein HlyD  28.57 
 
 		 400 aa  53.5  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.460648 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2024  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.85 
 
 		 419 aa  53.5  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000305818 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0942  acriflavine resistance protein E  24.79 
 
 		 374 aa  53.5  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3523  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.07 
 
 		 438 aa  53.9  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.51854  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3585  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.53 
 
 		 435 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0892  RND efflux membrane fusion protein precursor  30.83 
 
 		 370 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2367  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.19 
 
 		 360 aa  53.1  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2482  secretion protein HlyD  29.55 
 
 		 434 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.179732  normal  0.227362 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1670  RND family efflux transporter MFP subunit  25.74 
 
 		 371 aa  52.8  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2878  RND family efflux transporter MFP subunit  28.06 
 
 		 396 aa  53.1  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.247459  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1291  secretion protein HlyD family protein  28.57 
 
 		 285 aa  52.8  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0717284  normal  0.800787 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0438  hypothetical protein  33.33 
 
 		 352 aa  53.1  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000466929  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2203  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.85 
 
 		 419 aa  53.1  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2684  multidrug efflux system subunit MdtA  29.85 
 
 		 411 aa  53.1  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1963  putative secretion protein, HlyD family  30.83 
 
 		 390 aa  53.1  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000072673  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2000  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.19 
 
 		 360 aa  53.1  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.461729  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>