More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3228 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3228  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 
378 aa  753    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0806  efflux transporter, RND family, MFP subunit  61.54 
 
 
380 aa  439  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3575  efflux transporter, RND family, MFP subunit  42.78 
 
 
379 aa  285  5.999999999999999e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0183852  normal  0.158176 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4299  RND family efflux transporter MFP subunit  44.04 
 
 
405 aa  285  7e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1564  RND family efflux transporter MFP subunit  43.82 
 
 
369 aa  282  5.000000000000001e-75  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000112948  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2259  efflux transporter, RND family, MFP subunit  44.89 
 
 
397 aa  280  4e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.141283  normal  0.411522 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2783  efflux transporter, RND family, MFP subunit  42.42 
 
 
393 aa  268  1e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00987855 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6106  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.22 
 
 
378 aa  265  8e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1117  efflux transporter, RND family, MFP subunit  43.65 
 
 
376 aa  252  6e-66  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0140148  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0822  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.01 
 
 
390 aa  250  2e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.191782  normal  0.633382 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1433  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.11 
 
 
373 aa  250  3e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.195416  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1204  secretion protein HlyD  39.17 
 
 
395 aa  249  6e-65  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.377097  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4132  RND family efflux transporter MFP subunit  38.42 
 
 
384 aa  244  9.999999999999999e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1067  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.89 
 
 
391 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000252486  hitchhiker  0.000793327 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3019  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.09 
 
 
378 aa  233  4.0000000000000004e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.809394  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2173  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.42 
 
 
393 aa  228  1e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1188  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.81 
 
 
389 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.856123  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6592  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.88 
 
 
378 aa  221  1.9999999999999999e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1400  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.22 
 
 
399 aa  220  3e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000127527  normal  0.840586 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4802  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.76 
 
 
398 aa  219  7.999999999999999e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000012488 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3340  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.76 
 
 
371 aa  207  3e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0315517 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5537  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.5 
 
 
375 aa  206  8e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.728308  normal  0.481729 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4642  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.3 
 
 
383 aa  203  5e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.195012  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1247  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.61 
 
 
389 aa  202  6e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.374762  normal  0.534332 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0537  HlyD family multidrug resistance protein  36.42 
 
 
381 aa  201  9.999999999999999e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.996753  normal  0.690705 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0806  secretion protein HlyD  38.99 
 
 
371 aa  198  2.0000000000000003e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3238  RND family efflux transporter MFP subunit  34.98 
 
 
368 aa  186  7e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2953  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.31 
 
 
360 aa  184  3e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10068  Secretion protein HlyD  31.93 
 
 
367 aa  184  3e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.305445  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1458  RND family efflux transporter MFP subunit  33.94 
 
 
422 aa  182  7e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.235103  hitchhiker  0.000537348 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4863  RND family efflux transporter MFP subunit  34.98 
 
 
360 aa  182  7e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.176323  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5359  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.05 
 
 
360 aa  176  8e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.954819  normal  0.588118 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0292  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.39 
 
 
366 aa  172  1e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.390239  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2947  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.34 
 
 
363 aa  168  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0374  secretion protein HlyD  30.57 
 
 
368 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0795061 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5179  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.27 
 
 
361 aa  163  4.0000000000000004e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00472624 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0906  RND family efflux transporter MFP subunit  31.45 
 
 
391 aa  163  5.0000000000000005e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0910  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.33 
 
 
393 aa  161  2e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2230  RND family efflux transporter MFP subunit  31.37 
 
 
362 aa  159  6e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0402  secretion protein HlyD  32.43 
 
 
403 aa  159  8e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4407  RND family efflux transporter MFP subunit  30.89 
 
 
360 aa  159  8e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1728  secretion protein HlyD  30.06 
 
 
363 aa  158  1e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0143164  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3601  secretion protein HlyD  29.41 
 
 
386 aa  156  7e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.804898  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0841  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.53 
 
 
393 aa  151  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.85215 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1129  secretion protein HlyD  31.66 
 
 
368 aa  151  2e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.827247  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2035  secretion protein HlyD  30.16 
 
 
430 aa  150  3e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.789986  hitchhiker  0.00327746 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0809  secretion protein HlyD  29.75 
 
 
392 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.165865 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44050  multidrug efflux pump membrane fusion protein  29.41 
 
 
427 aa  147  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3440  secretion protein HlyD  30.41 
 
 
415 aa  147  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2852  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.25 
 
 
520 aa  147  3e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4534  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.57 
 
 
424 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.452412  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2041  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.63 
 
 
419 aa  145  8.000000000000001e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0718692  normal  0.0182823 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1849  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.08 
 
 
422 aa  145  1e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00425578 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0982  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.92 
 
 
363 aa  145  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.407835  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0849  RND efflux system membrane fusion protein  33.04 
 
 
418 aa  145  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.8894  decreased coverage  0.000437743 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1701  secretion protein HlyD  28.69 
 
 
412 aa  143  4e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.17328  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2066  secretion protein HlyD  28.24 
 
 
428 aa  143  5e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.567226  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4918  RND family efflux transporter MFP subunit  29.89 
 
 
405 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.890764  normal  0.731397 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3829  secretion protein HlyD  29.94 
 
 
387 aa  141  9.999999999999999e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.192626  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0287  acridine efflux pump  28.74 
 
 
394 aa  142  9.999999999999999e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3014  secretion protein HlyD  29.89 
 
 
405 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3800  RND family efflux transporter MFP subunit  29.78 
 
 
404 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.582867  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5352  RND family efflux transporter MFP subunit  29.89 
 
 
405 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.730017  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3456  RND family efflux transporter MFP subunit  30.14 
 
 
391 aa  141  1.9999999999999998e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0295  HlyD family secretion protein  29.35 
 
 
405 aa  140  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2369  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.08 
 
 
433 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.137399  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5230  RND family efflux transporter MFP subunit  29.62 
 
 
405 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0639393  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4070  secretion protein HlyD  30.03 
 
 
405 aa  139  6e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.409958  normal  0.154431 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2859  acridine efflux pump  30.11 
 
 
373 aa  139  6e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.768203  normal  0.0209077 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3680  secretion protein HlyD family protein  27.76 
 
 
405 aa  139  6e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3930  RND family efflux transporter MFP subunit  29.37 
 
 
400 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4699  RND family efflux transporter MFP subunit  29.62 
 
 
405 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2434  RND family efflux transporter MFP subunit  28.99 
 
 
383 aa  138  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.671436  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1593  secretion protein HlyD  29.65 
 
 
400 aa  138  2e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000034507  unclonable  0.000000261884 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2697  multidrug resistance protein  30.58 
 
 
400 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1536  AcrA/E family efflux transporter MFP subunit  25.59 
 
 
416 aa  137  3.0000000000000003e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2450  RND family efflux transporter MFP subunit  28.76 
 
 
373 aa  137  3.0000000000000003e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3096  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.61 
 
 
396 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.219805 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0525  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexA precursor  29.22 
 
 
442 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.106985  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1011  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.69 
 
 
395 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.279031  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0942  acriflavine resistance protein E  28.42 
 
 
374 aa  137  4e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05530  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexA precursor  29.22 
 
 
383 aa  136  5e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0011  acriflavin resistance lipoprotein A precursor  27.54 
 
 
398 aa  136  6.0000000000000005e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.511373  normal  0.0259122 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1886  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.85 
 
 
379 aa  135  8e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0158662  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003895  membrane fusion protein of RND family multidrug efflux pump  28.12 
 
 
379 aa  135  9e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00341624  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3238  secretion protein HlyD  29.67 
 
 
393 aa  135  9.999999999999999e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0285  RND family efflux transporter MFP subunit  27.04 
 
 
386 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.884794  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4303  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.12 
 
 
386 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0501  RND family efflux transporter MFP subunit  28.66 
 
 
430 aa  135  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2106  RND family efflux transporter MFP subunit  29.72 
 
 
408 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.553946  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2160  secretion protein HlyD  32.36 
 
 
391 aa  134  3.9999999999999996e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.879337  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1117  secretion protein HlyD  28.79 
 
 
367 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2775  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.97 
 
 
420 aa  134  3.9999999999999996e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1828  secretion protein HlyD  28.53 
 
 
406 aa  133  5e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2285  RND family efflux transporter MFP subunit  26.84 
 
 
428 aa  133  5e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00134622 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3353  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29 
 
 
396 aa  133  6e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.462389  normal  0.0123154 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3015  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.38 
 
 
384 aa  133  6e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1575  RND membrane fusion protein AcrA  27.65 
 
 
448 aa  132  6.999999999999999e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.853878 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0389  RND family efflux transporter MFP subunit  29.39 
 
 
434 aa  132  7.999999999999999e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1596  HlyD family multidrug efflux protein  25.63 
 
 
371 aa  132  9e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.616153  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>